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基于机器学习方法的拟南芥基因组DNA复制时间预测研究
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作者 李椰 李东维 +1 位作者 李昭宏 杨若林 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2021年第4期133-141,共9页
[目的]基于机器学习方法,构建拟南芥基因组DNA复制时间分类器,探究与复制时间相关的表观遗传修饰,为进一步研究DNA复制时间的表观遗传调控机制提供参考。[方法]收集拟南芥全基因组的DNA复制时间数据和多种DNA表观遗传修饰特征(ChIP-Seq... [目的]基于机器学习方法,构建拟南芥基因组DNA复制时间分类器,探究与复制时间相关的表观遗传修饰,为进一步研究DNA复制时间的表观遗传调控机制提供参考。[方法]收集拟南芥全基因组的DNA复制时间数据和多种DNA表观遗传修饰特征(ChIP-Seq)数据,以及染色质开放状态(DNase-Seq)数据,先通过t-SNE初步对DNA表观遗传修饰特征数据降维来衡量DNA复制早晚的可预测性,并利用皮尔逊相关系数计算了多种DNA表观遗传特征与DNA复制时间信号两两之间的相关性,再通过构建随机森林、多类别逻辑回归和支持向量机3种分类器对DNA复制时间进行建模分析,以十折交叉验证和ROC曲线下的面积(AUC)为衡量指标,用80%的数据建模,20%的数据对模型效果进行验证。[结果]3种分类器对DNA复制时间都具有良好的预测能力,平均AUC均达0.8以上。DNA复制早期信号与RNA聚合酶Ⅱ结合信号以及染色质开放状态信号等呈正相关,而复制晚期信号则与其呈负相关。其中H3.1、H3.3、H2AW、H4K16ac、H3K36me3、H3K4me3均可能与DNA复制时间存在密切关系。[结论]拟南芥基因组DNA复制时间可以通过表观遗传修饰进行准确预测,其中对DNA复制晚期的预测最为准确;并发现了与DNA复制时间关系密切的组蛋白变体及表观遗传修饰。 展开更多
关键词 拟南芥 DNA复制时间 表观遗传修饰特征 机器学习
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编码中断及中断位置对时间复制的影响 被引量:1
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作者 尹华站 张锋 黄希庭 《西南大学学报(社会科学版)》 CSSCI 北大核心 2009年第5期18-21,共4页
为了探讨时间复制任务中是否存在编码方式(连续编码和中断编码)和中断位置效应,实验1和2分别考察编码阶段有无中断和中断位置对时间复制成绩的影响。结果发现,对于1 700 ms靶时距而言,两种编码方式条件下的时间复制成绩无显著差异;对于2... 为了探讨时间复制任务中是否存在编码方式(连续编码和中断编码)和中断位置效应,实验1和2分别考察编码阶段有无中断和中断位置对时间复制成绩的影响。结果发现,对于1 700 ms靶时距而言,两种编码方式条件下的时间复制成绩无显著差异;对于2 300 ms靶时距而言,中断编码任务条件下显著较连续编码任务条件下时间复制长度短。而且,不管对1 700 ms还是2 300 ms靶时距而言,随着中断位置越靠后,时间复制长度都越短。这说明,编码中断及中断位置对时间复制有显著影响,时间复制任务中存在中断位置效应。 展开更多
关键词 时间复制 中断编码 连续编码 中断位置
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时间复制任务中的计时中断效应 被引量:1
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作者 尹华站 黄希庭 《心理与行为研究》 CSSCI 2008年第3期161-165,共5页
以计时中断范式和时间复制任务相结合,考察了时间复制任务中是否存在计时中断效应。结果表明:(1)计时中断范式中1700ms和2300ms时距复制均出现高估现象,说明两种时距均低于相邻的高低估现象的转换点;(2)计时中断范式中1700ms和2300ms的... 以计时中断范式和时间复制任务相结合,考察了时间复制任务中是否存在计时中断效应。结果表明:(1)计时中断范式中1700ms和2300ms时距复制均出现高估现象,说明两种时距均低于相邻的高低估现象的转换点;(2)计时中断范式中1700ms和2300ms的时距复制任务没有支持计时标量特性;(3)计时中断范式中1700ms和2300ms的时间复制任务出现了计时中断效应。 展开更多
关键词 时间复制 计时中断 标量特性 高低估现象
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连续时间动态复制定理的推广与证明(英文)
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作者 刘海龙 吴冲锋 《控制理论与应用》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第3期453-456,共4页
推广了由Bertsimas,KoganandLo (1997) [1] 提出的非完全市场中的连续时间动态复制定理 ,然后 ,我们运用随机最优控制理论证明了这个定理 .
