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大豆开花和成熟期显性E1等位基因关联分析
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作者 张普 贾世豪 +3 位作者 莎珍 杨植雅 欧侨欣 曹永策 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期624-633,共10页
【目的】深入解析大豆开花期和成熟期的遗传基础,发掘控制性状的重要基因组区间,为分子标记辅助选择育种和新基因克隆提供依据。【方法】以224份携带显性E1等位基因的大豆种质为试验材料,在4个种植环境下调查表型数据,用R-mrMLM软件包中... 【目的】深入解析大豆开花期和成熟期的遗传基础,发掘控制性状的重要基因组区间,为分子标记辅助选择育种和新基因克隆提供依据。【方法】以224份携带显性E1等位基因的大豆种质为试验材料,在4个种植环境下调查表型数据,用R-mrMLM软件包中的6种多位点关联分析模型对大豆开花和成熟期进行全基因组关联分析。【结果】共检测到91个开花期和83个成熟期QTNs(quantitative trait nucleotides),其中6个开花期和10个成熟期QTNs能在多环境中检测到,这些环境稳定QTNs分布于15个区间大小在90~490 kb的单倍型(基因组)内,并新检测到6个基因组区间。【结论】显性E1等位基因背景下大豆开花和成熟期的QTN构成复杂,位于5号染色体39.52~40.01 Mb等15个基因组区间是该群体中控制大豆开花期或成熟期的重要位点。 展开更多
关键词 大豆 开花期 成熟期 基因关联分析 基因组区间
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惩罚广义估计方程在纵向数据基因关联分析中的应用 被引量:2
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作者 曹红艳 曾平 +2 位作者 李治 崔跃华 张岩波 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2017年第4期534-537,共4页
目的探讨惩罚广义估计方程(pGEE)在纵向数据基因关联分析的应用,为纵向数据基因关联分析提供方法学参考。方法以小鼠糖尿病发病相关的数量性状位点识别为例,分别采用广义估计方程(GEE)和pGEE进行分析。结果 pGEE筛选出糖尿病发病关联位... 目的探讨惩罚广义估计方程(pGEE)在纵向数据基因关联分析的应用,为纵向数据基因关联分析提供方法学参考。方法以小鼠糖尿病发病相关的数量性状位点识别为例,分别采用广义估计方程(GEE)和pGEE进行分析。结果 pGEE筛选出糖尿病发病关联位点,为分子生物学研究提供了重要的候选位点。结论 pGEE能有效的实现高维纵向数据的变量选择,识别出有意义的关联位点。 展开更多
关键词 惩罚广义估计方程 纵向数据 SCAD 基因关联分析 数量性状位点
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全基因关联研究及其在精神分裂症中的应用进展 被引量:3
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作者 郭伟云 李文强 +1 位作者 牛玉璐 吕路线 《新乡医学院学报》 CAS 2010年第3期310-313,共4页
全基因组关联研究(GWAS)是目前研究复杂遗传性疾病的重要手段。单核苷酸多态性(SNPs)和拷贝数变异(CNVs)已成为复杂疾病易感基因定位的优选标记。基于SNPs和CNVs的GWAS在疾病易感基因定位分析中实现了高通量的全基因组覆盖和无假设分析... 全基因组关联研究(GWAS)是目前研究复杂遗传性疾病的重要手段。单核苷酸多态性(SNPs)和拷贝数变异(CNVs)已成为复杂疾病易感基因定位的优选标记。基于SNPs和CNVs的GWAS在疾病易感基因定位分析中实现了高通量的全基因组覆盖和无假设分析,与以往遗传学研究方法相比,效率更高、可信度更强,在糖尿病、肥胖等疾病中被广泛应用。精神分裂症(SP)是复杂遗传性疾病的典型代表,GWAS为SP的研究带来了突破。本文就GWAS及其在SP研究中的应用进展做一综述。 展开更多
关键词 基因关联研究 精神分裂症 单核苷酸多态性 拷贝数变异
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病例对照设计为基础的候选基因关联研究中交互作用的统计方法进展 被引量:4
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作者 金如锋 夏昭林 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期265-270,共6页
