与大肠癌分化相关的基因标记物

肿瘤的分化是一个复杂的过程,各种肿瘤基因及其产物可能在其中发挥了重要作用。研究和检测各种癌基因和抑癌基因及其编码产物在大肠癌组织中的表达水平,有助于给大肠癌的诊断和预后评估提供新思路,将来也可作为对传统病理检查方法的一种有益补充。作者就与大肠癌分化相关的基因标记物做一综述。

基因标记物在头颈部肿瘤中的应用

基因标记物在临床已有许多研究与应用。本文综述了近年来基因标记物在头颈部肿瘤中早期诊断、精确分期及判断预后等方面的应用研究。

基因标记物与子宫内膜癌相关性研究进展

肿瘤的发生是多基因、多步骤的复杂过程,癌基因的激活、抑癌基因的失活、细胞周期调节紊乱及细胞异常增殖均可导致正常子宫内膜细胞的恶性转化及子宫内膜癌的发生发展。选取具有代表性基因标记物——凋亡抑制基因(survivin)、抑癌基因(PTEN)、增殖细胞核抗原(PCNA),综述三者在子宫内膜细胞癌变过程中的作用及其相关性。

外周血基因标记物mRNA表达与老年癌性肠梗阻肝转移的相关性

目的分析外周血基因标记物mRNA表达与老年癌性肠梗阻肝转移的相关性。方法采用PT-PCR法检测老年癌性肠梗阻病人外周血标本中COX-2,CK-20及CD44v6 mRNA表达。结果 20例老年癌性肠梗阻病人中伴肝转移的14例病人中,85.7%(12/14)的病人外周血中至少有一种基因mRNA表达阳性,而在非转移的6例病人中,仅有1例阳性表达,阳性率仅为16.7%(1/6),具有显著性差异(P=0.003 0)。结论采用RT-PCT技术对肠梗阻病人的外周血标本的COX-2,CK-20及CD44v6 mRNA表达进行检测分析,对癌性肠梗阻的转移有较高的预测价值,同时也可对肿瘤生物靶向治疗靶点的选择提供理论依据。

人类特异性粪厌氧菌基因标记物实时荧光定量PCR检测方法的建立和应用

针对人类粪便污染,选择来源于拟杆菌和双歧杆菌16S rRNA的基因片段作为标记物,分别建立了相应的实时荧光定量PCR检测方法。选取不同来源的粪便样品进行检测,证实了引物的特异性。回收纯化从污水中扩增所得的目标PCR片段,经过连接转化,筛选阳性克隆提取其重组质粒作为实时荧光定量PCR的标准品。通过检测一系列梯度稀释的标准品,确定了拟杆菌基因标记物和双歧杆菌基因标记物定量PCR检测方法分别在1.98×102～1.98×107copy/μL和2.12×101～2.12×107copy/μL范围内具有良好的线性关系。

肿瘤中前列腺癌基因表达标记物1的调控作用研究

长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200 nt的非编码RNA,不具备编码蛋白质能力,曾被认为是基因组中的暗物质。大量研究表明lncRNA能够抑制肿瘤细胞凋亡并具有调控表观遗传学、调节转录及翻译等重要分子生物学功能,在肿瘤中起原癌基因或抑癌基因的作用。前列腺癌基因表达标记物1(PCGEM1)作为一种lncRNA,在诸多人类肿瘤中呈现异常表达并能够调控肿瘤增殖和侵袭迁移等恶性生物学行为。本文就肿瘤中PCGEM1的调控作用进行综述。

癌基因标记物和原发肿瘤的病理学特征不能预示头颈部鳞状细胞癌淋巴结的转移

荷兰柴顿大学医院耳鼻喉科的Takes医生等人经过研究认为.癌基因标记物的检测和原发肿瘤的组织病理学特征对于头颈部鳞状细胞癌淋巴结转移的预示意义不大。

膀胱肿瘤标记物研究进展

膀胱癌的发病率居泌尿系恶性肿瘤的第一位,据美国1998年的资料显示约60000患者患膀胱肿瘤,其中70%～80%为恶性肿瘤[1].

基于PI3K/AKT/mTOR信号通路的胶质母细胞瘤复发标记物的筛选

目的:基于TCGA大数据分析,筛选能够有效预测胶质母细胞瘤(GBM)复发的生物标志物。方法:下载TCGA数据库中GBM患者的mRNA表达谱和临床病理参数数据集,采用基因集富集分析(GSEA)和基因集变异分析(GSVA)两种分析方法分析复发和未复发患者之间的差异信号通路,利用Cox回归分析从差异信号通路中筛选出与总体生存相关的基因,基于筛选出的基因表达水平的线性组合并经Cox回归系数加权处理建立风险评分模型。采用Cox回归分析评估风险评分模型能否预测GBM复发。结果:GSEA和GSVA分析结果显示,PI3K/AKT/mTOR信号通路为目标通路。以总生存为终点事件,经Cox回归分析,从该通路中筛选出5个基因用于风险评分模型的构建。风险评分=0.3771×MAP2K3基因表达水平+(-0.2690)×MAP2K6基因表达水平+(-0.4887)×MAPK1基因表达水平+(-0.3256)×PTEN基因表达水平+0.7945×RAC1基因表达水平。Cox回归分析结果表明,该风险评分模型可以预测GBM复发,HR(95%CI)为1.593(1.153~2.200)。结论:成功构建了基于PI3K/AKT/mTOR信号通路的GBM复发风险评分模型。

