基因芯片法筛选萎缩性胃炎相关的差异表达基因

目的:建立大鼠萎缩性胃炎模型,用高密度基因芯片筛选萎缩性胃炎相关的差异表达基因.方法:采用热盐水、盐水、热水灌胃的方法建立大鼠萎缩性胃炎模型,并设立正常对照组、正常喂养组作为对照.提取标本的总RNA,定量后并反转录成cDNA,萎缩性胃炎标本标记上Cy5,正常对照标本标记上Cy3,与含有8248个大鼠基因的cDNA芯片进行杂交,常规洗片,扫描,分析杂交结果.结果:热盐水组灌胃12wk的大鼠经病理诊断已存在萎缩性胃炎的特征,盐水、热水组灌胃的大鼠在24wk时经病理诊断也存在萎缩性胃炎的特征;热盐水组与正常对照组之间的差异基因共有436个,145个基因在萎缩性病变组织中呈高表达,291个基因在正常组织中呈高表达;热水组与正常对照组之间的差异表达基因共有398个,98个基因在萎缩性病变组织中呈高表达,300个基因在正常组织中呈高表达;热盐水组与盐水组之间差异表达基因共有36个,其中23个在热盐水组中呈高表达,13个基因在盐水对照组中呈高表达.结论:成功地建立了大鼠萎缩性胃炎的模型;筛选出了与热盐水、盐水、热水诱发的萎缩性胃炎发生有关的差异表达基因.

基因芯片法监测粤东地区妇女人乳头瘤病毒

目的:调查分析粤东地区妇女HPV感染率及其亚型的分布,有利于建立和完善粤东地区妇女的HPV监测体系。方法:采用凯普的基因芯片导流杂交HPV DNA基因分型检测法和亚能生物HPV基因分型检测法,本文共检测3304例标本,其中汕头市中心医院对2122例样本进行21种HPV亚型(凯普)的检测与分析,附二院对1182例(包括肿瘤医院28例)样本进行23种HPV亚型(亚能)的检测与分析。结果:中心医院2122例受检者HPV阳性例数为523例,总阳性率为24.7%,高危型感染的主要型别是HPV16、HPV52、HPV58;附二院1182例受检者HPV阳性例数为351例,总阳性率为29.7%,高危型感染的主要型别是HPV52、HPV16、HPV58。结论:粤东地区妇女HPV有较高的感染率,高危型感染的主要型别是HPV16、HPV52、HPV58;感染率分别为23.5%、21.5%1、3.5%。

脑膜炎患者脑脊液中基因芯片法鉴定出金色分枝杆菌1例报告

临床上不少非结核分枝杆菌病被漏诊或误诊为结核病，脑脊液中检出非结核分枝杆菌非常少见。我院分枝杆菌菌种鉴定基因芯片检测系统通过借助核酸分子杂交配对的特性对DNA样品的序列信息进行高效的解读和分析，可以对目前国内发病率较高的17种分枝杆菌进行菌种鉴定，具有较好的临床辅助意义。现报告1例经基因芯片法检测脑脊液得以确诊的病例，供参考。

实时荧光定量PCR法与基因芯片法检测HPV的比较

目的比较基于PCR的基因芯片方法和实时荧光定量PCR方法检测女性子宫颈脱落细胞HPV DNA的相关性。方法收集2050份样本采用基因芯片法和实时荧光定量PCR方法进行比对试验,两者结果不符的进行测序验证,并对检测结果进行一致率及阳性率统计分析。结果两种方法总一致率、阳性一致率及阴性一致率都在95.0%以上;荧光定量PCR法检测HPV16阳性率50.0%,HPV18阳性率13.9%。结论两种方法检测的一致性良好,本实验中所使用的新型12+2高危型人乳头状瘤病毒核酸检测试剂盒适合应用于育龄期妇女的宫颈癌筛查及随访。

