植物系统学研究中常用基因分子标记特点分析

阐述了目前常用于植物系统学和进化研究的一些常用的 DNA分子标记技术 ,分析了各自的使用范围和应用特点 ,提出在使用这些分子标记来研究分子系统学时必须注意的问题。

利用基因组SSR分子标记对老芒麦品种(种质)鉴别和品种纯度鉴定

利用从老芒麦（Elymus sibiricus）自身基因组中开发出来的6对多态性SSR引物,对3个老芒麦牧草品种和7个种质进行分子指纹图谱鉴别研究.结果表明：6对SSR引物在这10个材料中共检测出21个多态性SSR标记片段,每对引物可以检测到2～5个数目不等的片段,平均为3.5个.6对引物中3对核心引物组合可以将这10个材料进行有效鉴别.进一步选用3对引物对2个老芒麦品种进行纯度鉴定,表明SSR标记可以对品种群体中具有变异位点的个体进行有效鉴定,同时揭示野生栽培品种‘同德’老芒麦比育成品种‘多叶’老芒麦具有较高的遗传变异度.

昆虫分子标记基因和序列及应用

本文综述了昆虫分子系统学中应用较广的核糖体DNA (rDNA)、线粒体DNA(mtDNA)、核蛋白编码基因和卫星、微卫星DNA等几类核酸分子标记基因和序列及其研究进展。检疫性害虫的分子检测可选择其中一种或多种分子标记基因。

分子标记基因在动物寄生螨类基因差异研究中的应用

关于寄生在不同宿主体上的同一种螨属于同一个种的不同亚种还是不同的种的问题,学者们至今还未达成一致观点。传统的动物寄生螨虫分类主要依据形态学和宿主的特异性进行,随着现代分子生物学技术的发展,分子标记技术被广泛应用于动物寄生螨虫的分类。

基因特异性分子标记在植物育种中的研究进展

基因特异性分子标记是基于基因序列中功能性单核苷酸多态性(SNP)或插入和缺失(InDels)位点开发而成,具有选择效率高、共显性、与目标基因共分离、不受遗传背景影响等优点,且与生物表型性状高度相关,在生物表型性状的鉴定中更突显出其准确性和直接性,可以准确地跟踪、定位不同遗传背景下的目标等位基因,是农作物分子标记辅助选择育种中理想的分子标记类型。对基因特异性分子标记的原理、开发及在植物育种的应用进行论述,并探讨了基因特异性分子标记的发展趋势,以期为分子标记辅助育种提供参考依据。

分子标记技术的两种新分类思路及目标分子标记技术的提出

简述了应用广泛的几种常用分子标记技术RFLP、RAPD、SSR、ISSR、AFLP的优缺点,以及对这些分子标记技术的常用分类方法,提出了分子标记技术的两种新分类思路,第一种思路完善了以技术原理分类的方法,把基因芯片技术归于同时基于分子杂交和PCR的第三类分子标记技术,第二种思路根据标记的基因组来源分为随机分子标记、目标分子标记、目的基因分子标记和功能性分子标记四大类,结合有关文献对这四大分子标记技术类型进行了各自的概念界定,着重介绍了目标分子标记技术产生的理论与技术背景,并列出了目标分子标记技术的代表种类及相关信息,认为开发目的基因分子标记和功能性分子标记将是分子标记技术的发展趋势。

利用基因示踪分子标记对水稻淀粉合成基因进行功能分析

细粒粘连淀粉合成酶、淀粉分支酶1和淀粉分支酶3是关系到水稻胚乳中淀粉生物合成的3种主要酶。为了鉴定籼稻品种93-11和粳稻品种日本晴基因组数据库中的同源区域，已经使用了编码相应淀粉分支酶1和淀粉分支酶3的Sbe1、Sbe3基因的通用序列。使用序列多样性来开发出基因示踪标记，以便区分这两个位点Sbe1和Sbe3中的籼稻等位基因和粳稻等位基因。

基于抑制消减杂交开发长穗偃麦草(Lophopyrum elongatum)特异分子标记

分别以二倍体长穗偃麦草和普通小麦中国春的基因组DNA作实验组和对照组,运用抑制消减杂交(SSH)技术去除2个基因组DNA之间的同源序列,获得长穗偃麦草特异的DNA片段构建的单向抑制消减文库,并对随机克隆测序。根据测序结果设计引物,获得36个长穗偃麦草基因组特异分子标记,成功率高达69.2%。这些标记均能在具有长穗偃麦草E染色体的不同小麦背景和不同世代中稳定表现,可用于小麦背景中跟踪长穗偃麦草染色体或片段。

