多基因风险评分用于结直肠癌风险预测的研究进展

结直肠癌是全球最为常见的消化系统恶性肿瘤,其发生、发展过程受到遗传和环境因素共同作用。多基因风险评分可汇总多个遗传易感位点的效应,提升疾病风险的预测能力。本文就国内外结合多基因风险评分的结直肠癌风险预测模型研究进展作一综述,为优化结直肠癌人群风险识别策略,制定公共卫生综合防控政策提供参考和证据。

家族性高胆固醇血症患者基因风险评分与心血管疾病的相关性

目的探究家族性高胆固醇血症(FH)患者基因风险评分与心血管疾病(CVD)的相关性。方法选取2016年1月-2019年6月在新疆生产建设兵团医院诊断及就诊的FH患者199例,根据是否合并心血管疾病分为观察组(n=43)与对照组(n=156),对比一般资料及血脂水平,包括:伴随疾病、吸烟史、家族CVD史、甘油三酯(TC)、总胆固醇(TC)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C).低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C),同时检测低密度脂蛋白受体(LDLR).,载脂蛋白B(ApoB)、枯草溶菌素转化酶(PCSK9)基因的风险评分,使用Spearman相关分析探究基因风险评分与LDL.-C水平的关系,使用Logistie回归分析CVD的独立危险因素。结果观察组的年龄、家族性心血管病史率显著高于附照组,观察组的TC(1=2.171,P=0.031)、TC(t=6.325,p=0.000)及LDL-C(1=6.890,P=0.000)水平显著高于对照组,HDL-C水平显著低于对照组(1=5.137,P=0.031);所有患者基因风险评分分布在1.25~2.25,中位分数1.90,观察组高基因风险比例显著高于对照组(81.40%vs 49.36%;χ^2=14.060,P=0.000).基因风险评分与LDL-C水平呈显著正相关(r=0.358,P=0.000)。多因索Logistie回归分析显示年龄(OR=1.369,P=0.001)、家族性心血管病史(OR=3.043,P=0.044)、LDL-C(OR=1.734,P=0.000)、高基因风险评分(OR=6.507,P=0.003)是心血管疾病发生的独立危险因素,HDL-C(OR=0.008,P=0.000)是心血管疾病的独立保护因素。结论FH患者基因风险评分与LDL-C水平呈显著正相关,高基因风险评分是CVD发生的独立危险因素。

论我国转基因风险防范机制的完善

自从转基因技术问世以来,在科学上一直难以证明其对环境和人身损害是否存在风险,因此各方对转基因技术和产品的态度也是不尽相同的。欧盟针对转基因在科学上的不确定性提出了风险预防原则,并施以严格的风险防范机制和措施;而美国奉行的是以科学确定性为基础的实质等同原则,对转基因采取与常规产品相同的规制措施。文章认为我国可以对欧盟和美国的制度进行兼容并包,一方面以风险预防原则为指导,建立风险防控体系;另一方面应以科学确定原则为指导,尊重科学规律,将转基因风险预防技术手段法律化;同时从程序上完善和保障公众的知情权、参与权和选择权。

端粒长度与2型糖尿病:孟德尔随机化研究与多基因风险评分分析

多项观察性研究表明,端粒长度缩短与2型糖尿病(type 2 diabetes,T2D)之间存在关联。然而,传统观察性研究结果常受到混杂因素和反向因果关联的影响,端粒长度与T2D是否存在因果关联尚不明确。本研究在中国汉族人群中利用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)和多基因风险评分(polygenic risk score,PRS)方法探索端粒长度与T2D的因果关系。MR研究选取8个与端粒长度相关的独立遗传变异作为工具变量,利用2632例中国汉族人群T2D全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)数据,检验遗传预测的端粒长度与T2D的关系。利用中国汉族人群GWAS数据,采用PRS分析评价端粒长度PRS与T2D的关系。MR研究共纳入1318例T2D患者和1314例正常对照,逆方差加权、MR-Egger回归、简单中位数和加权中位数法估计的OR值分别为0.78(95%CI:0.36~1.68,P=0.522)、0.23(95%CI:0.01~7.64,P=0.412)、0.60(95%CI:0.28~1.28,P=0.185)和0.64(95%CI:0.31~1.33,P=0.233),遗传预测的较长端粒长度与T2D之间不存在关联。PRS分析未发现端粒长度PRS与T2D显著关联的一致结果。本研究采用MR和PRS方法未发现端粒长度与T2D具有因果关联,后续研究中增大样本量有助于得出更可靠的结论。

