8个猪种ESR和FSHβ基因合并基因型与繁殖性状关系的研究

采用测序和PCR-SSCP方法,对莱芜猪、鲁莱黑猪、里岔黑猪、鲁烟白猪、新沂蒙黑猪5个山东地方/培育猪种和大约克夏、长白、杜洛克3个引进猪种共8个猪种323头繁殖母猪进行ESR和FSHβ基因的多态性分析,并采用最小二乘法分析了这2个基因座的合并基因型对繁殖性状的影响。结果表明:2个基因位点在8个猪种的测定群体中均存在多态性,但山东地方/培育猪种与引进猪种间在合并基因型频率上存在较大差异。遗传效应分析表明,合并基因型对初产和经产胎次的产仔数影响显著(P<0.05),优势合并基因型BBBB的母猪比AAAA合并基因型母猪的初产总产仔数和活产仔数分别多2.54和2.65头/胎,经产总产仔数和活产仔数分别多2.29和2.35头/胎,并且合并基因型对产仔性状的遗传效应并非各基因型效应的简单相加。

猪ESR、FSH-β和PRLR基因合并基因型对产仔数的影响

统计了辽宁省3个引进猪种:长白、大白和杜洛克的产仔数记录,并采用PCR-RFLP方法检测3个猪种ESR、FSH-β和PRLR基因的多态性,分析3个基因的单基因及合并基因型对产仔数的影响。结果表明,ESR、FSH-β和PRLR基因都存在AA、AB和BB3种基因型,在各猪群内基因型分布差异不显著(P>0.05),各基因均处于遗传平衡状态。单基因分析表明,ESR和FSH-β基因型产仔数的最小二乘均值具有按AA、AB、BB递增的趋势,BB型为优良基因型,而PRLR基因的优良基因型为AA型。ESR、FSH-β和PRLR基因的合并分析表明BBBBAA为最优合并基因型,合并后效应显著(P<0.05)或极显著(P<0.01),且合并基因型的遗传效应高于单基因型效应。因此,可以利用合并基因型对猪的产仔数进行标记辅助选择。

奥希替尼联合培美曲塞/铂类对表皮生长因子受体合并TP53基因突变的非小细胞肺癌疗效及预后分析

目的探究奥希替尼联合培美曲塞/铂类对EGFR合并TP53突变的非小细胞肺癌(NSCLC)疗效及预后分析。方法选取中国人民解放军联勤保障部队第904医院在2016年1月至2022年6月间诊治的80例表皮生长因子受体合并TP53基因突变的NSCLC患者纳入本次研究,随机数字法分为对照组(40例)和研究组(40例)。对照组行奥希替尼治疗,研究组行奥希替尼联合培美曲塞/铂类化疗治疗。对两组临床疗效、血清指标水平、用药安全性以及预后进行对比分析。结果研究组总缓解率(ORR)和疾病控制率(DCR)均优于对照组(P<0.05)。治疗后,两组细胞角蛋白19片段(CYFRA21-1)、癌胚抗原(CEA)水平均低于治疗前(P<0.05),研究组低于对照组(P<0.05)。治疗后,两组白细胞介素4(IL-4)、血管内皮生长因子(VEGF)、细胞间黏附分子-1(ICAM-1)水平均低于治疗前(P<0.05),研究组低于对照组(P<0.05)。两组不良反应差异无统计学意义(P>0.05)。研究组随访1年后的生存率明显高于对照组(P<0.05)。治疗后,两组生存质量测定表(EORTC QLQ-C30)评分高于治疗前(P<0.05),研究组高于对照组(P<0.05)。结论奥希替尼联合培美曲塞/铂类化疗方案用于EGFR合并TP53基因突变的NSCLC的临床治疗,可有效发挥抗肿瘤效果,下调炎症水平,提升疗效,改善患者预后,且用药具有较高安全性,不会明显增加不良反应。

