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丙型肝炎病毒NS5a区血清型特异性多肽的选择及应用 被引量:1
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作者 窦晓光 韩晓霜 +1 位作者 李智伟 冯国和 《诊断学理论与实践》 2007年第3期213-217,共5页
目的:从HCV非结构5a区(NS5a)选出基因型特异性多肽,并应用酶免疫法(EIA)进行HCV血清分型。方法:根据HCV NS5a高免疫源区(2182~2343)的氨基酸序列,设计并合成305个特异性多肽,应用已知基因1~6型的抗-HCV阳性血清,通过EIA法检测每个多... 目的:从HCV非结构5a区(NS5a)选出基因型特异性多肽,并应用酶免疫法(EIA)进行HCV血清分型。方法:根据HCV NS5a高免疫源区(2182~2343)的氨基酸序列,设计并合成305个特异性多肽,应用已知基因1~6型的抗-HCV阳性血清,通过EIA法检测每个多肽的抗原性,并用基因型特异性多肽进行血清分型,同时将其与序列分析法基因分型结果进行比较。结果:不同基因型间NS5a区氨基酸的同源性较低,相同基因型不同区段氨基酸的同源性也很低。对305个特异性多肽抗原性检测结果表明,主要线性抗原区位于氨基酸残基R3、R7和R9区。18个来自保守区的多肽可与不同基因型抗-HCV阳性血清反应;12个多肽具基因型特异性。血清基因分型结果与基因分型的结果高度一致。结论:HCV NS5a高免疫源区存在主要的线性抗原;来自高度保守区的多肽抗原无基因型特异性,可用于HCV抗体检测;基因型特异性多肽可用于HCV基因分型,特别适用于HCV RNA阴性患者。 展开更多
关键词 合成多肽 基因型特异性 肝炎病毒 非结构5a区
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巢式PCR检测北京地区乙型肝炎病毒基因型的分布 被引量:1
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作者 殷继明 李卓 +3 位作者 刘芳 刘道洁 郝娃 牛京勤 《首都医科大学学报》 CAS 2006年第3期358-360,共3页
目的了解北京地区乙型肝炎病毒(HBV)感染者HBV基因型分布情况。方法从前S1基因到S基因中的保守序列设计出10条内外引物,将其中8条内引物分成A、B组,分别扩增A、B、C、D、E、F型HBV,根据PCR产物片断判定HBV基因型。结果用此种方法检测HB... 目的了解北京地区乙型肝炎病毒(HBV)感染者HBV基因型分布情况。方法从前S1基因到S基因中的保守序列设计出10条内外引物,将其中8条内引物分成A、B组,分别扩增A、B、C、D、E、F型HBV,根据PCR产物片断判定HBV基因型。结果用此种方法检测HBV感染的不同转归类型患者血清728份,对HBV DNA阳性标本进行基因型分析。HBV DNA阳性者276例,其中自限性感染者阳性率为5.8%(14/243),慢性无症状HBV携带者血清HBV阳性率为42.6%(113/265),慢性肝炎患者HBV阳性率为67.7%(149/220)。慢性肝炎组HBV DNA检出率与其他2组比较差异有统计学意义(P<0.05)。在276例HBV DNA阳性标本中,各基因型在不同组分布不同,但差异无统计学意义。HBV基因型总检出率以C型为主,占76.8%,B型占21·7%,同时检出B型和C型为1.5%,未检出A、D、E、F基因型。结论北京地区感染HBV基因型为B型和C型,以C型为主,感染结局不同组间基因型分布比较差异无统计学意义。 展开更多
关键词 肝炎病毒 基因 基因型特异性引物PCR
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2015—2023年河南省信阳市丙型肝炎病毒基因型分布特征
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作者 张秀娟 赵耀 程鹏飞 《现代疾病预防控制》 2024年第8期572-574,594,共4页
目的了解信阳市丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)基因型分布特征,为丙型肝炎(丙肝)临床治疗方案的选择提供依据。方法收集2015—2023年南阳市丙肝临床诊断和确诊病例,筛选丙肝病毒载量(HCV-RNA)≥1.0×10~3IU/mL病例的血清样本... 目的了解信阳市丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)基因型分布特征,为丙型肝炎(丙肝)临床治疗方案的选择提供依据。方法收集2015—2023年南阳市丙肝临床诊断和确诊病例,筛选丙肝病毒载量(HCV-RNA)≥1.0×10~3IU/mL病例的血清样本,进行HCV基因型检测,描述性分析基因型人群分布、时间分布及地区分布特征。结果795例丙肝病例血清样本中,共检出1、2、3、6等4种HCV基因型,1b、2a、3a、3b、6a等5种基因亚型。主要为1b型646例(81.26%),其次为2a型138例(17.36%)。不同性别HCV基因型分布差异无统计学意义(χ^(2)=1.675,P>0.05)。1型基因15~<31岁构成比最高(100.00%),41~<51岁年龄组最低(77.46%);2型基因在41~<51岁年龄组构成比最高(19.72%),15~<31岁年龄组最低(0.00%)。2015—2019年检出1b型和2a型2种亚型,2020、2022、2023年分别新增3a型、6a型、3b型和混合型。11个县区丙肝患者基因型均以1b型为主,构成比为58.00%~95.65%。结论2015—2023年信阳市丙肝基因型主要以1b型和2a型为主,2020—2023年逐渐增加至4种基因型、5种基因亚型。在丙肝治疗前推荐进行HCV分型检测,以便临床选择基因型特异性方案,对减轻疾病负担有重要意义。 展开更多
关键词 肝炎病毒 基因 分布 基因型特异性方案
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型特异性基因鉴定法确定蓝氏贾第鞭毛虫C2株基因型的研究 被引量:1
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作者 曾书瑞 巨红妹 +1 位作者 王云华 李雅杰 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2013年第9期803-806,共4页
目的鉴定中国四川蓝氏贾第鞭毛虫(简称贾第虫)C2株的型特异性基因,为其基因分型提供依据。方法根据GenBank中收录的贾第虫基因序列,选取贾第虫WB株的2个型特异性基因和GS株的5个型特异性基因,设计引物,以C2株基因组DNA为模板,进行PCR反... 目的鉴定中国四川蓝氏贾第鞭毛虫(简称贾第虫)C2株的型特异性基因,为其基因分型提供依据。方法根据GenBank中收录的贾第虫基因序列,选取贾第虫WB株的2个型特异性基因和GS株的5个型特异性基因,设计引物,以C2株基因组DNA为模板,进行PCR反应。从中选取一个没有PCR产物的基因设计外围引物(该引物预期能扩增出此基因的侧翼序列和其相邻基因的部分序列),再次进行PCR反应。将纯化的PCR产物克隆至pMD19-T载体并测序。型特异性基因的缺失通过对其相邻片段的扩增验证。结果从中国四川贾第虫C2株基因组DNA中成功扩增出贾第虫WB株的2个型特异性基因GL50803_3386和GL50803_4447,扩增片段长度分别为1 586bp和1 080bp,并证实其缺失1个贾第虫GS株的型特异性基因GL50581_2613。结论中国四川贾第虫C2株可能属于贾第虫WB株。 展开更多
关键词 蓝氏贾第鞭毛虫 基因 异性基因
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Endotoxin receptor CD14 gene variants and histological features in chronic HCV infection 被引量:2
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作者 Eva Askar Giuliano Ramadori Sabine Mihm 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2009年第31期3884-3890,共7页
