多靶点沉默CCR5基因载体构建及沉默效果验证

目的筛选沉默CCR5基因的靶点并验证多靶点沉默CCR5基因的效果。方法检索人CCR5基因的cDNA序列,设计针对CCR5 mRNA的siRNA,选择与靶基因结合具有高特异性的3个siRNA序列,合成shRNA双链,构建多靶点沉默CCR5重组质粒。同时合成CCR5过表达质粒。经测序验证后进行质粒慢病毒包装。首先,用CCR5过表达慢病毒转染Jurkat T细胞,实时荧光逆转录定量聚合酶链反应(real-time reverse transcription quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)检测CCR5过表达情况。Control组(空白对照)为Jurkat T细胞,将CCR5过表达细胞分组为CCR5-OE组(CCR5过表达)、CCR5-OE-NC组(CCR5过表达阴性对照)、CCR5-OE-沉默组(CCR5过表达沉默)。RT-qPCR和Western bolt检测CCR5沉默重组质粒对目的基因的沉默效果。实验中各项数据的分析选用SPSS软件,作图选用GraphPad Prism软件。结果测序结果证明,CCR5过表达质粒含有目的序列,CCR5沉默重组质粒中含有3个目的靶点序列。RT-qPCR检测CCR5过表达情况显示,细胞CCR5的基因表达显著升高,可进行后续实验。CCR5沉默慢病毒感染后,RT-qPCR和Western bolt检测各组CCR5表达结果显示,多靶点CCR5沉默组的CCR5基因表达水平和蛋白表达水平较CCR5-OE组降低(P均<0.05)。结论成功构建多靶点沉默CCR5基因重组质粒,验证多靶点沉默CCR5基因的有效性,为基因编辑治疗艾滋病提供实验数据。

慢病毒载体介导的小鼠骨髓树突状细胞RelB基因沉默

目的:利用慢病毒载体沉默小鼠骨髓树突状细胞(DC)的RelB基因,建立RelB基因低表达的骨髓致耐受DC,为自身免疫病的防治提供新方法。方法:设计小鼠RelB基因干扰的靶序列R5,合成并克隆到慢病毒载体上,与慢病毒的包装材料在293FT细胞中包装成病毒颗粒,收集病毒上清,测定病毒滴度,然后包装慢病毒感染DC,RT-PCR和免疫荧光方法检测,灰度扫描并用软件分析RelB基因的表达水平,未成熟DC作对照组,选择T6包装病毒为RNAi的阴性对照。结果:RT-PCR和免疫荧光方法发现R5病毒感染的DCRelB基因表达水平与未成熟DC基因表达水平接近,低于成熟DC的表达水平(P<0.05),而实验对照T6组病毒感染的DC其RelB基因表达水平高于未成熟DC(P<0.05)和R5病毒转染DC组(P<0.05)。结论:小鼠骨髓DC表达的RelB基因被慢病毒载体有效沉默,有望成为DC免疫治疗的新载体。

番茄茄红素β-环化酶基因高效沉默载体构建

番茄茄红素是番茄果实中含量最多的一种类胡萝卜素,也是植物类胡萝卜素代谢过程中的一个重要中间产物。它的环化是在茄红素β-环化酶(Lyc-b)和茄红素ε-环化酶(Lyc-e)催化下完成的,其中茄红素β-环化酶在番茄茄红素转变为β-胡萝卜素的过程中起主要作用。我们利用RT-PCR方法从番茄叶片中克隆出Lyc-b基因,将PCR产物与pGEM-T载体连接后进行测序,扩增的DNA序列与发表的茄红素β-环化酶序列一致。以此为模板,克隆了400bp左右的目的片段,利用Gateway系统构建Lyc-b基因目的片段的pJawoh18-2b ihpRNA表达载体。经PCR与酶切鉴定的阳性克隆转化农杆菌LBA1100,利用农杆菌叶盘法转化番茄获得了抗性愈伤及再生苗,以检测ihpRNA沉默载体能否降低茄红素β-环化酶基因表达,并为进一步了解该基因在番茄类胡萝卜素代谢过程中的作用奠定基础。这些数据未在本文列出。