青海高原型牦牛GHR基因多态性与生长发育的关联性

【目的】探索青海高原型牦牛(Bos grunniens)生长激素受体(growth hormone receptor)基因GHR多态性及其与生长性状的关联性。【方法】以440头同等放牧条件下的30~36月龄健康牦牛为试验群体,PCR扩增其GHR基因,测序后用DNASTAR 7.1软件分析单核苷酸多态性(SNP)位点,研究不同基因型及其合并基因型与生长发育指标(体质量、体高、体斜长、胸围和管围)的关联性。【结果】青海高原型牦牛GHR基因上存在g.732091C>G、g.732195A>G和g.732373G>A 3个SNP位点,其中g.732195A>G上存在2种基因型(AA,AG),g.732091C>G和g.732373G>A上各存在3种基因型(分别为CC、CG、GG和GA、AA、GG);卡方检验表明,g.732091C>G、g.732195A>G和g.732373G>A均处于Hardy-Weinberg极度不平衡状态,且g.732195A>G为低度多态(PIC<0.25),g.732091C>G和g.732373G>A为中度多态(0.25<PIC<0.50)。与生长性状的关联性分析发现,g.732091C>G、g.732195A>G和g.732373G>A能够显著或极显著影响高原型牦牛的体质量和胸围,优势基因型分别为g.732091C>G和g.732373G>A的GG以及g.732195A>G的AA。对合并基因型分析发现,合并基因型GG-AA-GG个体的生长发育尤其是体斜长表现最佳。【结论】青海高原型牦牛GHR基因有3个SNP位点,因其与青海高原型牦牛的部分生长性状相关,可作为牦牛分子标记辅助选择的候选基因。

GH和CRBP4基因及合并基因型对仙居鸡产蛋数的遗传效应

以GH和CRBP4基因作为影响鸡繁殖性状的候选基因,采用PCR-SSCP方法检测仙居鸡GH基因外显子4和CRBP4基因外显子3区域的单核苷酸多态性,并分析GH、CRBP4单基因型及2个基因合并基因型与65周龄产蛋数的关联。结果表明:GH基因exon4(C2338G/C2341T)的突变和CRBP4基因exon2的突变(C826T)基因型CC型与该鸡品种的65周龄产蛋数显著相关(P<0.05),AA、CC型对产蛋数的加性效应分别为3.56、3.60;合并基因型AACC型个体65周龄产蛋数与对照组相比差异显著(P<0.05);2个基因间的互作效应不显著(P>0.05)。

MC4R和PROP1基因多态性及合并基因型与中国美利奴羊生长性状的关联分析

为了探讨MC4R和PROP1基因作为绵羊生长性状候选基因的可能性,寻找与绵羊生长性状相关的分子标记。本研究采用PCR-SSCP方法检测中国美利奴羊和德国美利奴羊MC4R和PROP1基因的多态性,分析了多态位点不同基因型及合并基因型与中国美利奴羊生长性状的关联性。结果表明:MC4R基因MC4R-3位点存在G894C突变,MC4R-4位点3′侧翼区存在A1223G、G1229A和T1307G3个突变位点;PROP1基因在外显子3上存在A2660G突变,导致Thr181Ala改变。关联分析表明,在中国美利奴羊群体中,MC4R-4位点不同基因型个体体斜长和腰角宽差异显著(P<0.05),优良基因型为BB;PROP1基因不同基因型个体尻宽和胸围差异显著(P<0.05),优良基因型为BB;PROP1-MC4R-4优良基因型聚合体BB-BB个体体斜长高于其它合并基因型个体(P<0.05)。结果提示绵羊MC4R和PROP1基因单核苷酸多态性及合并基因型对中国美利奴羊生长性状有一定的影响,可以作为进行绵羊生长性状分子标记辅助选择的候选基因。