肿瘤标记物在大肠癌临床诊治中的应用进展

总结肿瘤标记物在大肠癌临床诊治中的应用进展。对有关大肠癌临床诊治中肿瘤标记物的文献进行综述,重点讨论血清、基因和急性期蛋白三类标记肿瘤物对大肠癌临床诊治方面的价值和潜力。结果是恰当选择肿瘤标记物有助于大肠癌临床诊治。目前,基因和急性期蛋白为大肠癌肿瘤标记物探索的新方向,有望成为提高大肠癌诊治效率的新检查方法。三类肿瘤标记物对大肠癌诊治有临床意义,联合检测可提高大肠癌诊治的准确性和有效性。

生物信息学在筛选影响结直肠癌预后基因中的应用

目的拟用生物信息学方法,筛查出影响结直肠癌(CRC)预后的相关基因,为寻找CRC早期诊断标志物提供指导。方法用生物信息学手段,对正常结直肠和CRC组织进行对比分析,筛选出差异表达基因(DEGs)。结果共检测到62个DEGs,分析发现下调的DEGs在肾素和胰腺分泌调节信号通路富集,相关基因为CLCA1和CLCA4,而上调的DEGs未见明显的信号通路。对其中6个下调基因进行分析,发现6个下调基因中有2个对结肠腺癌预后有明显影响,通过富集分析发现,CLCA4在肾素分泌通路中表达明显降低。结论CLCA1和CLCA4在CRC中表达明显降低,有可能成为CRC的潜在诊断标志物和治疗靶点。

绿色荧光蛋白在蛋白质研究中的应用

绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)自发现以来,由于具有自发荧光等特性,在分子生物学和细胞生物学领域得到广泛应用。GFP作为一种报道分子,在研究蛋白质相互作用和构象变化、检测蛋白质表达、蛋白质和细胞荧光示踪中,起到了重要的作用。该文通过对绿色荧光蛋白特性的分析,介绍其作为荧光标记在蛋白质研究中的应用,并展望进一步的研究前景。

结直肠癌组织和血清外泌体lncRNA PCGEM1、miR-152-3p的表达及其临床意义

目的:研究结直肠癌组织和血清外泌体长链非编码核糖核酸前列腺癌基因表达标记物1(lncRNA PCGEM1)、微小RNA-152-3p(miR-152-3p)的表达及其临床意义。方法:选取2020年1月至2021年10月南京医科大学附属无锡人民医院收治的138例结直肠癌患者作为结直肠癌组,另选取同期体检健康的90例健康人群作为健康组。检测血清外泌体、结直肠癌组织与癌旁组织中lncRNA PCGEM1、miR-152-3p相对表达量。分析结直肠癌组织、血清外泌体lncRNA PCGEM1、miR-152-3p表达与结直肠癌患者临床病理特征及预后的关系。Cox模型分析结直肠癌患者预后的影响因素。受试者工作特征(ROC)曲线分析lncRNA PCGEM1、miR-152-3p对结直肠癌的诊断价值。结果:结直肠癌组织、血清外泌体lncRNA PCGEM1相对表达量分别高于癌旁组织和健康组,miR-152-3p相对表达量均低于癌旁组织和健康组(P<0.05)。血清外泌体与癌组织中lncRNA PCGEM1、miR-152-3p表达与TNM分期、分化程度、浸润深度、淋巴结转移、远处转移有关(P<0.05)。LncRNA PCGEM1高表达组的生存率低于lncRNA PCGEM1低表达组,miR-152-3p低表达组生存率低于miR-152-3p高表达组(P<0.05)。血清外泌体lncRNA PCGEM1、miR-152-3p及分化程度、淋巴结转移、浸润深度是影响患者预后的因素(P<0.05)。血清外泌体lncRNA PCGEM1、miR-152-3p联合应用的曲线下面积(AUC)、灵敏度、特异度均较各指标单独应用明显提升(P<0.05)。结论:结直肠癌患者癌组织和血清外泌体中lncRNA PCGEM1表达上调、miR-152-3p表达下调,血清外泌体lncRNA PCGEM1、miR-152-3p联合诊断结直肠癌的效能更高。

第36届危重病大会萃集新的大规模临床试验概要

在过去20年中脓毒症死亡率有所下降．可能是加强了对其的监护支持和对其本质更清楚所致。至今最大临床试验（SSC）发现，2002年脓毒症的死亡率降低了25％。得益此成果的主要途径是2004年颁布的脓毒症循证指南。据此指南要求对以下几项证据的校定。