多基因风险评分在恶性肿瘤风险预测中的应用展望

多基因风险评分通过综合多个易感位点的累积效应预测个体的肿瘤发病风险,对肿瘤高危人群的筛查和有效防治具有应用价值。近年来,多基因风险评分的构建方法和应用范畴得到了进一步拓展和完善。本文就多基因风险评分应用于恶性肿瘤风险预测的最新进展进行简要介绍,总结其应用展望和挑战。

多基因风险评分的构建及其在卒中领域的应用

卒中是一种由遗传和环境因素共同作用引起的复杂疾病,人类遗传学的发展为卒中的个体化预防和治疗提供了新的机会。多基因风险评分是根据个体的基因型和相关的全基因组关联研究数据,对一种性状或疾病的遗传倾向进行估计,是遗传学研究中全基因组关联研究的补充方法。多基因风险评分可以对患者进行风险分层以进行个性化管理,从而有助于卒中等复杂疾病的精准预测和防控。基于此,本篇综述阐述了多基因风险评分的构建及其在卒中研究中的应用情况,以期为国内相关研究提供思路。

多基因风险评分在精神障碍研究中的应用进展

多基因风险评分(polygenic risk score,PRS)作为全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)的补充方法,已广泛应用于各类复杂性状疾病的遗传学研究中,精神疾病一直是PRS应用的重要领域。国际上关于PRS的研究范式渐趋成熟。国内关于PRS方法的综述主要关注于复杂性状疾病的总体进展[1-2],或将其作为遗传风险分析方法的一种类型进行介绍[3]。

多基因风险评分在复杂性状疾病中的应用进展

随着精准医学的提出以及基因组医学研究的不断深入,人类基因组信息可有效辅助临床进行更精确的疾病诊断,并帮助医师制定个体化的治疗方案,同时也可被用于大范围的人群筛查,并根据个体差异而采取相应措施,阻止疾病的发生。复杂性状疾病(complex disease)发病由多个基因位点共同参与且与环境因素相互作用决定疾病表型的遗传疾病,如心血管疾病、肿瘤性疾病、自身免疫病等。人类基因组信息中,遗传风险评分作为研究单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与复杂性状疾病间关系的方法.

乳腺癌多基因风险评分、风险预测和精准预防的研究进展

近年来全基因组关联研究已经鉴定了众多与肿瘤发病风险相关的易感基因与遗传位点。多基因风险评分可以综合多个易感位点的效应,构建肿瘤风险预测模型,评估个体肿瘤的发生风险,进而确定高危人群,提高肿瘤筛查或预防性治疗的效果。作者以乳腺癌为例,阐述多基因风险评分在乳腺癌风险预测方面的最新进展,并对其进一步的应用进行了论述。

多基因风险评分在儿童肥胖干预效果可持续性中的作用

目的 探索多基因风险评分(PRS)与儿童肥胖干预效果可持续性的关联,为未来开展基于遗传背景、可持续、个性化的儿童肥胖干预提供科学依据。方法 从一项研究儿童干预效果的整群随机对照试验(2018年9月—2021年4月)中,选取北京地区148名基线时处于超重肥胖的儿童作为研究对象,采集唾液进行全基因组测序。构建4个PRS:加权和未加权PRS69,加权和未加权PRS_(67)。分析PRS与干预组别对干预效果可持续性(干预结束到最后一次随访期间肥胖相关指标变化)的交互作用。结果 PRS与干预组别对干预结束后儿童校正体质量指数(BMI)的腰围、校正BMI的腰臀比和收缩压的反弹程度存在交互作用。与对照组相比,干预组儿童加权PRS69每增加一个单位(1个s),校正BMI的腰围(β=0.34,95%CI:0.05~0.63,P=0.020)和校正BMI的腰臀比(β=0.29,95%CI:0.03~0.56,P=0.031)在干预结束后反弹得越多;加权PRS_(67)和未加权PRS_(67)每增加一个单位(1个s),收缩压在干预结束后反弹得越多(β=3.58,95%CI:0.50~6.66,P=0.023;β=3.75,95%CI:0.78~6.71,P=0.014)。结论 超重肥胖儿童PRS越高(携带风险等位基因越多),其在干预结束后的校正BMI的腰围、校正BMI的腰臀比和收缩压越容易反弹。未来应在干预结束后重点关注这些高危儿童的饮食和运动行为,预防和控制发生肥胖反弹。

