禽类蛋壳及基质蛋白质的研究进展

在蛋壳形成过程中,方解石晶粒生长竞争并与基质蛋白质相互作用,形成一种高度复杂有序的生物矿化结构。文章综述蛋壳的形成及蛋壳基质蛋白质方面的研究进展。

禽蛋壳基质蛋白质ovocalyxin-36在蛋壳中的分布、基因结构以及生物活性

ovocalyxin-36(OCX-36)是由禽类输卵管形成蛋壳的区域分泌的特异性蛋白质,分子质量36 ku,在蛋壳形成钙化阶段表达上调。该蛋白质同杀菌通透性增强蛋白质(BPI)、脂多糖结合蛋白质(LBP)及腭肺鼻上皮癌关联蛋白质(PLUNC)家族蛋白质的序列具有同源性。本文综述了OCX-36在蛋壳中的分布、基因结构以及生物活性。

细胞外基质蛋白质预测工具研究进展

细胞外基质蛋白质在细胞的一系列生物过程中发挥着重要作用,它的异常调节会导致很多重大疾病。理论细胞外基质蛋白质参考数据是实现细胞外基质蛋白质高效鉴定的基础,研究者们已经基于机器学习的方法开发出一系列的细胞外基质蛋白质预测工具。文中首先阐述了基于机器学习模型构建细胞外基质蛋白质预测工具的基本流程,之后以工具为单位总结了已有细胞外基质蛋白质预测工具的研究成果,最后提出了细胞外基质蛋白质预测工具目前面临的问题和可能的优化方法。

核基质结合区结合蛋白质1在胃癌中的表达及其与临床病理特征的关系

目的检测胃癌组织中核基质结合区结合蛋白质1(special AT-rich sequence-binding protein 1,SATB-1)与临床病理特征的相关性。方法应用免疫组织化学Envision法检测97例胃癌患者和20例癌旁组织中SATB1蛋白的表达,应用Spearman法分析其与临床病例特征的相关性。结果胃癌组织中SATB1蛋白表达阳性率为60%,高于癌旁组织10%,差异有统计学意义(P<0.05)。SATB1蛋白在胃癌中的阳性表达率与淋巴结转移,肿瘤浸润深度和临床TNM分期密切相关(P<0.05),与年龄、性别、肿块大小无显著相关性(P>0.05)。结论 SATB1在胃癌组织中的高表达预示胃癌恶性程度高,临床分期晚,可能存在淋巴结转移,预后不良,因此检测SATB1表达可作为临床筛选胃癌高危转移者、制定治疗方案和判断预后的一个新指标。

老年颅脑损伤急性期患者GCS评分与血清中超敏C反应蛋白、基质金属蛋白质-2和-9的关系

CT对颅脑损伤的诊断有重要价值,但是其判断病变程度及预后仍局限。近来人们更倾向于研究患者血清中的表达,并证实了相关蛋白的表达意义。高敏C反应蛋白（hs-CRP）是急性时相蛋白,基质金属蛋白质（MMP）-2、-9是MMP家族的经典成员,对细胞外基质有明显的降解作用,近年来研究显示hs-CRP、MMP-2、-9在颅脑损伤患者中高表达,对疾病进展有一定促进作用。

