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基于mtDNA和rDNA基因序列的中国按蚊属塞蚊亚属种类的系统发育研究(双翅目:蚊科)
被引量:
12
1
作者
吴静
马雅军
马颖
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第9期1030-1038,共9页
【目的】应用mtDNA和rDNA基因特征重建中国按蚊属塞蚊亚属已知种类的系统发育关系,以阐明亚属内各蚊种的亲缘关系。【方法】对采自中国的按蚊属塞蚊亚属Anopheles(Cellia)20种蚊的mtDNA-COⅡ和rDNA-28S-D3序列进行测定和分析,以按蚊...
【目的】应用mtDNA和rDNA基因特征重建中国按蚊属塞蚊亚属已知种类的系统发育关系,以阐明亚属内各蚊种的亲缘关系。【方法】对采自中国的按蚊属塞蚊亚属Anopheles(Cellia)20种蚊的mtDNA-COⅡ和rDNA-28S-D3序列进行测定和分析,以按蚊属按蚊亚属Anopheles(Anopheles)的中华按蚊An.(An.)sinensis和赫坎按蚊An.(An.)hyrcanus为外群,采用COⅡ和D3单基因,以及"COⅡ+D3"联合数据组以邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯法(BI)等重建这些种类的系统发育树。【结果】mtDNA-COⅡ和rDNA-28S-D3序列的长度范围分别为685bp和375~410bp,在塞蚊亚属蚊种间的遗传距离分别为0.015~0.117和0.003-0.111。各系统树显示外群被合理分开,除在COⅡ树中新塞蚊系为并系外,各系均聚为单系群,新迈蚊系和迈蚊系亲缘关系最近。联合数据组构建的系统合意树显示中国塞蚊亚属各蚊种形成4支,除伪威氏按蚊与多斑按蚊种团未聚为单系群外,其他各种团和复合体成员种均分别聚在一起,各分支的置信值均大于50%。【结论】本研究获得的分子系统发育树清楚地显示了中国按蚊属塞蚊亚属各种类及系之间的系统发育关系,对其分类和防治研究具有参考价值。
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关键词
按
蚊
属
塞蚊亚属
分子系统学
MTDNA
rDNA
系统发育
下载PDF
职称材料
基于rDNA-ITS2序列的中国按蚊属塞蚊亚属部分种类的系统发育研究(双翅目:蚊科)
被引量:
12
2
作者
马雅军
吴静
马颖
《Entomotaxonomia》
CSCD
北大核心
2011年第4期245-256,共12页
应用rDNA-ITS2序列,采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)和最大似然法(ML),以按蚊亚属Anopheles的中华按蚊An.(An.)sinensis和赫坎按蚊An.(An.)hyrcanus为外群,对采自中国的按蚊属Anopheles塞蚊亚属Cellia21种蚊进行了系统发育分析。结果表...
应用rDNA-ITS2序列,采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)和最大似然法(ML),以按蚊亚属Anopheles的中华按蚊An.(An.)sinensis和赫坎按蚊An.(An.)hyrcanus为外群,对采自中国的按蚊属Anopheles塞蚊亚属Cellia21种蚊进行了系统发育分析。结果表明:rDNA-ITS2序列的长度范围为435~838bp,塞蚊亚属蚊种间遗传距离为0.027~0.496,平均值为0.336。各种方法重建的系统发育树均显示新迈蚊系Neomyzomyia为单系,新塞蚊系Neocellia和迈蚊系Myzomyia为并系。21种蚊在系统发育树中均分为4支,伪威氏按蚊An.pseudowillmori和塞沃按蚊An.sawadwongporni未归入多斑按蚊种团(An.maculatus group),其它各种团和复合体成员种的聚类关系与形态分类结果一致。本研究重建的分子系统发育树阐明了中国按蚊属塞蚊亚属各系及蚊种之间的亲缘关系,ITS2序列具有足够的信息贡献量。
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关键词
双翅目
按
蚊
属
塞蚊亚属
RDNA-ITS2
系统发育
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职称材料
rDNA-ITS2序列作为中国按蚊分子鉴别特征的评述:Ⅱ塞蚊亚属
被引量:
1
3
作者
伍桐
诸德源
+1 位作者
王一然
马雅军
《寄生虫与医学昆虫学报》
CAS
2014年第1期6-16,共11页
为评价核糖体DNA第2内转录间隔区( rDNA-ITS2)序列作为中国按蚊属塞蚊亚属蚊种鉴别的分子特征。笔者整理和分析了数据库中注册的所有中国记录的塞蚊亚属蚊种的rDNA-ITS2序列,并应用MEGA软件计算其在种内和种间的差异性( p距离)。截...