适于烟草脆裂病毒诱导的本氏烟基因沉默分析的对照载体构建(英文)

对烟草脆裂病毒(Tobacco rattle virus,TRV)诱导的基因沉默分析体系中目前最常用的对照载体——空pYL156载体(pYL156∷00)对沉默处理后番茄和本氏烟(Nicotiana benthamiana)植株的病毒症状和生长影响进行分析.结果表明:pYL156∷00沉默处理后的番茄和本氏烟植株均表现出严重的系统性病毒症状,生长受到显著抑制,因此,pYL156∷00并不是一个用于TRV诱导的番茄和本氏烟基因沉默分析的好的对照载体;为获得更好的对照载体,试验构建了2个新的对照载体pYL156∷NIRi和pYL156∷eGFP,它们分别通过在pYL156∷00载体多克隆位点插入253bp菜豆亚硝酸还原酶基因内含子序列和400bp eGFP基因片段而获得,对这2个对照载体对沉默处理后本氏烟植株的病毒症状和生长情况的影响与pYL156∷00进行比较分析.结果表明:pYL156∷00沉默处理后的植株表现出较严重的系统性病毒症状,生长受到显著抑制,其中26.7%植株死亡;pYL156∷NIRi沉默处理后的植株也表现出明显的病毒症状以及生长受抑制现象,但与pYL156∷00相比,所受影响较小,只有13.3%植株死亡;而pYL156∷eGFP沉默处理后的植株不表现明显的病毒症状,植株生长也不受显著影响;病毒积累量检测结果显示,3个对照载体沉默处理的植株病毒症状和生长受抑制情况与植株体内TRV病毒的积累水平密切相关.这些结果表明,新构建的pYL156∷eGFP可以作为一个优越的对照载体应用于TRV诱导的基因沉默分析.

水稻蛋白二硫键异构酶基因沉默载体构建及其转基因后代的高温结实特性分析

采用RT-PCR法亚克隆了PDI基因保守区内450bp的靶标序列作为干扰区段,构建了含有内含子hpRNA(ihpRNA)的双元表达载体pTCK303-RiOsPDI,经农杆菌介导转化日本晴,获得转基因植株;通过在T0代对其潮霉素(Hyg)抗性基因的PCR鉴定,确定携带有干扰片段的T-DNA区已整合到水稻基因组中,且在转基因T1代符合3∶1的分离模式。半定量PCR和荧光定量PCR的检测结果表明,PDI基因沉默转基因阳性植株不同器官中的PDI表达量均显著降低,尤其是其籽粒中表达量较微,几乎能引起靶基因80%左右沉默。对转基因T2代植株的高温结实特性和籽粒理化品质的检测结果,PDI基因沉默会引起高温胁迫处理下结实率的大幅度降低,耐热性显著下降,但其在常温处理下的结实率与对照之间无显著差异。此外,PDI基因沉默后,稻米的透明度下降、垩白度增加,但对籽粒粗蛋白总量和直链淀粉含量的影响不甚明显。

CDK2 shRNA慢病毒载体的构建及其基因沉默效应

目的构建CDK2 shRNA慢病毒载体,并在黑色素瘤细胞B16-F1中鉴定其基因沉默效应。方法体外构建3个慢病毒重组目的质粒p UL-CDK2-shRNAs和1个阴性对照慢病毒重组质粒p UL-NC-shRNA,转化感受态细胞,PCR鉴定后进一步测序验证;293T细胞中测定病毒滴度;用重组慢病毒感染B16-F1细胞测定其感染效率,RT-PCR和Western印迹检测其对B16-F1细胞中CDK2的基因沉默效应。结果 PCR鉴定后进一步测序表明,成功构建了重组慢病毒质粒;病毒滴度为4.5×107~5.5×107TU/ml;用重组慢病毒感染B16-F1细胞,当感染复数(MOI)为10时,感染效率可达90%;RT-PCR和Western印迹结果表明,与未感染组和NC-shRNA感染组细胞相比,CDK2-shRNA1、CDK2-shRNA2、CDK2-shRNA3感染的细胞中CDK2 mRNA和蛋白表达均受到不同程度抑制(P<0.05),以CDK2-shRNA3感染组的抑制率最高,RT-PCR和Western Blot检测其抑制率分别为78.5%±4.23%和70.5%±3.54%。结论利用RNAi技术成功构建了3种CDK2-shRNA重组慢病毒载体,均可有效感染B16-F1细胞并具有一定的基因沉默效应,其中以针对靶位点1012-1020的p UL-CDK2-shRNA3基因沉默效应最强,为进一步研究CDK2基因沉默对黑色素瘤化疗敏感性的影响奠定了基础。