候选基因关联研究中基因-基因、基因-环境交互作用的统计分析有利于揭示疾病的发生机制。本文针对病例对照设计的候选基因关联研究,综述交互作用的统计方法及其进展。交互作用的统计方法包括参数法和非参数法。参数法中最常用的为Logis... 候选基因关联研究中基因-基因、基因-环境交互作用的统计分析有利于揭示疾病的发生机制。本文针对病例对照设计的候选基因关联研究,综述交互作用的统计方法及其进展。交互作用的统计方法包括参数法和非参数法。参数法中最常用的为Logistic回归模型,非参数法主要是数据挖掘方法。有4类数据挖掘方法可用于候选基因关联研究,包括降维法、基于树的方法、模式识别法和贝叶斯法。本文对最常用且可靠的几种数据挖掘方法(多因子降维法、分类回归树、随机森林、贝叶斯上位效应关联图谱)的原理、分析过程和优缺点予以比较。参数法和非参数法分析交互作用时各有优缺点;低维数据的分析可采用参数法和非参数法,高维数据的分析则主要采用非参数法。随着基因分型技术的发展,可检测的SNP规模逐渐增大,使得非参数方法的应用越来越广。 展开更多
关键词 候选基因关联研究 病例对照设计 交互作用 数据挖掘
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基于信息熵的加权基因关联网络融合方法 被引量:6
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作者 伍度志 杨帆 赵静 《电子科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第2期286-291,共6页
针对加权基因关联网络(WGAN)的融合问题,提出了基于信息熵的加权网络数据融合方法。该方法利用信息熵来刻画基因间连边的不确定程度,并由此实现对4个现有的人类加权基因关联网络的融合,从而获得一个规模更大、生物学信息更丰富的WGAN网... 针对加权基因关联网络(WGAN)的融合问题,提出了基于信息熵的加权网络数据融合方法。该方法利用信息熵来刻画基因间连边的不确定程度,并由此实现对4个现有的人类加权基因关联网络的融合,从而获得一个规模更大、生物学信息更丰富的WGAN网络。融合效果的验证结果表明,新的WGAN网络包含了更多的基因连边,其边权比原始网络中的边权有更强的生物学相关性,同时在疾病基因预测中表现出更为满意的效果。 展开更多
关键词 数据融合 疾病基因预测 信息熵 加权基因关联网络
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类风湿关节炎病因和发病机制的理性思维——多基因关联的抗原驱动的链式炎症反应 被引量:3
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作者 孟济明 邹和建 叶霜 《内科理论与实践》 2009年第6期502-510,共9页
从1892年Garrod命名“类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)”以来,先后提出了“血管外免疫复合物”、“细胞超敏反应”、“二相疾病”等病因和发病机制假说;直到1986年Alareon才概略地提出了“易感基因与生态体系反应异常”学说... 从1892年Garrod命名“类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)”以来,先后提出了“血管外免疫复合物”、“细胞超敏反应”、“二相疾病”等病因和发病机制假说;直到1986年Alareon才概略地提出了“易感基因与生态体系反应异常”学说,而对具体内容表述较少^[1]。 展开更多
关键词 类风湿关节炎 基因关联遗传 发病机制 炎症反应
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对遗传算法困难度测量的基因关联法的研究 被引量:1
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作者 李建武 李敏强 《控制理论与应用》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第2期247-251,共5页
针对基因关联测度法的本质及意义进行了详细的理论剖析和实证研究.首先分析了反映遗传算法基因关联程度的标准化的基因关联方差与基因关联相关系数,进一步归纳出两个基本定理,并给予了严格的数学证明.最后用一些初等函数及NNK-模型对这... 针对基因关联测度法的本质及意义进行了详细的理论剖析和实证研究.首先分析了反映遗传算法基因关联程度的标准化的基因关联方差与基因关联相关系数,进一步归纳出两个基本定理,并给予了严格的数学证明.最后用一些初等函数及NNK-模型对这一方法进行了实证分析,实验结果表明,对于困难问题该方法能够给予准确的判别,而对于某些较为容易的问题可能产生误判. 展开更多
关键词 遗传算法 基因关联 遗传算法困难度 NK-模型
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老年痴呆与Klotho基因关联性研究进展 被引量:2
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作者 陈非 马厚勋 陈恳 《现代医药卫生》 2014年第20期3077-3079,共3页
