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5S-rRNA基因间区序列变异用于金银花药材道地性研究初探 被引量:59
1
作者 李萍 蔡朝晖 邢俊波 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2001年第9期834-837,共4页
目的 研究金银花药材道地性形成的基因基础。方法 用 SDS法提取金银花 L onicera japonica不同居群、外类群细毡毛忍冬 L.similis和山银花 L.confusa的总 DNA,进行 5 S- r RNA基因间区的 PCR扩增和测序 ,并用软件 Mega进行分析。结果... 目的 研究金银花药材道地性形成的基因基础。方法 用 SDS法提取金银花 L onicera japonica不同居群、外类群细毡毛忍冬 L.similis和山银花 L.confusa的总 DNA,进行 5 S- r RNA基因间区的 PCR扩增和测序 ,并用软件 Mega进行分析。结果  L onicera L.属植物 5 S- r RNA基因间区约 2 10 bp,其中 G+C含量较高 ,达 70 %左右 ,不同居群的 L.japonica碱基序列有差别 ,通过测序可以进行鉴别。L.confusa与 L.japonica间的遗传距离较大。结论 种间 5 S- r RNA基因间区的序列差异大于种内 ;道地药材之间的遗传距离较小 ;道地与非道地药材之间的遗传距离大于道地药材之间的遗传距离。 展开更多
关键词 金银花 道地性 5S-rRNA基因间区序列变异 中药
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PCR-SSCP分析Q热立克次体中国分离株16S-23SrDNA基因间区
2
作者 胡廷徽 温博海 +1 位作者 万泽生 俞树荣 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第11期1312-1314,共3页
目的 建立快速分析Q热立克次体分离株 16S 2 3SrDNA基因间区株间差异的PCR SSCP方法。方法 用半套式PCR扩增 7株中国分离株 (七医、新桥、雅安、李、YS 8、YS 9和YH 11)和 3株国际参考株 (九里、Henzerling和Grita)的 16S 2 3SrDNA基... 目的 建立快速分析Q热立克次体分离株 16S 2 3SrDNA基因间区株间差异的PCR SSCP方法。方法 用半套式PCR扩增 7株中国分离株 (七医、新桥、雅安、李、YS 8、YS 9和YH 11)和 3株国际参考株 (九里、Henzerling和Grita)的 16S 2 3SrDNA基因间区 ,对扩增产物进行PCR SSCP分析。结果  3株云南分离株 (YS 8,YS 9和YH 11)与其它 7株之间的差异较大。与此区域的序列分析结果一致。结论 Q热立克次体分离株的 16S 2 3SrRNA基因间区由于适应不同的地理环境可发生变异 ,PCR SSCP是快速分析这些变异的有效方法。 展开更多
关键词 贝氏柯克斯体 16S-23S rDNA基因间区 PCR-SSCP 中国分离株 差异
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基于叶绿体psbA-trnH基因间区序列鉴定肉苁蓉属植物(英文) 被引量:26
3
作者 韩建萍 宋经元 +6 位作者 刘昶 陈君 钱俊 朱英杰 石林春 姚辉 陈士林 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期126-130,共5页
肉苁蓉的干燥肉质茎是常用中药材, 药典收录基源植物有管花肉苁蓉和荒漠肉苁蓉两种, 但是市场上经常会与黄花列当、草苁蓉、盐生肉苁蓉及沙苁蓉等混用。本文对不同类群肉苁蓉及混淆品的叶绿体 psbA-trnH基因间区进行 PCR 扩增并测序, ... 肉苁蓉的干燥肉质茎是常用中药材, 药典收录基源植物有管花肉苁蓉和荒漠肉苁蓉两种, 但是市场上经常会与黄花列当、草苁蓉、盐生肉苁蓉及沙苁蓉等混用。本文对不同类群肉苁蓉及混淆品的叶绿体 psbA-trnH基因间区进行 PCR 扩增并测序, 获得了该区间的完整序列, 用 K-2P 法建立了系统进化树, 聚类结果与形态分类相符。所得结果显示, psbA-trnH 片段序列在肉苁蓉及混淆品种间存在丰富的变异, 肉苁蓉属各种的种间遗传距离从 0.077% 到 0.743%, 种内遗传距离从 0% 到 0.007%, 种内和种间存在明显的"barcoding gap"。肉苁蓉属各种与黄花列当的遗传距离为 0.979% 至 1.149%, 与草苁蓉的遗传距离为 1.066% 至 1.224%。研究结果表明psbA-trnH 基因间区可以作为条形码来鉴定肉苁蓉及其混淆品。 展开更多
