全基因组基因表达频谱研究的新方法——SAGE和IPGI

SAGE和IPGI是新近发展起来的用于全基因组基因表达频谱分析和寻找差异基因的新技术 ,可以同时反映正常或异常等不同功能状态下细胞整个基因组基因表达的全貌 ,特别是对低丰度表达基因有较高的检测结果 ,因而具有重要的应用价值。本文简介SAGE和IPGI技术的基本原理、操作方法及其应用前景。

SAGE技术在大豆上的应用

随着功能基因组学研究的兴起 ,基因表达研究的分析方法也在不断发展。而基因序列表达分析技术 (SAGE)是一种以测序为基础 ,采用数字化分析手段 ,在转录物水平上研究细胞或组织基因表达模式的有效工具。该技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞表达的基因 ,获得这些基因表达丰度的数量信息 ,还可比较不同组织、不同时空条件下基因表达的差异 ,从而发现新基因。SAGE技术在农作物方面的应用相对较少 ,但进展很快。笔者着重介绍了SAGE在大豆基因表达分析中的应用 ,简要评述此种方法的原理及优缺点 ,并分析了SAGE所存在的问题。