种群遗传变异及基因多样度分析

阐述了种群遗传学和生态遗传学研究的基本单位——种群的定义和单位含义,其一是种系变异含义,其二是生态适应含义,并概述了遗传变异的研究历史。从3个方面及质量性状变异、数量性状变异与基因变异,介绍了种群遗传变异的研究方法,重点介绍了基因变异的测量和亚种群基因多样度的测量。

长期施用化肥对红壤磷形态、磷酸酶活性及phoD基因丰度和多样性的影响

以湖南省祁阳县的国家红壤肥力与肥料效益长期试验地为平台,采用单施氮肥(N)、氮钾配施(NK)、氮磷配施(NP)和氮磷钾配施(NPK)4种不同组合的无机肥料添加方式,结合实时定量PCR和高通量测序技术,探究长期施用化肥对土壤磷形态、磷酸酶活性及phoD基因丰度和多样性的影响。结果表明:与单施氮肥处理相比,氮与磷、钾配施可以缓解土壤酸化趋势,氮磷配施能够显著增加土壤中各形态磷含量。与单施氮肥处理相比,氮磷、氮钾处理显著提高了土壤碱性磷酸酶活性、土壤总细菌丰度及phoD基因丰度;氮磷钾配施显著提高了土壤碱性磷酸酶活性和土壤总细菌丰度,但显著降低土壤phoD基因丰度。磷酸酶编码基因phoD基因群落的α-与β-多样性在处理间不存在显著差异,且所有处理中来源于假单胞菌属与紫色杆菌属的phoD基因分别超过总序列的45%。此外,链霉菌属、马赛菌属以及短波单胞菌属与土壤磷素存在显著的正相关关系。以上结果表明:在不同养分输入条件下,调节功能菌群丰度及磷酸酶活性的关键因素不同。氮磷钾的合理配施能够增加土壤磷含量和磷酸酶活性,改变phoD基因丰度和群落结构,提高土壤的供磷能力,但长期施用化肥会使土壤微生物物种趋于单一化。

非平衡群体基因变异测量的Shannon信息量方法

在Ｓｈａｎｎｏｎ信息量的基础上，对非平衡群体建立了群体基因型相对信息量Ｓ＇（Ｇ），纯合体相对信息量Ｓ＇Ｊ（Ｇ）、杂合体相对信息量Ｓ＇Ｈ（Ｇ）的概念，并赋予它们以遗传学意义．与基因一致度Ｊ和基因多样度Ｄ进行了理论比较，结果表明，二者在数量规律上有很好的一致性，但又是相对独立的指标体系，且各相对信息量还有新的内涵．Ｓ＇（Ｇ）既能表征基因变异，又能反映基因型水平上的遗传变异，Ｓ＇Ｊ（Ｇ）主要反映纯合体的遗传变异，Ｓ＇Ｈ（Ｇ）主要反映杂合体的遗传变异．各相对信息量既可反映群体的遗传变异程度，又能比较不同位点间的遗传变异程度．

Rh系统单倍型在中国人群中的分布

对中国已发表的１２５个人群Ｒｈ血型系统表型分布频率数据进行了收集和整理。用累积计算法（Ｃｏｕｎｔｉｎｇ ｍｅｔｈｏｄ）重新计算单倍型频率，通过各单倍型的分布差异分析中国不同地区不同民族、人群的遗传差异。分组比较了不同地区汉族和少数民族人群的基因多样度和基因分化度，结果表明南方少数民族和北方少数民族民族亚群体基因多样度有明显差异。用不同方法计算各小组遗传距离并进行聚类分析。最后，计算了除维吾尔族和哈萨克族外的６８个人群间的遗传距离并聚类比较，结果表明Ｒｈ基因单倍型的分布与地理分布基本相符。

壮药战骨种质资源遗传多样性ISSR分析

目的对壮药战骨种质资源的遗传多样性进行研究。方法采用ISSR分子标记技术分析9个战骨种群的遗传多样性。结果 13条引物共检测到73个位点,其中65个位点具有多态性,多态位点百分率(PPL)为89.04%。战骨总的Nei’s基因多样度指数(H)为0.226 5,Shannon’s多样性信息指数(I)为0.357 2,各种群的平均H、I为0.147 6、0.221 9。种群间基因分化系数(Gst)为0.348 4,基因流(Nm)为0.935 1。9个种群可聚类划分为2个大种群组。结论战骨种群遗传多样性为中等偏低水平;战骨种群的遗传变异主要存在于种群内;战骨的生物学特性和分布区域的片段化是导致种群间出现一定的遗传分化和种群遗传多样性较低的主要原因。