关键词 psbA-trnH基因间区 肉苁蓉 鉴定
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基于叶绿体psbA-trnH基因间区序列鉴定山东丹参为新种 被引量:12
4
作者 李晓娟 韩建萍 +5 位作者 李建秀 陈晓辰 张龙霏 李佳 顾正位 张永清 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期1338-1344,共7页
为从分子水平鉴定山东丹参(Salvia shandongensis)及其近缘物种,本研究采用psbA-trnH序列对山东丹参、丹参(S.miltiorrhiza)和白花丹参(S.miltiorrhiza f.alba)共计33份材料进行了PCR扩增并测序,获得了该间隔区的完整序列。采用CodonCod... 为从分子水平鉴定山东丹参(Salvia shandongensis)及其近缘物种,本研究采用psbA-trnH序列对山东丹参、丹参(S.miltiorrhiza)和白花丹参(S.miltiorrhiza f.alba)共计33份材料进行了PCR扩增并测序,获得了该间隔区的完整序列。采用CodonCodeAligner进行序列拼接,应用MEGA5.0计算山东丹参及其近缘种的种内、种间的K2P距离,构建UPGMA树。结果显示,山东丹参psbA-trnH序列长度约为391 bp,丹参和白花丹参psbA-trnH序列长度约为386 bp,psbA-trnH序列在山东丹参及其近缘种种间存在丰富的变异,山东丹参种内平均K2P遗传距离为0,丹参和白花丹参种内平均K2P遗传距离分别为0.002和0.001,山东丹参与丹参种间遗传距离为0.034~0.04,与白花丹参种间遗传距离为0.005~0.008,山东丹参种内平均K2P遗传距离均远远小于丹参和白花丹参种间平均K2P遗传距离;聚类结果显示山东丹参与丹参、白花丹参(变型)可明显区分,这与形态分类特征相符。本研究首次从分子水平确立了山东丹参在植物分类学上的地位,揭示了山东丹参与近缘种之间的亲缘关系,为山东丹参药用植物新资源的开发提供DNA遗传分子鉴定的科学依据。研究结果表明psbA-trnH基因间区可作为条形码来鉴定山东丹参及其近缘种。 展开更多
关键词 psbA-trnH基因间区 山东丹参 丹参 白花丹参 DNA分子鉴定
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棉花曲叶病毒大基因间区启动子在宿主植物中的表达活性 被引量:2
5
作者 谢迎秋 刘玉乐 朱祯 《中国科学(C辑)》 CSCD 2000年第3期225-232,T001,共8页
棉花曲叶病毒(CLCuV)是一种单链DNA病毒,属于双生病毒亚组Ⅲ.为了研究其基因组大基因间区(LIR)的功能,以CLCuV侵染的烟草叶片组织总DNA为模板,通过聚合酶链反应扩增LIR并插入克隆载体.将LIR分别以互... 棉花曲叶病毒(CLCuV)是一种单链DNA病毒,属于双生病毒亚组Ⅲ.为了研究其基因组大基因间区(LIR)的功能,以CLCuV侵染的烟草叶片组织总DNA为模板,通过聚合酶链反应扩增LIR并插入克隆载体.将LIR分别以互补链及病毒链基因转录方向与gus报告基因和nos终止子融合,构建了植物表达载体.通过农杆菌介导的方法转化烟草并测定转化植株的GUS活性,实验结果表明,LIR在互补链基因方向具有强启动子活性, GUS平均活性是CaMV 35S启动子的5~6倍,单株最高的GUS活性达到CaMV 35S启动子的 10倍;组织化学定位证实其在叶肉及维管组织均有活性. LIR在病毒链基因方向的启动子活性较低.报道了CLCuV来源的分离的LIR在互补链基因方向可作为一种新型的强启动子元件应用于植物遗传操作. 展开更多
关键词 基因间区 启动子 棉花曲叶病毒 基因表达
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番茄黄化曲叶病毒基因间区缺失突变体在北京的发现与证实 被引量:1
6
作者 赵宇楠 程晓龙 +4 位作者 赵萍萍 陈亚萍 芦佳 李常保 姚磊 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1591-1598,共8页