慢病毒表达载体的构建及沉默FOXQ1基因在大肠癌细胞系DLD-1中的表达

目的:构建FOXQ1基因shRNA慢病毒干扰系统,沉默FOXQ1基因在大肠癌细胞系DLD-1中的表达.方法:根据FOXQ1基因的序列,设计合成3对shRNA干扰序列,退火后连接到载体质粒PLKO.1-puro,将重组质粒转化至STBl3感受态中,涂板培养挑取单菌落,摇菌后小提质粒,选取酶切及测序鉴定正确的重组质粒去内毒素大提,将质粒与辅助包装质粒pRSV-rev、pMDlg-pRRE和pCMV-VSV-G利用磷酸钙法共转染293-T细胞,收集病毒上清,感染目的细胞DLD-1,嘌呤霉素筛选FOXQ1沉默细胞,经荧光定量PCR及Western blot检测干扰效果.结果:酶切及测序结果显示shRNA成功插入载体PLKO.1-puro中,共转染293-T细胞成功获取病毒上清,感染DLD1细胞,经嘌呤霉素筛选出FOXQ1沉默细胞,荧光定量PCR及Western blot鉴定FOXQ1基因表达最高抑制率为90.4%.结论:通过构建FOXQ1基因shRNA慢病毒干扰系统,成功获取FOXQ1基因沉默细胞.为后续FOXQ1基因在肿瘤发生发展的研究奠定实验基础.

重组马铃薯X病毒载体介导的烟草γ-微管蛋白基因沉默

用重组马铃薯X病毒(potato virus X,PVX)载体将γ-微管蛋白反义基因导入烟草(Nicotiana tabacum var.Samsun NN),得到了γ-微管蛋白基因沉默的烟草植株。它与侵染PVX空载体的正对照相比有明显的差异:不同形态的叶片分层交替生长;到生殖期所有的花苞都提前脱落;小孢子不能发育到四分体阶段。沉默的形态反应主要起始于顶端幼嫩组织。在沉默过程中除存在基因沉默及恢复现象外还出现靶基因水平的陡然升高,甚至有时会明显反超过正常对照水平。

桃果实中ACC合酶基因克隆及基因沉默载体构建

植物中乙烯是一种具有促进果实成熟和衰老的内源激素。ACC合酶是植物乙烯生物合成途径中一个重要的限速酶,沉默ACC合酶基因的表达能减少植物性内源性乙烯的产生。以中华寿桃为研究材料,采用RT-PCR技术,克隆获得ACC合酶基因。将该基因酶切回收后连接到pTRV-RNA2载体上,转化DH5α,筛选阳性克隆,进行酶切鉴定。测序后与已知序列进行同源性比较,其同源性达到99%,表明将ACC合酶基因成功连接到pTRV-RNA2基因沉默载体上。

β-arrestin2抗基因RNA慢病毒载体体外基因沉默效应研究

目的:探讨β-arrestin2抗基因RNA慢病毒载体在体外工具细胞中的基因沉默效应及其携带的用于活体核磁共振成像监测的铁蛋白报告基因的表达。方法:用构建的β-arrestin2抗基因RNA慢病毒感染NG108-15细胞,实时荧光定量PCR和Western Blot方法检测β-arrestin2抗基因RNA慢病毒对工具细胞的β-arrestin2 mRNA和蛋白表达的下调作用,以及该病毒所携带的用于活体核磁共振成像监测的铁蛋白报告基因的表达。结果:构建的β-arrestin2抗基因RNA慢病毒能显著降低工具细胞中β-arrestin2 mRNA和蛋白的表达,与对照组相比实时荧光定量PCR和Western Blot方法检测的沉默效率分别为79%和82%(P<0.05)。感染病毒组的NG108-15细胞的铁蛋白表达量显著升高,是对照组细胞的2.29倍(P<0.05)。结论:构建的β-arrestin2抗基因RNA慢病毒在工具细胞中对β-arrestin2基因具有显著的沉默效应,该病毒携带的铁蛋白报告基因在工具细胞中表达。成功验证了β-arrestin2抗基因RNA慢病毒在体外的基因沉默效应和铁蛋白报告基因的表达,为该病毒的在体研究奠定了基础。