随着人口老龄化社会结构的形成,老年痴呆发病率逐年增高[1],已成为世界性严重的公共健康问题,给社会、家庭带来了沉重负担。有关痴呆的病因和发病机制的研究主要集中在早老素基因、淀粉样蛋白前体基因、载脂蛋白E基因等方面[2]。近年来... 随着人口老龄化社会结构的形成,老年痴呆发病率逐年增高[1],已成为世界性严重的公共健康问题,给社会、家庭带来了沉重负担。有关痴呆的病因和发病机制的研究主要集中在早老素基因、淀粉样蛋白前体基因、载脂蛋白E基因等方面[2]。近年来研究发现,在Klotho基因敲除后的小鼠中过早出现与人类老年阶段相关的多种行为和病理变化,即被认为可能Klotho基因参与了老年痴呆的发病机制,特别是与其发生认知功能障碍具有关联性, 展开更多
关键词 老年人 痴呆 Klotho基因关联 研究进展 综述
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基于潜变量构建高维单核苷酸多态性基因关联模型
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作者 张岩波 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2011年第3期329-332,共4页
在后基因组时代,单核苷酸多态性(single-nu-cleotide polymorphisms,SNPs)研究已成为生物医学许多研究领域的焦点。
关键词 潜变量 单核苷酸多态性 基因关联模型
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基于全基因关联分析的代谢组学在植物中的应用 被引量:5
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作者 袁进成 孟亚轩 +3 位作者 孙颖琦 赵心月 王凤霞 刘颖慧 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期12-18,共7页
植物代谢物是人类食物和营养物质的重要来源。代谢组学是对生物体内代谢物进行定量和定性分析,研究代谢物合成和调控机制的一门新兴学科。基于代谢组的全基因组关联分析(metabolome-based genome-wide association study,mGWAS)是将代... 植物代谢物是人类食物和营养物质的重要来源。代谢组学是对生物体内代谢物进行定量和定性分析,研究代谢物合成和调控机制的一门新兴学科。基于代谢组的全基因组关联分析(metabolome-based genome-wide association study,mGWAS)是将代谢组数据作为表型,与基因型数据进行关联分析的一种方法。概述了近几年利用mGWAS技术在植物代谢调控网络研究、初生和次生代谢物的形成机制、代谢物在植物生长发育和胁迫应答中的作用,同时综述了mGWAS在代谢物相关候选基因的定位和调控营养、品质相关代谢通路的挖掘,为深入了解植物代谢物合成调控的遗传机制奠定基础。 展开更多
关键词 代谢组学 基因关联分析 mGWAS 进展
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帕金森病与多动症存在基因关联 被引量:1
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作者 丁香园 《上海医药》 CAS 2014年第22期38-38,共1页
丹麦学者首次发现,青年型帕金森病和突触前Na+离子耦联多巴胺运载体(DAT)基因突变存在基因关联。他们的研究表明,DAT基因(SLC6A3)上的两个突变不仅与早发型帕金森病有关,而且涉及注意力缺失过动症(ADHD)、抑郁狂躁型忧郁症抑... 丹麦学者首次发现,青年型帕金森病和突触前Na+离子耦联多巴胺运载体(DAT)基因突变存在基因关联。他们的研究表明,DAT基因(SLC6A3)上的两个突变不仅与早发型帕金森病有关,而且涉及注意力缺失过动症(ADHD)、抑郁狂躁型忧郁症抑和自闭症。DAT通过介导多巴胺的再摄取,从突触间隙回到神经细胞中,调控多巴胺的作用。DAT基因突变已经被识别并与婴儿期运动障碍联系起来。多动症同样与多巴胺能信号转导异常有关。 展开更多
关键词 青年型帕金森病 基因关联 多动症 AT基因突变 DAT基因 早发型帕金森病 多巴胺能 信号转导异常
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最新推荐前列腺癌分级组别预后与基因关联
12
作者 Rubin MA 王新光 《现代泌尿生殖肿瘤杂志》 2016年第2期85-85,共1页
国际泌尿病理学会及2016世界卫生组织蓝皮书推荐对前列腺癌评分采用新的五级分级系统.新的五级预后分级系统定义了评分从一级到五级分别为≤6、3+4、4+3、8、〉8.最近研究显示每一组都与前列腺癌的生化复发的不同风险率相关联.在此项... 国际泌尿病理学会及2016世界卫生组织蓝皮书推荐对前列腺癌评分采用新的五级分级系统.新的五级预后分级系统定义了评分从一级到五级分别为≤6、3+4、4+3、8、〉8.最近研究显示每一组都与前列腺癌的生化复发的不同风险率相关联.在此项研究中. 展开更多
关键词 前列腺癌 基因关联 预后 世界卫生组织 分级系统 风险率 评分
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外阴阴道牙龈综合征:一种具特征性临床表现并新发现与HLAII-DQB1*0201等位基因关联的扁平苔藓严重亚型