为评价核糖体DNA第2内转录间隔区( rDNA-ITS2)序列作为中国按蚊属塞蚊亚属蚊种鉴别的分子特征。笔者整理和分析了数据库中注册的所有中国记录的塞蚊亚属蚊种的rDNA-ITS2序列,并应用MEGA软件计算其在种内和种间的差异性( p距离)。截止2013年7月, GenBank中已注册ITS2序列共442条,隶属塞蚊亚属蚊27种。计算结果显示, ITS2序列在大多数种内的变异性小于1%;而注册的浅色按蚊、乌头按蚊和溪流按蚊的序列种内差异较大,无法确定其种特异序列;忽略上述3蚊种进行计算的其他种间序列差异性范围为2.80%(大劣按蚊与大劣按蚊D)~68.3%(多斑按蚊与迷走按蚊)。结果提示rDNA-ITS2序列在中国塞蚊亚属大多数蚊种中具有良好的种内保守性和种间解析度,少数种类无法区分。
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关键词
RDNA-ITS2
塞蚊亚属
鉴别
评述
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职称材料
题名
基于mtDNA和rDNA基因序列的中国按蚊属塞蚊亚属种类的系统发育研究(双翅目:蚊科)
被引量:
12
1
作者
吴静
马雅军
马颖
机构
第二军医大学病原生物学教研室
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第9期1030-1038,共9页
基金
国家自然科学基金委员会-云南省人民政府联合基金(U0932604)
上海市科委基础研究重点项目(No.08JC1405400)
文摘
【目的】应用mtDNA和rDNA基因特征重建中国按蚊属塞蚊亚属已知种类的系统发育关系,以阐明亚属内各蚊种的亲缘关系。【方法】对采自中国的按蚊属塞蚊亚属Anopheles(Cellia)20种蚊的mtDNA-COⅡ和rDNA-28S-D3序列进行测定和分析,以按蚊属按蚊亚属Anopheles(Anopheles)的中华按蚊An.(An.)sinensis和赫坎按蚊An.(An.)hyrcanus为外群,采用COⅡ和D3单基因,以及"COⅡ+D3"联合数据组以邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯法(BI)等重建这些种类的系统发育树。【结果】mtDNA-COⅡ和rDNA-28S-D3序列的长度范围分别为685bp和375~410bp,在塞蚊亚属蚊种间的遗传距离分别为0.015~0.117和0.003-0.111。各系统树显示外群被合理分开,除在COⅡ树中新塞蚊系为并系外,各系均聚为单系群,新迈蚊系和迈蚊系亲缘关系最近。联合数据组构建的系统合意树显示中国塞蚊亚属各蚊种形成4支,除伪威氏按蚊与多斑按蚊种团未聚为单系群外,其他各种团和复合体成员种均分别聚在一起,各分支的置信值均大于50%。【结论】本研究获得的分子系统发育树清楚地显示了中国按蚊属塞蚊亚属各种类及系之间的系统发育关系,对其分类和防治研究具有参考价值。
关键词
按
蚊
属
塞蚊亚属
分子系统学
MTDNA
rDNA
系统发育
Keywords
Anopheles
Cellia
molecular phylogenetics
mtDNA
rDNA
phylogeny
分类号
Q961 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
基于rDNA-ITS2序列的中国按蚊属塞蚊亚属部分种类的系统发育研究(双翅目:蚊科)
被引量:
12
2
作者
马雅军
吴静
马颖
机构
第二军医大学病原生物学教研室
出处
《Entomotaxonomia》
CSCD
北大核心
2011年第4期245-256,共12页
基金
国家自然科学基金委员会-云南省人民政府联合基金(U0932604)资助
文摘