番茄microRNA基因沉默载体的构建方法

该试验提出了一种简单且快速构建番茄中人工miRNA表达载体的方法,以包含miR319a前体骨架的质粒pRS300为模板,以重叠PCR技术来扩增miR1917的前体。miR1917的靶基因是LeCTR1,是乙烯反应中的一种负调控因子。含有miR1917的重组前体成功地转化到表达载体pGreen0029-35s中,通过植物根癌农杆菌C58介导的叶盘法成功获得了转基因植株。此种方法可为番茄中miRNA的作用机理研究提供一定的理论基础。

病毒载体诱导转录后基因沉默系统的建立及烟草(Nicotiana bentha miana)rbcs基因功能的研究

RNA沉默是一种序列特异性的RNA降解过程 ,主要作用于同源性较高的转录产物 ,它广泛存在于各种生物中 ,在植物中称转录后基因沉默 (Post TranscriptionalGeneSilencing ,PTGS)、动物中称为RNA干扰(RNAinterference ,RNAi)、真菌中被称为RNA压制 (RNAquelling)。病毒诱导转录后基因沉默是由携带基因片段的病毒载体感染植物引起相应的寄主基因沉默的现象 ,是一种典型的RNA沉默现象。本论文建立了病毒载体诱导转录后基因沉默系统 ,并运用该体系研究烟草 (Nicotianabenthamiana)的 1,5二磷酸核酮糖羧化酶 /加氧酶小亚基 (Ribulose - 1,5 -bisphosphate (RuBP)carboxylase/oxylasesmallsubunit,rbcS)基因的部分功能。具体包括以下内容 :1、分别用携带与 1,5二磷酸核酮糖羧化酶 /加氧酶小亚基 (rbcS)基因同源的cDNA片段的烟草脆裂病毒载体 (pTV rbcS)和马铃薯X病毒载体 (pgR10 7 rbcS)侵染烟草 (Nico tianabenthamiana) ,诱导内源rbcS基因沉默 ;2、分别用携带与八氢番茄红素脱氢酶 (phytoenedesat urase ,PDS)基因同源的cDNA片段的烟草脆裂病毒载体 (pTV PDS)和马铃薯X病毒载体 (pgR10 7 PDS)侵染烟草 (Nicotianabenthamiana) ,诱导内源PDS基因沉默 ;3、利用携带与绿色荧光蛋白 (GFP)同源的cDNA片段的烟草脆裂?

慢病毒载体介导半乳凝素-3-shRNA沉默基因对肿瘤细胞的影响

目的:构建干扰半乳凝素-3(Galectin-3)的重组U6慢病毒质粒,体外评价和观察内源性小RNA干扰效果及对细胞增殖和凋亡的影响.方法:根据siRNA设计原则,设计合成短发夹DNA,用于体内转录合成干扰Galectin-3编码序列的发夹RNA.连接,筛选,酶切,鉴定pGCL-GFP/U6 Gal-3shRNA-1;以含无关序列发夹结构的质粒载体为对照,感染乳腺癌细胞系,采用RT-PCR和Western Blot检测mRNA和蛋白表达水平与对照组的差别;MTT法和流式细胞检测其对细胞增殖、凋亡的干扰情况.结果:测序证实重组质粒构建成功,体外试验表明,Galectin-3的mRNA和蛋白表达均一致降低,转染组为(0.028%),阴性对照组为(0.617%),空白对照组为(0.992%),转染组mRNA干扰效率达95%(P<0.05);Galectin-3蛋白表达明显下调,与阴性对照组和空白对照组相比较,差异有统计学意义(P<0.05).MTT检测结果转染组为(0.40±3.69)%,阴性对照组(0.71±0.16)%;转染组和阴性对照组间差异均有统计学意义(P<0.05).细胞凋亡百分率为68.78%.结论:慢病毒介导的Galectin-3-shRNA成功在体外敲减了肿瘤细胞的目的蛋白,影响了肿瘤的发生与发展.

