基于网络药理学探讨复方丹参滴丸治疗糖尿病周围神经病变的作用机制

目的基于网络药理学探讨复方丹参滴丸治疗糖尿病周围神经病变(DPN)的作用机制。方法(1)在中药系统药理学数据库和分析平台中检索复方丹参滴丸3种药物(丹参、三七和冰片)的活性成分,在SwissTargetPrediction平台对活性成分进行反向靶点预测。利用GeneCards^(■)数据库和OMIM^(■)数据库预测DPN相关靶点。对上述两类靶点取交集后获得药物-疾病共同靶点。(2)针对药物-疾病共同靶点及其对应的活性成分、药物,采用Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点网络后筛选关键活性成分。针对药物-疾病共同靶点,利用STRING数据库构建蛋白-蛋白互相作用网络,再利用Cytoscape软件进行拓扑分析以获得关键靶点。(3)针对药物-疾病共同靶点,在微生信平台进行功能富集分析和通路富集分析。(4)利用AutoDock Vina软件,将关键活性成分和关键靶点进行分子对接。结果(1)最终获得99个药物-疾病共同靶点。(2)关键活性成分包括甘草素、积雪草酸、木犀草素和丹参醇B;关键靶点包括热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)和白细胞介素6(IL-6)。(3)功能富集分析结果显示,药物-疾病共同靶点涉及类固醇代谢过程等生物过程,膜筏等细胞组分,核受体活性、配体激活的转录因子活性等分子功能;通路富集分析结果显示,药物-疾病共同靶点富集的信号通路包含糖尿病并发症中的晚期糖基化终末化产物-晚期糖基化终末化产物受体信号通路。(4)分子对接结果显示,4个关键活性成分与3个关键靶点的结合能均≤-5.0 kcal/mol,结合活性良好。结论复方丹参滴丸可通过甘草素、积雪草酸、木犀草素和丹参醇B等多种活性成分,作用于HSP90AA1、STAT3、IL-6等关键靶点,发挥抗氧化应激、抗炎、调控机体代谢等作用,从而治疗DPN。

基于网络药理学探究复方丹参滴丸治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病的作用机制

目的:通过网络药理学方法探讨复方丹参滴丸治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(coronary artery disease,CAD)的潜在作用机制。方法:利用TCMSP和Swiss TargetPrediction数据库进行复方丹参滴丸化学成分潜在靶基因预测;通过GeneCards、OMIM和DisGeNET数据库检索CAD的相关靶点;运用Cytoscape软件进行网络可视化分析;Metascape平台对核心靶点进行GO以及KEGG通路富集分析。结果:复方丹参滴丸中丹参酮IIA、木犀草素、槲皮素、积雪草酸等56种有效活性成分,可能通过作用于TNF、IL6、AKT1、VEGFA、IL1B等66个核心靶点,调控脂蛋白及动脉粥样硬化、HIF-1信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路等多种途径,起到抗炎、调节氧化应激及脂代谢紊乱、修复血管损伤等功效,从而达到治疗CAD的目的。结论:通过网络药理学方法预测了复方丹参滴丸治疗CAD的潜在靶点及作用机制,为后续基础研究提供了理论依据。

基于网络药理学和生物信息学探讨满药复方木鸡颗粒治疗肝癌的分子机制

利用网络药理学和生物信息学方法揭示复方木鸡颗粒治疗肝癌的作用机制。通过TCMSP、Swiss Target Prediction数据库分别获取复方木鸡颗粒的活性成分以及相关靶点;在GEO数据库筛选肝癌的相关靶点;利用Venny 2.1在线平台获取药物与疾病的共同靶点;由Cytoscape 3.8.2绘制药物–成分–靶点–疾病网络;用STRING数据库构建PPI网络;通过DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析;利用Kaplan Meier-Plotter数据库对关键基因的表达量及预后关联性进行分析;运用AutoDock软件对关键成分和靶点进行分子对接验证。复方木鸡颗粒中共获得37个活性成分,筛选出57个共有靶点,涉及生物过程98条、细胞成分17条、分子功能37条,介导15条信号通路。生存期分析结果显示,ESR1、CYP3A4、G6PD基因的表达量与肝癌患者的生存期具有相关性。分子对接表明筛选的6个活性成分与6个关键靶点蛋白之间具有较好的结合能力。复方木鸡颗粒中的大豆皂苷C、柚皮素、β-谷固醇、汉黄芩素等活性成分可以作用于ESR1、CYP3A4、G6PD等靶点,可能通过P53、戊糖磷酸途径、MAPK等信号通路发挥治疗肝癌的作用。