SIRT1和SIRT2基因多态性及合并基因型与秦川牛肉用性状的关联分析

旨在探讨SIRT1和SIRT2基因的多态性与秦川牛肉用性状的关系,寻找与秦川牛肉用性状相关的分子标记。本研究利用DNA测序和PCR-PFLP方法检测秦川牛SIRT1和SIRT2基因的多态位点并对其进行基因分型,同时分析了单个多态位点不同基因型及合并基因型与秦川牛肉用性状的关联性。结果发现,在SIRT1基因3′侧翼区检测到两个多态位点(G25764A和A25846G),同样在SIRT2基因3′侧翼区也检测到两个突变位点(C19501T和C19518T)。关联性分析表明,在本试验所选取的505头秦川牛样本中,G25764A位点上AA基因型个体的眼肌面积极显著高于AB基因型(P<0.01);A25846G位点上AA基因型个体的眼肌面积与AB和BB两组基因型分别存在显著性差异(P<0.05)和极显著性差异(P<0.01);C19501T位点的不同基因型对眼肌面积和肌间脂肪影响显著(P<0.05),优良基因型为AA;C19518T的BB基因型个体背膘厚显著高于AA基因型(P<0.05)。通过合并基因型发现,AB-BB-AA-BB的各个肉用性状表现最优(P<0.01或P<0.05)。以上结果提示,SIRT1和SIRT2基因单核苷酸多态性及合并基因型对秦川牛肉用性状有一定的影响,可以作为进行秦川牛肉用性状分子标记辅助选择的候选基因。

猪雌激素受体、卵泡刺激素-β、催乳素受体和视黄醇结合蛋白4基因合并基因型对产仔数的影响

目的探讨猪雌激素受体(estrogenreceptor,ESR)、卵泡刺激素-β(folliclestimulatinghormonebetasubunit,FSH-β)、催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)和视黄醇结合蛋白4(retinol-binding proteins 4,RBP4)基因合并基因型对产仔数的影响。方法采用PCR法从来自沈阳地区9个种猪场的大白猪、长白猪、杜洛克猪扩增ESR、FSH-β、PRLR、RBP4基因,PCR-RFLP法检测各基因的多态性,分析4种基因的单基因及合并基因型对产仔数的影响。结果 ESR、FSH-β、PRLR和RBP4基因均存在AA、AB和BB 3种基因型,各基因均处于遗传平衡状态。4种基因的单基因分析表明,长白猪、大白猪FSH-β基因的总产仔数差异有统计学意义(P<0.05),BB型为优良基因型;其他3种基因的产仔数差异无统计学意义(P>0.05),ESR基因的优良基因型为AA型,PRLR基因的优良基因型为BB型,RBP4基因的优良基因型为AB型。4种基因的合并分析表明,AABBBBAB为最优合并基因型。结论合并基因型的遗传效应显著高于单基因的遗传效应,可利用合并基因型对猪的产仔数进行标记辅助选择。

辽宁省3个引进猪种ESR和FSH-β基因合并基因型对繁殖性状的影响

本研究以辽宁省3个引进猪种长白、大白和杜洛克为实验材料,采用PCR-RFLP方法检测ESR和FSH-β基因的多态性,分析这2个基因的单基因与合并基因型对繁殖性状的影响。结果表明:ESR和FSH-β基因都存在AA、AB和BB 3种基因型,在各猪群内基因型分布差异不显著(P>0.05),两基因均处于遗传平衡状态;单基因分析表明大部分繁殖性状的最小二乘均值具有按基因型AA、AB、BB递增的趋势,ESR和FSH-β基因的优良基因型为BB型;ESR与FSH-β的合并分析表明BBBB为最优合并基因型,合并后效应显著(P<0.05),且合并基因型的遗传效应高于单基因型效应。因此,可以利用合并基因型对猪的繁殖性状进行标记辅助选择。