沉默抑制子CMV 2b基因的克隆及其反向重复植物表达载体的构建

从安徽亳州采集表现明显CMV症状的烟草样本,取ELISA检测阳性反应最强的样本提取总RNA。设计特异性引物扩增CMV RNA2部分片段,克隆并测序。其中包含的2b基因全长336个核苷酸,编码111个氨基酸。将来源于安徽烟草的CMV 2b基因与其它CMV 2b基因进行序列比对,结果表明,来源于安徽烟草的CMV2b基因与来源于韩国的2b基因AF033667的核苷酸序列相似性最高,达98.8%。构建2b基因系统关系树,也表明来源于安徽烟草的CMV 2b基因与AF033667亲缘关系最近。以安徽CMV 2b为模板,分别扩增大小约为300 bp的正向片段CMV 2b(r)和反向片段CMV 2b(i)。先后将反向片段CMV 2b(i)和正向片段CMV 2b(r)分别插入载体pSK-In所含intron两侧,获得重组质粒pSK-2b(r)-In-2b(i)。再将含intron的正反向片段插入pBIN438,最终得到含CMV 2b部分序列反向重复的植物表达载体pBIN-2b(r)-In-2b(i)。

白菜雄性不育相关基因BcMF3和BcMF4的A9启动子的基因沉默植物表达载体的构建

以白菜(Brassica campestris ssp.chinensis,syn.B.rapa ssp.chinensis)雄性不育相关基因BcMF3和BcMF4为沉默对象,利用绒毡层组织特异性的A9启动子,构建了反义RNA、RNA干涉和双价反义RNA植物表达载体。结果表明,经过一系列分子操作,获得了A9启动子和目的基因片段,并利用它们构建了5个基因沉默植物表达载体,可用于基因功能验证。

WRKY33转录因子基因沉默载体的构建

参照拟南芥WRKY33转录因子基因序列设计引物,利用RT-PCR技术从大白菜中克隆了WRKY33基因编码区460bp的序列,利用双链RNA介导的基因沉默技术,构建WRKY33基因沉默植物表达载体,为进一步研究该基因在植物与软腐病菌互作中的功能及其作用机制奠定基础。首先将WRKY基因片段连接至pUCm-T载体上,用PstⅠ/BamHⅠ和PstⅠ/XhoⅠ分别对pUCm-WRKY载体进行酶切,得到2个WRKY基因片段;先后将其连接到pBSSK-in载体上,构建成pBSSK-WRKY-in-WRKY载体,该载体中的2个WRKY片段大小一致,反向重复;并用SacⅠ/KpnⅠ酶切pBSSK-WRKY-in-WRKY载体得到WRKY-intron-WRKY片段,连入表达载体pCAMBIA1301中,构建成该基因的沉默植物表达载体。

人鼠共打靶ERβ特异性基因沉默载体的构建和鉴定

目的:构建人和鼠共打靶特异性ERβ基因沉默慢病毒载体。方法:检索人和小鼠ERβ基因转录本及其序列,应用SiRNA Target Finder软件设计人和小鼠共打靶ERβ基因沉默siRNA和阴性对照siRNA,合成发夹状双链shRNA,与线性化质粒PLL3.7连接构建为重组质粒(ERβ-shRNA-PLL3.7和阴性对照质粒ER-N-shRNA-PLL3.7),经鉴定后,转染人成骨肉瘤细胞MG63和小鼠成骨细胞株MC3T3-E1,经Realtime-PCR和western blot法检测重组质粒对目的基因沉默效果。应用SPSS16.0软件统计分析,检验水准为α=0.05。结果:经测序证明重组质粒中含有目的shRNA序列。分别转染小鼠成骨细胞株MC3T3-E1和人成骨肉瘤细胞MG63细胞后,无论Realtime-PCR检测ERβ基因表达,还是western blot法检测蛋白表达,均较空白对照组或阴性对照组显著降低,差异有显著性,P<0.05。结论:成功构建了人和小鼠共同高效打靶的ERβ基因沉默慢病毒载体质粒,并包装成假病毒颗粒,为利用小鼠作为动物模型研究人基因功能或开发基因药物奠定了基础。

