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题名基于图形表达的基因序列相似性分析
被引量:1
- 1
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作者
周迎春
骆嘉伟
张惜珍
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机构
湛江师范学院信息科学与技术学院
湖南大学计算机与通信学院
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出处
《科学技术与工程》
2007年第21期5593-5599,共7页
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基金
湖南省自然科学重点基金(06JJ4076)
湖南省财政厅项目基金([2005]90)资助
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文摘
提出一种新的基因序列图形表达方法及特征参数Z_Inv,这种图形表达不仅具有良好的非退化特征,而且充分保留了基因序列的生物学特征。通过实验比较分析,特征参数Z_Inv具有计算简单且比其他不变量更接近于矩阵最大特征值不变量λ。最后将这一图形表达及特征参数应用于基因序列的相似性分析中。实验结果表明,利用图形表达及其特征参数的基因序列形似性分析具有较好的合理性。
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关键词
基因图形表达
矩阵特征值
相似性分析
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Keywords
gene graphic representation matrix eigenvalue similarity analysis
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分类号
TP391.77
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名基于图形表达的基因序列模糊聚类应用研究
- 2
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作者
周迎春
骆嘉伟
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机构
湛江师范学院信息科学与技术学院
湖南大学计算机与通信学院
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出处
《武汉理工大学学报(信息与管理工程版)》
CAS
2009年第1期25-29,共5页
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基金
湖南省自然科学重点基金资助项目(06JJ4076)
湖南省财政厅基金资助项目(200590)
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文摘
给出了一种新的非退化的基因图形三维表达方法,这一表达方法不仅避免了图形的重叠和交叉,同时还保留了序列的生物学特征。利用这种表达方法对H5N1病毒基因序列进行数字特征的提取,并引入基于多维PFS判别函数进行模糊聚类分析应用。在聚类分析过程中直接利用数字特征作为源数据,分析结果表明,利用该图形表达建立基因序列数字特征矩阵进行的聚类分析具有一定的合理性。
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关键词
基因图形表达
聚类分析
伪F统计量
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Keywords
gene graphic representation
clustering analysis
Pseudo F -Statistics
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分类号
TP39
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名基于分层的平衡迭代规约聚类分析算法研究
被引量:1
- 3
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作者
周迎春
骆嘉伟
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机构
湛江师范学院信息科学与技术学院
湖南大学计算机与通信学院
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出处
《科学技术与工程》
2008年第10期2579-2583,2588,共6页
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基金
湖南省自然科学重点基金[06JJ4076]
湖南省财政厅基金[200590]资助
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文摘
详细分析讨论了BIRCH算法中存在的不足,并针对其不足进行一定的改进,提出了一种基于离差平方和的改进多阈值BIRCH算法,充分利用离差平方和来建立簇与簇的相关性,相对于单纯以簇之间的中心距离来建立相关性有一定的改进,同时在分裂因子的确定上采用了簇中直径的最大值,克服因采用经验值确定分裂因子的缺陷。最后,引入到基因序列图形表达数据聚类分析应用中。
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关键词
BIRCH算法
聚类特征
基因图形表达数据
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Keywords
BIRCH algorithm clustering feature data of gene graphical representation
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分类号
TP391.77
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名一种改进的BIRCH聚类分析算法及其应用研究
被引量:6
- 4
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作者
周迎春
骆嘉伟
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机构
湛江师范学院信息科学与技术学院
湖南大学计算机与通信学院
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出处
《湛江师范学院学报》
2009年第3期83-87,共5页
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基金
湖南省自然科学重点基金资助项目(06JJ4076)
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文摘
文中详细分析讨论了BIRCH算法中存在的不足,并针对其不足进行一定的改进,提出了一种基于离差平方和的改进多阈值BIRCH算法,充分利用离差平方和来建立簇与簇的相关性,相对于单纯以簇之间的中心距离来建立相关性有一定的改进,同时在分裂因子的确定上采用了簇中直径的最大值,克服因采用经验值确定分裂因子的缺陷.最后,引入到基因序列图形表达数据聚类分析应用中.
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关键词
BIRCH算法
聚类特征
基因图形表达数据
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Keywords
BIRCH algorithm
clustering feature
data of gene graphical representation
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分类号
TP391.77
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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