基因芯片法检测乙肝相关性肝硬化患者HBV感染血清标志物

目的探讨乙型肝炎相关性肝硬化患者乙肝五项(HBV-M)不同模式及乙肝病毒DNA(HBVDNA)阳性的临床意义。方法64例肝硬化患者用酶联免疫吸附法(ELISA)检测HBV-M,基因芯片法检测HBVDNA,全自动生化分析仪检测肝功能。结果64例肝硬化患者中,HBV-M模式有4种,HBsAg、HBeAg、HBcAb阳性者15例,HBVDNA阳性率100.00%;HBsAg、HBeAb、HBcAb阳性者22例,HBVDNA阳性率68.18%;HBsAg、HBcAb阳性者24例,HBVDNA阳性率70.83%;单纯HBsAb阳性者3例,HBVDNA均阴性。肝硬化患者各种HBV-M中HBVDNA总阳性率为73.44%。HBVDNA阳性组与阴性组间ALT、总胆红素差异无统计学意义(P>0.05)。结论半数以上HBV相关肝硬化患者有活动性复制,有必要对HBVDNA阳性的肝硬化患者进行抗病毒治疗,改善预后。

基因芯片法对丙型肝炎病毒RNA的基因型分析

目的:制备丙型肝炎病毒(HCV)基因的分型诊断芯片,检测其对丙型肝炎患者血清HCV RNA基因分型诊断的价值。方法:根据HCV 5’端非编码区末端(5’UTR)和C区设计引物和特异性探针,将设计的20条特异性寡核苷酸探针用核苷酸合成仪合成后,配制成50μmol/ml的点样液,用点样仪点到特殊处理的玻片介质上,制成HCV基因分型诊断芯片。收集HCV RNA阳性的丙型肝炎患者血清30份作为实验组,健康人血清30份作为对照组。用荧光定量PCR仪对两组血清进行HCV RNA定量检测,实验组血清HCV RNA含量均大于500 copies/ml,对照组血清HCV RNA均为阴性。两组血清进行HCV RNA分离纯化、逆转录反应、巢式PCR扩增后,分别用基因芯片与核酸序列测定法进行双盲HCV基因分型检测。结果:实验组血清基因诊断芯片检测均为阳性;基因分型1b型23例,3a型2例,3b型1例,2a型1例,2b型1例,混合型1b+2a 1例,1b+3b型1例;核酸序列测定分型1b型25例,3a型2例,3b型1例,2a型1例,2b型1例;两种方法检测的基因分型符合率为93.3％。对照组血清基因芯片检测均阴性。结论:制备的HVC基因诊断芯片可以用于检测血清HCV RNA,并进行基因诊断分型,准确率较高。

基因芯片法检测载脂蛋白E(ApoE)基因型试剂性能验证

目的:评价利用基因芯片法检测载脂蛋白E(ApoE)基因型检测试剂性能。方法:利用基因芯片法检测载脂蛋白E(ApoE)6种不同的基因型:E2/E2、E3/E3、E4/E4,E3/E4、E2/E3、E2/E4。其检测结果与直接测序结果比较。结果:该方法的准确性,精密度均>90%,与测序法符合率100%。结论:利用基因芯片法检测载脂蛋白E(ApoE)基因型检测试剂性能有很好的准确性,精密度。

应用Xpert MTB/RIF和基因芯片法快速检测结核分枝杆菌及其对利福平的耐药性分析

目的:探究应用Xpert MTB/RIF和基因芯片法快速检测结核分枝杆菌及其对利福平的耐药性。方法:收集医院2017年1月—2019年12月间收治的符合"结核病诊断标准"的住院患者320例临床资料,将其患者痰涂片阳性标本每例分成3份,按不同方法(罗氏培养、Xpert检测以及结核分枝杆菌DNA提取法)检测,其中302例为有效标本,采用金标准比例法实施药物敏感性试验,分析和评价2种新型检测法(Xpert MTB/RIF和基因芯片法)检测结核分枝杆菌对利福平耐药性的特异度、灵敏度以及准确度。结果:应用Xpert MTB/RIF检测结核分枝杆菌对利福平耐药的灵敏度为95.83%,特异度为95.63%,准确度为95.69%(Kappa=0.902);而基因芯片法检测结核分枝杆菌对利福平耐药的灵敏度为87.63%,特异度为96.59%,准确度为93.71%(Kappa=0.854);Xpert MTB/RIF和基因芯片法检测与比例法检测数据分别采用χ^(2)检验,其差异无统计学意义(P>0.05)。结论:应用Xpert MTB/RIF和基因芯片法检测结核分枝杆菌对利福平耐药的测试,均具有快速、可靠、高敏感度和高特异度等特点,可为指导临床制定或调整治疗方案提供参考依据。