核基质结合区结合蛋白质1基因和环氧化酶-2基因在胃癌中的表达及意义

目的研究核基质结合区结合蛋白质1（SATB1）基因及环氧化酶-2（COX-2）基因在胃癌组织中的表达及其意义。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应检测30例胃癌组织及相应癌旁组织中SATB1基因、COX-2基因的表达,分析SATB1基因及COX-2基因表达与患者临床病理因素的相关性。结果胃癌组织中SATB1基因、COX-2基因表达量分别为癌旁组织的3.95倍和2.88倍,差异有统计学意义（P〈0.05）;SATB1基因、COX-2基因在胃癌组织中的表达与淋巴结转移、肿瘤-淋巴结-转移分期、肿瘤浸润深度有关（P〈0.05）,与性别、年龄、肿瘤分化程度无关（P〉0.05）。有淋巴结转移组SATB1基因、COX-2基因的表达量分别为无淋巴结转移组的1.99倍、2.38倍（P〈0.05）;T4组SATB1基因、COX-2基因的表达量分别为T1～T2组的2.61倍、1.97倍（P〈0.05）,Ⅰ期、Ⅱ期SATB1基因、COX-2基因的表达量差异无统计学意义（P〉0.05）,Ⅲ～Ⅳ期SATB1基因、COX-2基因的表达量分别为Ⅰ期的2.99倍和2.52倍（P〈0.05）。胃癌组织中SATB1基因与COX-2基因的表达呈正相关（r=0.482,P〈0.05）。结论SATB1基因和COX-2基因参与了胃癌的发展、浸润及转移,二者具有协同作用。

核基质结合区结合蛋白质1在乳腺癌中的表达及其临床意义

目的探讨核基质结合区结合蛋白质1（SATB1）在乳腺癌中的表达及其与临床病理特征的关系。方法用免疫组织化学sP法和qRT—PCR技术检测39例乳腺癌组织、19例对应癌旁组织、13例乳腺良性病变组织中SATB1蛋白及其mRNA的表达情况，分析SATB1及其mRNA表达与临床病理特征的关系。结果乳腺癌组织中SATB1阳性表达率为71．8％，明显高于乳腺良性病变的38．5％和癌旁组织的15．8％（P〈0．01）；SATB1mRNA在乳腺癌组织中的表达量分别为乳腺良性病变组织和癌旁乳腺组织的4．5倍；SATB1及mRNA在乳腺良性病变组织和癌旁乳腺组织之间的差异均无统计学意义（P〉0．05）。SATB1及其mRNA在肿瘤体积大、腋窝淋巴结转移数多、分期晚的乳腺癌组织中表达水平显著增高（P〈0．05）；而在不同年龄，不同组织学分级，不同人表皮生长因子受体-2（Herb-2）、雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）表达的乳腺癌组织中，SATB1及其mRNA表达的差异无统计学意义（P〉0．05）。SATB1与SATB1mRNA表达呈正相关（P〈0．01）。结论SATB1及SATB1mRNA表达水平增高与乳腺癌的发生、侵袭和转移密切相关，有望成为判断乳腺癌预后的一个重要指标。

口腔鳞癌转移与特异性核基质结合区结合蛋白质1(SATB1)表达的关系

目的：检测特异性核基质结合区结合蛋白质1在口腔鳞状细胞癌中的表达及其与浸润转移的关系。方法：采用免疫组织化学染色法及逆转录-聚合酶链反应检测SATB1在各组织中的表达。结果：52例口腔鳞癌原发灶中,SATB1蛋白在病理分级Ⅱ~Ⅲ级组（中~低分化鳞癌）表达明显高于Ⅰ级组（高分化鳞癌）（P〈0.05）;在临床分期Ⅲ~Ⅳ期组高于Ⅰ~Ⅱ期组（P〈0.05）。SATB1蛋白和mRNA的表达在16例淋巴结转移组高于36例无淋巴结转移组（P〈0.05）。SATB1mRNA的表达量在6例淋巴结转移灶高于16例转移组原发灶（P〈0.05）。结论：SATB1蛋白及SATB1mRNA在口腔鳞癌中的表达上调与口腔鳞癌的恶性程度及转移相关;SATB1可能在口腔鳞癌的发展、转移过程中起到促进的作用。

核基质结合区结合蛋白质1与肿瘤关系的研究进展

近年来恶性肿瘤的发病率呈持续上升状态,严重威胁着人类的健康和生存质量。肿瘤转移是恶性肿瘤的标志之一,如何控制肿瘤的转移播散是一直困扰着研究者和医务人员的问题。核基质结合区结合蛋白质1因在肿瘤转移和细胞凋亡方面的重要作用成为学者研究的热点之一,临床疾病相关的研究发现其在乳腺癌、肺癌、胃癌等恶性肿瘤中呈高表达倾向。

