RFLP揭示的籼粳基因组多态性

目的揭示籼粳基因组的多态性。方法选用分布于水稻12条染色体上的RFLP对多个水稻品种进行分析,结合生物信息学方法分析这些籼粳特异性标记的籼粳特异性及其序列分子的生物学基础。结果筛选到28个RFLP籼粳特异性探针,籼粳特异性标记的生物信息学分析表明,这些标记在基因组水平上存在差异。结论这些标记能对水稻品种进行籼粳稻分子分类。水稻基因组序列图的完成和释放,使得这些籼粳特异性标记揭示的基因组多态性可以在基因组序列水平上进行分析和验证。

空间搭载水稻种子后代基因组多态性及其与空间重离子辐射关系的探讨

神舟三号飞船搭载带核径迹辐射探测器的水稻种子装置,回收后应用随机扩增多态性DNA(randomamplified polymorphic DNA,RAPD)技术,分析了201粒升空种子长出植株的基因组多态性。在检测的189个基因座位范围内,30.2%的植株中发现与地面对照不同的扩增带,单株的多态性座位数为1￣25。特异扩增带的测序及单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)分析进一步证明了空间搭载水稻种子确实可导致当代植株基因组发生变异。同一技术分析个别种子连续世代的基因组多态性,结果显示,当代的部分多态性可遗传至后代。7粒受空间高原子序数、高能粒子轰击的种子,在当代植株均显示不同程度的基因组多态性,从胚受粒子击中的3粒种子后代中,筛选出农艺性状明显变异的突变株系,初步暗示了空间高能重离子辐射对诱导基因组的多态性,乃至遗传性表型变异的有效性。

AFLP-银染法检测植物基因组多态性

本文采用银染法代替同位素标记法,分别对玉米、菜花、番茄进行了AFLP分析。结果表明用银染法同样可得到清晰的AFLP指纹图谱,而且银染法具有无放射性,操作简便,实验成本低,实验周期短的优点。

真核生物基因组多态性分析的DNA指纹技术

真核生物的基因组大且复杂，广泛分布着各种形式的重复序列，由于它们不编码肽链，很少受到自然选择和人工选择作用的影响而保持着高度的多态性［１］。此外，ＤＮＡ分子还以一定的频率发生着各种变异，如个别碱基的突变，序列的缺失，插入或重排，所有这些导致了ＤＮＡ组...

原发性肾病综合征患者红细胞CR1密度相关基因组多态性与临床疗效的相关性分析

目的:探讨原发性肾病综合征(PNS)患者红细胞CR1密度相关基因组多态性及数量表达、黏附活性与临床疗效的关系。方法:测定45例PNS患者的红细胞CR1密度相关基因及数量表达与黏附活性,采用黄芪护肾汤配合标准激素疗程进行治疗。结果:45例PNS患者红细胞CR1密度相关基因高表达26例,中表达13例,低表达6例。高表达的数量表达和黏附活性高于中表达,中表达的数量表达和黏附活性高于低表达,比较有显著差异(P<0.05)。治疗后完全缓解20例,部分缓解15例,无效6例,复发4例。26例高表达患者主要分布在完全缓解和部分缓解组,13例中表达患者分布在完全缓解、部分缓解、无效和复发组,6例低表达患者分布在部分缓解、无效和复发组。结论:PNS患者红细胞CR1密度相关基因的表达与免疫分子数量表达及黏附活性成正相关,红细胞CR1密度相关基因组多态性与临床疗效存在密切关系。

中华民族基因组多态性数据库的构建(英文)

为配合总体的实验研究构建了中华民族基因组多态性 (GenomicPolymorphismofChineseEthnicGroups ,简称GPCEG)数据库 ,现已初步建成包括民族名称、基本情况介绍、体态特征、基因多态性数据、永生细胞株系、参考文献、国际相关数据库连接等内容的数据库 ,并完成了其可视化浏览及查询系统的建立 ,为建成具有中国特色的国家自有数据库奠定了基础 。

自发性高血压大鼠的基因组多态性

目的:应用随机扩增多态DNA聚合酶链反应(RAPD-PCR)技术分析自发性高血压大鼠(SHR)的基因组多态性。方法:运用100条引物对WKY和SHR的DNA进行RAPD-PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳观察。结果:与WKY相比,100条引物中有13条引物出现基因组多态性,SHR扩增产物的电泳条带出现增加、丢失、移位和密度改变,其它87条引物扩增结果无明显改变。结论:SHR存在基因组多态性,RAPD-PCR方法可用于检测SHR的基因组多态性。

肿瘤坏死因子基因组多态性在脓毒症发病中的作用

目的 探讨肿瘤坏死因子 (TNF)及内毒素受体 (CD14 )基因组上单个核苷酸多态性(SNP)的频率、基因型与外科感染病人脓毒症发病的关系 ,观察SNP对在体单个核细胞 (PBMC)内TNF αmRNA表达的影响。方法 选择 113例外科感染的患者 ,10 0例正常人群为对照组 ,对TNF基因上 3个位点及CD14基因 1个位点进行PCR扩增、限制性内切酶酶切分析SNP基因型。患者分全身炎症反应综合征 (SIRS)组和脓毒症组 ,对各SNP基因型的频率进行分析。在出现脓毒症临床表现 2 4h内 ,对PBMC内TNF αmRNA表达水平进行测定。结果 TNF基因组上的 3个SNP均可影响在体PBMC内TNF αmRNA的表达。CD14基因组 - 15 9位点C→T、TNF基因组上 - 30 8位点G→A、- 86 3C→A 3个SNP与脓毒症的发生有相关性 (P <0 .0 5 )。结论 TNF基因组上的SNP通过影响TNF αmRNA的表达而影响机体对感染的反应性 ,产生SIRS甚至脓毒症等临床表现。

工业用产黄青霉菌基因组的RAPD多态性研究

为寻找高产菌株的分子标记,尝试利用RAPD(random amplified polymorphic DNA)技术,对青霉素生产菌株进行基因组多态性分析,分别以9株不同产量的产黄青霉菌基因组DNA为模版,筛选引物23条,并且对一条高产菌株特异条带进行了克隆与杂交验证.

