不同时期H_5N_1病毒的HA和NA基因进化树及基因变异率线性回归分析

利用Genbank上从1996-2007年的所有的H5N1禽流感病毒的HA基因和NA基因进行进化树分析,基因变异率线性回归分析表明1996-2000年的HA基因和NA基因的变异率要明显低于2000-2007年间的变异率,其原因也许与2000-2007年间东南亚各国大量使用疫苗有关。

环境因子对大石鸡种群遗传结构的影响

大石鸡是我国特有种 ,仅分布于青海东部 ,甘肃中部 ,宁夏六盘山以西 ,是我国北方干旱和半干旱荒漠环境指示鸟类。研究其遗传多样性与环境变化的关系 ,不仅是生态遗传学的前沿领域 ,而且在进化生物学和保护生物学领域都有重要的理论意义。采用聚合酶链式反应 ( PCR)和直接测序的方法 ,测定了甘肃境内由北向南的 5个大石鸡 ( Alectorismagna)种群 (兰州、榆中、定西、武山和礼县 )的线粒体 DNA( mt DNA)控制区 ( D-loop) 4 5 7～ 4 5 8个碱基长度的基因序列。结果表明兰州、榆中、定西、武山和礼县种群的平均碱基含量中 A( F=0 .30 <F0 .0 5( 4 ,32 ) =2 .6 7)、G( F =0 .77<F0 .0 5( 4 ,32 ) =2 .6 7)差异不显著 ,但 C( F=7.1 7>F0 .0 1( 4 ,32 ) =3.97)、T( F=6 .4 4>F0 .0 1( 4 ,32 ) =3.97)差异极显著。 5个种群的基因变异率分别为 0 .32± 0 .2 7%、0 .4 8± 0 .4 5 %、0 .6 2± 0 .4 3%、0 .4 4± 0 .2 4 %、0 .1 7± 0 .1 4 % ,种群内的平均基因变异率为 0 .4 1± 0 .1 7% ,种群间的平均基因变异率为 0 .4 6± 0 .1 0 % ,种群内和种群间的平均基因变异率差异不明显( F=2 .5 9<F0 .0 5( 1 ,4 70 ) =3.86 )。大石鸡种群的平均基因变异率与年平均气温 ( r=-0 .81 1 8,P>0 .0 5 )和无霜期 ( r=-0 .81