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噪声诱导多细胞系统的同步切换 被引量:1
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作者 张家军 王军威 +1 位作者 苑占江 周天寿 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第8期929-939,共11页
在以往的工作中讨论了对单细胞的基因开关系统噪声如何诱导连贯切换.在此,对多细胞的基因开关网络系统研究各种噪声(包括细胞内噪声和细胞环境噪声)对同步切换的影响.发现:细胞内基因调控过程中的合成率和降解率的随机涨落以及细胞内的... 在以往的工作中讨论了对单细胞的基因开关系统噪声如何诱导连贯切换.在此,对多细胞的基因开关网络系统研究各种噪声(包括细胞内噪声和细胞环境噪声)对同步切换的影响.发现:细胞内基因调控过程中的合成率和降解率的随机涨落以及细胞内的附加噪声均能够诱导群体基因开关系统的同步切换,而且存在一个最优的噪声强度,它使得这种同步切换的效果最佳.另一方面,细胞环境的随机涨落所导致的噪声(即环境噪声),不但能诱导上述同步切换,而且当细胞内噪声不足以诱导细胞群体的同步切换时,它通过压制内部噪声来达到增强群体系统的协作行为.最后,还分析了受噪声影响的信号分子的扩散率对细胞群体切换行为的影响. 展开更多
关键词 噪声 同步切换 基因开关系统 群体感应机制 合成基因
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噪声诱导的连贯切换 被引量:2
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作者 苑占江 张家军 周天寿 《中国科学(B辑)》 CSCD 北大核心 2007年第5期446-452,共7页
以著名的基因开关系统为例,数值地调查了噪声对其双稳性的影响.发现基因调控过程中的合成率或降解率的涨落所导致的噪声以及环境涨落引起的噪声均能够诱导连贯切换,而且发现存在一个最合适的噪声强度,它不仅能实现这种切换,而且能使弱... 以著名的基因开关系统为例,数值地调查了噪声对其双稳性的影响.发现基因调控过程中的合成率或降解率的涨落所导致的噪声以及环境涨落引起的噪声均能够诱导连贯切换,而且发现存在一个最合适的噪声强度,它不仅能实现这种切换,而且能使弱信号被最优地扩大.此外,还发现由Poisson τ-跳跃算法所引入的内部噪声不能够诱导上述切换. 展开更多
关键词 噪声 连贯切换 基因开关系统 基因调控 人造基因
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Spontaneous modulation of a dynamic balance between bacterial genomic stability and mutability: roles and molecular mechanisms of the genetic switch 被引量:1
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作者 TANG Le LIU RuoWei +3 位作者 JIN Gang ZHAO ErYing LIU GuiRong LIU ShuLin 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2014年第3期275-279,共5页
Bacteria need a high degree of genetic stability to maintain their species identities over long evolutionary times while retaining some mutability to adapt to the changing environment.It is a long unanswered question ... Bacteria need a high degree of genetic stability to maintain their species identities over long evolutionary times while retaining some mutability to adapt to the changing environment.It is a long unanswered question that how bacteria reconcile these seemingly contradictory biological properties.We hypothesized that certain mechanisms must maintain a dynamic balance between genetic stability and mutability for the survival and evolution of bacterial species.To identify such mechanisms,we analyzed bacterial genomes,focusing on the Salmonella mismatch repair(MMR)system.We found that the MMR gene mutL functions as a genetic switch through a slipped-strand mispairing mechanism,modulating and maintaining a dynamic balance between genetic stability and mutability during bacterial evolution.This mechanism allows bacteria to maintain their phylogenetic status,while also adapting to changing environments by acquiring novel traits.In this review,we outline the history of research into this genetic switch,from its discovery to the latest findings,and discuss its potential roles in the genomic evolution of bacteria. 展开更多
关键词 genetic switch genomic evolution mismatch repair comparative genomics Salmonella genome
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