拟南芥复制因子C亚基3基因突变削弱了植物对紫外辐射的抗性(英文)

在前期以EMS(甲基磺酸乙酯)筛选更多抗生物和非生物逆境的突变体试验中,发现了1个从G到A的点突变体rfc3-1,该点突变削弱了植株抗紫外辐射的能力.将野生型拟南芥复制因子C亚基3基因转化到突变株rfc3-1后恢复了突变株的野生型表型,证明紫外辐射抗性异常表型是由拟南芥复制因子C亚基3基因突变所引起的,AtRFC3在拟南芥紫外辐射抗性中起重要作用.

拟南芥复制因子C亚基1在胚胎发生中起重要作用(英文)

复制因子C包含1个大亚基和4个小亚基,在DNA复制、损伤修复和细胞增殖中起重要作用,拟南芥复制因子C亚基1(AtRFC1)是人类复制因子C大亚基p140的同源蛋白。在对3个复制因子C亚基1的T-DNA插入突变株系rfc1-1、rfc1-2和rfc1-3的检验中,证实插入位点分别位于第16、19号外显子和启动子区域。T-DNA在外显子中的插入突变引起胚胎发育异常并导致胚胎和种子败育。将野生型拟南芥复制因子C亚基1基因转化到突变株系rfc1-1和rfc1-2后恢复了突变株的野生型表型,证明胚胎发生异常表型是由拟南芥复制因子C亚基1基因突变所引起的,AtRFC1在拟南芥胚胎发生中起重要作用。

人类复制因子C4在肺腺癌进展中的初步功能探究

目的:分析人类复制因子C第四大亚基(RFC4)在肺腺癌组织和细胞中的表达,探究其在肺腺癌进展中的作用。方法:通过starBase分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中RFC4在肺腺癌组织中的表达;通过Kaplan-Meier plotter分析RFC4与肺腺癌的预后关系;利用人肺腺癌细胞A549、H1437和人正常肺上皮细胞BEAS-2B分析RFC4在肺腺癌细胞中的表达情况;转染RFC4 siRNA后,利用CCK-8法和Transwell法检测RFC4 siRNA对肺腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。结果:RFC4在肺腺癌组织中高表达,并与肺腺癌预后有较强的相关性,RFC4表达越高,肺腺癌患者的总生存期和无复发生存期就越低,预后较差;同样地,RFC4在肺腺癌细胞系中的表达也高于正常肺上皮细胞;RFC4 siRNA降低了肺腺癌细胞中RFC4的表达,使肺腺癌细胞的增殖、迁移侵袭能力下降。结论:RFC4在肺腺癌细胞中高表达,并促进了肺腺癌细胞增殖、迁移和侵袭,涉及的详细分子机制还须进一步探究。

复制因子C蛋白复合物功能研究进展

复制因子C(repication factor C,RFC)是由5个亚基组成的蛋白复合物,在DNA复制和修复及细胞分裂增殖和抗逆性生长中具有重要的生物学功能。近年来,动物中有关RFC的研究发展较快,但是植物中有关RFC的研究起步较晚,研究相对滞后。从RFC蛋白复合体的组成与功能,酵母、人类和植物RFC各亚基的功能等方面综述RFC的研究进展。

基于多组学数据分析复制因子C4在肝细胞癌中的表达及预后

目的探讨复制因子C4(RFC4)作为肝细胞癌(HCC)潜在的预后标志物及其临床意义。方法使用基因表达谱分析(GEPIA)、Oncomine、UALCAN、人类蛋白图谱数据库和Kaplan-Meier plotter网站,分析RFC4 mRNA和蛋白在HCC中的表达,探讨其表达水平与HCC临床病理特征和预后的关系。通过cBioPortal网站分析HCC中RFC4的基因突变、拷贝数变异、mRNA表达及与预后的关系。利用String、Metascape数据库和Cytoscape软件对共表达基因和蛋白间的相互作用进行分析及可视化处理,并预测其生物学功能。结果与正常组织相比,RFC4 mRNA在HCC中显著高表达(P=4.58×10-8),同时发现RFC4 mRNA的表达水平与HCC的淋巴结转移、肿瘤分期及病理分级有关(P<0.05)。生存分析结果显示,相比RFC4 mRNA低表达组,RFC4 mRNA高表达组患者的总生存时间(HR=1.81,95%CI:1.26~2.59;P=0.001)、无进展生存时间(HR=1.65,95%CI:1.20~2.26;P=0.0019)及无复发生存时间(HR=1.70,95%CI:1.19~2.42;P=0.0029)均显著缩短。相比无RFC4基因改变组,RFC4基因变异组患者的预后更差(P<0.05)。富集分析结果显示,RFC4与其相关表达基因主要参与细胞周期、细胞分裂、DNA复制和修复等生物学过程。结论HCC中RFC4过度表达与预后相关,其可能是HCC潜在的预后生物标志物。