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作者 Setterfield J.F Neill S +1 位作者 Shirlaw P.J. 周少娜 《世界核心医学期刊文摘(皮肤病学分册)》 2006年第9期57-57,共1页
Background: The vulvovaginal gingival syndrome is an uncommon and severe variant of lichen planus characterized by erosions or desquamation of vulval, vaginal, and gingival mucosae with a predilection for scarring and... Background: The vulvovaginal gingival syndrome is an uncommon and severe variant of lichen planus characterized by erosions or desquamation of vulval, vaginal, and gingival mucosae with a predilection for scarring and stricture formation. Objective: We sought to define the clinical, immunopathologic, and human leukocyte antigen findings in a large cohort of patients. Methods: The clinical presentation and outcome during long-term follow-up were documented in 40 patients. In addition, human leukocyte antigen typing for class II by polymerase chain reaction and sequence-specific primers was performed. Results: During a mean follow-up period of 8.7 (SD ± 6.8) years, long-term sequelae included strictures of the esophagus, lachrymal ducts, and external auditory canal; loss of vulval architecture; vaginal stenosis; and buccal mucosal fibrosis. The DQB1 0201 allele was present in 80% of patients versus 41.8% of control subjects (P ≤ .0042; relative risk 3.71). Conclusion: Early diagnosis of this distinct subgroup of lichen planus, combined with appropriate therapeutic measures, may help to minimize the significant physical and psychologic morbidity associated with this scarring disorder. 展开更多
关键词 等位基因关联 外阴阴道 临床表现 扁平苔藓 综合征 牙龈 亚型 人类白细胞抗原
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德科学家确认侵袭性牙周炎与冠心病的基因关联
14
《广州医学院学报》 2009年第4期86-86,共1页
据德新社报道,德国基尔大学的科学家已确认侵袭性牙周炎与冠心病之间存在基因关联。德新社援引基尔大学临床分子生物学研究所科学家舍费尔在一个学术会议上的讲话说,基尔大学的科学家在研究侵袭性牙周炎患者9号染色体上的基因变异时... 据德新社报道,德国基尔大学的科学家已确认侵袭性牙周炎与冠心病之间存在基因关联。德新社援引基尔大学临床分子生物学研究所科学家舍费尔在一个学术会议上的讲话说,基尔大学的科学家在研究侵袭性牙周炎患者9号染色体上的基因变异时发现, 与这一疾病相关的基因变异体与冠心病患者身上的有关基因变异体是同样的。 展开更多
关键词 侵袭性牙周炎 冠心病患者 德科学家 基因关联 基因变异体 临床分子生物学 9号染色体 牙周炎患者
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精神患者焦虑抑郁因子的基因关联性研究进展
15
作者 刘俐男 陈丽霞 刘永义 《内蒙古医学杂志》 2021年第4期443-445,共3页
精神活动异常在诊断意义中被称之为精神障碍,它可以在认知、情感、行为和意志等方面表现出不同程度的精神异常。大量临床观察及科学研究表明,多种精神障碍存在相似的临床症状。焦虑和抑郁最为常见,不仅对精神患者的康复造成影响,患者的... 精神活动异常在诊断意义中被称之为精神障碍,它可以在认知、情感、行为和意志等方面表现出不同程度的精神异常。大量临床观察及科学研究表明,多种精神障碍存在相似的临床症状。焦虑和抑郁最为常见,不仅对精神患者的康复造成影响,患者的生存质量也随之降低。如今全基因组关联分析(GWAS)已经成为研究复杂疾病/性状遗传学发病机制的强有力手段。以下将对精神患者焦虑抑郁因子GWAS的研究进展做一综述。 展开更多