茭白品种间基因组ISSR多态性分析

对浙江、湖北、江苏等省3个野生茭白材料17个不同品种的茭白种质资源进行了收集,利用ISSR方法对茭白植株进行了基因组多态性分析.结果表明,野生茭白与栽培茭白品种间具有明显的多态性,不同来源的栽培茭白品种间也具有一定的多态性,多态性比例分布在12%-25%之间.利用DPS软件对茭白植株的多态性位点进行的系统聚类分析发现,野生茭白与栽培茭白间距离较远,茭白地域分布及栽培特性与种质资源多样性相关。

我国旋毛虫地理株基因组DNA多态性的RAPD分析

以旋毛虫(Trichinella spiralis,T1)、乡土旋毛虫(T.nativa,T2)、布氏旋毛虫(T.britovi,T3)、伪旋毛虫(T.pseudospiralis,T4)、纳氏旋毛虫(T.nelsoni,T7)的国际参考株作为对照,应用随机扩增多态性DNA技术对我国7个旋毛虫地理株(河南、湖北、云南、陕西西安、天津、黑龙江同江及哈尔滨株)基因组DNA进行了PCR扩增,根据扩增产物的电泳条带进行MEGA分析,计算遗传距离并构建进化树。结果显示,T1与我国7个旋毛虫地理株之间的遗传距离均小于0.365 9,其中哈尔滨株与云南株、河南株与西安株的遗传距离小于0.166 7,其遗传相似性分别为83.33%与86.35%;天津株与哈尔滨株及云南株的遗传距离小于0.250 0;同江株与其他6个地理株的遗传距离均大于0.284 1,与T1的遗传距离小于0.263 3;湖北株与其他6个地理株及T1的遗传距离大于0.301 3。T2、T3、T4、T7与我国7个地理株之间的遗传距离均大于0.589 8。我国7个旋毛虫地理株均为T1,其中哈尔滨株、云南株及天津株归为一类,河南株与西安株归为一类,同江株与湖北株各单独归为一类。

广西右江流域壮、汉族正常人群红细胞CR1基因组密度多态性研究

目的探讨广西右江流域壮、汉族正常人群红细胞CR1基因组密度多态性分布及CR1数量的变化。方法采用PCR和HindⅢ酶切技术（RFLP）测定壮、汉族正常人群红细胞CR1基因组密度多态性分布。结果壮族人群组HH型占36．67％（55／120），HL型占30．00％（45／120），LL型占33．33％（50／120）；汉族人群组HH型占55％（55／100），HL型占40％（40／100），LL型占5％（5．00％），壮、汉族人群LL型分布比较差异有显著性（P〈0．01）。结论壮族人群红细胞CR1基因LL型比汉族人群高。存在明显的种族差异．提示右江流域β-地中海贫血的高发可能与壮族人群高比率的LL型有关。

喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地及其鼠疫菌基因组多态性

喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地分布在我国青海、四川、西藏、甘肃和新疆5个省份，面积超过69万km。，约占我国活跃鼠疫疫源地面积的50％。有研究表明，青藏高原地区菌株的遗传多样性非常广泛，鼠疫菌的最古老分支也分离于该地区，

正常人红细胞CR1密度相关基因组多态性分布分析

采用PCR和Hind Ⅲ酶切技术研究了正常人红细胞CR1密度相关基因组多态性,发现在189例中国正常人群中,红细胞CR1密度相关基因HH型比率是79％,HL型比率是18％,LL型比率是3％。在30岁以上成年人中,64例男性的HH型（85.9％）明显高于63例女性HH型比率（68.2％,P<0.01）。在94例女性组中,60岁以上人群的HH型比率是62％与10～19岁女性人群的HH型比率94％相比有显著差异（P<0.05）。这些结果表明老年人红细胞CR1密度相关基因多态性与性别相关。

基于全基因组多态性的安农S-1与株1S亲缘关系分析

在两系法杂交水稻育种中,温敏核不育系具有重要作用。常用的温敏核不育系大多来源于TMS5基因编码区第71至72个碱基发生GC→TA或TC→TA的变异。本研究利用全基因组测序手段,结合生物信息学,分析了安农S-1及其衍生系准S,以及株1S及其衍生系华煜4127S在全基因组及tms5功能区域内的多态性,验证了这4个温敏核不育系的亲缘关系。

3种鲍基因组DNA多态性的RAPD分析

利用随机扩增多态DNA技术检测了中间鲍Haliotismidae、皱纹盘鲍Haliotisdiscushannai和九孔鲍Haliotisdiversicolorsupertexte3种鲍基因组DNA的多态性,初步进行了分子水平上的分类研究。经24个随机引物扩增,共得到376条多态性片段,片段长度为250～2500bp。根据片段的共享度计算出平均遗传距离指数,并采用UPGMA和NJ两种聚类分析方法进行处理得到系统树。在UP GMA聚类中,中间鲍与九孔鲍先聚在一起,有较近的亲缘关系,其次是皱纹盘鲍,而它们之间的遗传距离相差不大,NJ聚类图上就反映出3种鲍聚为3类,所以两种聚类分析结果基本一致,与它们形态上存在明显差异的结果基本吻合,说明RAPD技术可以作为鲍种质鉴定和分类的一种有效、简便的辅助手段。