急性T细胞白血病细胞变异型sil-tal1融合转录本和基因组DNA断裂点

本研究探究1例儿童急性T淋巴细胞白血病(T-ALL)的变异型sil-tal1融合转录本的序列。将PCR扩增产物克隆入质粒载体并测序,针对变异部分序列设计引物,对基因组DNA进行PCR扩增及序列比对。结果表明,在cDNA水平发现4种不同的融合转录本,分别保留了sil基因的部分外显子或内含子序列,并存在插入和删除现象。经分析白血病细胞的基因组DNA序列,发现了一种新的sil-tal1重组,其sil基因的断裂点在DNA水平上与文献报道不同。结论:此例患儿白血病细胞的tal1基因发生了新型重组,并表达经典型的和至少3种变异型的融合转录本,此现象可能是由于白血病细胞转录剪接机制异常所致。

锅柄式PCR及其在混合谱系白血病基因断裂区中的应用

染色体11q23的混合谱系白血病(MLL)基因的断裂点簇集群区(BCR)的转位,可引起婴儿急性白血病及与DNA拓扑异构酶Ⅱ抑制剂的生化治疗法相关的白血病。由于MLL基因包括大约30个不同的转位伴侣基因,几个断裂点所在的伴侣基因的序列还不清楚,因而对MLL基因断裂点的PCR克隆是很困难的。锅柄式PCR,即用已知5'端序列和未知的3'端伴侣基因序列以形似一个锅和一个柄的模板扩增断裂点基因DNA,是一种克隆MLL基因断裂区的新方法,可以扩增未知3'端序列的断裂点簇集群区。

癌-睾丸抗原SSX基因在肝细胞癌中的表达及临床意义

目的:检测癌-睾丸抗原SSX1-5 mRNA在肝细胞癌(HCC)组织中的表达,探讨其用于HCC免疫治疗的可能性.方法:采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术,检测61例HCC组织及52例配对的HCC癌旁组织中SSX1-5 mRNA,结合临床相关指标进行统计学分析.随机抽取PCR阳性产物进行DNA测序.结果:SSX1、SSX2、SSX4和SSX5 mRNA在HCC中的表达率分别为42.6%(26/61)、8.2%(5/61)、39.3%(24/61)和6.6%(4/61);未检测到SSX3的表达.在癌旁组织中,未检测到SSX1-5 mRNA;HCC组织中,至少表达1个SSX基因者达50.8%(31/61);表达2个或2个以上者达32.8%(20/61),表达3个或3个以上者达9.8%(6/61),同时表达4个者达3.3%(2/61).SSX的表达与临床相关指标关系的分析结果显示:门静脉癌栓形成与SSX1的表达、患者的年龄与SSX4的表达均具有显著性差异(P<0.05);DNA测序证实PCR阳性产物为目的基因.结论:SSX1、SSX2、SSX4和SSX5在HCC组织中表达频率不尽相同,但具有较强的特异性,提示有可能成为HCC免疫治疗的靶抗原.

精神分裂症断裂点基因1单核苷酸多态性与中国汉族儿童孤独症的关系

目的探讨精神分裂症断裂点基因1（DISCl）单核苷酸多态性（SNPs）与中国汉族儿童孤独症的关系。方法采用ⅢuminaHumanHapCNV370-Duo芯片对278个孤独症核心家系（患儿及其父母）、157例孤独症患儿和435例正常对照进行全基因组SNP分型。从中选取DISCl基因的分型数据，采用病例一对照关联分析及传递不平衡检验分析等位基因与孤独症的关系。结果共有52个SNPs纳入本研究。1．病例一对照关联分析结果发现，6个位点（rs4658939，rs2793093，rsl0495309，rs2492367，rs11122362，rsl073179）的等位基因频率，以及7个单体型（rs823163-rs823161-rs4658933-rsl417585-rsl0864693-rs6541281构建的单体型AGAAAG，rs4658939一rs2793093一rs10495309构建的单体型GGG和AAA，rs2492367-rsl2046794构建的单体型GG和AG，rs9432040-rs2356606-rs11122362构建的单体型GAA，rs9431714-rsl073179构建的单体型GG）的频率在孤独症组和对照组间的差异均有统计学意义（矿=4．704、4．915、5．568、8．087、4．043、5．183、5．369、5．295、4．440、5．304，7．615、4．018，4．811，P=0．030、0．027、0．018、0．005、0．044、0．023、0．021、0．021、0．035、0j021、0．006、0．045、0．028）。2．传递不平衡检验分析表明，rs4658945位点的等位基因A和rslll22362位点的等位基因G，以及rsl0495310-rs4658945构建的单体型AG和rs9432040-rs2356606-rs11122362构建的单体型GAA在亲代与受累子代间的传递差异有统计学意义X2=4．445、5．400、3．973、5．126，P=0．035、0．020、0．046、0．024）。结论DISC1基因rs11122362位点及rs9432040-rs2356606．rs11122362构建的单体型GAA与孤独症存在关联，支持DISC1基因与中国汉族儿童孤独症的易感性相关。