在北京发现两种致病性有差异的番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)毒株,得到两个不同的TYLCV分离物BJ03和BJ04,并对它们进行了全长扩增测序。TYLCV-BJ03全长为2 781 bp,TYLCV-BJ04全长为2 740 bp。进化树分析显示,... 在北京发现两种致病性有差异的番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)毒株,得到两个不同的TYLCV分离物BJ03和BJ04,并对它们进行了全长扩增测序。TYLCV-BJ03全长为2 781 bp,TYLCV-BJ04全长为2 740 bp。进化树分析显示,这两个毒株分别属于以色列株系TYLCV-IL进化分支下中国的两个不同亚群。二者核酸序列的同源性为99.15%,主要差异在基因间区(intergenic region,IR)。BJ04比BJ03的IR区在互补链方向TATA-box与保守的9核苷酸序列之间缺失41个碱基。通过针对缺失片段设计的特异引物验证,进一步证实了TYLCV的IR区缺失突变体的存在。在对温室中不同发病番茄样本的检测中,同时检测到被两种毒株单独侵染和复合侵染的植株。 展开更多
关键词 番茄 番茄黄化曲叶病毒 基因间区 序列缺失
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16S-23S rRNA间区基因RFLP用于病原菌区分 被引量:3
7
作者 温杰 刘毅 《大连医科大学学报》 CAS 2005年第4期276-279,共4页
[目的]探讨16S-23SrRNA间区基因RFLP用于临床常见病原菌区分的可能性。[方法]183株临床分离来的细菌经荧光PCR扩增后进行不完全限制性酶切,产物进行毛细管电泳。[结果]所有细菌的酶切产物经毛细管电泳后,不同细菌产生不同的RFLP谱图,互... [目的]探讨16S-23SrRNA间区基因RFLP用于临床常见病原菌区分的可能性。[方法]183株临床分离来的细菌经荧光PCR扩增后进行不完全限制性酶切,产物进行毛细管电泳。[结果]所有细菌的酶切产物经毛细管电泳后,不同细菌产生不同的RFLP谱图,互相之间能够明显区分。[结论]该方法可以将临床常见病原菌准确区分到种的程度,极有应用价值。 展开更多
关键词 16S-23S rRNA基因 病原茵 聚合酶链反应(PCR) 限制性酶切片段长度多态性(RFLP)
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Q热立克次体中国株的16S-23SrDNA间区序列分析 被引量:3
8
作者 胡廷徽 温博海 +2 位作者 万泽生 俞树荣 张雪 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期30-34,共5页
用PCR扩增了 7株中国分离株 (七医、新桥、雅安、李、YS 8、YS 9和YH 1 1 )和2株国际参考株 (Henzerling和Grita)的 1 6S 2 3SrDNA基因间区 ,对扩增产物进行了序列分析。结果发现它们仅在少数几个碱基位上有不同。在第 6 0位上 3个云南... 用PCR扩增了 7株中国分离株 (七医、新桥、雅安、李、YS 8、YS 9和YH 1 1 )和2株国际参考株 (Henzerling和Grita)的 1 6S 2 3SrDNA基因间区 ,对扩增产物进行了序列分析。结果发现它们仅在少数几个碱基位上有不同。在第 6 0位上 3个云南分离株YS 8、YS 9、YH 1 1和Grita株与Stein等报道的序列 (包括九里、其它国际参考株和一些法国临床分离株 )的碱基序列一致 ,为“C” ;其他 5株为“A” ,此位点的不同可能与适应不同的地理环境相关。另外 ,YS 9株在第 8和 2 0 8位、新桥株在第 43 2位也分别出现缺失 ,可能与适应不同的动物宿主或在实验室传代情况不同有关。 展开更多
关键词 贝氏柯克斯体 16S-23S rRNA基因 基因间区 序列分析 Q热 立克次体
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rRNA基因ITS区序列分析在粘帚霉属生防菌株种级分类上的应用 被引量:6
9
作者 马桂珍 张拥华 +1 位作者 李世东 谢丙炎 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期704-707,共4页
对分离自不同地域的粘帚霉属不同种类的生防菌株rRNA基因转录间区进行了克隆测序,用Clustal X软件进行自动排序,用Njplot程序构建系统进化树.供试26个粘帚霉菌株分在4个组,与传统形态分类结果一致,同一种类的不同来源的菌株差异不明显.... 对分离自不同地域的粘帚霉属不同种类的生防菌株rRNA基因转录间区进行了克隆测序,用Clustal X软件进行自动排序,用Njplot程序构建系统进化树.供试26个粘帚霉菌株分在4个组,与传统形态分类结果一致,同一种类的不同来源的菌株差异不明显.研究表明,可以根据ITS区DNA序列差异对粘帚霉属进行种级分类,但不能用于区分种内不同地域的菌株之间的差别. 展开更多