复制因子C亚基3基因突变对拟南芥开花和种子发育的影响

以拟南芥突变体rfc3-1为材料,研究了拟南芥复制因子C亚基3(AtRFC3)基因突变对拟南芥植株开花和种子发育的影响。结果表明:RFC3基因突变导致rfc3-1的开花时间比野生型植株提前1周,呈小花表型,且导致种子发育异常。将野生型AtRFC3基因转化到突变体rfc3-1后,恢复了突变株的野生型表型,证实AtRFC3基因在拟南芥花器官和种子发育中起重要作用。

肺鳞状细胞癌组织中Flap-核酸内切酶1和复制因子C2的表达及临床意义

目的探讨肺鳞状细胞癌组织中Flap-核酸内切酶1(Flap-endonuclease 1,FEN1)和复制因子C2(replication factor C2,RFC2)的表达及其临床意义。方法采用生物信息学方法分析FEN1、RFC2在肺鳞状细胞癌组织中的表达;采用免疫组化法检测80例肺鳞状细胞癌及癌旁组织中FEN1和RFC2蛋白的表达,利用RT-PCR法检测两者mRNA表达并分析相关性,分析FEN1、RFC2与临床病理特征的关系;收集患者随访资料,绘制患者的生存曲线。结果FEN1和RFC2在肺鳞状细胞癌组织中的高表达率分别为77.50%(62/80)、70.00%(56/80),在癌旁组织中的高表达率分别为42.50%(34/80)、32.50%(26/80),与公共数据库分析结果一致。RT-PCR结果显示,肺鳞状细胞癌组织中RFC2、FEN1 mRNA表达均高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.01);相关性分析结果显示,两者的表达存在明显正相关。不同TNM分期患者的FEN1、RFC2蛋白表达差异有统计学意义,是否存在胸膜侵犯与RFC2蛋白的表达差异有关。FEN1、RFC2高表达肺鳞状细胞癌患者的总生存期均低于低表达组。单因素分析结果表明:RFC2高表达、FEN1高表达、TNM分期与肺鳞状细胞癌患者的预后有关;多因素分析结果表明:TNM分期、FEN1和RFC2高表达是影响肺鳞状细胞癌患者预后的独立危险因素。结论FEN1和RFC2有助于评估肺鳞状细胞癌患者的预后,两者之间存在协同作用,可能成为新的肿瘤标志物。

复制因子C4在胰腺导管腺癌中的表达及其与预后相关性研究

目的检测复制因子C4(RFC4)在胰腺导管腺癌组织中的表达情况,初步探究RFC4与胰腺导管腺癌的临床预后关系。探讨RFC4作为胰腺导管腺癌潜在的生物标志物的可能性。方法通过生物信息学的方法分析RFC4在胰腺导管腺癌组织及癌旁正常组织中的mRNA水平,并分析其表达与胰腺导管腺癌患者的生存率间的关系。回顾性分析76例接受手术治疗的胰腺导管腺癌患者的临床病理资料。采用免疫组化法检测胰腺导管腺癌组织和癌旁正常组织中的RFC4蛋白的表达水平,分析其与胰腺导管腺癌患者临床病理特征的关系。结果生物信息学分析结果显示,RFC4的mRNA在胰腺导管腺癌组织中显著高表达,并与患者总生存率(P=0.046)与无病生存率(P=0.042)显著相关。免疫组化结果表明,RFC4在胰腺导管腺癌组织中的表达明显高于癌旁正常组织。RFC4在胰腺导管腺癌组织中的高表达与肿瘤大小相关(P=0.043),而与年龄、性别、肿瘤分级的相关性无统计学意义(均P>0.05)。结论胰腺导管腺癌组织中RFC4呈显著高表达并提示不良预后,且其表达水平与胰腺导管腺癌患者肿瘤大小有关。RFC4可能作为胰腺导管腺癌潜在的预后预测因子。