特异性核基质结合区结合蛋白质1(SATB1)与肿瘤发生、发展和转移的研究进展

肿瘤的发生、发展以及转移是一个涉及多基因调控的过程，特别是肿瘤转移，更是由多种肿瘤转移基因及转移抑制基因参与调节的复杂过程。随着研究的不断深入，人类在乳腺癌、前列腺癌、膀胱癌和结肠癌等恶性肿瘤中相继发现肿瘤相关性核基质结合蛋白[1-5]，并探明了这些核基质结合蛋白成分、结构和功能在肿瘤发生发展中的重要作用，为肿瘤的诊断、判断预后及治疗提供了非常有价值的依据。SATBI是一种组织特异性的核基质结合蛋白，主要在胸腺细胞中高水平表达[5]。目前，已有资料揭示SATBl参与了某些肿瘤相关基因的表达调节，与肿瘤的发展及转移有着密切联系。

特异性核基质结合区结合蛋白质1在口腔良恶性肿瘤中表达的初步研究

目的检测特异性核基质结合区结合蛋白质1(special AT-rich sequence binding protein 1,SATB1)在口腔常见良恶性肿瘤中的表达,初步分析其表达与口腔鳞癌病理分级的关系。方法选口腔鳞癌36例,腺样囊性癌14例,口腔多形性腺瘤4例,口腔白斑4例,正常牙龈组织2例。采用免疫组织化学染色法检测SATB1在各组织中的表达差异。结果 SATB1主要表达于肿瘤细胞胞核中。口腔鳞癌36例中14例(38.9%)SATB1表达阳性,主要表达于细胞浆中,部分表达于细胞核内;腺样囊性癌14例(100.0%)SATB1表达阳性,主要表达于细胞核中,表达较口腔鳞癌明显;1例多形性腺瘤组织和1例口腔白斑组织有少量SATB1弱阳性表达;2例口腔正常牙龈上皮组织中SATB1未见明显表达。SATB1在Ⅱ～Ⅲ级鳞癌表达明显高于Ⅰ级鳞癌(P<0.01)。结论 SATB1在口腔鳞癌中主要表达于胞浆,并与病理分级有关,在腺样囊性癌中主要表达于胞核。

核基质结合区结合蛋白质1研究进展

核基质相关蛋白改变是恶性肿瘤细胞的主要表现形式,可使染色质发生折叠、基因复制保真度和基因表达发生改变。核基质结合区(MAR)结合蛋白(MARBPs)表达异常可影响染色质构成、干扰转录调控程序,致肿瘤形成。某些MARBPs特异性表达于肿瘤组织,是肿瘤诊断和预后的指标。核基质结合区结合蛋白质1(SMAR1)在乳腺癌中的表达急剧下调。本文就SMAR1在细胞生长、凋亡和肿瘤形成中的作用作一综述。