关键词 连续时间动态复制定理 推广 证明 随机最优控制理论
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基因组印迹调节 被引量:1
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作者 余升红 《生物技术》 CAS CSCD 2005年第3期83-85,共3页
虽然大多数哺乳动物基因都是双座位表达,但是有一少部分基因发生印迹,只有父母双方基因中的一个实际表达,这种表观遗传过程迁涉到发育不同阶段基因的表达调节,十分复杂,原则上印迹基因在生殖细胞中必须用表观遗传标记顺式标记,这些标记... 虽然大多数哺乳动物基因都是双座位表达,但是有一少部分基因发生印迹,只有父母双方基因中的一个实际表达,这种表观遗传过程迁涉到发育不同阶段基因的表达调节,十分复杂,原则上印迹基因在生殖细胞中必须用表观遗传标记顺式标记,这些标记能够通过细胞分裂进行保存,在成熟生物分化细胞中能够指导多基因单座位表达,在生殖细胞形成早期两个座位上的表达差别必须消除,以便在成熟生殖细胞中重新设置印迹,在该文中,概述了目前所知介导这些过程的分子机制。 展开更多
关键词 DNA甲基化 复制时间 反义RNA
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网络、信息池与时间复制——网络复制经济模型 被引量:31
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作者 张永林 《经济研究》 CSSCI 北大核心 2014年第2期171-182,共12页
本文通过网络与信息的内在关系研究信息集聚、衍生与创新,揭示网络信息池特征,给出时间复制概念,构建复制经济模型论证网络经济的效率递增性、协同效应与内生规模经济。本文发现,在网络经济中,物质流已经转化为信息流,信息不再是虚拟的... 本文通过网络与信息的内在关系研究信息集聚、衍生与创新,揭示网络信息池特征,给出时间复制概念,构建复制经济模型论证网络经济的效率递增性、协同效应与内生规模经济。本文发现,在网络经济中,物质流已经转化为信息流,信息不再是虚拟的存在,而是物质性的创新;在现代的网络概念中,时间、空间与信息统一,每个行为主体都是信息的生产者、媒介和消费者;通过"时间复制"把信息和空间等网络元素转化为时间,根据时间与货币收入的内在关系转化、突破和克服网络信息等经济要素的量化和边际分析困难。本文工作为信息经济与网络经济等相关研究提出本源性发现和分析方法。 展开更多
关键词 网络 信息池 时间复制 网络协同效应 复制经济模型
原文传递
期望中断效应的注意共享解释—来自ERP的证据
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作者 尹华站 黄希庭 李丹 《心理学探新》 CSSCI 2009年第6期67-70,78,共5页
以1700毫秒和2300毫秒为考察时距,采用时距复制任务,对编码阶段的中断位置进行操纵,并记录了14名大学生在进行时距复制任务时编码阶段的事件相关电位(ERP)。行为结果发现:分别就1700毫秒和2300毫秒而言,中断位置越靠后,复制时距越短。... 以1700毫秒和2300毫秒为考察时距,采用时距复制任务,对编码阶段的中断位置进行操纵,并记录了14名大学生在进行时距复制任务时编码阶段的事件相关电位(ERP)。行为结果发现:分别就1700毫秒和2300毫秒而言,中断位置越靠后,复制时距越短。脑电结果发现:无中断条件的(控制任务1)编码阶段在350~550毫秒和350~1150毫秒的CNV平均波幅分别较中断位置为550毫秒的条件和中断位置为1150毫秒条件显著更高;无中断条件的(控制任务2)编码阶段在350~750毫秒和350~1550毫秒的CNV平均波幅分别较中断位置为750毫秒的条件和中断位置为1550毫秒条件显著更高。这说明了间断编码的时间复制任务中存在期望中断效应且以注意共享机制解释期望中断效应得到了电生理学证据的直接支持。 展开更多
关键词 时间复制 期望中断效应 注意共享 CNV波幅
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五大记录型DVD之比较
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作者 关月 《视听技术》 2003年第10期45-46,共2页
DVD-R的生产量是其他格式总和的2倍。而旦,DVD-R的性价比也是最高的。今后DVD-R将占据难以撼动的主流地位几成定局。
关键词 DVD—R 复制时间 互换性 DVD+R DVD-RAM DVD-RW DVD+RW
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新品大全
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《电脑采购》 1998年第22期8-9,共2页
PowerShotA5是佳能公司新推出的世界上最小的XGA级数码相机,它的体积为103mm(长)*68mm(宽),重量只有230克(不含电池)。Power Shot A5造型独特,采用铝合金机身、伸缩镜头、可放在T恤的口袋内,携带方便。PowerShotA5拥有810,000像素的CCD... PowerShotA5是佳能公司新推出的世界上最小的XGA级数码相机,它的体积为103mm(长)*68mm(宽),重量只有230克(不含电池)。Power Shot A5造型独特,采用铝合金机身、伸缩镜头、可放在T恤的口袋内,携带方便。PowerShotA5拥有810,000像素的CCD(图像传感器)及标准5毫米高光学分辨率镜头,配合两个非球面镜片元素,可将失真度减至最低,其图像分辨率高达1024*768。PowerShotA5利用佳能原创讯号处理的集成电路,可减少复制时间。 展开更多
关键词 图像传感器 数码相机 铝合金 图像分辨率 光学分辨率 集成电路 非球面镜 复制时间 佳能公司 失真度
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一种基于异构机群环境下的移动Agent系统分布式容错机制 被引量:1
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作者 周克江 《现代计算机》 2006年第6期22-24,共3页
容错机制就是评价移动Agent系统服务质量的重要标准,同时,它也是移动Agent技术优势得以体现的重要手段。本文提出一种基于异构机群环境下的移动Agent系统分布式容错机制,并分析了当前的种种Agent系统容错机制,以期进一步完善MAS容错策略。
关键词 异构机群 MAS 检查点 基于时间复制技术 投票协议 FASHC
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Synthesis of Novel Ionic Liquid ([C_4 CNmim]^+ PF_6^-) and Application to Preparation of Polyketone 被引量:3
