目的:基于分子对接分析复方一枝黄花喷雾剂化学成分与HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L的结合情况。方法:利用TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology)结合文献构建复方一枝黄花喷雾剂小分子配体库,采用Surflex-Dock模块完...目的:基于分子对接分析复方一枝黄花喷雾剂化学成分与HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L的结合情况。方法:利用TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology)结合文献构建复方一枝黄花喷雾剂小分子配体库,采用Surflex-Dock模块完成复方一枝黄花喷雾剂与HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L的分子对接分析。通过Ligplot计算核心成分与HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L形成的氢键、疏水作用。结果:获得复方一枝黄花喷雾剂活性成分74个,通过分子对接发现,26个活性成分与HIV-1蛋白酶有较好的结合(Total score>7),5个活性成分与Cathepsin L蛋白酶有较好的结合(Total score>7)。Diosmetin与HIV-1蛋白酶相互作用形成四个氢键(Gly27,Gly48,Gly49,Arg8),Harmonyl与HIV-1蛋白酶相互作用形成两个氢键(Arg8,Asp30)。结论:本研究初步筛选复方一枝黄花喷雾剂具有抗HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L的化学成分,为抗病毒药物的开发提供思路。展开更多
文摘目的:基于分子对接分析复方一枝黄花喷雾剂化学成分与HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L的结合情况。方法:利用TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology)结合文献构建复方一枝黄花喷雾剂小分子配体库,采用Surflex-Dock模块完成复方一枝黄花喷雾剂与HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L的分子对接分析。通过Ligplot计算核心成分与HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L形成的氢键、疏水作用。结果:获得复方一枝黄花喷雾剂活性成分74个,通过分子对接发现,26个活性成分与HIV-1蛋白酶有较好的结合(Total score>7),5个活性成分与Cathepsin L蛋白酶有较好的结合(Total score>7)。Diosmetin与HIV-1蛋白酶相互作用形成四个氢键(Gly27,Gly48,Gly49,Arg8),Harmonyl与HIV-1蛋白酶相互作用形成两个氢键(Arg8,Asp30)。结论:本研究初步筛选复方一枝黄花喷雾剂具有抗HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L的化学成分,为抗病毒药物的开发提供思路。