细胞周期相关基因的胶质母细胞瘤预后模型构建及RFC2的细胞增殖效应研究

目的研究复制因子C亚基2(RFC2)与胶质母细胞瘤(GBM)患者预后和肿瘤细胞增殖之间的关系,并探索其在GBM发展中的潜在分子通路。方法利用生物信息学方法,筛选出可作为GBM独立预后因素的细胞周期基因,结合临床指标,构建GBM患者风险评分模型并验证其预测能力,对目标基因RFC2进行GO、KEGG和GSEA分析。取对数生长期的U87 GBM细胞进行慢病毒转染后分组(空白对照组、shRFC2#1、shRFC2#2),通过qRT-PCR、Western blotting、Edu染色、克隆形成实验检测mRNA表达、蛋白表达和细胞增殖。结果RFC2在GBM中表达上调,并随着胶质瘤病理级别升高,呈明显上升趋势。基因功能与通路分析结果提示,RFC2在姐妹染色体分离、染色体分离、细胞器裂变、核分裂、核有丝分裂等进程中,促进细胞周期过程中G1向S期转变。qRT-PCR和Western blotting结果显示,相较空白对照组,慢病毒敲低组中转录mRNA减少(P<0.0001)、翻译蛋白量减少;同样,与空白对照组相比,慢病毒敲低组Edu染色阳性率降低(P<0.0001),集落形成能力相应降低(P<0.001)。结论RFC2在GBM中高表达,且与胶质瘤分级和患者不良预后相关,促进GBM细胞增殖;RFC2有可能成为GBM潜在的生物标志物和治疗靶标。

不同妊娠滋养细胞疾病组织中RFC2、PCNA表达的研究

背景与目的:基因表达谱芯片检测发现葡萄胎和绒毛膜癌存在复制因子C(replicationfactorC,RFC)高表达。复制因子C亚单位2(replicationfactorCsubunit2,RFC2)与DNA的复制和修复及细胞周期信号检查点的功能有关。本研究检测RFC2和增殖细胞核抗原(proliferatingcellnuclearantigen,PCNA)蛋白在妊娠滋养细胞疾病(gestationaltrophoblasticdisease,GTD)中的表达情况,探讨二者表达的意义。方法:采用免疫组化SP法检测15例正常绒毛、38例葡萄胎、42例侵蚀性葡萄胎和18例绒毛膜癌组织中RFC2和PCNA蛋白表达情况。结果:葡萄胎、侵蚀性葡萄胎、绒毛膜癌组织中的RFC2和PCNA蛋白表达水平显著高于正常绒毛(PRFC2=0.000,PPCNA=0.004)。葡萄胎、侵蚀性葡萄胎、绒毛膜癌组织中RFC2的表达水平无显著性差异(P值分别为1.000、0.256)。术前未化疗的滋养细胞肿瘤患者(包括侵蚀性葡萄胎和绒毛膜癌)的RFC2表达高于术前化疗≥3疗程者(P=0.028)。WHOⅢ期者RFC2蛋白表达高于Ⅰ期者(P=0.01)。WHO预后评分为高危者,其RFC2表达显著高于低危者(P=0.018)。绒毛膜癌组织中PCNA的表达高于葡萄胎(P=0.037),葡萄胎恶变者PCNA的表达高于未恶变者(P=0.039)。高危组、中危组PCNA的表达高于低危组(P=0.036,P=0.048)。PCNA的表达与滋养细胞肿瘤术前?