关键词 精神患者 焦虑 抑郁 基因 基因关联分析
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基于疾病与基因关联性分析的遗传位点选取 被引量:1
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作者 陈莲 郭元辉 《数学学习与研究》 2017年第17期150-151,共2页
以2016年全国研究生数学建模竞赛B题"遗传性疾病和性状的遗传位点"提供的数据,按照1∶1的病例对照设计,运用Pearson卡方检验和病例组与对照组的碱基差异的正态分布情况各选取出24个可能的致病位点.将两种方法选取出的24个可能的致病... 以2016年全国研究生数学建模竞赛B题"遗传性疾病和性状的遗传位点"提供的数据,按照1∶1的病例对照设计,运用Pearson卡方检验和病例组与对照组的碱基差异的正态分布情况各选取出24个可能的致病位点.将两种方法选取出的24个可能的致病位点与300个基因进行全基因组关联分析,找出最有可能的致病基因. 展开更多
关键词 遗传位点 Pearson卡方检验 正态分布检验 基因关联分析
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大豆叶型性状全基因组关联分析与候选基因鉴定 被引量:1
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作者 王琼 朱宇翔 +5 位作者 周密密 张威 张红梅 陈新 陈华涛 崔晓艳 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期623-632,共10页
大豆叶片的形状和垂直分布影响群体冠层结构和光合效率并最终影响大豆的产量。植物叶片大小、形态因着生位置不同而产生差异的现象称为异形叶,虽然异形叶现象在被子植物中广泛存在,但目前关于大豆叶片发育过程中异形叶的调控的研究还很... 大豆叶片的形状和垂直分布影响群体冠层结构和光合效率并最终影响大豆的产量。植物叶片大小、形态因着生位置不同而产生差异的现象称为异形叶,虽然异形叶现象在被子植物中广泛存在,但目前关于大豆叶片发育过程中异形叶的调控的研究还很有限。本研究通过对283份大豆种质资源的叶长、叶宽、叶形指数和异形叶指数等叶型相关的性状在江苏南京进行连续2年的考察,利用全基因组关联分析检测到181个叶型性状相关位点,其中能够在2个环境或多个性状中重复检测到的位点18个。利用检测到的与叶型相关的SNP位点,结合基因的表达谱数据、拟南芥中同源基因的功能,鉴定与大豆叶片发育和异形叶形成相关的候选基因。其中在20号染色体的相关位点Chr20:36152820上游发现已知的大豆叶形调控基因Ln(Glyma.20G116200)。此外,在19号染色体的相关位点Chr19:45155943附近鉴定到2个候选基因Glyma.19G192700、Glyma.19G194100,分别被注释为Growth-regulating factor 4(GRF4)和LITTLE ZIPPER 3(ZPR3)基因的同源基因,为阐明大豆异形叶等叶型性状遗传的分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 大豆 叶型 异形叶 基因关联分析 SNP标记
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大豆地方种质资源鲜籽粒可溶性糖含量的全基因组关联分析 被引量:1
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作者 张玉梅 丁文涛 +5 位作者 蓝新隆 李清华 胡润芳 郭娜 林国强 赵晋铭 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期2079-2091,I0001-I0004,共17页
【目的】可溶性糖含量是鲜食大豆重要的品质性状之一,研究大豆鲜籽粒可溶性糖含量的遗传变异,深入解析可溶性糖含量的遗传机制,为鲜食大豆种质创新及品质育种提供依据。【方法】利用来自东北大豆生态区、北方大豆生态区、黄淮海大豆生... 【目的】可溶性糖含量是鲜食大豆重要的品质性状之一,研究大豆鲜籽粒可溶性糖含量的遗传变异,深入解析可溶性糖含量的遗传机制,为鲜食大豆种质创新及品质育种提供依据。【方法】利用来自东北大豆生态区、北方大豆生态区、黄淮海大豆生态区和南方大豆生态区的133份大豆地方种质,在2021年连江春季、福清春季和秋季3个环境下对鲜籽粒可溶性糖含量进行表型测定,结合82187个高质量SNP标记,基于混合线性模型MLM(Q+K)对可溶性糖含量进行全基因组关联分析,挖掘可溶性糖含量显著相关的SNP位点,并以显著SNP位点为中心,两端各扩展119.07 kb连锁不平衡衰减距离为候选区间,根据候选区间内基因的注释和组织表达信息预测候选基因。【结果】3个环境下,鲜籽粒可溶性糖含量的变异范围为3.37—33.84 mg·g^(-1),遗传变异系数为24.59%—32.69%,可溶性糖含量遗传率为68.14%。