基因芯片法和线性探针法在HCV基因分型的应用比较

目的 评价基因芯片技术在丙型肝炎病毒 (HCV)基因分型中的临床应用价值。方法 对HCVRNA阳性血清用基因芯片法和线性探针法进行基因分型。结果 基因芯片法和线性探针法的符合率是 10 0 %。结论 基因芯片法的准确率与国外第二代线性探针法试剂盒相同 ,而操作简单 ,特别是能准确地检出HCV混合感染 ,具有良好的应用前景。

基因芯片法检测结核分枝杆菌耐药性的可行性分析

目的分析基因芯片法检测结核分枝杆菌（MTB）耐药性的灵敏度、特异度及符合率,为临床提供方便、准确、快速的MTB耐药性的检测方法。方法以DNA测序法为金标准,采用基因芯片法与比例法药敏试验同时对2014年8~12月收治的250例结核病患者的痰液标本分离MTB菌株进行耐药性检测,比较两种方法检测MTB对利福平和异烟肼耐药性的效能。结果基因芯片法与比例法药敏试验检测MTB对利福平的耐药率分别为3.0%、3.5%,对异烟肼的耐药率分别为6.7%、8.2%。以DNA测序法为金标准,基因芯片法检测MTB对利福平与异烟肼耐药性的灵敏度、特异度及符合率均高于比例法药敏试验,且检测时间短于比例法药敏试验,差异均有统计学意义（P〈0.05）。结论运用基因芯片法检测MTB对利福平和异烟肼的耐药性,具有较高的灵敏度、特异度与符合率,可以代替比例法药敏试验成为检测MTB耐药性的有效方法。

基因芯片法和涂片法在肺部感染分枝杆菌诊断中的应用评价

目的探讨基因芯片法和涂片法检测分枝杆菌的一致性。方法采集肺部感染患者痰标本先进行直接涂片查找抗酸杆菌,然后用基因芯片法平行检测分枝杆菌。对两种方法的结果进行统计,分析两种方法的差异性。结果136例患者痰标本用基因芯片法共检测出抗酸杆菌69例,阳性率为50.7%,其中结核分枝杆菌56例(81.2%),非结核分枝杆菌13例(18.8%);涂片法共找到抗酸杆菌50例,阳性率为36.8%。结论基因芯片法检测抗酸杆菌的阳性率明显高于涂片法,而且可以检测出抗酸杆菌的种类,其结果明显优于涂片法,为临床鉴别肺部疾病提供了重要依据。

实时荧光PCR与基因芯片法检测人乳头瘤病毒的方法学比较

目的:比较实时荧光PCR法与基因芯片法检测人乳头瘤病毒的结果分析。方法:选择2018年6月~2020年6月的患者为研究对象,分别采用实时荧光PCR与基因芯片法检测HPV感染情况,均做宫颈细胞学检查,对两种检测HPV亚型的不同分型方法进行分析。结果:采用基因芯片法对23种高危型HPV感染的阳性率为23.29%(17/73);实时荧光PCR法对15种高危型HPV阳性率的检出结果为13.70%(10/73),差异无统计学意义(P>0.05)。同时采用两种方法检测的共有73例,两种方法对15种高危型HPV检出均为阳性的有48例,不符合的为5例;基因芯片法对HPV感染阳性的诊断敏感度、特异度、准确度分别为98.75%、98.8%、98.69%;荧光PCR法的敏感度、特异度、准确度分别为97.50%、99.47%、96.77%,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:实时荧光PCR与基因芯片法对HPV阳性检出情况高度一致,尤其在高危型HPV检测中,均有良好的诊断效能,应根据实际情况,合理选择检测方法。

