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菖蒲芋螺不同大小基因组DNA片段的分离制备 被引量:1
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作者 丁青 刘月鹏 +3 位作者 朱晓鹏 吴科榜 罗素兰 长孙东亭 《热带生物学报》 2017年第3期267-276,共10页
使用常规酚/氯仿抽提法(CTAB法)、离心柱法和磁珠吸附法,分别从菖蒲芋螺毒腺、肌肉及肝胰脏中提取基因组DNA,利用普通琼脂糖凝胶电泳与脉冲场电泳(PFGE)对基因组DNA片段进行分离,并检测提取DNA的大小和分布范围,同时,对脉冲场电泳条件... 使用常规酚/氯仿抽提法(CTAB法)、离心柱法和磁珠吸附法,分别从菖蒲芋螺毒腺、肌肉及肝胰脏中提取基因组DNA,利用普通琼脂糖凝胶电泳与脉冲场电泳(PFGE)对基因组DNA片段进行分离,并检测提取DNA的大小和分布范围,同时,对脉冲场电泳条件进行了优化。结果表明,3种方法均可提取基因组DNA,其中CTAB法和离心柱法提取的毒腺DNA纯度高,产率大,可用于后续实验,而磁珠法产率适中且纯度不高,但离心柱法的DNA片段较小,大多在9 kb以下,而CTAB法提取的DNA片段较大,获得的20 kb以上的大片段量较多,更适合于大片段基因组文库的构建。3种芋螺组织中,肝胰脏产率最高但片段弥散有降解,毒腺DNA片段较大且集中,产率也较高,而肌肉的DNA片段产率最低且片段较小。因此,用CTAB法提取菖蒲芋螺毒腺的DNA更适合构建大片段基因组DNA文库。筛选高质量的菖蒲芋螺的DNA,利用优化的脉冲场电泳条件进行分离回收,获得了不同大小片段的DNA,为后续菖蒲芋螺不同载体系统的基因组文库构建奠定了基础。 展开更多
关键词 菖蒲芋螺 基因组dna提取方法 基因组dna片段 分离制备 脉冲场电泳
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簇毛麦基因组特异DNA序列标记的建立和应用 被引量:3
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作者 迟世华 杨足君 +3 位作者 冯娟 周建平 刘成 任正隆 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期1-5,共5页
为建立簇毛麦基因组特异DNA序列的分子标记,以普通小麦中国春、绵阳11、川农17和R111以及多年生簇毛麦、硬粒小麦-多年生簇毛麦双二倍体TDB-3为材料,用120条随机引物进行RAPD分析,筛选出一个多年生簇毛麦的特异性RAPD片段,克隆测序表明... 为建立簇毛麦基因组特异DNA序列的分子标记,以普通小麦中国春、绵阳11、川农17和R111以及多年生簇毛麦、硬粒小麦-多年生簇毛麦双二倍体TDB-3为材料,用120条随机引物进行RAPD分析,筛选出一个多年生簇毛麦的特异性RAPD片段,克隆测序表明该片段全长为937 bp(记为OPM2937)。以OPM2937的DNA序列为基础设计了一对特异引物,并用该特异引物对多年生簇毛麦、二倍体簇毛麦以及中国春-二倍体簇毛麦附加系CSDA1V^CSDA7V与小麦-多年生簇毛麦衍生后代进行了扩增,结果表明,凡具有簇毛麦染色体的材料均可扩增出目标DNA片段,而不具簇毛麦染色体的材料均未能得到扩增。将OPM2937在NCBI中进行序列比对,发现它是一个新的序列,说明OPM2937为簇毛麦基因组的一个特异序列,该DNA序列标记可用于快速跟踪检测小麦背景中的簇毛麦染色体。 展开更多
关键词 簇毛麦属 RAPD 基因组特异性dna片段
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野生稻细胞核DNA提取的研究 被引量:3
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作者 侯思名 张薇 +4 位作者 白现广 钟巧芳 高月芬 黄兴奇 程在全 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2009年第5期1215-1218,共4页
药用野生稻是中国最具利用价值的野生稻资源之一,具有许多优良的性状和有利基因,是改良栽培稻培育新品种的宝贵基因库,而其CC基因组的优良基因有望以大片段形式通过B IBAC等载体转化到栽培稻中。B IBAC文库不仅能作为大片段基因组文库... 药用野生稻是中国最具利用价值的野生稻资源之一,具有许多优良的性状和有利基因,是改良栽培稻培育新品种的宝贵基因库,而其CC基因组的优良基因有望以大片段形式通过B IBAC等载体转化到栽培稻中。B IBAC文库不仅能作为大片段基因组文库的载体,而且能通过根癌农杆菌介导将克隆片段导入植物基因组直接进行转化,可用于筛选分离基因等研究。如何获得基因组DNA大片段非常关键,本研究采取琼脂糖包埋基因组的方法获得大片段DNA,并对其中的一些步骤进行了优化,为构建药用野生稻B IBAC文库打下了很好的基础,值得在其它植物类似研究中参考。 展开更多
关键词 药用野生稻 BIBAC载体 基因组片段dna制备
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一种用于构建红色红曲霉基因组cosmid文库的大片段DNA制备方法 被引量:4
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作者 安洋 杨晶 +1 位作者 徐欣欣 刘钢 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期1385-1388,共4页