关键词 粘帚霉 rRNA基因转录 克隆 序列
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不同产地浙贝母的基因序列及生物碱含量比较 被引量:23
10
作者 蔡朝晖 李萍 +2 位作者 李松林 董婷霞 詹华强 《中药材》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期157-159,共3页
目的:探讨道地药材形成的基因基础。方法:以AS和AS-1为引物对4个不同产地浙贝母的5S-rRNA基因间区进行了PCR扩增和测序,并采用酸性染料比色法测定了它们的总生物碱含量及用柱前衍生化气相色谱法测定了其中2个单体生物碱的含量。结果:不... 目的:探讨道地药材形成的基因基础。方法:以AS和AS-1为引物对4个不同产地浙贝母的5S-rRNA基因间区进行了PCR扩增和测序,并采用酸性染料比色法测定了它们的总生物碱含量及用柱前衍生化气相色谱法测定了其中2个单体生物碱的含量。结果:不同产地浙贝母的5S-rRNA基因间区具有相同的碱基序列,均为588bp;它们的总生物碱含量相当,气相色谱结果也表明,它们含有相同的单体生物碱,只是各单体生物碱的含量不同。结论:不同产地浙贝母的差异不是由碱基序列,而是由小环境因素引起的。 展开更多
关键词 浙贝母 道地药材 5S-rRNA基因间区序列 生物碱 基因序列
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栽培稻种内rDNA基因IGS序列分析及系统学意义 被引量:8
11
作者 戴小军 欧立军 +2 位作者 李文嘉 梁满中 陈良碧 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1569-1573,共5页
以普通野生稻为对照,将rDNA基因间区(IGS)序列用于栽培稻种内不同亚种以及亚种内不同品种的亲缘关系分析。结果表明,栽培稻种内IGS序列长度为2130~2145bp,G+C含量为74.59%~75.29%,变异位点229个,占10.70%,信息位点76个,占3.51%。IGS... 以普通野生稻为对照,将rDNA基因间区(IGS)序列用于栽培稻种内不同亚种以及亚种内不同品种的亲缘关系分析。结果表明,栽培稻种内IGS序列长度为2130~2145bp,G+C含量为74.59%~75.29%,变异位点229个,占10.70%,信息位点76个,占3.51%。IGS序列中籼亚种和粳亚种之间有38个亚种标志性碱基差异,主要分布在IGS5′端近400bp的序列中。用IGS序列构建的系统树能将栽培稻的籼亚种和粳亚种分为两大类,亚种内不同亲缘关系的品种也能区分开。本研究结果支持爪哇稻为栽培稻中一个独立亚种的观点。 展开更多
关键词 栽培稻 核糖体 基因间区(IGS) 系统树
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我国亚热带地区快生型大豆根瘤菌遗传多样性研究 被引量:3
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作者 杨成运 周俊初 +1 位作者 杨江科 段广才 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第1期48-53,共6页
利用16S rDNA PCR-RELP、16S rDNA基因序列分析以及16S-23S rDNA IGS PCR-RELP技术,对分离自我国江苏盐城、浙江温州、湖北仙桃及重庆等亚热带地区的31株大豆快生型根瘤菌(fast-growing rhizobia)进行了群体遗传多样性研究。16S rDNA PC... 利用16S rDNA PCR-RELP、16S rDNA基因序列分析以及16S-23S rDNA IGS PCR-RELP技术,对分离自我国江苏盐城、浙江温州、湖北仙桃及重庆等亚热带地区的31株大豆快生型根瘤菌(fast-growing rhizobia)进行了群体遗传多样性研究。16S rDNA PCR-RELP分析结果表明,所有供试大豆根瘤菌都与费氏中华根瘤菌USDA205聚成一类。供试代表菌株YcS2的16SrDNA基因序列与费氏中华根瘤菌USDA205的该序列相似性超过99.5%。16S-23S rDNAIGSPCR-RFLP研究结果表明:所有供试菌株分为10个基因型,在87%的相似性上分为4个类群。在此基础上筛选出10个代表菌株进行16S-23S rDNA基因序列分析,结果表明,10个供试菌株分为2个群,群Ⅱ(YcS3、ZzS1、YcS14)与新疆中华根瘤菌CCBAU110聚在一起,群Ⅰ(其余7个菌株)与费氏中华根瘤菌USDA205聚在一起。中国亚热带地区的快生型大豆根瘤菌具有高度的相似性。 展开更多
