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非甲~戊型肝炎患者血清HCV RNA测定及基因型分析
1
作者
何忠平
王红梅
+1 位作者
庄辉
李朋
《临床输血与检验》
CAS
2003年第1期15-18,共4页
目的 探讨临床诊断为“非甲~戊型肝炎”患者中丙型肝炎病毒感染状况及基因型分析。方法 应用逆转录巢式 PCR(n PCR)法检测 HCV RNA,并对 HCV RNA核心区部分序列克隆测序分析。结果 6 0例临床诊断为“非甲~戊型肝炎”患者中 ,应用 ...
目的 探讨临床诊断为“非甲~戊型肝炎”患者中丙型肝炎病毒感染状况及基因型分析。方法 应用逆转录巢式 PCR(n PCR)法检测 HCV RNA,并对 HCV RNA核心区部分序列克隆测序分析。结果 6 0例临床诊断为“非甲~戊型肝炎”患者中 ,应用 n PCR法检测有 3例阳性 ,检出率为 5 %。3个 HCV北京分离株与 HCV 型核苷酸同源性为 94 %~ 96 %。基因进化树分析显示 3个北京分离株为 HCV 型。结论 临床诊断为“非甲~戊型肝炎”患者中 ,存在少数丙型肝炎病毒感染 ,其基因型以 HCV
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关键词
非甲~戊型肝炎
丙型肝炎病毒
逆转录巢式PCR法
基因
测序
基因
型
基因进化树分析
法
病毒性肝炎
下载PDF
职称材料
3株TT病毒的基因组结构特点及其在肝炎病人中感染情况
2
作者
何忠平
庄辉
+3 位作者
董庆鸣
闫杰
周育森
黄呈辉
《中国公共卫生》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第3期266-268,共3页
目的 了解TT病毒 (TTV)分离株基因组结构特点及其在各型病毒性肝炎患者中感染情况。方法 对49株TTV相关病毒全基因组结构进行分子进化树分析 ,比较从我国分离的 3株TTV全基因结构与原型株的同源性 ,并采用巢式聚合酶链反应法 (nPCR)...
目的 了解TT病毒 (TTV)分离株基因组结构特点及其在各型病毒性肝炎患者中感染情况。方法 对49株TTV相关病毒全基因组结构进行分子进化树分析 ,比较从我国分离的 3株TTV全基因结构与原型株的同源性 ,并采用巢式聚合酶链反应法 (nPCR)对各型病毒性肝炎患者血清中TTVDNA进行检测。结果 3株TTV分离株基因组全长为 3 73 9bp ,有 2个读码框架 (ORFs) ,ORF1编码 770个氨基酸 ,位于 5 89~ 2 90 1核苷酸 ;ORF2编码 2 0 2个氨基酸 ,位于 10 7~ 715核苷酸。与TTV原型株TA2 78的核苷酸同源性为 86%~ 96% ,ORF1氨基酸同源性为88%~ 97% ,ORF2氨基酸同源性为 79%~ 96%。全基因组序列分子进化树分析表明 ,从我国分离的 3株TTV属于原型组。在 180例各型病毒性肝炎患者中 ,检出TTVDNA阳性 40例 ,阳性率为 2 2 2 %。在甲~戊型肝炎、非甲、戊型肝炎、慢性乙型肝炎患者和正常人中 ,TTVDNA流行率分别为 2 4 2 % ( 2 9/12 0 ) ,18 3 % ( 11/60 ) ,17 8% ( 10 6/5 95 )和 19 8% ( 19/96) ,4组无显著性差异。结论 从我国分离的 3株TTV的全基因结构特点与原型株相似 ,各型病毒性肝炎。
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关键词
肝炎病人
感染
TT病毒
基因进化树分析
巢式PCR
序列
分析
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职称材料
2012~2016年宁夏急性驰缓性麻痹病例监测系统中非脊灰肠道病毒病原鉴定分析
被引量:
4
3
作者
袁芳
马江涛
+1 位作者
陈慧
马学旻
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期884-888,共5页
对宁夏2012~2016年急性驰缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例监测中分离到的非脊灰肠道病毒(Non-polio enterovirus,NPEV)进行血清型别鉴定和基因特征分析。采用RD和L20B两种细胞对采集自AFP病例及其接触者的粪便标本进行病毒...
