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应用RAPD特异标记分析拟鹅观草属部分物种的基因组组成
1
作者
丁春邦
周永红
+2 位作者
杨瑞武
张利
郑有良
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期249-253,共5页
选用小麦族中8个基本基因组(E、H、I、P、St、W、Ns、R)的特异RAPD引物进行PCR扩增检测,分析Pseudoroegneriagracillima、P.kosaninii、Roegneriaalashanica和R.magnicaespes这4个四倍体物种的基因组组成。结果表明:P.gracillima、P.kos...
选用小麦族中8个基本基因组(E、H、I、P、St、W、Ns、R)的特异RAPD引物进行PCR扩增检测,分析Pseudoroegneriagracillima、P.kosaninii、Roegneriaalashanica和R.magnicaespes这4个四倍体物种的基因组组成。结果表明:P.gracillima、P.kosaninii、R.alashanica和R.magnicaespes中除了含有St或经修饰的St基因组外,都不含E、H、I、P、W、Ns和R基因组,由此推断P.gracillima和P.kosaninii至少含有一个St或经修饰的St基因组,另一个基因组是否为Y基因组,需要进一步研究证实。结合前人细胞遗传学研究的结果,推断R.alashanica和R.magnicaespes为同源四倍体或部分同源四倍体,其基因组组成为StStStSt或St1St1St2St2。因此,结合外部形态特征以及前人细胞遗传学、分子标记研究和核型分析的结果,推断R.alashanica和R.magnicaespes与P.elytrigioides一样,也可能是在中国分布的四倍体拟鹅观草属物种,为系统整理和研究国产拟鹅观草属物种及其地理分布提供了DNA分子水平上的资料。
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关键词
拟鹅观草属
RAPD
基因组
特异标记
基因组组成
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职称材料
绿鲍(Haliotis fulgens)线粒体基因组全序列测定及分析
2
作者
郭睿
张善霹
+6 位作者
蔡雷鸣
杨小强
王伟
江小斌
林钦
林枫
林哲龙
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期64-78,共15页
为高效鉴别鲍属物种和更好地管理和保护鲍种质资源,本研究通过高通量测序获得了养殖绿鲍(Haliotis fulgens)稚贝的线粒体基因组全序列,并对其序列和结构特征进行分析。结果表明,绿鲍线粒体基因组全长17 041 bp,含有37个编码基因,其中蛋...
为高效鉴别鲍属物种和更好地管理和保护鲍种质资源,本研究通过高通量测序获得了养殖绿鲍(Haliotis fulgens)稚贝的线粒体基因组全序列,并对其序列和结构特征进行分析。结果表明,绿鲍线粒体基因组全长17 041 bp,含有37个编码基因,其中蛋白质编码基因13个、t RNA基因22个、r RNA基因2个。13个蛋白质编码基因均以AUG为起始密码子,以UAG或UAA为终止密码子。除t RNA-Ser^((AGN))外的21个tRNA基因可折叠成典型三叶草结构。分析发现t RNA-Glu和COX3间存在富含A+T的非编码区,其内含有2个带回文序列的发卡结构。基于已报道的10个鲍属线粒体基因组全序列构建系统发育树,发现绿鲍与皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)、红鲍(Haliotis rufescens)、黑鲍(Haliotis cracherodii)聚为一支。将绿鲍与皱纹盘鲍13个线粒体编码蛋白的结构域比较,发现二者ND2、ND4的跨膜结构域数量存在差异,这是否与二者的高温耐受性差异有关,有待进一步研究。总之,绿鲍线粒体基因组全序列的首次获取和分析,丰富了鲍类细胞遗传信息,为分类、种质鉴定与种质资源保护提供了基础数据和参考。
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关键词
绿鲍
线粒体
基因组
基因组组成
系统发育
结构域
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职称材料
题名
应用RAPD特异标记分析拟鹅观草属部分物种的基因组组成
1
作者
丁春邦
周永红
杨瑞武
张利
郑有良
机构
四川农业大学小麦研究所
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期249-253,共5页