关键词 大豆根瘤菌 多样性 16S RDNA 基因间区
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真核生物基因组转录诱导融合基因的研究进展 被引量:2
13
作者 吕聪颖 赵刚彬 吕贯廷 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第12期1255-1259,共5页
真核生物的基因组由基因和基因间区组成.基因转录时,从转录起始点开始到该基因的转录终止点结束,形成独立的转录单元.然而有少量的文献表明,转录有时会通读基因间区,产生包含上游基因、基因间区和下游基因的融合基因转录本.融合转录本... 真核生物的基因组由基因和基因间区组成.基因转录时,从转录起始点开始到该基因的转录终止点结束,形成独立的转录单元.然而有少量的文献表明,转录有时会通读基因间区,产生包含上游基因、基因间区和下游基因的融合基因转录本.融合转录本经基因间剪接而成为有功能的成熟转录本.对真核生物转录诱导融合基因的基因间剪接方式、产生机制和意义进行了综述. 展开更多
关键词 基因间区 转录 融合转录本
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重庆地区家蚕微孢子虫遗传多态性分析 被引量:2
14
作者 申子刚 潘国庆 +3 位作者 许金山 李田 刘含登 周泽扬 《自然科学进展》 北大核心 2008年第5期579-586,共8页
为探讨家蚕微孢子虫种内的遗传多样性,对本实验室保存的一株家蚕微孢子虫的SSUrDNA,rDNA-ITS,rDNA-IGS,Sec61β5′上游序列(Nb-IGS1)和Hsp705′上游序列(Nb-IGS2)进行了PCR扩增和序列测定.多重序列比对发现它们都存在着不同程度的多态性... 为探讨家蚕微孢子虫种内的遗传多样性,对本实验室保存的一株家蚕微孢子虫的SSUrDNA,rDNA-ITS,rDNA-IGS,Sec61β5′上游序列(Nb-IGS1)和Hsp705′上游序列(Nb-IGS2)进行了PCR扩增和序列测定.多重序列比对发现它们都存在着不同程度的多态性.其中rDNA-ITS和rDNA-IGS遗传多样性最为明显,序列中存在较大的差异区域,包括多碱基的插入或缺失、单碱基的转换和颠换;而对基因上游的调控序列分析发现,Nb-IGS1和Nb-IGS2序列中存在着少量的变异位点.结合GenBank中Nosema属微孢子虫的同源序列,分别构建rDNA-ITS和rDNA-IGS系统树,结果表明重庆地区家蚕微孢子虫遗传分化比较明显.研究表明家蚕微孢子虫种内存在遗传多样性. 展开更多
关键词 家蚕微孢子虫 遗传多态性 核糖体小亚基 基因间区
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双位点保守基因特异性PCR-CE-RFLP快速鉴定病原菌的实验与临床研究
15
作者 石胜 朱振宇 +5 位作者 熊燕 王小朝 陈青龙 许鸿灏 卢岑 陈炎添 《现代预防医学》 CAS 北大核心 2007年第20期3837-3839,共3页
[目的]初步建立一个临床常见病原菌的标准PCR-CE-RFLP数据库,为临床快速鉴定病原菌奠定基础。[方法]选取临床分离的病原菌共167株,筛选16S rRNA基因和16S-23S rRNA间区基因的合适引物,分别用FAM和JOE两种荧光素标记,调整PCR反应条件,让... [目的]初步建立一个临床常见病原菌的标准PCR-CE-RFLP数据库,为临床快速鉴定病原菌奠定基础。[方法]选取临床分离的病原菌共167株,筛选16S rRNA基因和16S-23S rRNA间区基因的合适引物,分别用FAM和JOE两种荧光素标记,调整PCR反应条件,让两种引物能同时在同一条件下反应,所得产物先用普通琼脂糖凝胶电泳,再分别用限制性内切酶HaeIII进行不完全酶切,酶切产物50倍稀释后进行毛细管电泳(PCR-CE-RFLP),测定酶切片段长度差异。[结果]针对16S rRNA基因的RFLP谱数据只能将病原菌鉴定到"科"的程度,而单纯应用16S-23S rRNA间区基因的RFLP谱数据虽能区分绝大多数细菌,但个别种属内仍然出现相似的谱型。经过双位点PCR-CE-RFLP分析后,则可将所有细菌鉴定到"种"的程度。[结论]利用16S rRNA基因和16S-23S rRNA间区基因PCR-CE-RFLP进行细菌鉴定简便快捷,能将传统方法需要十几个小时甚至几十小时的鉴定工作缩短到几个小时,是一种极有临床应用价值的快速诊断方法。 展开更多
