人类白细胞抗原基因分型方法分辨水平的专家共识

人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因分型已广泛应用于造血干细胞捐献者资料库建立、供受者组织配型、血小板基因数据库建立以及疾病关联诊断、遗传学和其他科学研究。随着HLA等位基因数量的增加和分型技术发展,对于HLA基因分型分辨水平界定、供受者HLA位点结果描述和配合判定等存在一定差异,为提高对HLA基因分型分辨水平的界定和解读的规范性,HLA基因检测实验室和临床移植领域的多名专家,依据国内外相关文献和临床实践制定此专家共识,对国内HLA基因分型分辨水平的定义、分型方法、供受者结果描述和相合判定等进行了概述并达成共识,以期进一步规范实验室HLA基因分型,保障检测结果的准确性。

乙型肝炎病毒S基因分型方法的建立

目的 建立乙型肝炎病毒 (HBV)S基因分型方法。方法 利用PCR扩增乙型肝炎病毒S基因 ,对上海地区无症状携带者、慢性乙型肝炎、重型肝炎的HBVDNA进行分型。结果 2例无症状携带者为C型 ;85例慢性乙型肝炎 19例B型(2 2 .3% ) ,5 3例C型 (6 2 .3% )、13例BC混合型 (15 .3% ) ;16例重型肝炎 ,B型 3例 (18.7% )、C型 4例 (2 5 0 % )、BC混合型 9例(5 6 .3% )。结论 新的基因分型方法 ,简化了传统的序列分型法 ,结果可靠 。

牛分枝杆菌基因分型方法及其在牛结核病流行病学中的应用

结核病是人类已知的最古老的疾病之一，早在1901年诺贝尔奖获得者Von Behring就曾强调“牛结核病是影响农业生产最具破坏力的一种传染病”。100多年过去了，结核病依然严重威胁着人类和动物的健康，并且其每年对全球农业造成的损失达30亿美元。牛结核病（bovine tuberculosis）已被世界动物卫生组织（OIE）列为B类动物疫病，是由牛分枝杆菌（Mycobaeterium bovis，MB）和结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis，TB）所引起的一种人畜共患慢性消耗性传染病，可以通过吸入含菌气溶胶或食用受污染的乳制品而从牛传染到人，牛结核病有众多的宿主谱，几乎可以感染所有的温血脊椎动物．其传播和流行严重地影响着畜牧业持续发展和人类健康。

乙型肝炎病毒基因分型方法及临床和分子流行病学意义

自1988年Okamoto初步建立了乙型肝炎病毒（HBV）基因A～D分型标准后，目前HBVDNA基因型已分为A～F六型。本文就乙型肝炎病毒基因型的分型方法及其临床和分子流行病学意义的有关情况作一简要综述。

乙型肝炎基因分型方法及其临床意义

有效数据统计结果显示,我国乙型肝炎病毒（HBV）感染率高达65%左右,乙型肝炎表面抗原携带率约占总人口的7.2%[1]。乙型肝炎是由HBV引起的以肝脏炎性病变为主的传染性疾病,该疾病的发生会导致患者在生活中受到不同程度的歧视,身体健康也会受到严重影响[2]。随着我国医疗水平的提升,有关该疾病的研究也取得了新的进展。

Diego血型系统DNA基因分型方法

背景 Diego血型系统分型的血清学试剂已影响了稀有Di(b-)型供血者的鉴定,他们的血液是那些含Dib抗体而需要输注Dib抗体阴性血的患者必需的。建立一个可供选择的Di分型方法作为当前流行的血清学分型方法的补充是一个重要和必须的目标。设计和方法

长QT综合征的遗传学检测——一种临床高效基因分型方法的研发与验证

背景：长QT综合征（long QT syndrome，LQTS）的严重程度及其对治疗的反应因致病遗传位点而异。因此，我们迫切需要建立一种能快速进行遗传学分析的方法。 目的：对LQTS患者进行筛查，确定遗传学检测方法、突变类型及发生率。 设计、患者及地点：于1996年7月至2004年7月连续对430例患者进行遗传学检测，确定KCNQ1、KCNH2和SCN5A基因高频率突变密码子的检出是否可以成为一种新型、快速、高效基因分型策略。利用变性高效液相色谱法和DNA测序法筛查KCNQ1、KCNH2、SCN5A、KCNE1和KCNE2基因的全部编码区。确定突变的频率和类型，找出重复突变。另有一组连续75例先证者作为验证组，以便在前述LQTS人群中对检出重复突变的发生率进行前瞻性定量分析。 主要观测指标：提出一种新型LQTS基因分型法。 结果：在430例先证者（KCNQ149％、KCNH239％、SCA5A10％、KCNE11．7％、KCNE20．75％）中，有310例（72％）共检出235种不同的突变，其中138种为新的突变。58％的先证者在KCNQ1、KCNH2和SCA5A基因64种密码子携带非个人突变。在75例前瞻性先证队列和以往报告的LQTS队列中亦于这些密码子（52％）证实相似的突变发生率。 结论：我们提出了一种改进LQTS遗传突变筛查效果的方法，这种新方法拓展了基因分型的范围，可使我们更好地对LQTS患者进行危险分层和治疗。

