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一种衡量基因语义相似度的新方法
被引量:
2
1
作者
张少华
尚学群
王淼
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2011年第3期957-960,968,共5页
提出了一种新的方法来衡量基因之间的语义相似度。本方法的主要原则是同时依赖于GO拓扑结构图中基因注释项之间的路径长度和基因注释项的公共祖先节点在GO拓扑结构图中的深度。用人工数据和取自酵母基因数据库的基因数据进行了实验,结...
提出了一种新的方法来衡量基因之间的语义相似度。本方法的主要原则是同时依赖于GO拓扑结构图中基因注释项之间的路径长度和基因注释项的公共祖先节点在GO拓扑结构图中的深度。用人工数据和取自酵母基因数据库的基因数据进行了实验,结果表明本方法比传统方法更有效。
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关键词
路径长度
基因本体项的深度
基因
本体
项的
相似度
基因
相似度
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题名
一种衡量基因语义相似度的新方法
被引量:
2
1
作者
张少华
尚学群
王淼
机构
西北工业大学计算机学院
出处
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2011年第3期957-960,968,共5页
基金
国家"863"计划重大资助项目(2009AA01A404)
国家自然科学基金资助项目(60703105)
陕西省自然科学基金资助项目(2007F27)
文摘
提出了一种新的方法来衡量基因之间的语义相似度。本方法的主要原则是同时依赖于GO拓扑结构图中基因注释项之间的路径长度和基因注释项的公共祖先节点在GO拓扑结构图中的深度。用人工数据和取自酵母基因数据库的基因数据进行了实验,结果表明本方法比传统方法更有效。
关键词
路径长度
基因本体项的深度
基因
本体
项的
相似度
基因
相似度
Keywords
path length
depth of GO(gene ontology) term
GO term similarity
gene similarity
分类号
TP311 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种衡量基因语义相似度的新方法
张少华
尚学群
王淼
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2011
2
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