关键词 聚合酶链反应(PCR) 限制性酶切片段长度多态性(RFLP) 16SRRNA基因 16S-23SrRNA基因 毛细管电泳 病原菌
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生物强化MBR系统处理溴氨酸启动期特性研究 被引量:3
16
作者 王竞 邢林林 +3 位作者 曲媛媛 周集体 宋智勇 吕红 《大连理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第5期647-651,共5页
采用鞘氨醇单胞菌强化膜生物反应器(MBR),对模拟溴氨酸废水进行处理.考查了生物强化MBR启动期溴氨酸的降解、污泥特性及细菌生理状态的变化,并用DNA指纹技术——核糖体基因间区序列分析(RISA)揭示MBR启动期污泥的菌群变化.结果显示,采... 采用鞘氨醇单胞菌强化膜生物反应器(MBR),对模拟溴氨酸废水进行处理.考查了生物强化MBR启动期溴氨酸的降解、污泥特性及细菌生理状态的变化,并用DNA指纹技术——核糖体基因间区序列分析(RISA)揭示MBR启动期污泥的菌群变化.结果显示,采用生物强化可以使MBR迅速启动并稳定运行.在启动期,污泥浓度下降,沉降性和絮凝性变好;脱氢酶活性下降并稳定在一个较低的水平上;胞外聚合物中蛋白和多糖含量略有上升;启动期末期膜出水溴氨酸脱色率可达90%以上,COD去除率可达60%以上.RISA指纹分析表明污泥系统多样性减少,形成了降解溴氨酸的功能群落. 展开更多
关键词 生物强化 膜生物反应器 溴氨酸 核糖体基因间区序列分析
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Identification of Stellaria media by PCR 被引量:6
17
作者 黄文哲 董婷霞 +2 位作者 戚欢阳 卢振强 詹华强 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS 2005年第3期144-148,共5页
Aim To provide a rapid and reliable method for identifying the fork medicine Stellaria media (Linn. ) Cyr. (Herba Stellariae mediae) (Caryophyllaceae) from its adulterant Myosoton aquaticure (L.) Fries (Herba... Aim To provide a rapid and reliable method for identifying the fork medicine Stellaria media (Linn. ) Cyr. (Herba Stellariae mediae) (Caryophyllaceae) from its adulterant Myosoton aquaticure (L.) Fries (Herba Myosoti aquatici) (Caryophyllaceae) by polymerase chain reaction (PCR) technology. Methods A molecular genetic approach has been developed to identify S. media for the first time. 5S-rRNA spacer domain was amplified by PCR from the isolated genomic DNA, and the PCR products were then sequenced. Results The nucleotide sequences of S. media and M. aquaticum were measured to determine their identity. Furthermore, the nucleotide sequences of three Stellaria species, S. vestita, S. longifolia and S. radians, were also measured for the sake of providing the evidence of the biological phylogeny of SteUaria. Diversity between DNA sequence and restriction enzyme mapping among a variety of the species was found in their 5S-rRNA spacer domains. Conclusion The 5S-rRNA spacer domains can be used as a molecular marker for differentiating S. media from M. aquaticum and in phylogenetie studies of Stellaria. 展开更多