【目的】制备用于构建红色红曲霉cosmid文库的大片段基因组DNA。【方法】采用优化的酚氯仿抽提法制备DNA,并利用Sau3AI切割至平均大小为40 kb,然后使用Stratagene包装蛋白构建cosmid文库。基于PCR法使用同源探针从该文库中进行了目的基... 【目的】制备用于构建红色红曲霉cosmid文库的大片段基因组DNA。【方法】采用优化的酚氯仿抽提法制备DNA,并利用Sau3AI切割至平均大小为40 kb,然后使用Stratagene包装蛋白构建cosmid文库。基于PCR法使用同源探针从该文库中进行了目的基因的筛选。【结果】制备了浓度为5μg/μL,平均片段大小大于48 kb的红色红曲霉大片段基因组DNA。利用该DNA构建的cosmid文库基因组覆盖倍数为10,并筛选到了含有目的片段的cosmid。【结论】通过该方法制备红色红曲霉大片段基因组DNA简便易行并且完全可以用于构建cosmid文库。 展开更多
关键词 红色红曲霉 片段基因组dna cosmid文库
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Effect of p27mt gene on apoptosis of the colorectal cancer cell line Lovo 被引量:2
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作者 Jun Chen Wu-Hua Ding +3 位作者 Shao-Yong Xu Jia-Ning Wang Yong-Zhang Huang Chang-Sheng Deng 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2009年第22期2794-2799,共6页
AIM: To construct p27mt recombinant adenovirus, transfect the colorectal cell line Lovo and observe the effects of p27mt on Lovo cell apoptosis and cell cycle inhibition. METHODS: We constructed recombinant adenovir... AIM: To construct p27mt recombinant adenovirus, transfect the colorectal cell line Lovo and observe the effects of p27mt on Lovo cell apoptosis and cell cycle inhibition. METHODS: We constructed recombinant adenovirus containing p27mt by homologous recombination in bacteria. The colorectal cancer cell line Lovo was infected with recombinant replication-defective adenovirus Ad- p27mt, and expression of p27mt was determined by Western blotting; the inhibitory effect of p27mt on Lovo cells was detected by cytometry. Cell cycle was determined by flow cytometry. DNA fragment analysis identified the occurrence of apoptosis. RESULTS: The recombinant adenovirus which already contained p27mt target gene was successfully constructed. When multiplicity of infection was ≥50, the infection efficiency was 100%. After transfection of Lovo cells with Ad-p27mt the cells had high p27 expression which was identified by immunoblotting assay. PI staining and flow cytometry showed that 77.96% of colorectal cancer cells were inhibited in phase G0/G1, while in the Ad-LacZ group and blank control group, 27.57% and 25.29% cells were inhibited in the same phase, respectively. DNA fragment analysis, flow cytometry and TUNEL assay demonstrated that p27mt is able to induce apoptosis in colorectal cancer cells. CONCLUSION: p27mt has an obvious blocking effect on colorectal cancer cell cycle, and most cells were inhibited in phase G0/G1. Therefore, p27mt can induce apoptosis in colorectal cells. 展开更多
关键词 APOPTOSIS Cell cycle Colorectal cancer p27mt Recombinant adenovirus
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