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作者 郭锦棠 胡光 高珊 《Transactions of Tianjin University》 EI CAS 2011年第2期107-110,共4页
N-valeronitrile-N'-methylimidazolium hexafluorophosphate ([C 4 CNmim]+ PF 6),as a novel ionic liquid with polar nitrile functional group,was prepared.The structure of the ionic liquid was characterized by using IR... N-valeronitrile-N'-methylimidazolium hexafluorophosphate ([C 4 CNmim]+ PF 6),as a novel ionic liquid with polar nitrile functional group,was prepared.The structure of the ionic liquid was characterized by using IR and 1 H NMR.As a medium,the ionic liquid plays an important role in copolymerization of carbon monoxide (CO) with styrene (St).Some synthetic conditions were determined,including the usage of ionic liquid,palladium composite catalyst and methanol,CO pressure,reaction time and reaction temperature.The influence of these factors on catalytic activity was analyzed.The results show that the catalytic activity has reached 1 724.1 gStCO/(gPd·h) and the catalyst could be reused 5 times under the optimal condition:composite catalyst 0.015 mmol,ionic liquid 3 mL,methanol 0.75 mL,CO pressure 2MPa,reaction time 2 h and reaction temperature 70℃.This CO/St copolymerization within [C 4 CNmim]+ PF 6 system could facilitate ionic liquids with efficient and economical applications to polymeric materials. 展开更多
关键词 nitrile ionic liquid POLYKETONE synthetic condition carbon monoxide STYRENE
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Recursive and Nonrecursive Traversal Algorithms for Dynamically Created Binary Trees
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作者 Robert Logozar 《Computer Technology and Application》 2012年第5期374-382,共9页
The modeling of dynamical systems from a time series implemented by our DSA program introduces binary trees of height D with all leaves on the same level, and the related subtrees of height L 〈 D. These are called e-... The modeling of dynamical systems from a time series implemented by our DSA program introduces binary trees of height D with all leaves on the same level, and the related subtrees of height L 〈 D. These are called e-trees and e-subtrees. The recursive and nonrecursive versions of the traversal algorithms for the trees with dynamically created nodes are discussed. The original nonrecursive algorithms that return the pointer to the next node in preorder, inorder and postorder traversals are presented. The space-time complexity analysis shows and the execution time measurements confirm that for these O(2D) algorithms, the recursive versions have approximately 10-25% better time constants. Still, the use of nonrecursive algorithms may be more appropriate in several occasions. 展开更多
关键词 Binary e-trees algorithms tree traversal PREORDER inorder postorder RECURSIVE nonrecursive space-time complexity.
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新的中心粒是在细胞周期的哪个时间产生的
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作者 刘秀荣 张光慧 《生物学通报》 北大核心 2002年第12期23-23,共1页
关键词 中心粒 细胞周期 产生 中学 生物教材 复制时间
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