对宁夏2012~2016年急性驰缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例监测中分离到的非脊灰肠道病毒(Non-polio enterovirus,NPEV)进行血清型别鉴定和基因特征分析。采用RD和L20B两种细胞对采集自AFP病例及其接触者的粪便标本进行病毒分离,分离获得的毒株使用肠道病毒简并引物进行全长VP1区基因扩增、核苷酸序列测定、基因型别鉴定和基因系统发生学分析。2012~2016年共收集959份粪便标本,其中采自AFP病例粪便标本426份,密接者粪便标本533份,分离到67株NPEV,除4株未鉴定出型别外,共鉴定出23个肠道病毒血清型,其中A组肠道病毒(EV-A)23株(36.51%),包括7个血清型,以CV-A4(12.69%)、CV-A8(6.35%)和EV-A71(6.35%)为主;B组人肠道病毒(EV-B)40株(63.5%),包括17个血清型,以CV-B组4、2和3为主,分别占11.11%、9.52%和7.93.%,未鉴定出C组和D组人肠道病毒。宁夏2012~2016年从AFP病例及密接者标本中分离到的NPEV以EV-B组为主要型别,占63.49%,随着时间的推移一些主要流行的血清型别发生了变化。
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关键词
急性迟缓性麻痹(AFP)
非脊灰肠道病毒
基因
型别
基因进化树分析
原文传递
题名
非甲~戊型肝炎患者血清HCV RNA测定及基因型分析
1
作者
何忠平
王红梅
庄辉
李朋
机构
北京地坛医院
安徽省立医院
北京医科大学微生物系
出处
《临床输血与检验》
CAS
2003年第1期15-18,共4页
基金
北京市委组织部优秀人才项目资助 (2 0 0 2 -0 4)
文摘
目的 探讨临床诊断为“非甲~戊型肝炎”患者中丙型肝炎病毒感染状况及基因型分析。方法 应用逆转录巢式 PCR(n PCR)法检测 HCV RNA,并对 HCV RNA核心区部分序列克隆测序分析。结果 6 0例临床诊断为“非甲~戊型肝炎”患者中 ,应用 n PCR法检测有 3例阳性 ,检出率为 5 %。3个 HCV北京分离株与 HCV 型核苷酸同源性为 94 %~ 96 %。基因进化树分析显示 3个北京分离株为 HCV 型。结论 临床诊断为“非甲~戊型肝炎”患者中 ,存在少数丙型肝炎病毒感染 ,其基因型以 HCV
关键词
非甲~戊型肝炎
丙型肝炎病毒
逆转录巢式PCR法
基因
测序
基因
型
基因进化树分析
法
病毒性肝炎
Keywords
Non A~E hepatitis Hepatitis C virus Reverse transcripted nested polymerase chain reaction\ \ Genotype
分类号
R512.6 [医药卫生—内科学]
R446.11 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
3株TT病毒的基因组结构特点及其在肝炎病人中感染情况
2
作者
何忠平
庄辉
董庆鸣
闫杰
周育森
黄呈辉
机构
北京大学医学部微生物学系
北京地坛医院
军事医学科学院流行病学微生物学研究所
深圳市宝安区血站
出处
《中国公共卫生》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第3期266-268,共3页
基金
北京市委组织优秀人才工程基金资助
文摘