AIM:To analyze the correlation between CD14 rs2569190/C-159T single nucleotide polymorphism (SNP) and disease progression in chronic hepatitis C.METHODS: Liver biopsy specimens from a total of 137 and 349 patients wit... AIM:To analyze the correlation between CD14 rs2569190/C-159T single nucleotide polymorphism (SNP) and disease progression in chronic hepatitis C.METHODS: Liver biopsy specimens from a total of 137 and 349 patients with chronic hepatitis C were separately evaluated with respect to necroinflammatory activity (grading) and architectural changes (staging). In one group, further histological lesions characteristic for hepatitis C, hepatitis C virus subtypes, and biochemical parameters of liver disease were also investigated. Samples of genomic DNA were genotyped for the respective SNP by 5'-nuclease assays using fluorescent dye-labeled allele-specif ic probes.RESULTS: Genotype distribution did not deviate from the Hardy-Weinberg equilibrium. In the first group, patients homozygous for the variant allele T were found to be younger than C allele carriers (39.6±12.5 vs 45.7±11.5, P=0.008). Among the histological lesions studied, portal lymphoid aggregates were more frequently observed among TT homozygotes than among C carriers (21/37 vs 32/100, P=0.008). The presence of portal lymphoid aggregates was closely correlated with hepatic inflammation (P=0.003) and with bile duct damage (P<0.001). The degree of fibrosis, in contrast, was not found to be related to the CD14 gene C-159T polymorphism.CONCLUSION: The data suggest a possible relationship between CD14 C-159T polymorphism and the formation of portal lymphoid aggregates, but not liver fibrosis progression in chronic hepatitis C. 展开更多
关键词 CD14 ENDOTOXINS Hepatitis C virus Inflammation LIPOPOLYSACCHARIDES Liver fibrosis Portal system Single nucleotide polymorphism
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Efficacy of seasonal pandemic influenza hemagglutinin DNA vaccines delivered by electroporation against aseasonal H1N1 virus challenge in mice 被引量:2
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作者 TAN Lei LU HuiJun +6 位作者 ZHANG Dan WANG KaiYan TIAN MingYao LIU CunXia LIU YanYu HU Bo JIN NingYi 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2011年第4期293-299,共7页
Prophylactic DNA vaccines against the influenza virus are promising alternatives to conventional vaccines. In this study, we generated two candidate gene-based influenza vaccines encoding either the seasonal or pandem... Prophylactic DNA vaccines against the influenza virus are promising alternatives to conventional vaccines. In this study, we generated two candidate gene-based influenza vaccines encoding either the seasonal or pandemic hemagglutinin antigen (HA) from the strains A/New Caledonia/20/99 (HIN1) (pV1AS) and A/Califorrtia/04/2009 (H1N1) (pVEH1), respectively. After verifying antigen expression, the immunogenicity of the vaccines delivered intramuscularly with electroporation was tested in a mouse model. Sera of immunized animals were tested in hemagglutination inhibition assays and by ELISA for the presence of HA-specific antibodies. HA-specific T-cells were also measured in IFN-γ ELISpot assays. The protective efficacy of the candidate influenza vaccines was evaluated by measuring mortality rates and body weight after a challenge with 100 LD50 of mouse-adapted A/New Caledonia/20/99 (H1N1). Mice immunized with either one of the two vaccines showed significantly higher T cell and humoral immune responses (P〈0.05) than the pVAX1 control group. Additionally, the pV1A5 vaccine effec- tively protected the mice against a lethal homologous mouse-adapted virus challenge with a survival rate of 100% compared with a 40% survival rate in the pVEH1 vaccinated group (P〈0.05). Our study indicates that the seasonal influenza DNA vac- cine completely protects against the homologous A/New Caledonia/20/99 virus (H1N1), while the pandemic influenza DNA vaccine only partially protects against this virus. 展开更多
关键词 seasonal influenza pandemic influenza HEMAGGLUTININ DNA vaccine ELECTROPORATION H1N1 influenza virus
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