关键词 Stellaria media Myosoton aquaticum 5S-rRNA spacer domain DNA sequence Stellaria
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瑞士乳酸杆菌HZ521株的分子鉴定及其部分生物学特性研究 被引量:2
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作者 朱炳林 张茜茜 方维焕 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2009年第2期49-52,共4页
根据GenBank中乳酸杆菌16 S^23 S rRNA基因间沉默区序列设计引物,进一步鉴定猪源乳酸杆菌分离株HZ521;并通过体外试验,以嗜酸乳酸杆菌ATCC 4356为参考菌株,探讨HZ521株的益生素作用。部分16 S^23 S rRNA基因序列同源性分析结果表明,该... 根据GenBank中乳酸杆菌16 S^23 S rRNA基因间沉默区序列设计引物,进一步鉴定猪源乳酸杆菌分离株HZ521;并通过体外试验,以嗜酸乳酸杆菌ATCC 4356为参考菌株,探讨HZ521株的益生素作用。部分16 S^23 S rRNA基因序列同源性分析结果表明,该分离株属于瑞士乳酸杆菌。HZ521株具有较强的产酸能力,能耐受强酸,对Hela细胞的黏附率为87.2%,显著高于ATCC4356株(P<0.01)。表明瑞士乳酸杆菌HZ521株具有益生素特性,可作为肠道益生素的候选菌株。 展开更多
关键词 瑞士乳酸杆菌 16S-23SrRNA 基因沉默 黏附 益生素
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rDNA ITS序列在鉴定尖端赛多孢子菌中的应用 被引量:16
19
作者 彭慧 郑岳臣 《同济医科大学学报》 CSCD 2000年第1期26-28,共3页
为探明一例眼外伤摘除的眼球活组织中培养分离出的一株形态特异的尖端赛多孢子菌的分子生物学特征及其与波氏假阿利什菌、一般尖端赛多孢子菌标准株的亲缘关系,采用聚合酶链式反应(PCR)扩增其rDNA中基因间转录区(ITS),... 为探明一例眼外伤摘除的眼球活组织中培养分离出的一株形态特异的尖端赛多孢子菌的分子生物学特征及其与波氏假阿利什菌、一般尖端赛多孢子菌标准株的亲缘关系,采用聚合酶链式反应(PCR)扩增其rDNA中基因间转录区(ITS),并对PCR产物进行限制性片段长度多态性分析(RFLP)。结果发现,形态特异的尖端赛多孢子菌株与标准株及其它同种菌株具有相同的酶切图谱,而与顶孢霉和烟曲霉则不一致,表明该菌株就是波氏假阿利什菌的无性期。该标准菌株的ITS序列酶切图谱可供快速、准确地鉴定尖端赛多孢子菌及其有性期,以便于临床早期诊断和及时治疗。 展开更多
关键词 尖端赛多孢子菌 基因转录 聚合酶链反应
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副粘病毒新成员尼—帕病毒的分子特征
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作者 邱昌庆 《畜牧兽医科技信息》 2001年第5期21-21,共1页
最近,一种称之为尼帕病毒(Nipab Virus,NV)的新副粘病毒出现在马来西亚和新加坡,该病毒感染猪引起呼吸道综合征并感染与猪群接近的人群,引起致死性脑炎,从而造成该地区的极大恐慌。初步的研究表明NV在抗原性上和遗传上与亨德拉病毒(Herd... 最近,一种称之为尼帕病毒(Nipab Virus,NV)的新副粘病毒出现在马来西亚和新加坡,该病毒感染猪引起呼吸道综合征并感染与猪群接近的人群,引起致死性脑炎,从而造成该地区的极大恐慌。初步的研究表明NV在抗原性上和遗传上与亨德拉病毒(Herdra vivus,HV)相关。美国人兽共患病专家对NV的N、P/C、F和G基因测序分析,并于HV及副粘病毒的其他成员做比较,发现NV的基因间区与HV的一致。 展开更多
关键词 副粘病毒 新成员 呼吸道综合征 尼帕病毒 亨德拉病 病毒感染 基因间区 测序分析 抗原性 开放读码框架
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