目的 了解TT病毒 (TTV)分离株基因组结构特点及其在各型病毒性肝炎患者中感染情况。方法 对49株TTV相关病毒全基因组结构进行分子进化树分析 ,比较从我国分离的 3株TTV全基因结构与原型株的同源性 ,并采用巢式聚合酶链反应法 (nPCR)对各型病毒性肝炎患者血清中TTVDNA进行检测。结果 3株TTV分离株基因组全长为 3 73 9bp ,有 2个读码框架 (ORFs) ,ORF1编码 770个氨基酸 ,位于 5 89~ 2 90 1核苷酸 ;ORF2编码 2 0 2个氨基酸 ,位于 10 7~ 715核苷酸。与TTV原型株TA2 78的核苷酸同源性为 86%~ 96% ,ORF1氨基酸同源性为88%~ 97% ,ORF2氨基酸同源性为 79%~ 96%。全基因组序列分子进化树分析表明 ,从我国分离的 3株TTV属于原型组。在 180例各型病毒性肝炎患者中 ,检出TTVDNA阳性 40例 ,阳性率为 2 2 2 %。在甲~戊型肝炎、非甲、戊型肝炎、慢性乙型肝炎患者和正常人中 ,TTVDNA流行率分别为 2 4 2 % ( 2 9/12 0 ) ,18 3 % ( 11/60 ) ,17 8% ( 10 6/5 95 )和 19 8% ( 19/96) ,4组无显著性差异。结论 从我国分离的 3株TTV的全基因结构特点与原型株相似 ,各型病毒性肝炎。
关键词
肝炎病人
感染
TT病毒
基因进化树分析
巢式PCR
序列
分析
Keywords
TT virus
phylogenetic tree analysis
nest polymerase chain reaction(nPCR)
sequence analysis
分类号
R512.6 [医药卫生—内科学]
下载PDF
职称材料
题名
2012~2016年宁夏急性驰缓性麻痹病例监测系统中非脊灰肠道病毒病原鉴定分析
被引量:
4
3
作者
袁芳
马江涛
陈慧
马学旻
机构
宁夏疾病预防控制中心
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期884-888,共5页
文摘
对宁夏2012~2016年急性驰缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例监测中分离到的非脊灰肠道病毒(Non-polio enterovirus,NPEV)进行血清型别鉴定和基因特征分析。采用RD和L20B两种细胞对采集自AFP病例及其接触者的粪便标本进行病毒分离,分离获得的毒株使用肠道病毒简并引物进行全长VP1区基因扩增、核苷酸序列测定、基因型别鉴定和基因系统发生学分析。2012~2016年共收集959份粪便标本,其中采自AFP病例粪便标本426份,密接者粪便标本533份,分离到67株NPEV,除4株未鉴定出型别外,共鉴定出23个肠道病毒血清型,其中A组肠道病毒(EV-A)23株(36.51%),包括7个血清型,以CV-A4(12.69%)、CV-A8(6.35%)和EV-A71(6.35%)为主;B组人肠道病毒(EV-B)40株(63.5%),包括17个血清型,以CV-B组4、2和3为主,分别占11.11%、9.52%和7.93.%,未鉴定出C组和D组人肠道病毒。宁夏2012~2016年从AFP病例及密接者标本中分离到的NPEV以EV-B组为主要型别,占63.49%,随着时间的推移一些主要流行的血清型别发生了变化。
关键词
急性迟缓性麻痹(AFP)
非脊灰肠道病毒
基因
型别
基因进化树分析
Keywords
Acute flaccid paralysis(AFP)
Non-polio enterovirus
Molecular identification
Epidemiology
分类号
R5 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
非甲~戊型肝炎患者血清HCV RNA测定及基因型分析
何忠平
王红梅
庄辉
李朋
《临床输血与检验》
CAS
2003
0
下载PDF
职称材料
2
3株TT病毒的基因组结构特点及其在肝炎病人中感染情况
何忠平
庄辉
董庆鸣
闫杰
周育森
黄呈辉
《中国公共卫生》
CAS
CSCD
北大核心
2003
0
下载PDF
职称材料
3
2012~2016年宁夏急性驰缓性麻痹病例监测系统中非脊灰肠道病毒病原鉴定分析
袁芳
马江涛
陈慧
马学旻
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
4
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