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黄瓜23对高多态性SSR标记的筛选与评价
被引量:
12
1
作者
吕婧
时秋香
+2 位作者
任毅
张忠华
黄三文
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第11期2140-2148,共9页
目前在黄瓜种质研究中仍然缺乏可用的引物。利用黄瓜基因组连锁遗传图谱开发的995对备选SSR引物,挑出在7条染色体上均匀分布且能扩增出清晰稳定单一条带的多态性引物23对,并利用这些引物对黄瓜种质遗传多样性进行了探讨。通过来自不同...
目前在黄瓜种质研究中仍然缺乏可用的引物。利用黄瓜基因组连锁遗传图谱开发的995对备选SSR引物,挑出在7条染色体上均匀分布且能扩增出清晰稳定单一条带的多态性引物23对,并利用这些引物对黄瓜种质遗传多样性进行了探讨。通过来自不同国家和地区的30份代表性黄瓜种质资源进行SSR扩增分析,从中能够得到153条多态性条带。不同引物分析得到的种质遗传多样性差异较大,供试种质间平均期望杂合度为0.57,平均PIC值(多态性信息量)为0.60。23对引物可以清晰检测出亚洲、欧美和印度群体遗传多样性,较客观地反映了群体结构和地域性差异等信息。
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关键词
黄瓜
基因组连锁遗传图谱
SSR标记
种质
遗传
多样性
原文传递
题名
黄瓜23对高多态性SSR标记的筛选与评价
被引量:
12
1
作者
吕婧
时秋香
任毅
张忠华
黄三文
机构
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第11期2140-2148,共9页
基金
农业部‘948’项目(2008-Z42)
国家自然科学基金项目(30972011)
国家‘863’计划项目(2010AA10A108)
文摘
目前在黄瓜种质研究中仍然缺乏可用的引物。利用黄瓜基因组连锁遗传图谱开发的995对备选SSR引物,挑出在7条染色体上均匀分布且能扩增出清晰稳定单一条带的多态性引物23对,并利用这些引物对黄瓜种质遗传多样性进行了探讨。通过来自不同国家和地区的30份代表性黄瓜种质资源进行SSR扩增分析,从中能够得到153条多态性条带。不同引物分析得到的种质遗传多样性差异较大,供试种质间平均期望杂合度为0.57,平均PIC值(多态性信息量)为0.60。23对引物可以清晰检测出亚洲、欧美和印度群体遗传多样性,较客观地反映了群体结构和地域性差异等信息。
关键词
黄瓜
基因组连锁遗传图谱
SSR标记
种质
遗传
多样性
Keywords
cucumber
genome linkage map
SSR marker
germplasm genetic diversity
分类号
S642.2 [农业科学—蔬菜学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
黄瓜23对高多态性SSR标记的筛选与评价
吕婧
时秋香
任毅
张忠华
黄三文
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
12
原文传递
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参考文献
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