基于网络药理学探讨中药复方龙牡汤治疗特应性皮炎的作用机制

目的利用网络药理学探索中药复方龙牡汤在特应性皮炎(Atopic dermatitis,AD)中的作用机制。方法从TCMSP、BATMAN-TCM数据库获取龙牡汤的活性成分及其所对应的药物靶点,构建药物靶点的蛋白质互作网络及功能富集分析。从GEO数据库下载有关特应性皮炎的普通转录组数据进行差异分析,通过GeneCards、DisGeNET数据库检索得到AD相关靶点。将药物靶点和疾病靶点取交集得到药效靶点,对药效靶点进行GO、KEGG富集分析,构建出“中药-活性成分-药效靶点-AD”网络。结果获得复方龙牡汤55种活性成分以及262个药物靶点以及AD的157个疾病靶点,交叉分析后得到龙牡汤治疗特应性皮炎的药效靶点10个。通过GO分析这10个药效靶点基因在内皮细胞凋亡过程的调控(Regulation of endothelial cell apoptotic process)、内皮细胞凋亡过程(Endothelial cell apoptotic process)、上皮细胞凋亡过程的调控(Regulation of epithelial cell apoptotic process)等通路上显著富集;KEGG分析药效靶点基因在TNF信号通路(TNF signaling pathway)、脂质与动脉粥样硬化(Lipid and atherosclerosis)、流体剪切应力和动脉粥样硬化(Fluid shear stress and atherosclerosis)等通路上显著富集。结论复方龙牡汤通过多个信号通路起效,其中CCL2、FOS、MMP9、IRF1、VCAM1与TNF信号通路显著正相关。

复方丹参滴丸联合阿托伐他汀钙治疗慢性心力衰竭临床观察

目的探讨复方丹参滴丸联合阿托伐他汀钙对慢性心力衰竭(congestive heart failure,CHF)患者心功能及细胞因子的影响。方法选取2020年8月—2022年8月就诊于济宁市中医院CHF患者92例进行研究,按照随机数字表法分为2组,各46例。对照组予以阿托伐他汀钙片进行治疗,观察组在对照组基础上采用复方丹参滴丸进行治疗,于治疗3个月后评估。对比2组临床疗效、心功能、细胞因子、血管活性物质、不良反应。结果观察组治疗总有效率(95.65%)高于对照组(80.43%),差异有统计学意义(P<0.05)。治疗前2组心功能、细胞因子、血管活性物质对比,差异无统计学意义(P>0.05);与对照组对比,观察组治疗后左室射血分数(left ventricular ejection fractions,LVEF)高,左室舒张末期内径(left ventricular end diastolic diameter,LVEDD)、左室收缩末期内径(left ventricular end systolic diameter,LVESD)低,6 min步行距离(six minute walk distance,6MWD)长,可溶性生长刺激表达基因2蛋白(soluble growth stimulation expression gene 2 protein,sST2)、半乳糖凝集素-3(galectin-3)水平均低,内皮素-1(endothelin-1,ET-1)、血管紧张素Ⅱ(angiotensinⅡ,AngⅡ)、脑利钠肽(brain natriuretic peptide,BNP)水平均低(P<0.05)。观察组不良反应(13.04%)与对照组(10.87%)对比,差异无统计学意义(P>0.05)。结论CHF患者经复方丹参滴丸与阿托伐他汀钙治疗后心功能得到显著改善,且血清细胞因子水平趋于正常,血管活性物质生成有效一致,且安全性高。