子宫内膜癌组织中GMNN、RFC4表达变化及其与患者预后的关系

目的分别从生物信息学、组织标本的角度观察人子宫内膜癌组织中Geminin(GMNN)及人类复制因子C第四大亚基(RFC4)的表达变化,分析其与患者预后的关系。方法利用UALCAN数据库分析GMNN、RFC4 mRNA和蛋白在子宫内膜癌组织和正常子宫内膜组织中的表达差异,利用OncoLnc数据库比较GMNN、RFC4 mRNA高表达与低表达子宫内膜癌患者的总生存率,利用GEPIA数据库分析GMNN与RFC4mRNA表达的相关性。取手术切除的40例子宫内膜癌患者的新鲜癌组织和癌旁组织标本,采用RT-qPCR法检测GMNN、RFC4 mRNA表达。取正常子宫内膜组织120例、不典型增生子宫内膜组织100例、子宫内膜癌组织133例石蜡标本,采用免疫组化EnVision法检测GMNN、RFC4蛋白表达,比较不同临床病理参数的子宫内膜癌患者肿瘤组织GMNN、RFC4蛋白表达的差异。Kaplan-Meier生存分析法比较不同GMNN、RFC4蛋白表达水平患者的总生存率,Cox回归分析法分析影响子宫内膜癌患者预后的相关因素;Pearson相关分析法分析GMNN、RFC4蛋白在子宫内膜癌组织中表达的相关性。结果生物信息学分析显示,GMNN、RFC4 mRNA和蛋白在人子宫内膜癌中的表达均高于正常子宫内膜组织(P均<0.05);GMNN及RFC4 mRNA高表达患者的生存时间均低于低表达患者(P均<0.05);GMNN与RFC4 mRNA表达呈正相关(r=0.58,P <0.01)。组织标本检测显示,GMNN、RFC4 mRNA在子宫内膜癌组织中的表达均高于癌旁组织(P均<0.05);GMNN、RFC4蛋白在子宫内膜癌中的高表达率高于正常子宫内膜组织和不典型子宫内膜组织(P均<0.05),合并淋巴结转移、FIGO病理分期Ⅲ+Ⅳ期、Ki67表达阳性、p53表达阳性患者的GMNN、RFC4蛋白高表达率分别高于无淋巴结转移、FIGO病理分期Ⅰ+Ⅱ期、Ki67表达阴性、p53表达阴性的患者(P均<0.05)。GMNN、RFC4蛋白高表达患者的总生存率低于低表达患者(P均<0.05),GMNN蛋白高表达、RFC4蛋白高表达、淋巴结转移、FIGO病理分期Ⅲ+Ⅳ期、Ki-67阳性是子宫内膜癌患者预后的独立影响因素(P均<0.05)。GMNN与RFC4蛋白在子宫内膜癌组织中的表达呈正相关(rs=0.303,P <0.01)。结论 GMNN、RFC4mRNA及蛋白在子宫内膜癌组织中表达升高,其表达水平与子宫内膜癌的恶性生物学行为、预后密切相关,两者可能作为子宫内膜癌诊断和治疗的新靶点。

宫颈癌进展中潜在肿瘤标志物的生物信息学分析

目的用生物信息学分析方法研究宫颈癌的潜在肿瘤标志物。方法从基因表达(GEO)数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)中下载三个数据集,鉴定差异表达基因(DEGs)并筛选Hub基因,进行基因本体论(GO)和《京都基因与基因组百科全书》(KEGG)通路富集分析。结果通过一系列生物信息学分析最终确定,在宫颈癌进展过程中可能存在4个潜在靶基因[DNA复制起始因子45(CDC45),复制因子C4(RFC4),驱动蛋白家族成员2C(KIF2C),DNA拓扑异构酶Ⅱα(TOP2A)]。结论CDC45、RFC4、KIF2C和TOP2A可能是宫颈癌的潜在肿瘤标志物,具有重要的研究价值。

小脑性共济失调伴神经病和前庭反射消失综合征的研究进展

小脑性共济失调伴神经病和前庭反射消失综合征(CANVAS)是一种以小脑性共济失调、感觉神经病和双侧前庭病变为特征的常染色体隐性遗传病。最近研究证实复制因子C亚单位1(RFC1)基因内含子区的AAGGG双等位重复扩增是该病的致病原因。近2年研究者通过对基因确诊的CANVAS进行临床研究,显著扩展了该病的临床表型并提出了RFC1基因相关疾病这一概念。文中对CANVAS的临床表现、特征性辅助检查和遗传学改变作一系统综述并对其诊断标准进行讨论,以提高临床医师对该病的认识。