老年颅脑损伤急性期患者GCS评分与血清中超敏C反应蛋白、基质金属蛋白质-2和-9的关系

目的研究老年颅脑损伤急性期患者格拉斯哥昏迷评分(GCS)评分与血清中超敏C反应蛋白(hsCRP)、基质金属蛋白质-2(MMP-2)和基质金属蛋白质-9(MMP-9)的关系,为临床诊疗提供依据。方法选取2014年1月至2015年1月我院收治的老年颅脑损伤急性期患者150例,根据GCS评分将患者分为轻度组(57例)、中度组(51例)和重度组(42例),另选取同期健康体检者50例作为对照组,检测各组受检者的hs-CRP、MMP-2和MMP-9水平,应用Spearman秩相关性分析GCS评分与hs-CRP、MMP-2和MMP-9的关系。结果对照组受检者的hs-CRP、MMP-2和MMP-9水平分别为(2.09±0.62)ng/mL、(15.23±0.86)ng/mL、(13.09±1.59)ng/mL,均明显低于轻度组的(7.09±1.32)ng/mL、(87.08±5.34)ng/mL、(70.53±8.53)ng/mL以及中度组的(18.34±0.87)ng/mL、(103.64±6.62)ng/mL、(108.71±6.08)ng/mL和重度组的(28.13±0.63)ng/mL、(189.42±9.03)ng/mL、(189.42±2.64)ng/mL,轻度组hs-CRP、MMP-2和MMP-9水平均明显低于中度组和重度组,中度组hs-CRP、MMP-2和MMP-9水平明显低于重度组,差异均具有统计学意义(P<0.05);Spearman秩相关性分析显示,GCS评分与hs-CRP、MMP-2和MMP-9均呈负相关(P<0.05)。结论老年颅脑损伤急性期患者的hs-CRP、MMP-2和MMP-9水平均会升高,且GCS评分与hs-CRP、MMP-2和MMP-9水平呈负相关关系,临床上可通过测定血清hs-CRP、MMP-2和MMP-9水平来反映颅脑损伤程度。

蛋白质基质脂肪模拟物制备方法及其应用的研究进展

随着人们对饮食健康的关注日益增加,脂肪摄入过多带来的负面影响渐渐被人们正视。因此,脂肪替代品应运而生。脂肪模拟物作为脂肪替代品的一部分,由于其安全可靠得到了国内外的广泛研究。脂肪模拟物的制备是生产低脂食品的关键环节,目前蛋白质基质的脂肪模拟物主要通过物理方法、化学方法或者酶解法来制备,其应用主要在肉制品、乳制品、烘焙制品以及色拉调味品中。通过总结近年来国内外对脂肪模拟物的研究,对蛋白质基质脂肪模拟物的制备方法进行了分类阐述,并对不同的方法进行了分析和展望;对蛋白质基质脂肪模拟物的原料蛋白及其应用进行了较全面的总结。

联合检测尿核基质蛋白22和尿脱落细胞在监测膀胱癌术后复发中的临床价值

目的探究联合检测尿脱落细胞和尿核基质蛋白22(NMP22)在监测膀胱癌术后复发中的临床应用价值。方法对我院2017年10月至2022年3月收治的106例膀胱癌手术后患者行荧光膀胱镜检查,检查前分别留取尿液样本行NMP22和尿脱落细胞检测;以荧光膀胱镜检查和病理结果为金标准,评价单独检测与联合检测NMP22和尿脱落细胞在诊断膀胱癌复发中的敏感性、特异性、准确性、阳性率和癌检出率,以及在不同分期、分级肿瘤中的阳性检出率。结果单独检测NMP22和尿脱落细胞诊断膀胱癌复发的敏感性分别为60.78%和50.98%,特异性分别为78.18%和87.27%,准确性均为69.81%,而联合检测的敏感性高达92.16%、特异性为74.55%、准确性升至83.02%。联合检测NMP22和尿脱落细胞的阳性率(57.55%)、癌检出率(44.34%)均高于单独检测NMP22的阳性率(40.57%)、癌检出率(29.25%)以及单独检测尿脱落细胞的阳性率(31.13%)、癌检出率(24.53%)。在Ta期和G1级肿瘤中,联合检测的阳性率明显高于单独检测尿脱落细胞的阳性率(P<0.05);在T1期肿瘤中,联合检测的阳性率明显高于单独检测NMP22的阳性率(P<0.05);在G2级肿瘤中,联合检测的阳性率明显高于单独检测NMP22和单独检测尿脱落细胞的阳性率(P<0.05)。结论联合检测NMP22和尿脱落细胞可以明显提高诊断膀胱癌复发的敏感性、准确性、阳性率和癌检出率,提高在Ta、T1期和G1、G2级肿瘤中的检出阳性率,可在行膀胱镜复查前为膀胱癌患者提供更充分、全面及准确的评估,具有一定的临床意义。