DNA依赖蛋白激酶在人支气管上皮细胞癌变株和肺癌组织中的异常表达

目的:探讨辐射诱发人支气管上皮细胞癌变株和肺癌组织中DNA依赖蛋白激酶(DNA dependent protein kinase, DNA-PK)的激酶活性或表达变化。方法:用Western blot和p53蛋白为特异性底物的磷酸化反应分别检测癌变细胞中DNA-PKcs表达和激酶活性,用免疫组化结合病理图像定量分析技术检测肺癌组织和癌旁组织中DNA-PKcs蛋白的表达情况。结果:a粒子辐射诱发的人支气管上皮细胞癌变株BERP35T-1的DNA-PKcs表达水平比亲本细胞BEP2D提高30%,激酶活性显著提高。所检测的14例非小细胞肺癌组织中DNA-PKcs蛋白表达水平普遍高于相对应的癌旁组织,两组之间有显著性差异(P < 0.05)。结论:非小细胞肺癌组织中DNA-PKcs表达增加,可能成为肺癌的一个生物标记物。

lncRNA PCGEM1在早期原发性肝细胞癌外周血中的表达及临床意义

目的:探讨长链非编码RNA前列腺癌基因表达标记物1(lncRNA PCGEM1)在早期原发性肝细胞癌患者外周血中的表达及其对诊断和预后的意义。方法:选取2016年3月—2019年12月在宣城市中心医院普外科接受肝癌切除术治疗的70例早期原发性肝细胞癌患者,其中男性62例,女性8例;年龄31~71岁,平均(49.04±9.26)岁。另外选择同期体检的70名健康成年志愿者作为对照组,其中男性61例,女性9例;年龄25~68岁,平均(49.40±8.86)岁。采用qRT-PCR检测患者手术前后和健康体检者外周血中PCGEM1的表达;分析其与早期肝癌临床病理特征间的关系。应用受试者工作特征(ROC)曲线分析PCGEM1对早期肝癌诊断和肝癌细胞分级预测的价值。结果:患者术前外周血中PCGEM1的表达量高于术后和健康体检者(均P<0.001),ROC分析结果显示血清PCGEM1能对早期肝癌诊断和肝癌细胞分级进行预测(均P<0.001)。肿瘤直径>5 cm、无肿瘤包膜和肝癌细胞分级差(Ⅲ级和Ⅳ级)的早期肝癌患者血清PCGEM1的表达量升高(均P<0.05)。结论:早期原发性肝细胞癌患者外周血中PCGEM1的表达升高,高表达患者肿瘤直径大且恶性程度高,提示预后较差。

LncRNA lncRNA PCGEM1和LncRNA lncRNA PVT1在哮喘患者血清中表达与意义

目的:检测长链非编码RNA(lncRNA)前列腺癌基因表达标记物1(PCGEM1)和lncRNA细胞瘤多样异位基因1(PVT1)在哮喘(BA)患者血清中的表达水平,探讨其临床意义。方法:前瞻性选取2016年1月—2019年4月经本院收治确诊的93例BA患者作为观察组,同期选取90例体检健康人群作为对照组;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测血清中lncRNA PCGEM1、lncRNA PVT1水平;酶联免疫吸附试验(ELISA)法测定血清中白细胞介素6(IL-6)、白细胞介素17(IL-17)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)水平;Pearson法分析BA患者血清中lncRNA PCGEM1、lncRNA PVT1与IL-6、IL-17、TNF-α表达的相关性;利用受试者工作特性曲线(ROC)预测lncRNA PCGEM1、lncRNA PVT1表达对BA的诊断价值。结果:观察组血清中lncRNA PCGEM1表达水平显著低于对照组(P<0.05),lncRNA PVT1、IL-6、IL-17、TNF-α表达水平均显著高于对照组(P<0.05)。BA患者血清中lncRNA PCGEM1与IL-6、IL-17、TNF-α表达呈负相关(r=-0.551、-0.686、-0.602,P<0.05),lncRNA PVT1与IL-6、IL-17、TNF-α表达呈正相关(r=0.709、0.694、0.637,P<0.05);lncRNA PCGEM1与lncRNA PVT1表达呈负相关(r=-0.634,P<0.05)。lncRNA PCGEM1诊断BA的ROC曲线下面积为0.859,截断值为0.52,灵敏度为89.2%,特异性为70.0%;lncRNA PVT1诊断BA的ROC曲线下面积为0.892,截断值为2.36,灵敏度为82.8%,特异性为85.6%;两者联合诊断BA的ROC曲线下面积为0.949,截断值为0.47,灵敏度为90.3%,特异性为88.9%。结论:BA患者血清中lncRNA PCGEM1呈低表达,lncRNA PVT1呈高表达,两者呈负相关,对BA均有一定的诊断价值,且两者联合检测的诊断价值更高。