水稻胚乳突变体的诱发及其微卫星分子标记鉴定

用 3 50Gy6 0 Coγ射线辐照高表观直链淀粉含量 (apparentamylosecontent,AAC)早籼稻新品种金早 97 47,筛选鉴定出 4个暗胚乳突变体和 2个云雾状胚乳突变体。AAC测定表明 ,暗胚乳和云雾状胚乳突变的AAC明显比原亲本低。以Wxup2 485为引物 ,发现两类胚乳突变的Wx基因微卫星分子标记相同 ,与原亲本显著不同 ,前者为 (CT) 1 8 (CT) 1 8,后者为 (CT) 1 1 (CT) 1 1。

杂交粳稻亲本米质性状配合力的分子标记区段检测

选用152个SSR引物扩增11个粳稻细胞质雄性不育系和9个粳稻恢复系的分子标记基因型,并按NCⅡ遗传设计配制99个F1组合,检测20个亲本中有关糙米率、精米率、整精米率、垩白粒率、垩白度、碱消值、胶稠度和直链淀粉含量8个米质性状的一般配合力的分子标记区段。结果发现27个分子标记区段与亲本8个米质性状一般配合力显著相关,共包含49个分子标记区段基因型。其中,31个SSR分子标记区段基因型与亲本8个米质性状优异一般配合力显著相关,涉及14条染色体臂;18个SSR分子标记区段与亲本8个米质性状不良一般配合力显著相关。49个分子标记区段基因型中,有2个分子标记区段基因型与亲本4个米质性状一般配合力共相关;2个分子标记区段基因型分别与亲本3个米质性状一般配合力共相关,8个分子标记区段基因型分别与亲本2个米质性状一般配合力共相关。第7染色体长臂上的分子标记区段基因型RM542-80/105与碱消值相关,增效37.0%;第1染色体短臂上的分子标记区段基因型RM246-95/105与直链淀粉含量有关,减效23.8%;第8染色体长臂上的分子标记区段基因型RM3754-80/90可使F1糙米率、精米率、整精米率和碱消值分别增加1.1%、2.0%、2.4%和43.6%。这些分子标记区段基因型可直接用于改良杂交粳稻亲本米质性状一般配合力。

新型分子标记的开发和利用

比较遗传分析中常用的随机DNA分子标记、目的基因标记、功能性分子标记。综述了近年开发的几种分子标记,并对新型分子标记(功能性分子标记)进行阐述,如何利用Tilling技术和关联分析的方法开发功能性分子标记,并介绍了功能性分子标记的优点和利用前景。

甜瓜基因组学研究进展

甜瓜是一种世界性的园艺作物。随着现代生物技术的迅速发展,甜瓜基因组学研究越来越深入,国际葫芦科基因组计划也已经筹备完成即将启动。目前已构建有14张甜瓜遗传图谱,多个重要性状的分子标记及数量性状位点已找到并定位在图中,并开始在葫芦科作物之间进行比较基因组图谱方面的研究。已克隆出枯萎病抗性基因Fom-2,其它农艺性状基因的克隆工作也在陆续开展。本文在甜瓜遗传连锁图谱的构建、重要性状分子标记及QTL定位、比较基因组学及基因克隆等方面分别对其研究进展进行了探讨,以期为我国的甜瓜基因组学研究提供有益的参考。

太湖地区水稻地方品种资源品质基因及性状的遗传评价

研究水稻地方品种基因多样性可为优质种质资源的保护和选育新的品种提供理论依据。以太湖地区511份水稻地方品种为供试材料,选用19个与淀粉合成相关的基因内分子标记对其淀粉品质基因进行检测,并与86份育成品种作比较。结果发现:地方品种粳稻的平均多态信息含量(PIC)为0.172 6,稍高于育成品种粳稻的平均PIC值0.110 1。基于各材料间的Nei氏遗传距离,按照UPGMA方法进行聚类,所有研究材料被分为6个类群。第Ⅰ类群主要是籼稻,育成品种粳稻主要集中在第Ⅱ类群和第Ⅲ类群的上半段,地方品种粳稻主要集中在第Ⅲ类群下半段、第Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ类群,二者分布在不同的区域,已出现遗传分化。分别依据国家优质米的标准,有众多太湖地区水稻地方品种属于品质性状比较优良的优质稻谷,这些品种可用于今后的品质育种。