复方丹参滴丸联合丁苯酞治疗急性脑梗死的疗效及对患者血清炎性因子的影响

目的基于核转录因子(NF-κB)信号通路探究复方丹参滴丸联合丁苯酞对急性脑梗死(ACI)患者炎性反应的影响。方法选取2020年7月至2022年5月平顶山市第一人民医院收治的ACI患者118例,按随机数表法分为观察组和对照组各59例。对照组患者予以丁苯酞注射液治疗,观察组患者在对照组治疗的基础上联合复方丹参滴丸治疗,均连续治疗两周。治疗两周后,比较两组患者的疗效,以及治疗前、治疗一周后、两周后的美国国立研究院卒中量表(NIHSS)、简易智能状态量表(MMSE)、Barthel指数(BI)评分、脑神经因子[神经生长因子(NGF)及神经营养因子(NTF)]、NF-κB信号通路相关蛋白、mRNA和NF-κB信号通路相关因子[白细胞介素(IL)-1β、IL-6、IL-8、肿瘤坏死因子(TNF)-α]水平,同时比较两组患者治疗期间的不良反应发生情况。结果观察组患者的临床治疗总有效率为94.92%,明显高于对照组的81.36%,差异有统计学意义(P<0.05);治疗一周和两周后,两组患者的NIHSS评分均呈下降趋势,且观察组明显低于对照组,MMSE及BI评分呈升高趋势,且观察组明显高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05);治疗一周和两周后,两组患者的NGF、NTF均呈升高趋势,且观察组明显高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05);治疗一周后、两周后,两组患者的NF-κB p50蛋白、NF-κB p50 mRNA、NF-κB p65蛋白、NF-κB p65 mRNA均呈下降趋势,且观察组明显低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05);治疗一周后、两周后,两组患者的NF-κB信号通路相关因子IL-1β、IL-6、IL-8、TNF-α均呈下降趋势,且观察组明显低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05);治疗期间,观察组患者不良反应总发生率为11.86%,略高于对照组的8.47%,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论复方丹参滴丸联合丁苯酞可通过调控NF-κB信号通路,抑制炎性反应,加速神经功能缺损恢复,临床应用效果显著且安全性较高。

基于系统虚拟药理学复方丹参滴丸抗血小板聚集药效物质基础研究

目的:基于系统虚拟药理学研究复方丹参滴丸抗血小板聚集药效物质基础,对该复方作用效应在分子网络层面上进行探析。方法:选择了16个血小板聚集相关靶点,构建该组方化学成分分子数据库,探讨数据库分子与血小板聚集靶点间相互作用关系。结果:该组方与16个血小板聚集靶点均有一定的潜在协同效应;并应用药理学实验对部分数据进行了验证。结论:本实验从分子层次上阐释了复方丹参滴丸抗血小板聚集系统药效物质基础,为该组方的临床应用提供了科学依据;同时,也为寻找血小板聚集药物提供一定的参考和借鉴。

基于计算药理学的复方丹参滴丸对氯吡格雷代谢酶的影响

目的:研究复方丹参滴丸对参与氯吡格雷代谢酶人源肝羧酸酯酶CES1、细胞色素CYP450 3A4、CYP4502C19、CYP450 1A2、CYP450 2B6的影响,对其作用效应进行整体分析。方法:选择了上述5个氯吡格雷代谢相关靶点,构建组方化学成分分子配体,采用计算药理学方法探讨配体与5个代谢酶间相互作用特征。结果:分别以1MX1(CES1)、3NXU(CYP450 3A4)、4GQS(CYP450 2C19)、2HI4(CYP450 1A2)、3IBD(CYP450 2B6)为受体,THA、RIT、OXU、Chlorzoxazone、CPZ评价得分为阈值,组方中分别有29、8、31、51、44个化合物分子与代谢酶蛋白CES1、CYP450 3A4、CYP450 2C19、CYP450 1A2、CYP450 2B6间存在一定的结合效应,分析对接的结果与文献cocktail法得出的结论完全一致。结论:复方丹参方可在整体层面上抑制氯吡格雷代谢酶CES1、CYP450 3A4、CYP450 2C19、CYP450 1A2、CYP450 2B6。