应用rDNA-ITS2序列,采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)和最大似然法(ML),以按蚊亚属Anopheles的中华按蚊An.(An.)sinensis和赫坎按蚊An.(An.)hyrcanus为外群,对采自中国的按蚊属Anopheles塞蚊亚属Cellia21种蚊进行了系统发育分析。结果表明:rDNA-ITS2序列的长度范围为435~838bp,塞蚊亚属蚊种间遗传距离为0.027~0.496,平均值为0.336。各种方法重建的系统发育树均显示新迈蚊系Neomyzomyia为单系,新塞蚊系Neocellia和迈蚊系Myzomyia为并系。21种蚊在系统发育树中均分为4支,伪威氏按蚊An.pseudowillmori和塞沃按蚊An.sawadwongporni未归入多斑按蚊种团(An.maculatus group),其它各种团和复合体成员种的聚类关系与形态分类结果一致。本研究重建的分子系统发育树阐明了中国按蚊属塞蚊亚属各系及蚊种之间的亲缘关系,ITS2序列具有足够的信息贡献量。
关键词
双翅目
按
蚊
属
塞蚊亚属
RDNA-ITS2
系统发育
Keywords
Diptera
Anopheles
Cellia
rDNA-ITS2
phylogeny
分类号
Q969 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
rDNA-ITS2序列作为中国按蚊分子鉴别特征的评述:Ⅱ塞蚊亚属
被引量:
1
3
作者
伍桐
诸德源
王一然
马雅军
机构
第二军医大学热带医学与公共卫生学系热带传染病教研室
第二军医大学学员旅学员一队
出处
《寄生虫与医学昆虫学报》
CAS
2014年第1期6-16,共11页
基金
国家科技重大专项课题(2012ZX10004219-010)
2012年和2013年度第二军医大学大学生创新能力培养基金项目fMS2012018,MS2013054)
文摘
为评价核糖体DNA第2内转录间隔区( rDNA-ITS2)序列作为中国按蚊属塞蚊亚属蚊种鉴别的分子特征。笔者整理和分析了数据库中注册的所有中国记录的塞蚊亚属蚊种的rDNA-ITS2序列,并应用MEGA软件计算其在种内和种间的差异性( p距离)。截止2013年7月, GenBank中已注册ITS2序列共442条,隶属塞蚊亚属蚊27种。计算结果显示, ITS2序列在大多数种内的变异性小于1%;而注册的浅色按蚊、乌头按蚊和溪流按蚊的序列种内差异较大,无法确定其种特异序列;忽略上述3蚊种进行计算的其他种间序列差异性范围为2.80%(大劣按蚊与大劣按蚊D)~68.3%(多斑按蚊与迷走按蚊)。结果提示rDNA-ITS2序列在中国塞蚊亚属大多数蚊种中具有良好的种内保守性和种间解析度,少数种类无法区分。
关键词
RDNA-ITS2
塞蚊亚属
鉴别
评述
Keywords
rDNA-ITS2
subgenus Cellia
taxonomy
review
分类号
S476.3 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于mtDNA和rDNA基因序列的中国按蚊属塞蚊亚属种类的系统发育研究(双翅目:蚊科)
吴静
马雅军
马颖
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
12
下载PDF
职称材料
2
基于rDNA-ITS2序列的中国按蚊属塞蚊亚属部分种类的系统发育研究(双翅目:蚊科)
马雅军
吴静
马颖
《Entomotaxonomia》
CSCD
北大核心
2011
12
下载PDF
职称材料
3
rDNA-ITS2序列作为中国按蚊分子鉴别特征的评述:Ⅱ塞蚊亚属
伍桐
诸德源
王一然
马雅军
《寄生虫与医学昆虫学报》
CAS
2014
1
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