水稻黑条矮缩病毒基因组片段6编码一种非结构蛋白

水稻黑条矮缩病毒（Rice black-streaked dwarf virus，RBSDV）是引起我国水稻黑条矮缩病和玉米粗缩病的病原。引起玉米粗缩病的RBSDV湖北分离物10条基因组dsRNA全序列已被确定，其中基因组片段6（S6）全长序列为2645bp，只含有一个阅码框（82—2460nt），编码一个分子量约为89．6kDa的蛋白（P6）。为进一步研究该蛋白的生物学功能，在大肠杆菌中表达了RBSDV基因组片段6编码的P6蛋白并制备了相应的抗血清。Western blotting分析显示，P6抗血清不与纯化的RBSDV粒子蛋白发生反应，而在被RBSDV感染的玉米叶片和带毒的传播介体——灰飞虱中可检测到P6。此结果表明，RBSDV—S6编码的蛋白是一种非结构蛋白。

水稻瘤矮病毒基因组第6片段(S6)序列测定与分析

【目的】了解水稻瘤矮病毒(RGDV)基因组结构与功能。【方法】根据已报道的RGDV基因组各片段末端序列及其反向重复特性,采用4轮RT-PCR的方法扩增RGDV基因组第6片段(S6),用生物学软件进行序列分析。【结果】得到了该病毒S6的全序列。S6全长1651bp,G+C含量39.13%,包含一个长的ORF,起始于第25位,终止于第1497位,编码490个氨基酸,分子量为53.3kD。【结论】该蛋白与伤瘤病毒(WTV)的P7的相似性为30.0%,与水稻矮缩病毒(RDV)的P7的相似性为31.7%。这是RGDVS6全序列的首次报道。