子痫前期风险预测基因的筛选

目的:探索对子痫前期(PE)有预测价值的基因。方法:应用高通量测序技术检测3例PE及3例正常孕妇脐带组织来源的间充质干细胞(MSC)的基因表达谱,利用DESeq2进行差异性分析,进行GO、KEGG通路分析,结合相关文献,筛选出关键基因。收集29例PE和28名正常孕妇的静脉血标本,应用RT-qPCR技术检测关键基因的表达情况。结果:共检出1130个差异表达基因,其中458个高表达,672个低表达;共筛选出3个关键基因[CXC基序趋化因子配体2(CXCL2)、糖蛋白非转移性黑色素蛋白B(GPNMB)、胸苷磷酸化酶(TYMP)],均为表达下调。RT-qPCR结果显示3个基因在PE孕妇静脉血中的表达均低于正常孕妇(P<0.05)。结论:CXCL2、GPNMB和TYMP或可作为预测PE的新分子标志物。

复发性流产风险基因的临床应用价值

复发性流产(RSA)是1%~5%育龄妇女的常见不良妊娠结局,其病因复杂,发病机制尚不明确。目前仍有约50%反复流产原因不明,RSA可能受到多种外源性和内源性因素的影响,其中遗传因素倍受关注。本文旨在探索RSA的相关风险基因,包括与血栓形成相关的F5、F2、MTFHR等基因、与免疫反应相关的HLA-G、CTLA4、IL-6等基因、与着床和胎盘形成相关的VEGFA、NOS3、MMP2等基因,以及与激素及其他相关的ESR1、ESR2、CYP1A1等基因,探讨基因多态性与RSA发生风险的关联。通过总结与RSA发生风险相关的易感基因,探索遗传因素在RAS风险预测的临床价值,有助于评估RSA的影响因素和发病机制,为建立精准多基因遗传风险评分(PRS)模型提供基础,并从遗传学的角度指导RSA高危人群的筛查及防控。

多基因遗传风险评分(PRS)在遗传疾病研究中的应用与前景:数据分析方法综述

多基因遗传风险评分(polygenic risk score,PRS)是一种新兴的遗传数据分析方法。该方法通过对个体多个遗传变异位点的综合考虑,对个体复杂疾病的遗传风险进行定量评估,在遗传学领域受到广泛关注,同时该方法的有效性也在临床应用中得到进一步验证。由于PRS的计算涉及大量的基因组数据分析,其模型的数据选择、构建方法以及验证方法均存在较大差异。本综述结合目前已发表的PRS相关研究和算法,对PRS模型以及其应用进行阐述。

人格独立的法律内涵及其损害赔偿——以“冒名上学”案与基因风险情势为视角

"冒名上学"案中的侵害客体正是人格独立。在基因时代,人格独立还面临着在基因层面被侵害的潜在风险。法律主体的人格独立是其享有一切权利和利益的基本前提。所谓人格独立,即特定人格的固有、唯一和非依附性的存在,它是主体性的一种彰显。人格独立是一般人格利益的首要内容,在法律上最终寓含着深刻的尊严价值,并呈现出综合性、符号性等的外观。人格独立的损害赔偿要在个案中进行合理的利益权衡,根据具体事实确定可予救济的损害及其范围。个案中的利益权衡,有助于实现侵权责任法对人格独立利益的保护和救济,最终目的是维护人的尊严。

基因犯罪初探:以风险社会为视角

基因犯罪是伴随着基因技术而产生,因基因技术不当研发、滥用所带来的以及侵犯基因资源、基因信息的严重危险、危害行为。基因犯罪往往关联着不可预知的基因风险,基因风险是系统性的、不可测量性的、人为建构性的、复杂性的新型风险;它正是"风险社会"中典型的风险型态。刑法须由法益保护的基点,转换到风险控制的维度,方能有效应对。

21基因复发风险评分与淋巴结阴性、激素受体阳性乳腺癌局部复发的关系

1文献来源 Mamounas EP,Tang G,Fisher B,et al.Association between the 21-gene recurrence score assay and risk of locoregional recurrence in node-negative,estrogen receptor-positive breast cancer：Results from NSABP B-14 and NSABP B-20[J].J Clin Oncol,2010,28（10）：1677-1683.