复方丹参滴丸联合常规西医治疗冠心病合并糖尿病有效性及安全性的Meta分析

目的对复方丹参滴丸联合常规西医治疗冠心病合并糖尿病的有效性和安全性进行系统评价。方法通过检索万方数据库(Wanfang)、中国知网(CNKI)、维普中文期刊(VIP)、中国生物医学文献数据库(SinoMed),以及Cochrane Library、PubMed、Embase和Web of Science等数据库,收集从建库至2023年5月复方丹参滴丸联合常规西医治疗冠心病合并糖尿病的随机对照试验(RCT),由2位研究人员独立完成文献筛选、数据整理和偏倚风险评价;应用RevMan 5.4软件进行Meta分析。结果纳入24项RCT,共2546例患者。Meta分析结果显示,复方丹参滴丸联合常规西医治疗在提高冠心病合并糖尿病的总有效率[OR=4.93,95%CI(3.49,6.98),P<0.00001]、血浆脂联素[MD=2.79,95%CI(2.30,3.27),P<0.00001],降低空腹血糖[SMD=-1.06,95%CI(-1.24,-0.88),P<0.00001]、餐后2 h血糖[MD=-1.53,95%CI(-1.71,-1.35),P<0.00001]、糖化血红蛋白[MD=-1.56,95%CI(-2.01,-1.11),P<0.00001]、同型半胱氨酸[MD=-8.47,95%CI(-8.89,-7.97),P<0.00001]、低密度脂蛋白[MD=-0.46,95%CI(-0.69,-0.24),P<0.0001]、总胆固醇[MD=-0.45,95%CI(-1.11,-0.20),P=0.005]、甘油三酯[MD=-0.42,95%CI(-0.50,-0.34),P<0.00001]、白细胞介素6[SMD=-1.34,95%CI(-1.61,-1.07),P<0.00001]、心血管不良事件[OR=0.35,95%CI(0.19,0.64),P=0.0006]、不良反应发生率[OR=0.45,95%CI(0.24,0.86),P=0.01]方面均优于常规西医治疗。结论复方丹参滴丸联合西医常规治疗冠心病合并糖尿病的疗效优于单纯西医治疗,而且安全性较好。但受纳入研究质量等因素的限制,上述结论仍需更多高质量的临床试验验证。

复方丹参滴丸联合西医常规治疗冠心病心绞痛的回顾性队列研究

[目的]观察复方丹参滴丸联合西医常规治疗冠心病心绞痛的临床疗效,分析其临床疗效优势。[方法]采用回顾性队列研究方法,收集天津市6家医院病案管理系统中的冠心病心绞痛患者,采集时间为2014年1月—2022年6月。将这些患者分为暴露组和非暴露组,暴露组使用复方丹参滴丸联合西医常规治疗,非暴露组单独使用西医常规治疗,两组按照1∶1比例进行匹配,每组各612例。观察两组患者住院期间心血管事件发生率、临床生化指标及颈部血管彩超。[结果]暴露组谷草转氨酶、乳酸脱氢酶、C反应蛋白、凝血酶时间、D-二聚体、血糖、糖化血红蛋白、肌酐、尿酸、谷丙转氨酶、总胆红素、白细胞计数、颈动脉内中膜厚度、颈动脉斑块检出率低于非暴露组,差异具有统计学意义(P<0.05)。[结论]复方丹参滴丸联合西医常规治疗的冠心病心绞痛患者心血管事件发生率较低,凝血功能、肾功能、肝功能、血糖、血脂水平较稳定,颈动脉内中膜厚度较小,斑块发生率较低。

