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人类基因组3pter-p26区域的序列比较分析
1
作者
罗春清
李彦
+10 位作者
张晓伟
张以琳
张海青
陈冲
吴清发
徐祖元
崔鹏
胡松年
王俊
杨焕明
董伟
《中国科学(C辑)》
CSCD
北大核心
2004年第4期376-384,共9页
对人类基因组3号染色体短臂的3pter-p26区域进行了初步分析,序列组装后整个区域全长约为8.1kb,靠近端粒区还存在一个约20∽30kb的空洞.序列比较分析表明:(i)该区域的GC含量为38.5%,为人类基因组所有近端粒区域最低;(ii)共含有4...
对人类基因组3号染色体短臂的3pter-p26区域进行了初步分析,序列组装后整个区域全长约为8.1kb,靠近端粒区还存在一个约20∽30kb的空洞.序列比较分析表明:(i)该区域的GC含量为38.5%,为人类基因组所有近端粒区域最低;(ii)共含有42个基因,平均大小为97.5kb,以前通过基因连锁分析定位于该区域的基因Cntn3存在定位错误,应位于3p12.3;(iii)该区域散在重复序列活跃程度高于全基因组平均水平,其中(TA)n含量是全基因组平均水平的2倍;(iV)该区域在小鼠6号染色体104.1∽112.4Mb的位置有一个保守的同源序列;通过染色体进化分析推断,3pter-p26区域可能于最近的一次染色体重排之后才转移到染色体的末端,其发生时间应在人与小鼠的基因组分离之后,在这次重排过程中,染色体断裂点附近的一些序列,连同所包含的基因发生了丢失,而丢失的基因总拷贝数却在基因组的其他地方得到了增加;(v)3pter-p26区域较低的GC含量可能不利于保持染色体末端的稳定,容易发生DNA丢失,而这又可能是引发基因表达异常导致疾病的原因之一。
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关键词
人类
基因
组
3pter-p26
序列比较分析
染色体
DNA序列
基因含量分布
原文传递
题名
人类基因组3pter-p26区域的序列比较分析
1
作者
罗春清
李彦
张晓伟
张以琳
张海青
陈冲
吴清发
徐祖元
崔鹏
胡松年
王俊
杨焕明
董伟
机构
中国科学院遗传与发育生物学研究所人类基因组中心
中国科学院基因组学研究所暨北京华大基因研究中心
出处
《中国科学(C辑)》
CSCD
北大核心
2004年第4期376-384,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(批准号: 30270726)
文摘
对人类基因组3号染色体短臂的3pter-p26区域进行了初步分析,序列组装后整个区域全长约为8.1kb,靠近端粒区还存在一个约20∽30kb的空洞.序列比较分析表明:(i)该区域的GC含量为38.5%,为人类基因组所有近端粒区域最低;(ii)共含有42个基因,平均大小为97.5kb,以前通过基因连锁分析定位于该区域的基因Cntn3存在定位错误,应位于3p12.3;(iii)该区域散在重复序列活跃程度高于全基因组平均水平,其中(TA)n含量是全基因组平均水平的2倍;(iV)该区域在小鼠6号染色体104.1∽112.4Mb的位置有一个保守的同源序列;通过染色体进化分析推断,3pter-p26区域可能于最近的一次染色体重排之后才转移到染色体的末端,其发生时间应在人与小鼠的基因组分离之后,在这次重排过程中,染色体断裂点附近的一些序列,连同所包含的基因发生了丢失,而丢失的基因总拷贝数却在基因组的其他地方得到了增加;(v)3pter-p26区域较低的GC含量可能不利于保持染色体末端的稳定,容易发生DNA丢失,而这又可能是引发基因表达异常导致疾病的原因之一。
关键词
人类
基因
组
3pter-p26
序列比较分析
染色体
DNA序列
基因含量分布
分类号
Q987 [生物学—遗传学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人类基因组3pter-p26区域的序列比较分析
罗春清
李彦
张晓伟
张以琳
张海青
陈冲
吴清发
徐祖元
崔鹏
胡松年
王俊
杨焕明
董伟
《中国科学(C辑)》
CSCD
北大核心
2004
0
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