猪繁殖性状主效基因及其合并基因型对产活仔数的影响

研究分析了大白、长白和杜洛克3个品种ESR和FSH-β基因的多态性及单基因、多基因合并与产活仔数的关系。结果表明:ESR和FSH-β基因在3个品种中均检测到AA、AB和BB 3种基因型,且A基因为优势基因型。ESR和FSH-β基因在3个品种中,产活仔数具有按照基因型AA、AB、BB递增的趋势,BB型个体产活仔数显著高于AA和AB型(P<0.05),BB型为优良基因型。合并基因型在3个品种中,BBBB型产活仔数均显著高于其他合并基因型(P<0.05),为最优合并基因型,AAAA为最劣合并基因性;合并基因型效应显著(P<0.05),且高于单基因效应。因此,可以将这2个基因通过分子标记辅助选择或分子标记辅助选配的方法应用到猪的生产实践中,以提高猪的产仔数。

基于片段合并的胚胎电子细胞基因压缩方法

针对胚胎电子细胞中基因存储硬件消耗较大的问题,提出了一种基于基因片段合并的胚胎电子细胞基因压缩编码方法。在编码过程中,把问题转化为图着色问题,采用遗传算法对基因中的填充位(X位)进行兼容赋值,从而把基因片段合并为基本兼容基因片段,实现基因压缩。利用概率论的知识对采用基因压缩方法实现基因存储的新型胚胎电子细胞结构的硬件消耗进行了理论分析。以实际电路作为目标电路进行仿真,结果表明,上述方法能有效地降低基因存储的硬件消耗。

藏猪繁殖性状多基因效应分析

藏猪是我国特有的高原型地方猪种,具有适应高海拔恶劣气候环境、抗病、耐粗、肉质鲜美等特点,但繁殖力低。文章以促卵泡素β亚基(FSHβ)、雌激素受体(ESR)、促乳素受体(PRLR)和视黄醛结合蛋白4(RBP4)等基因作为繁殖性状主要候选基因,测定76头藏猪的基因型,分析单基因和多基因合并对繁殖性状的影响效应。结果说明,在藏猪群体中,FSHβ、ESR和PRLR基因不同基因型繁殖性状差异显著,优良基因型分别为BB、BB和AA。藏猪RBP4基因只有2种基因型,对繁殖性状影响不显著。FSHβ-ESR-PRLR基因的合并优良基因型为BB-BB-AA,多基因聚合效应高于单基因效应。

ESR与PRLR基因对民猪产仔数的影响

采用PCR -SSCP ,检测ESR与PRLR基因的多态性 ,并采用混合模型统计了基因型与表型值 (产仔数 )的相关性 ,分析了民猪ESR与PRLR基因各基因型及其合并基因型对民猪产仔数性状的影响。结果表明 :就民猪总产仔数、活产仔数的最小二乘均值而言 :ESR基因基因型间 ,AB型较AA和BB高 ,差异不显著 (P >0 .0 5 ) ;PRLR基因基因型间 ,AA >BB >AB ,差异也不显著 (P >0 .0 5 ) ;两基因的互作效应显著 (P <0 .0 5 ) ,其中ESR与PRLR基因的合并基因型AAAA为最佳的合并基因型 (P <0 .0 5 )。

大白猪NCOA1和FUT1基因多态性与繁殖性能的关联分析

本研究利用PCR-RFLP技术检测685头大白母猪NCOA1和FUT1基因多态性并对其分型,同时分析了单个基因型以及合并基因型与母猪繁殖性能的关联性。结果表明:2个基因都检测到了3种基因型;经产母猪NCOA1基因中AB型个体的总产仔数、总活仔数、死胎显著高于AA型个体(P<0.05);经产母猪FUT1基因中AA型个体的总产仔数、总活仔数、健仔数以及初生窝重显著高于AG型和GG型个体(P<0.05);经产母猪合并基因AAAA型和ABAG型个体的总产仔数、总活仔数、健仔数显著高于AAAG型个体(P<0.05),ABAG型个体的死胎显著高于AAAG型个体(P<0.05),AAAA型个体的初生窝重显著高于AAAG和AAGG型个体(P<0.05)。由此可见,NCOA1和FUT1单基因型以及合并基因型对繁殖性能具有一定的影响,可以用其作为遗传标记辅助选择。