沙门菌血清分型方法的比较

血清分型是沙门菌最基本和最重要的流行病学调查手段,不同血清型沙门菌引起的临床症状和造成的危害不同,快速准确地进行血清分型对于畜禽沙门菌病的防控和公共卫生安全意义重大。基于此,本试验选择我国1971—2020年分离的51株沙门菌(13种血清型),分别用全基因组测序(WGS)分型方法和液相芯片分型方法进行血清分型,并与玻片凝集法进行比较,分析3种分型方法的优劣。结果显示,玻片凝集法测得51株沙门菌的血清分型结果与原始结果一致;WGS分型方法和液相芯片分型方法分别测得34株和23株沙门菌血清分型与玻片凝集法结果一致。3种分型方法相比,WGS分型方法可鉴定出玻片凝集法和液相芯片分型方法无法分型的菌株,在操作时间和成本上更具优势。本试验可为沙门菌的血清分型研究提供参考。

丙型肝炎病毒逆向点杂交基因分型方法的建立及初步应用

目的利用逆向点杂交技术建立丙型肝炎病毒(HCV)基因分型新方法。方法在HCV5’端非编码区(5’UTR)设计引物与分型探针,将活性氨基标记的分型探针依次固定在尼龙膜上,制成HCV基因分型逆向点杂交检测膜条。分离纯化血清中的HCVRNA,经逆转录反应和生物素标记引物聚合酶链反应(PCR)巢式扩增后,将扩增产物与检测膜条杂交,过氧化物酶和四甲基联苯胺显色,判断基因分型结果。最后,通过与基因测序结果比较确定新方法的有效性。从佛山地区丙型肝炎患者中随机抽取60份经荧光定量PCR方法对HCVRNA进行过定量分析的血清,用新建方法进行HCV基因分型检测。结果新建HCV逆向点杂交基因分型方法可对所有60份HCVRNA拷贝数在102～106/ml之间的抽检血清进行基因分型,发现1b型50例,占83.3%;1a型2例,占3.3%;2a型2例,占3.3%;1a、1b混合型5例,占8.0%;1b、2a混合型1例,占1.7%;未发现2b、3a和3b型。新方法基因分型结果与测序分型结果一致。结论PCR逆向点杂交技术可以准确有效和简便经济地进行HCV基因分型,适用于临床检测与流行病学研究。在佛山地区人群中感染的HCV以1b型为主。

应用液态芯片技术建立结核分枝杆菌间隔区寡核苷酸基因分型方法

在结核病的分子流行病学研究中，间隔区寡核苷酸基因分型法（spaceroligonucleotidetyping，Spoligotyping）是主要的MTB基因分型方法，其分型原理是根据MTB基因组中存在多拷贝的正向重复序列，在特定的2个正向重复序列之间的是否存在非重复间隔序列，不同的菌株可能存在差别。Spoligotyping分型通过分析MTB基因组中43个正向重复间隔序列存在的多态性来区分不同菌株，并根据相邻3个间隔序列的存在情况，

32株孢子丝菌临床株两种基因分型方法比较

我们曾应用随机扩增多态DNA（RAPD）技术和rDNA限制性片段长度多态性（RFLP）-Southern印迹杂交方法进行申克孢子丝菌种内分型，国内外众多学者亦将线粒体DNA限制性片段长度多态性（mtDNA RFLP）方法用于孢子丝菌种内分型的研究中。本研究选用32株不同地区来源及不同临床类型的孢子丝菌菌株作为研究对象，分别用RAPD、mtDNA—RFLP方法进行分型，探讨申克孢子丝菌的基因学特征，研究基因型与菌种地区来源及疾病临床类型的相关性，并对目前已报道的2种基因分型方法进行比较。

湖南省231株结核分枝杆菌Spoligotyping和MLVA基因分型方法及其结果分析

随着1998年结核分枝杆菌（Mycobacteriu tuberculosis）H37Rv全基因测序工作完成[1],以及分子生物学技术的发展,人类已采用基因分型技术在分子水平上了解结核分枝杆菌的传播规律和近期传染率等.