快速导流杂交基因芯片法检测人乳头瘤病毒的实验观察

目的探讨导流杂交基因芯片法(HybrMax法)在人乳头瘤病毒基因分型中的应用价值。方法利用快速导流杂交基因芯片技术对来我院妇科门诊就诊的796例妇女进行下生殖道HPV感染分型检测;选取其中502例,依据细胞学病理结果分为正常细胞学组、慢性炎症组、宫颈上皮内瘤变组(CIN组)和宫颈癌组,将各组HPV分型结果进行比对分析。结果细胞学正常组HPV感染率12.06%,慢性炎症组为23.69%,CINⅠ组33.69%,CINⅡ组59.61%,CINⅢ组为79.54%,宫颈癌组为96%,组间感染率对比差异有统计学意义(P<0.05)。各组均有HPV多重感染情况,且随着病变程度的加重,HPV多重感染率逐渐升高,组间差异有统计学意义(P<0.05)。结论快速导流杂交基因芯片技术HPV分型检测结合宫颈细胞学检查对宫颈病变患者的随访检查和疗效观察有重要的临床应用价值,对宫颈癌的早期预防和治疗意义重大。

常规培养法与基因芯片法在细菌性痢疾患者黏液脓血便病原菌检测中的对比分析

目的比较常规培养法与基因芯片法在细菌性痢疾患者黏液脓血便病原菌检测中的价值。方法选取细菌性痢疾患者216例,分别采用常规培养法与基因芯片法对黏液脓血便进行病原菌检测,比较两种方法病原菌检测阳性率和检测时间。结果基因芯片法用于细菌性痢疾患者黏液脓血便病原菌检测阳性率高于常规培养法(P<0.05),检测时间短于常规培养法(P<0.05)。结论相较于常规培养法,基因芯片法用于细菌性痢疾患者黏液脓血便病原菌检测可有效提高检出率,缩短检测用时。

基因芯片法联合Xpert MTB/RIF对肺结核的诊断价值

目的 探讨基因芯片法联合结核分枝杆菌/利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术(Xpert MTB/RIF)对肺结核的诊断价值。方法 选取2019年3月至2021年2月本院收治的421例疑似肺结核患者为研究对象,采用基因芯片法、Xpert MTB/RIF及基因芯片法联合Xpert MTB/RIF处理痰标本。以痰培养结果为金标准,比较不同方法对肺结核的诊断效能;以药敏试验结果为参照,比较不同方法对利福平耐药的检出符合率。结果 基因芯片法联合Xpert MTB/RIF对肺结核的诊断灵敏度、特异度、准确度、阳性预测值、阴性预测值均高于基因芯片法、Xpert MTB/RIF,差异具有统计学意义(P<0.05)。基因芯片法联合Xpert MTB/RIF对利福平耐药的检出符合率高于基因芯片法、Xpert MTB/RIF,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论 基因芯片法联合Xpert MTB/RIF对肺结核的诊断价值较高,且可判断结核分枝杆菌对利福平的耐药性。

基因芯片法对细菌性痢疾患者黏液脓血便病原菌检测阳性率的影响

目的分析基因芯片法对细菌性痢疾患者黏液脓血便病原菌检测阳性率的影响。方法回顾性分析2017年1月至2019年12月我院细菌性痢疾患者598例,均行常规培养法和基因芯片法检测,对比常规培养法和基因芯片法病原菌检测结果、阳性检出率、检测时间。结果本组598例细菌性痢疾患者采用常规培养法检测出阳性159例,其中沙门菌27例,痢疾杆菌132例;采用基因芯片法检测出阳性289例,其中沙门菌83例,痢疾杆菌206例。基因芯片法阳性检出率48.33%(289/598)较常规培养法26.59%(159/598)高(P<0.05);基因芯片法检测时间较常规培养法短(P<0.05)。结论基因芯片法应用于细菌性痢疾患者,可提高黏液脓血便病原菌阳性检出率,并能缩短检测时间,可替代常规培养法,辅助临床早期诊断治疗,可作为病原微生物临床快速诊断发展方向。