秦川牛GH基因第5外显子的多态性及其与体尺性状的关联性

【目的】研究秦川牛生长激素基因第2外显子的多态性,及其与部分体尺性状指标的相关性。【方法】以502头2周岁左右秦川牛为研究对象,利用PCR-RFLP技术检测生长激素基因上存在的单核苷酸多态性(SNPs),并分析其与秦川牛体尺性状的关联性。【结果】在GH基因第5外显子中发现了2处SNPs,分别为错义突变和同义突变。位点1经AluⅠ酶切后产生AA、AB和BB 3种基因型,A、B等位基因频率分别为0.825 7和0.174 3;卡方检测显示,该位点在所检测秦川牛群体中处于Hardy-Weinbery不平衡状态;关联分析表明,该位点不同基因型个体之间在体高、胸围、体斜长和尻长上差异显著。位点2经AflⅡ酶切后产生CC和CD 2种基因型,C和D等位基因的频率分别为0.902 4和0.097 6;卡方检测显示,该位点在所检测秦川牛群体中处于Hardy-Weinbery不平衡状态;关联分析表明,该位点不同基因型个体间在腰角宽、坐骨端宽和尻长上差异显著。第5外显子2个位点合并基因型分析结果表明,双杂合基因型个体各体尺性状均显著高于其他基因型组合,并且多标记位点的组合效应高于单标记位点。【结论】组合ABCD各体尺性状数值均高于AB和CD基因型,组合ABCD可能是影响牛体尺性状的最佳基因型组合。

鸽黑素皮质素受体3、4(MC3R、MC4R)基因多态性与生长性状的相关分析

利用PCR-SSCP技术和DNA测序方法检测广东石岐肉鸽和哈尔滨地区灰色家鸽MC3R和MC4R基因部分编码区序列的单核苷酸多态性,分析了MC3R基因T91G突变位点和MC4R基因A903G突变位点导致的基因型与两群体鸽生长和体组成性状的关系。结果表明,这两个多态位点所导致的基因型对石岐肉鸽活重、屠体重、全净膛重均有显著影响(P<0.05);另外,利用这两个突变位点所产生的合并基因型在鸽群体中与生长和体组成性状作最小二乘分析,结果表明,两位点合并后的基因型对全净膛重影响显著(P<0.05)。多重比较结果表明,BBAA型全净膛重显著大于AABB型,BBAA型对于体重增长是有利基因型。

秦川牛IRS-1基因多态性与体尺和肉质性状的相关性

旨在研究秦川牛IRS-1基因外显子的多态性,及其与秦川牛体尺和肉质性状的相关性。选取384头同等饲养条件下的18～24月龄健康秦川牛母牛为研究对象,采用PCR-SSCP技术结合DNA测序技术检测IRS-1基因外显子上存在的SNPs位点,并将其与秦川牛体尺和肉质性状进行关联分析。经DNA测序发现,在IRS-1基因外显子的2 346(B1位点)和2 394bp处(B2位点)分别发生了G→A和C→G突变,经分析发现,分别为氨基酸序列第782处Glu和798处Leu的同义突变。通过SSCP带型分析分别出现CC、CD和AA、AB 2种基因型,均未检测出第3种纯合基因型;卡方检验显示,B1位点在所检测牛群中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而B2位点则处于Hardy-Weinberg极度不平衡状态(P<0.01);且B1处CC基因型为优势基因型,C为优势等位基因,处于低度多态状态;B2处基因型AA为优势基因型,A为优势等位基因,处于低度多态状态;关联分析表明,B1位点不同基因型个体间在体斜长、腰角宽、胸围和眼肌面积方面差异显著(P<0.05),B2位点在腰角宽、胸深和背膘厚方面差异显著(P<0.05)。将2个突变位点合并基因型进行单倍型分析发现,双杂合基因型个体(ABCD)除背膘厚和肌间脂肪含量外其他所分析的各性状均显著高于其他基因型组合,且多标记位点的组合效应值高于单标记位点。结果提示,IRS-1基因对秦川牛体尺及部分肉质性状有显著的影响,可以作为秦川肉牛新品系培育早期选择的候选基因,其中组合ABCD可能是影响秦川牛体尺和胴体性状的最佳基因型组合。