孕妇外周血胎儿ABO血型基因分型技术的建立

本研究目的是建立孕妇外周血胎儿ABO血型基因分型技术,用于ABO血型不合引起的新生儿溶血病的产前诊断。根据ABO血型基因DNA全序列和mRNA序列设计4对引物,选择20例健康供者血浆,提取血浆中DNA进行扩增,探索最佳的血浆DNA提取及PCR扩增条件,初步建立单人ABO血型基因分型技术。将O型血浆DNA与A型或B型血浆DNA按1:1、2:1、4:1、8:1、10:1、20:1、40:1、100:1进行混合,模拟孕妇外周血胎儿与孕妇自身ABO基因混合状态,建立混合ABO血型基因分型技术。选取14例孕30周以上的孕妇外周血标本,进行胎儿ABO血型基因型鉴定,并对孕妇进行追踪,尽量获取胎儿出生以后的外周血标本进行ABO血型鉴定,以评价孕妇外周血胎儿ABO血型基因分型技术的灵敏度与准确性。结果表明:单人血浆进行准确血型鉴定的最少模板DNA量约为0.625ng,500μl血浆提取的DNA量即可达到PCR扩增要求;当混合血浆中O型DNA所占比例≤10时,可以准确检测出非O基因的存在;14名O型孕妇外周血标本中9例标本扩增出非O型基因,5例未扩增出非O基因;通过血清学方法对5例胎儿出生后外周血进行ABO血型鉴定,其中A型3例,B型1例,O型1例,与其基因分型结果一致,符合率100%。结论:本研究建立的孕妇外周血胎儿ABO血型基因提取、分型技术,可以对妊娠中晚期胎儿ABO血型基因型进行准确鉴定,从而为新生儿溶血病的产前诊断与预防提供指导意见。

淋病奈瑟菌基因分型进展

淋病奈瑟菌表型分型方法的局限性限制其在该菌分型方面的应用.近年来,一系列该菌基因分型方法的建立弥补了表型分型方法的不足.各种基因分型方法,如Opa分型法、Por分型法、脉冲场凝胶电泳等有着各自不同的基因分型基础、应用范围及优缺点等.本文就近年来新发展的最主要的该基因分型方法作一简要介绍.

基因分型在正反定型不符病例中的诊断意义

ABO血型鉴定是临床患者输血前的一项重要检查。在某些疾病的影响下,可以导致ABO血型中的抗原或抗体减弱,出现ABO血型正反定型不符而鉴定困难的情况,从而影响输血配型。广西贵港市中心医院2009年10月-2010年1月收治的2例骨髓增生异常综合征的患者正反定型不符,采用PCR-SSP基因分型方法正确定型后输血,现报告如下。

乙型肝炎病毒基因分型特征及对抗病毒疗效的影响

慢性乙型肝炎是影响大约2．5亿人口（其中包括350万慢性乙型肝炎病毒携带者）身体健康的世界性问题，除了普遍接种乙型肝炎疫苗，有效和个性化的治疗，防止恶化成终末期肝病和肝癌的措施还是非常必要的。1988年首次提出 HBV基因型概念，由于错误的分类和不同的基因分型方法，曾经引起一些争议，近年来，全面的、动态的分类系统不断健全，相关性研究逐渐成为热点，国内外大量研究发现HBV基因型已成为影响慢性乙型肝炎疾病转归的主要因素之一，本文将对 HBV基因型地域特征、临床意义、致病性及抗病毒疗效等方面进行阐述和分析。

内蒙古炭疽芽胞杆菌多位点串联重复序列分型分析

炭疽芽胞杆菌是引起人和动物炭疽的病原菌,牛、羊等食草动物为主要传染源,人类主要通过接触炭疽病畜毛皮和食肉而感染,也可以通过吸入含有炭疽芽孢的粉尘或气溶胶而感染.我国炭疽自然疫源地分布广泛,炭疽病例时有发生.内蒙古地区是主要的炭疽自然疫源地,每年都有病例发生.炭疽杆菌是一种相对保守的细菌,很多基因分型方法都不能对其分型,Keim等[1]首次将MLVA8方法用于炭疽芽抱杆菌基因分子分型中,其选择6个染色体上VNTR多态性位点和2个质粒上VNTR多态性位点联合建立了MLVA8分析方法,是比较有效的区别不同炭疽芽胞杆菌的方法.