新辅助化疗对胃癌细胞超微结构及核基质结合区结合蛋白质1表达的影响

目的探讨新辅助化疗对胃癌细胞超微结构的影响与对胃癌组织中核基质结合区结合蛋白质1(Special AT rich sequence binding protein 1,SATB1)表达的关系。方法对2013年12月至2015年12月江苏省中医院消化系肿瘤外科60例进展期胃癌患者术后癌组织进行超微结构观察,60例中40例行新辅助化疗,其中20例用介入途径(介入组),20例用静脉途径(静脉组),另20例直接行手术治疗为对照组。同时检测新辅助化疗前、后胃癌组织及癌旁组织SATB1的免疫组化表达。结果对化疗敏感的病例癌细胞的细胞器严重损伤,包括核固缩、线粒体和内质网肿胀;对化疗不敏感的病例癌细胞的细胞器未受破坏或仅轻度损伤,其中介入组细胞损伤程度高于静脉组(P=0.047)。在癌细胞损伤明显的病例中,SATB1的表达更加明显(P=0.035)。结论介入法新辅助化疗对胃癌细胞的损伤作用更大。SATB1的表达与胃癌细胞损伤程度相关,可作为评估新辅助化疗疗效新的标志物。

翡翠贻贝外套膜转录组及贝壳珍珠质层和肌棱柱层蛋白质组分析

贝类贝壳在生物材料学及仿生学研究中占据着重要地位。贝壳基质蛋白质是贝壳中的主要有机质成分,对贝壳的形成以及贝壳的力学性能至关重要。翡翠贻贝(Perna viridis)贝壳主要由肌棱柱层和珍珠质层两种微观结构组成,其结构层次较简单,是研究贝壳基质蛋白质及其与贝壳形成关系的极好材料。为深入研究翡翠贻贝贝壳基质蛋白质的分子组成以及分布特点,首先采用扫描电子显微镜,观察翡翠贻贝贝壳内表面珍珠质层和肌棱柱层的微观结构;采用刮取法获得贝壳内表面珍珠质层和肌棱柱层的粉末;对不同层次的贝壳粉末,利用酸溶法去除碳酸钙成分,所获得的有机质组分通过离心将其分为酸可溶性组分和酸不溶性组分。采用Illumina深度测序技术对翡翠贻贝外套膜组织进行大规模测序和序列组装,在此基础上,采用LC-MS/MS质谱技术结合外套膜转录组数据库搜索,对翡翠贻贝肌棱柱层和珍珠质层贝壳基质蛋白质开展组学分析。扫描电镜观察结果表明,翡翠贻贝贝壳有两种不同形貌结构的层次,其中珍珠质层为片状堆叠结构,而肌棱柱层为柱状结构。翡翠贻贝外套膜转录组测序共计获得69 859条Unigene。蛋白质组学鉴定结果表明,翡翠贻贝贝壳中总计鉴定到蛋白质54种,其中38种为肌棱柱层所特有蛋白质,3种珍珠质层特有蛋白质,另有13种在珍珠质层和肌棱柱层均被鉴定到。肌棱柱层特有蛋白质的分子多样性明显强于珍珠质层。上述研究为进一步探讨贝壳不同微观层次的形成机制,以及贝壳基质蛋白质对贝壳不同结构层次的调控作用机制奠定了基础。