鸡AIRC基因多态性及其对肌肉肌苷酸含量的遗传效应分析

以鸡AIRC基因为侯选基因,以丝羽乌骨鸡、萧山鸡、白耳鸡、藏鸡、隐性白羽鸡为试验材料,采用PCR-SS-CP方法对AIRC基因所有外显子及部分内含子区域进行SNPs检测,在外显子3和8中各发现1个单核苷酸多态位点。各种基因型与胸肌肌苷酸(IMP)含量的方差分析结果表明,外显子3中CC基因型个体的肌肉IMP含量显著高于TC和TT基因型个体,TC基因型个体也稍高于TT型,但差异不显著;外显子8中CG基因型个体的肌肉IMP含量显著高于GG和CC基因型个体,GG基因型个体的胸肌肌苷酸含量也显著高于CC型。外显子3和8的合并基因型对IMP含量也有显著的影响,合并基因型为CCCG的个体比TTCC合并基因型的个体高2.25mg.g-1,合并基因型的遗传效应大于最优秀的单个基因型效应。因此,可以利用该合并基因型对鸡的肉质风味性状进行标记辅助选择。

长白猪雌激素受体和卵泡刺激素β基因多态性对繁殖性能的影响

本研究以84头长白猪为试验材料,采用PCR-RFLP方法检测雌激素受体(estrogen receptor,ESR)和卵泡刺激素β(follicle-stimulating hormoneβ,FSHβ)基因的多态性,并进一步分析这2个基因多态位点及其合并基因型对繁殖性能的影响。结果表明,ESR和FSHβ基因均存在AA、AB和BB 3种基因型,2基因座均处于Hardy-Weinberg平衡状态;单基因效应分析结果表明,ESR基因AB基因型个体部分繁殖性能指标显著高于AA基因型,AB基因型为ESR基因的有利基因型。初产母猪FSHβ基因中BB、AA、AB基因型个体的所有繁殖性能指标均呈递增趋势,而经产母猪中AA基因型个体的性能指标较高,但是差异不显著(P>0.05);ESR与FSHβ的合并效应分析结果表明,基因聚合效应并不是各个基因效应的简单相加,在繁殖性能已经稳定的第3胎次,AA-AB型个体的繁殖性能显著低于其他合并基因型个体,表明该基因型为不利的合并基因型,故在长白猪选种选育过程中应优先考虑被淘汰。

NCOA1和RBP4基因多态性与大白猪繁殖性能的关联分析

目的为了研究NCOA 1和RBP 4基因的多态性对母猪繁殖性能的影响。方法本试验利用PCR-RFLP技术检测试验猪群NCOA 1和RBP 4基因的多态性,并采用最小二乘法对基因多态性与总仔数、活仔数、健仔数、木乃伊数、死胎数等繁殖性状,分别进行单独基因型分析和合并基因型分析。结果对于NCOA 1基因,初产和经产母猪的总产仔数、总活仔数、健仔数和初生窝重都为AB型>AA型,但仅在经产母猪中总产仔数、活仔数差异达到显著水平(P<0.05);对于RBP 4基因,经产母猪的总产仔数、健仔数、初生窝重均表现为AA型>BB型>AB型,且AA型个体的健仔数、初生窝重极显著高于AB型(P<0.01);对于NCOA 1和RBP 4的合并基因型,经产母猪的总产仔数、活仔数、健仔数、死胎数、初生窝重均表现为ABBB型>AAAB型,且ABBB型个体的总产仔数、死胎数极显著高于AAAB型(P<0.01)。结论NCOA 1和RBP 4基因多态性对大白猪的繁殖性能有显著影响,可作为母猪繁殖性能改良的遗传标记。