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题名基于基因簇判别的人类miRNA功能预测研究
被引量:3
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作者
丁涛
高洁
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机构
江南大学理学院
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出处
《中国细胞生物学学报》
CAS
CSCD
2016年第12期1467-1472,共6页
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基金
国家自然科学基金(批准号:11271163)
江苏省研究生科研创新计划项目(批准号:KYZZ16_0309)资助的课题~~
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文摘
随着新一代测序技术的不断发展,面对海量的序列数据,如果仅靠生物实验的方法来挖掘微RNA(microRNA,miRNA)的基因功能似乎不可能,因此,通过判别新miRNA家族归属来预测其相关生物学功能为实际生物实验的研究开辟新的思路。该文运用基因簇判别方法,基于原始家族信息,对未确定家族归属或新发现的miRNA进行判别,确定其基因家族。研究发现,同一家族的成熟体miRNA成员序列之间存在高度相似性,并且参与相同的调控通路或作用于相同的靶基因,具有相似的生物学功能。因此,通过基因簇判别预测新miRNA家族归属,对新miRNA的基因表达实验与验证具有十分重要的指导意义。
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关键词
MIRNA
miRNA家族
基因簇判别
K-折交叉验证
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Keywords
miRNA
family classification
gene cluster discriminant analysis
K-fold cross-validation
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分类号
Q522
[生物学—生物化学]
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