基金
国家自然科学基金(30270099)
四川省教育厅
科技厅资助项目。
文摘
选用小麦族中8个基本基因组(E、H、I、P、St、W、Ns、R)的特异RAPD引物进行PCR扩增检测,分析Pseudoroegneriagracillima、P.kosaninii、Roegneriaalashanica和R.magnicaespes这4个四倍体物种的基因组组成。结果表明:P.gracillima、P.kosaninii、R.alashanica和R.magnicaespes中除了含有St或经修饰的St基因组外,都不含E、H、I、P、W、Ns和R基因组,由此推断P.gracillima和P.kosaninii至少含有一个St或经修饰的St基因组,另一个基因组是否为Y基因组,需要进一步研究证实。结合前人细胞遗传学研究的结果,推断R.alashanica和R.magnicaespes为同源四倍体或部分同源四倍体,其基因组组成为StStStSt或St1St1St2St2。因此,结合外部形态特征以及前人细胞遗传学、分子标记研究和核型分析的结果,推断R.alashanica和R.magnicaespes与P.elytrigioides一样,也可能是在中国分布的四倍体拟鹅观草属物种,为系统整理和研究国产拟鹅观草属物种及其地理分布提供了DNA分子水平上的资料。
关键词
拟鹅观草属
RAPD
基因组
特异标记
基因组组成
Keywords
Pseudoroegneria
RAPD
genome-specific markers
genome constitutions
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
绿鲍(Haliotis fulgens)线粒体基因组全序列测定及分析
2
作者
郭睿
张善霹
蔡雷鸣
杨小强
王伟
江小斌
林钦
林枫
林哲龙
机构
福州海洋研究院海洋与渔业技术研究中心
福州市海洋与渔业技术中心
福建省连江县官坞海产开发有限公司
出处
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期64-78,共15页
基金
福州海洋研究院项目(2021F12)
福建省科技厅项目(2021S0010)。
文摘
为高效鉴别鲍属物种和更好地管理和保护鲍种质资源,本研究通过高通量测序获得了养殖绿鲍(Haliotis fulgens)稚贝的线粒体基因组全序列,并对其序列和结构特征进行分析。结果表明,绿鲍线粒体基因组全长17 041 bp,含有37个编码基因,其中蛋白质编码基因13个、t RNA基因22个、r RNA基因2个。13个蛋白质编码基因均以AUG为起始密码子,以UAG或UAA为终止密码子。除t RNA-Ser^((AGN))外的21个tRNA基因可折叠成典型三叶草结构。分析发现t RNA-Glu和COX3间存在富含A+T的非编码区,其内含有2个带回文序列的发卡结构。基于已报道的10个鲍属线粒体基因组全序列构建系统发育树,发现绿鲍与皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)、红鲍(Haliotis rufescens)、黑鲍(Haliotis cracherodii)聚为一支。将绿鲍与皱纹盘鲍13个线粒体编码蛋白的结构域比较,发现二者ND2、ND4的跨膜结构域数量存在差异,这是否与二者的高温耐受性差异有关,有待进一步研究。总之,绿鲍线粒体基因组全序列的首次获取和分析,丰富了鲍类细胞遗传信息,为分类、种质鉴定与种质资源保护提供了基础数据和参考。
关键词
绿鲍
线粒体
基因组
基因组组成
系统发育
结构域
Keywords
Haliotis fulgens
mitochondrial genome
genome composition
phylogeny
domain
分类号
P735 [天文地球—海洋生物学]
Q959.212 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用RAPD特异标记分析拟鹅观草属部分物种的基因组组成
丁春邦
周永红
杨瑞武
张利
郑有良
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2005
0
下载PDF
职称材料
2
绿鲍(Haliotis fulgens)线粒体基因组全序列测定及分析
郭睿
张善霹
蔡雷鸣
杨小强
王伟
江小斌
林钦
林枫
林哲龙
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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职称材料
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