以下一代测序性基因组拷贝数分析技术的诊断方式对高龄孕妇产前诊断价值的分析

目的研究以下一代测序(NGS)性基因组拷贝数分析(CNV-seq)技术的诊断方式对高龄孕妇产前诊断价值。方法纳入从2017年4月~2017年12月,于我院产前诊断中心因高龄接受羊水CNV-seq检测的样本1600例作为研究对象。分析所有羊水样本的CNV-seq检测结果。结果 35~39岁孕妇bCNVs、pCNVs检出率略高于≥40岁孕妇;而非整倍体、致病性染色体异常检出率略低于≥40岁孕妇,但差异无统计学意义(均P>0.05)。18例pCNVs样本中11例为染色体微缺失/微重复综合征,7例为其他pCNVs;变异来源新发、父亲、母亲占比分别为38.89%、11.11%、27.78%。18例pCNVs样本孕妇继续妊娠人数11例,占比61.11%,终止妊娠人数7例,占比38.89%。5例染色体嵌合体样本的CNV-seq检测结果显示均无异常,其中1例样本经QF-PCR以及荧光原位杂交检测提示为三倍体。结论 CNV-seq可作为一种有效染色体拷贝数变异检测方式,且具有分辨率较高、准确性较高以及成本相对低廉的优势,值得临床推广应用。

低深度全基因组测序拷贝数变异分析技术在性发育异常患儿诊断中的应用价值

目的探讨低深度全基因组测序拷贝数变异分析(CNV-seq)技术在性发育异常(DSD)患儿诊断中的应用价值。方法纳入2019年10月至2020年10月至郑州大学第一附属医院就诊的5例身材矮小或外阴发育异常的DSD患儿。在外周血染色体核型分析、全外显子组测序(WES)、SRY基因检测的基础上,进行CNV-seq检测以明确病因。结果患儿1和2的社会性别为女性,染色体核型均为46,XY,WES结果为阴性,CNV-seq结果分别为46,XY,+Y(1.4)和46,XY,-Y(0.75)。其余3例患儿均携带可疑的Y染色体,综合分析发现其核型分别为45,X[60]/46,X,del(Y)(q11.221)[40]、45,X,16qh+[76]/46,X,del(Y)(q11.222),16qh+[24]和45,X[75]/46,XY[25]。结论联合运用CNV-seq等分子遗传学技术明确了46,XY DSD患儿的Y染色体拷贝数变异及45,X/46,XY DSD患儿可疑Y染色体的性质,为其临床诊疗提供了重要的依据。

颅底良性脊索肿瘤恶变临床病理与分子遗传学特征分析

目的探讨良性脊索肿瘤(benign notochordal cell tumour,BNCT)恶变及特定的分子生物学指标在肿瘤发生、发展中的作用。方法回顾性分析1例颅底BNCT恶变的临床病理学、影像学及免疫表型特征,将组织学形态为BNCT的第1次手术标本及组织学形态为经典型脊索瘤的第3次手术标本分别进行OncoScan全基因组拷贝数分析。结果BNCT恶变后出现3号和9号染色体的部分缺失,可导致相应片段的相关基因缺失,如SETD2、BAP1、PBRM1、FHIT、MITF、CDKN2A、CDKN2B等。这些基因中有重要的抑癌基因,一些基因可维持基因组的稳定,促进DNA修复。结论3号和9号染色体的缺失可能是肿瘤恶变的关键片段,是脊索瘤发生的早期事件。

罕见Y染色体重排致性发育异常患者1例的遗传学分析

目的探讨1例罕见的Y染色体重排致性发育异常(DSD)患者的遗传学病因。方法选取2018年5月2日因"身材矮小,第二性征发育不良"就诊于郑州大学第一附属医院的1例性发育异常女性患儿作为研究对象,收集患儿的临床资料。联合应用染色体G显带核型分析、SRY基因检测、全外显子测序(WES)、低深度全基因组测序拷贝数变异分析技术(CNV-seq)、荧光原位杂交技术(FISH)、全基因组测序(WGS)对患者进行遗传学检测。患儿遗传学特征明确后,给予相应治疗。结果患儿年龄为14岁,社会性别为女性,身材矮小,毛发旺盛,皮肤粗糙。外周血染色体核型为46,XY,且携带SRY基因。WES未检测到相关基因的致病性变异,但发现Yp11.32q12处存在59.37Mb重复。CNV-seq结果为47,XYY,外周血FISH结果提示患者为双着丝粒Y染色体嵌合体携带者,WGS发现Yp11.32q11.223存在大小为23.66 Mb的重复,同时Yq11.223q11.23存在约5.16 Mb的缺失,断裂点位于chrY:23656267。综合分析,患者的染色体核型应为46,X,psu idic(Y)(q11.223)[87]/46,X,del(Y)(q11.223)[13]。手术探查结果示性腺器官为卵巢组织,激素替代治疗后患儿有月经来潮,第二性征发育良好。结论联合多种遗传学检测明确了患儿的遗传学病因,为患儿的诊断及治疗提供了帮助。

46,XY,der(18)pat伴发育迟滞1例

报告收治1例9月龄患儿,发育迟滞,肌张力异常,智力轻度缺陷,通过外周血染色体核型分析和低测序深度基因组拷贝数变异分析(copy number variation sequencing,CNV-seq)对其病因进行深入的遗传学检测和分析,CNV-seq结果显示患儿在2号染色体q32.3-q36.3处重复31.90Mb,根据ACMG评级为致病性;患儿及其父亲外周血染色体核型分别为46,XY,der(18)t(2;18)(q32;p11.2)pat和46,XY,t(2;18)(q32;p11.2),说明患儿是染色体非平衡易位携带者,遗传了源自父亲染色体不平衡的配子,这是导致患儿发病的遗传学病因,患儿父亲再次生育时需要进行产前诊断。外周血染色体核型分析联合CNV-seq检测不仅可以发现患者染色体上不明来源的变异,还可以确定变异来源。