2009年新型甲型H1N1流感病毒基质蛋白基因进化的新探讨

目的探讨甲型H1N1流感病毒基质蛋白(M)基因的进化规律及M2蛋白的氨基酸替代情况。方法从NCBI数据库下载甲型H1N1病毒M基因179条进行预分析,最终选取50条采用MEGA4.0软件对其进行比对,采用NJ法构建进化树,同时采用MEGA4.0软件对M2蛋白氨基酸序列进行比对。结果不同地区新型甲型H1N1流感病毒M基因同源性高,达99.6%～100.0%,但与历史上流行的H1N1和H3N2流感病毒M基因差异较大,仅与1999-2002年间香港地区流行的H3N2亚型猪流感病毒同源性较近,为96.7%～97.7%。2009年流行的新型甲型H1N1流感病毒与历年来流行的H1N1人流感病毒相比,在第11、13、14、16、20、28、31、43、54、57、77、78、82、86、89、93位氨基酸位点发生了变异;与历年来流行的H1N1禽流感病毒相比,在第13、14、16、31、43、55、77、89位氨基酸位点发生了变异;与H1N1猪流感病毒相比,在第13、14、19、43、55位氨基酸位点发生了变异。2009年流行的甲型H1N1流感病毒与历年来流行的H3N2人流感病毒相比,在第11、13、16、20、28、31、43、54、57、77、78、82、86、89、93位氨基酸位点发生了变异;与历年来在欧亚大陆流行的猪流感病毒相比,所比较的19个位点均有部分毒株发生变异;而与1999-2002年间在香港流行的H3N2猪流感病毒相比,仅在第13、14、21、43位氨基酸位点发生变异。结论此次新型甲型H1N1流感病毒M基因可能由香港地区流行的H3N2猪流感病毒重组而来。M2蛋白胞外编码区氨基酸位点发生变异,提示在疫苗研制方面应注意由此带来的影响。跨膜区的突变可能是导致此次新型甲型H1N1流感病毒对金刚烷胺类特异性抗病毒药物产生耐药性的原因,第43位氨基酸位点可能为引起此次耐药的主要位点。

细胞外基质蛋白1基因在病理性瘢痕中的差异表达

目的:病理性瘢痕包括增生性瘢痕和瘢痕疙瘩,比较细胞外基质蛋白1基因在增生性瘢痕和瘢痕疙瘩中的表达差异并分析其意义。方法:实验于2003-05/2005-01在南方医科大学分子生物学研究所完成。病理性瘢痕标本来源于南方医院整形外科手术患者,正常皮肤组织来源于无瘢痕体质趋势及无免疫性疾病的包皮手术标本。术前均征求患者同意后方留取标本。抽提增生性瘢痕和瘢痕疙瘩与正常皮肤组织的总RNA,反转录并双色荧光标记,与含有细胞外基质蛋白1基因的人类基因表达谱芯片杂交,经荧光扫描、数据处理和统计学分析,比较细胞外基质蛋白1基因在3种组织中的表达差异。结果:①芯片杂交图像显示荧光信号强度较高,背景均一,符合重复性和可靠性的要求和分析标准。②细胞外基质蛋白1基因在瘢痕疙瘩组织中的表达为正常皮肤组织的3.32倍,而在增生性瘢痕中的表达仅为正常皮肤组织的1.09倍。结论:细胞外基质蛋白1基因在瘢痕疙瘩中高表达而在增生性瘢痕中无差异表达,提示细胞外基质蛋白1基因在瘢痕疙瘩中呈特异性表达。

血管内皮生长因子与细胞外基质蛋白1在胃癌中的表达及意义研究

目的探讨VEGF、ECM-1在胃癌组织中的表达及其与胃癌临床病理特征之间的关系以及之间有无相关性。方法应用免疫组织化学染色技术检测血管内皮生长因子(VEGF)及ECM-1在胃癌及正常胃组织中的表达。结果 (1)VEGF/ECM-1蛋白在胃癌组织中与正常胃组织两组间差异有统计学意义(P<0.01)。(2)VEGF/ECM-1阳性表达在不同组织分化程度、不同胃癌浸润深度、不同TNM分期及是否有淋巴结转移间,均差异有统计学意义(P<0.05)。(3)VEGF和ECM-1蛋白的表达存在正相关关系。结论 VEGF、ECM-1在胃癌组织中呈高表达状态,并且两者的表达均与胃癌临床病理特征有相关性。