多基因风险评分与复杂性疾病风险预测和精准预防:机遇和挑战

随着人类基因组学研究的飞跃发展,全基因组关联研究已成功鉴定出大量复杂性疾病的易感位点。多基因风险评分通过综合多个易感位点信息预测疾病风险,在人群风险预测、优化筛查方案、实施精准预防等方面初显应用价值。本研究就多基因风险评分的最新进展作一概述,总结其应用机遇和挑战。

21基因复发风险评分在乳腺黏液癌中的临床应用价值

目的探讨21基因复发风险评分在乳腺黏液癌(MBC)中的临床应用价值。方法选取接受手术治疗的96例雌激素受体(ER)阳性、人类表皮生长因子受体2(HER-2)阴性的MBC患者,收集所有患者的临床资料。提取所有患者肿瘤组织石蜡包埋标本中的RNA,采用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测21基因的表达,计算21基因复发风险评分,根据评分结果将所有患者分为低危组(<18分)、中危组(18~30分)和高危组(>30分)。采用多因素Logistic回归分析评估21基因复发风险评分的独立影响因素。采用Kaplan-Meier生存曲线评估无病生存期(DFS)。结果96例MBC患者中低危组23例(24.0%)、中危组63例(65.6%)、高危组10例(10.4%)。低危组、中危组及高危组之间孕激素受体(PR)表达、分子分型及肿块大小差异均有统计学意义(P<0.05),年龄、绝经时间、stage分期、Ki67表达差异均无统计学意义(P>0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,PR低表达是MBC患者21基因复发风险评分为高危的独立危险因素[比值比(OR)=7.271,95%可信区间(CI)为0.728~3.240]。化疗的选择与Ki67表达、分子分型、PR表达及21基因复发风险评分有关(P<0.05),与年龄、肿块大小、绝经时间、手术方式、stage分期无关(P>0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,21基因复发风险评分及Ki67表达是选择化疗的独立影响因素(P<0.05)。Kaplan-Meier生存曲线分析结果显示,低危组、中危组及高危组之间DFS差异均无统计学意义(P>0.05)。结论在MBC患者中,21基因复发风险评分与PR表达密切相关,是辅助化疗选择的独立影响因素,但不能预测患者DFS的长短。

转基因技术风险的哲学反思

[目的]对转基因技术的风险进行哲学反思。[方法]从哲学方面对转基因技术的风险进行讨论。[结果]从哲学分析层面提出:坚持机械论、还原论的科学观是转基因技术风险生产的认识论原因;转基因作为人工选择技术取代自然选择,转基因技术在自然属性上"僭越"是风险产生的内在原因。转基因的技术风险失控根源于社会制度,制度性风险才是转基因技术风险的根本原因。[结论]提出从独断、片面科学转变到反思、综合的科学,从消灭、创生的技术转变到保护、共生的技术,是人们科学观和技术观的必然变革。

多基因风险评分与机器学习建模策略下轻度认知障碍发展为阿尔茨海默病的预后研究

目的本研究从全基因组和候选基因组的角度探究多基因风险评分(polygenic risk score,PRS)与机器学习对轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)发展为阿尔茨海默病(alzheimer′s disease,AD)的预后预测性能,为MCI发展为AD的第5年预后预测建模提供更有力的方法理论依据。方法借助聚类与阈值(clumping and thresholding,C+T)、多基因风险评分-连续收缩(polygenic risk scores-continuous shrinkage,PRS-CS)、随机生存森林(random survival forest,RSF)、生存支持向量机(survival support vector machine,SSVM)4种常用统计方法对MCI发展为AD的第5年生存情况进行预测建模。利用C+T与PRS-CS得到的AD遗传风险得分作为独立的预测因子纳入Cox比例风险回归模型,RSF与SSVM则从候选基因组角度直接纳入所有与AD有关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNPs)进行统计建模。最后,采用C指数作为模型预测效果的评价指标。结果无论是C+T还是PRS-CS方法,在全基因组和候选基因组两种情况下的C指数差值均<0.01,而两种方法的C指数差值最大为0.04,二者差异均无统计学意义;机器学习的方法明显好于PRS方法,RSF和SSVM的C指数均能达到0.76,较C+T、PRS-CS高0.07、0.11,差异有统计学意义(均P<0.05)。结论机器学习方法表现优异,为MCI发展为AD的预后预测提供了更为可行的统计建模方案。