Robo1 RNA干扰慢病毒载体的构建及其基因沉默效应

目的构建Roundabout(Robo1)siRNA慢病毒载体,并在SKOV3卵巢癌细胞中鉴定其转染及基因沉默效果。方法根据GenBank中基因信息,采用干扰序列设计软件设计靶点,制备Robo1DNA片段,在T4DNA连接酶作用下,将线性化的病毒载体GV118与DNA片段制备合成GV118-siRNA目的质粒,转化感受态细胞,对于长出的克隆应用菌落PCR鉴定,再对PCR鉴定阳性的克隆进行测序和对比分析,重组病毒质粒与另外2种辅助包装原件载体质粒通过LipofectamineTM2000共转染293T细胞,培养48h后,收集细胞培养上清液,将病毒浓缩后在293T细胞中测定病毒滴度;并检测病毒载体在工具细胞SKOV3卵巢癌细胞中的转染效率,实时荧光定量PCR(RT-PCR)和Western blot方法检测Robo1siRNA慢病毒对SKOV3中Robo1的干扰作用。结果成功构建Robo1siRNA慢病毒载体GV118-siR-NA,病毒滴度为2×109 TU/mL;用该病毒体外转染SKOV3卵巢癌细胞,当感染复数(MOI)为10时,感染效率大于90%;RT-PCR和Western blot方法检测Robo1基因沉默的效率分别为76.7%、56.0%。结论成功构建了Robo1siR-NA慢病毒载体GV118-siRNA,该病毒载体在体外转染SKOV3卵巢癌细胞的效率较高,且具有显著的基因沉默效果。