通过全基因组关联分析,连江春季、福清春季和秋季3个环境下分别检测到与鲜籽粒可溶性糖含量显著关联的SNP有6、8和22个,表型变异解释率为12.43%—29.27%,以表型变异解释率较高的9个显著SNP位点所在的候选区间进行搜索,共获得86个基因,结合基因注释和组织表达信息,进一步筛选到9个候选基因,主要涉及转录因子、糖蛋白家族和糖类合成转运等生物学过程。其中,Glyma.01g016500、Glyma.13g042100、Glyma.16g131800和Glyma.16g155300在大豆种子及荚中表达水平较高,可作为大豆鲜籽粒可溶性糖的最具潜力候选基因。【结论】通过全基因组关联分析,检测到36个与鲜籽粒可溶性糖含量显著关联的SNP,进一步筛选出9个候选基因可能参与大豆鲜籽粒可溶性糖含量的调控,其中,Glyma.01g016500、Glyma.13g042100、Glyma.16g131800和Glyma.16g155300可作为调控大豆鲜籽粒可溶性糖含量的关键目标基因。 展开更多
关键词 大豆 鲜籽粒 可溶性糖含量 基因关联分析 候选基因
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成熟期水稻种子脱水速率全基因组关联分析 被引量:1
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作者 刘忠奇 张海清 +1 位作者 贺记外 桂金鑫 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期150-159,共10页
[目的]籽粒脱水速率直接影响种子的安全收获和快速干燥。选育成熟期籽粒含水量低、脱水速率快的品种,可保障种子质量,降低生产成本。[方法]采用来自82个不同国家和地区的165份水稻核心种质作为试验材料,将成熟期种子脱水速率表型与基因... [目的]籽粒脱水速率直接影响种子的安全收获和快速干燥。选育成熟期籽粒含水量低、脱水速率快的品种,可保障种子质量,降低生产成本。[方法]采用来自82个不同国家和地区的165份水稻核心种质作为试验材料,将成熟期种子脱水速率表型与基因型相结合进行GWAS分析,挖掘调控种子脱水的关键基因,为培育和创制脱水快速品种奠定基础。[结果]1)对165份水稻核心种质群体脱水速率性状进行描述性统计分析,结果显示2年脱水速率性状均呈连续性偏正态分布,2年快速脱水的脱水速率性状在年际间具有显著相关性。不同亚群之间快速脱水与慢速脱水速率正相关。2)GWAS关联分析共获得与脱水速率显著关联的SNP 170个,QTL 36个。通过LD分析定位到6个与脱水速率密切相关的QTL,分别为qGDR2.3、qGDR4.1、qGDR4.2、qGDR6.1、qGDR6.4、qGDR10.1。[结论]这些QTL区间内主要候选基因OsPIP1;1、Os TIFY9、Osb ZIP48、Os ATG8b、OsDREB1C、Os SCP46与水分转运活性、信号转导、转录调控、抗氧化防御密切相关,推测它们与成熟期水稻种子脱水速率相关,可作为候选基因。 展开更多
关键词 水稻种子 脱水速率 数量性状基因 基因关联分析
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大豆籽粒Ve含量的全基因组关联分析
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作者 张红梅 张威 +6 位作者 王琼 贾倩茹 孟珊 熊雅文 刘晓庆 陈新 陈华涛 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1223-1235,共13页
维生素E(Ve)是大豆油中一种天然抗氧化剂,是评价大豆油营养价值的重要指标。本研究利用含有264份的大豆自然群体在2021年和2022年测定了籽粒中α-、γ-和δ-生育酚含量,并进行全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)。... 维生素E(Ve)是大豆油中一种天然抗氧化剂,是评价大豆油营养价值的重要指标。本研究利用含有264份的大豆自然群体在2021年和2022年测定了籽粒中α-、γ-和δ-生育酚含量,并进行全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)。本研究共检测到199个与大豆Ve含量显著关联的SNP位点,其中9个可在2个环境或者2个性状被重复检测到,分别位于3号、7号、11号、12号、13号、15号、17号和18号染色体上。其中位于7号染色体上的显著关联信号是控制α-生育酚含量的主效位点,可在2年环境中被检测到,表型变异解释率为9.83%。对该位点候选基因进行筛选,获得一个编码myb转录因子的基因Glyma.07G054000,可能是这个位点的效应基因。另外,在12号染色体上得到2个编码γ-生育酚甲基转移酶的基因Glyma.12G014200和Glyma.12G014300,有可能是影响Ve含量的重要基因。本研究结果有助于解析大豆籽粒Ve含量的遗传基础及其调控机制,为大豆品质遗传改良奠定了基础。 展开更多
关键词 大豆 籽粒 Ve含量 基因关联分析 候选基因
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