支气管肺泡灌洗液基因芯片法病原体检测对难治性肺炎患儿的病原学诊断意义

目的探讨支气管肺泡灌洗液(BALF)基因芯片法检测对难治性肺炎患儿病原学诊断的意义。方法回顾性研究。收集2020年1月至2022年1月昆明医科大学附属昆明市儿童医院呼吸与危重症医学科诊断为难治性肺炎的500例患儿资料,住院期间行支气管镜检查及支气管肺泡灌洗治疗,取BALF行基因芯片法病原体检测,同时完善痰液、BALF细菌培养。采用χ^(2)检验比较不同检测法的病原检出阳性率。结果BALF基因芯片法病原体检测的阳性患儿482例(96.4%),仅单一病原体感染患儿71例(14.7%),另411例(85.3%)检出2种及2种以上病原体。其中,居前3位的细菌分别为:肺炎链球菌117例次(8.3%),流感嗜血杆菌63例次(4.5%),百日咳杆菌32例次(2.3%)。居前3位的病毒分别为:呼吸道合胞病毒269例次(19.1%),副流感病毒217例次(15.4%),腺病毒132例次(9.3%)。BALF基因芯片法细菌检测阳性的患儿116例(23.2%),BALF细菌培养阳性的患儿47例(9.4%),痰培养的阳性患儿43例(8.6%),BALF基因芯片法细菌检测的阳性率最高,与BALF培养及痰培养阳性率比较,差异均有统计学意义(χ^(2)=34.90、39.85,均P<0.001)。结论难治性肺炎患儿大部分为混合感染,BALF基因芯片法病原学检测可快速、高效地获取病原学结果,为临床抗感染治疗提供用药指导。

变色液体培养技术和基因芯片技术检测结核杆菌耐药的方法比较及其临床应用

目的利用变色液体培养法、基因芯片法检测痰标本结核杆菌耐药性,并与传统的比例法比较,评价这两种方法快速检测结核分枝杆菌耐药性的临床应用价值。方法应用变色液体培养法和基因芯片法同时检测62例涂阳肺结核痰标本MTB对R、H、S、E的耐药性,并与改良罗氏比例法结果进行比较。结果以比例法药敏结果为判断标准,则变色液体培养法测定异烟肼耐药性的敏感性、特异性、阳性预测值(PPV)、阴性预测值(NPV)及准确性分别为93%以上;同样,利福平为:94.4%以上;链霉素:85.7%(12/14)以上;乙胺丁醇:66.7%(4/6)以上。以比例法药敏结果为判断标准,基因芯片法测定H耐药性的敏感性、特异性、PPV、NPV及准确性分别为75%(12/16)、78.3%(36/46)、54.5%(12/22)、90%(36/40)、77.4%(48/62);同样利福平:83.3%(15/18)、86.4%(38/44)、71.4%(15/21)、92.7(38/41)、85.5%(53/62);链霉素:85.7%(12/14)、87.5%(42/48)、66.7%(12/18)、95.5%(42/44)、87.1%(54/62);乙胺丁醇:66.7%(4/6)、94.6%(53/56)、57.1%(4/7)、96.4%(53/55)、91.9%(57/62)。结论变色液体培养法测定痰标本结核菌H、R、S、E耐药性与比例法结果有较高的相符率,且简便、快捷、价廉、安全,可作为MTB耐药性的快速筛选方法,适合基层医院使用。基因芯片法检测MTB耐药性简便、快捷,但敏感性、特异性比比例法和变色液体培养法低,同时实验室设备和人员的要求都不是普通医院所能满足,目前可作为传统药敏试验的补充,要广泛应用于临床尚需更深入的研究。