启动子上的增强子和CpG岛在转基因沉默和位置效应中的作用

目的探讨哺乳动物细胞表达载体启动子上增强子和CpG岛调控元件在转基因沉默和位置效应中的作用。方法应用带增强子的八聚体结合转录因子4(OCT4)基因启动子、带CpG岛的性别决定区Y框蛋白2(SOX2)基因启动子、带增强子和CpG岛的巨细胞病毒(CMV)基因启动子以及不含近端增强子和CpG岛的NANOG基因启动子构建哺乳动物细胞表达载体,并分别转染中国仓鼠卵巢细胞株CHO-K1细胞和人胚胎肾细胞(HEK293)。应用Image J软件中Mean算法计算OCT4、SOX2、CMV和NANOG基因启动子在CHO-K1细胞和HEK293细胞介导的增强绿色荧光蛋白(EGFP)表达的荧光强度,应用Image J软件中Mininum、Maxentropy、Mean 3种算法分别计算OCT4、SOX2、CMV和NANOG基因启动子4种载体稳定转染CHO-K1细胞后形成的多个单细胞克隆混合生长样品在同一个样本中最大荧光强度的细胞、大于平均荧光强度的所有细胞和最小荧光强度的所有细胞的EGFP平均荧光强度;应用有限稀释法从G418筛选后获得的稳定转染的多个单克隆混合的CHO-K1细胞中,分别筛选含EGFP的pE-C1、pE-Oct4、pE-Sox2、pE-Nanog质粒稳定转染CHO-K1细胞的单克隆细胞,每个质粒载体随机筛选3个单克隆细胞,应用Image J软件分析EGFP平均荧光强度;应用酶联免疫吸附法检测转染第20、30天CHO-K1细胞中EGFP蛋白表达水平,应用实时荧光定量聚合酶链式反应法检测转染第20、30天CHO-K1细胞中EGFP mRNA表达水平。结果SOX2基因启动子在CHO-K1细胞和HEK293细胞中介导表达的EGFP平均荧光强度比较差异无统计学意义(t=0.770,P>0.05)。OCT4、CMV、NANOG基因启动子在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP平均荧光强度显著高于HEK293细胞(t=7.000、11.100、4.900,P<0.05)。SOX2基因启动子于转染第20、30天在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP蛋白水平比较差异无统计学意义(t=0.330,P>0.05)。CMV基因启动子于转染第20天在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP蛋白水平显著低于转染第30天(t=3.770,P<0.05);OCT4基因启动子于转染第20、30天在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP蛋白水平比较差异无统计学意义(t=2.500,P>0.05);NANOG基因启动子于转染第20、30天在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP蛋白表达水平比较差异无统计学意义(t=0.014,P>0.05)。转染第20天与转染第30天SOX2、CMV、NANOG基因启动子在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP平均荧光强度值比较差异均无统计学意义(t=0.130、0.830、0.210,P>0.05);转染第30天,OCT4基因启动子在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP平均荧光强度值显著低于转染第20天(t=5.750,P<0.05)。SOX2、CMV、OCT4、NANOG基因启动子在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP蛋白水平比较差异无统计学意义(F=4.070,P>0.05)。CMV、OCT4、NANOG基因启动子在CHO-K1细胞中介导的EGFP mRNA相对表达量显著高于SOX2基因启动子(t=5.440、5.000、5.740,P<0.05);CMV、OCT4基因启动子在CHO-K1细胞中介导的EGFP mRNA相对表达量显著高于NANOG基因启动子(t=3.220、4.270,P<0.05);CMV基因启动子在CHO-K1细胞中介导的EGFP mRNA相对表达量高于OCT4基因启动子,但差异无统计学意义(t=1.270,P>0.05)。SOX2基因启动子介导表达的EGFP在转录水平和转录后水平差异最大(t=16.900,P<0.05);NANOG基因启动子介导表达的EGFP在转录水平和转录后水平差异次之(t=14.930,P<0.05);OCT4和CMV基因启动子介导表达的EGFP在转录水平和转录后水平差异最小(t=2.060、0.430,P>0.05)。应用Mininum、Maxentropy、Mean 3种算法计算OCT4基因启动子在多克隆下介导表达的EGFP的荧光强度比较差异无统计学意义(F=3.720,P>0.05),SOX2、CMV和NANOG基因启动子在多克隆下介导EGFP表达的荧光强度比较差异均有统计学意义(F=516.400、428.500、28.120,P<0.05)。不同单克隆细胞中的差异分析显示,4种载体在不同单克隆细胞中介导表达的EGFP荧光强度值的标准误差相比,从高到低依次为NANOG基因启动子在不同单克隆细胞中介导表达的EGFP荧光强度值标准误差、SOX2基因启动子在不同单克隆细胞中介导表达的EGFP荧光强度值标准误差、OCT4基因启动子在不同单克隆细胞中介导表达的EGFP荧光强度值标准误差、CMV基因启动子在不同单克隆细胞中介导表达的EGFP荧光强度值标准误差,且OCT4基因启动子与SOX2、CMV基因启动子在单克隆细胞中介导表达的EGFP平均荧光强度比较差异有统计学意义(t=3.070、4.360,P<0.05)。结论带CpG岛的启动子能在转录后克服转基因沉默效应,带增强子的启动子具有克服位置效应的作用;二者的恰当组合可用于设计在哺乳动物细胞中高效稳定表达的启动子。

Noggin基因沉默表达载体的构建及效果评价

目的构建慢病毒介导的Noggin RNAi干扰序列,并分析这些干扰序列对Noggin基因的沉默效果。方法针对目的基因Noggin的m RNA设计四条干扰序列,并将这些序列连接到Lenti-KD慢病毒载体,将重组质粒瞬时转染HEK-293T包装细胞,获得重组慢病毒。将重组病毒感染MC3T3-E1细胞,利用puromycin进行筛选,获得稳定表达细胞系。通过实时荧光定量PCR和Western blot技术分析不同干扰序列的干扰效果。结果实时荧光定量PCR结果显示,四种干扰序列对Noggin基因的表达都有一定的沉默效果,但只有sh Noggin-1(P<0.01)对其表达影响显著。Western blot结果显示,四种干扰序列中只有sh Noggin-1(P<0.01)对Noggin的表达蛋白具有显著的降低作用。结论获得了一种Noggin基因的干扰序列,该序列能够干扰Noggin基因m RNA的稳定性,从而影响蛋白的表达。该干扰序列可以用于部分敲除Noggin基因,从而用于研究Noggin基因的功能。