苹果与梨远缘杂交种甘金和甘红果实品质特性评价及分子水平鉴定

【目的】对苹果与梨远缘杂交的优良品种甘金和优系甘红进行果实品质特性评价,并用特异性分子标记鉴定杂交种的真实性,为后期真杂种在抗逆育种研究领域应用提供理论支撑。【方法】对甘金和甘红树体的生长势和果实经济性状进行评价,将苹果金冠和西洋梨巴梨的基因组进行比对,分别筛选苹果和梨中特有的序列,通过设计属间特异性引物对甘金、甘红和亲本的DNA进行扩增。【结果】甘金和甘红树势生长健壮、抗逆性强和果实品质优。特异性引物M1、M2和M3在母本苹果品种中扩增出条带;P1、P2、P3这3对引物只能在父本梨品种中扩增出条带;2对通用引物U1和U2在苹果和梨杂交种中均能扩增出条带。此外,苹果M1、M2、M3和梨P1、P2、P3对杂交后代甘红、甘金进行扩增时,均出现条带,说明杂交后代既有苹果的基因,又有梨的基因。【结论】采用基因特异性分子标记开发的梨和苹果属间的特异性引物,鉴定远缘杂种的真实性,为苹果和梨以及其他果树的属间远缘杂交种的鉴定提供有价值的参考。

分子影像学

分子影像学是在分子水平,对活体特征和生物进程成像。相对于经典的影像诊断学,它偏重于疾病的基础变化、基因分子水平的异常,而不是基因分子改变的最终效应。分子信号成像技术是一个全新领域,放射学家在其中担任重要的任务。本文主要介绍分子医学及分子影像学的最新进展来评估靶分子。将来,通过加深对疾病本质的理解,靶分子成像技术将广泛用于疾病的早期诊断及早期疗效的评估。

课题名称：秦川牛肉质性状相关功能基因鉴定

课题内容、目标：以性状优良的秦川牛为研究对象，应用RAPD标记分析和微卫星标记分析，确定与秦川牛产肉性能和肉质性状相关的基因分子标记，以应用于肉牛产肉性状和肉质性状的分子辅助选择，提高肉牛育种的效率。

抗稻瘟病Pid3/Pid3-A4基因特异InDel分子标记开发与应用

为更加高效利用抗稻瘟病基因Pid3/Pid3-A4,通过分析3K水稻测序数据中Pid3基因等位变异,设计了Pid3和Pid3-A4基因特异InDel分子标记Pdg-C与PA4-C,利用这2个标记对中国杂交水稻常用亲本材料或品种以及美国水稻微核心种质资源进行检测.结果 显示,Pdg-C和PA4-C能够分别快速、准确、经济地区分Pid3和Pid3-A4基因;通过克隆测序、表达分析及接菌鉴定,明确了水稻品种华占携带Pid3基因,栽培稻311100携带Pid3-A4基因,它们作为抗病基因供体更便于在水稻育种中利用.

高产优质节水小麦新品种—中麦1062

中麦1062是中国农业科学院作物科学研究所于2004年以豫麦34为母本，与轮选987做父本进行杂交，再用轮选987回交2次，并结合优质基因分子标记进行辅助选择育成的高产优质节水广适性小麦新品种，2016年1月通过北部冬麦区国家审定，编号为国审麦2016028。

分子标记在牡丹遗传多样性分析与品种鉴定中的应用

分子标记技术的实用性越来越受到人们的重视,在牡丹种质资源遗传多样性分析和品种鉴定等研究方面,TRAP、SRAP、SCoT、EST-SSR和CDDP等新型目的基因分子标记方法的应用为以RAPD、AFLP、ISSR、SSR等传统随机DNA分子标记的研究成果提供了强有力的补充。此文分别对随机DNA分子标记和目的基因分子标记技术在牡丹遗传多样性及品种鉴定中的应用现状作了综述,指出了目前相关研究中存在的主要问题及其解决措施与方法,以期为牡丹种质资源的整理、亲缘关系的分析和品种鉴定工作提供研究基础和科学依据。

单核苷酸多态性与高脂血症

单核苷酸多态性 (SNPs)是新一代的基因分子标记 ,随着人类基因组图谱的绘制成功 ,SNPs被应用于寻找各种致病基因。本文简要介绍了SNPs以及其应用前景和识别与检测的方法 ,并介绍了其与高脂血症的关系。