复方丹参滴丸联合羟苯磺酸钙治疗糖尿病性视网膜病变临床效果的meta分析

目的系统评价复方丹参滴丸辅助羟苯磺酸钙治疗糖尿病性视网膜病变(DR)的临床效果。方法检索中国知网、万方数据知识服务平台、维普网、中国生物医学文献服务系统、PubMed、Embase、Web of Science和Cochrane Library建库至2023年7月复方丹参滴丸联合羟苯磺酸钙治疗DR的临床随机对照试验。结果共纳入11项临床随机对照试验,共848例患者,观察组425例,对照组423例。meta分析结果显示,与对照组比较,试验组视野灰度值[均值差(MD)(95%CI):-0.92(-0.96,-0.88),P<0.00001]、血管瘤体积[MD(95%CI):-3.11(-3.33,-2.89),P<0.00001]、出血斑面积[MD(95%CI):-0.76(-0.85,-0.67),P<0.00001]、黄斑厚度[MD(95%CI):-55.62(-62.59,-48.65),P<0.00001]、血管内皮生长因子水平[MD(95%CI):-17.63(-21.6,-13.59),P<0.00001]、肿瘤坏死因子-α水平[MD(95%CI):-13.3(-16.09,-10.68),P<0.00001]更低,视力[MD(95%CI):0.13(0.05,0.20),P<0.00001]更好。无明显不良反应或事件发生。敏感性分析检验证实模型稳定性高,结论可信度高。结论根据目前临床证据,复方丹参滴丸与羟苯磺酸钙联用可提高DR的临床疗效。

基于网络药理学及分子对接探究四黄止痢复方治疗仔猪腹泻的作用机制

【目的】利用网络药理学方法探究四黄止痢复方治疗仔猪腹泻的作用机制并进行分子对接模拟验证。【方法】在TCMSP数据库收集黄芩、黄柏、大黄、黄连、板蓝根和甘草的活性成分及对应靶点,在GeneCards数据库收集仔猪腹泻相关靶点,并通过UniProt数据库对收集到的靶点进行标准化。通过Venn在线作图网站获得共有靶点,并使用Cytoscape 3.9.1制作药物-靶点网络图得到主要活性成分。对共有靶点进行蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)、GO功能和KEGG通路富集分析,制作PPI网络图,筛选出核心靶点。利用PubChem和PDB数据库分析主要活性成分及靶点的3D结构文件,并通过Discovery Studio 2019 Client软件进行分子对接。【结果】四黄止痢复方治疗仔猪腹泻的主要活性成分为汉黄芩素、β-谷甾醇、金合欢素、去氢丹参酮ⅡA和四氢小檗碱,核心靶点包括肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、胱天蛋白酶3(caspase-3,CASP3)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL6)、血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)和转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)。GO功能富集分析结果显示,四黄止痢复方主要作用靶点的生物学功能富集到RNA聚合酶Ⅱ启动子转录调控、细胞凋亡、血管生成、IL8产生、细胞因子活性、生长因子活性等条目。KEGG通路富集分析结果显示,四黄止痢复方主要作用靶点富集在信号转导、免疫系统、病毒性感染等相关分子信号通路。分子对接结果表明,汉黄芩素与TNF,去氢丹参酮ⅡA、四氢小檗碱和金合欢素与STAT3都显示出良好对接活性。【结论】四黄止痢复方可能通过汉黄芩素、β-谷甾醇、金合欢素、去氢丹参酮ⅡA和四氢小檗碱等主要活性成分作用于IL6、VEGFA、STAT3、TNF、CASP3等靶点,进而通过癌症通路、脂质与粥样动脉硬化和人巨细胞病毒感染等通路对仔猪腹泻起到抗炎、抗氧化等治疗效果,体现了中药的多成分、多靶点、多通路的特点。

基于网络药理学探讨复方斑蝥胶囊调控乳腺癌铁死亡的机制研究

目的本研究旨在通过网络药理学探讨复方斑蝥胶囊(CMC)调控乳腺癌(BC)铁死亡的可能靶标及作用机制。方法分别利用TCMSP、Swiss Target Prediction、GeneCards、FerrDb等数据库获得CMC、BC以及调控铁死亡的相关靶点。利用STING网站构建药物-疾病交集靶点的蛋白相互作用信息图(PPI)。运用Cytoscape软件构建生成药物-活性成分-作用靶点网络图,再进行KEGG和GO功能富集分析,并通过分子对接来模拟活性成分作用于靶蛋白的结合情况,最后通过GEPIA、HPA和cBioPortal数据库验证核心靶点在乳腺癌中的表达及突变情况。结果共获得198个活性化学成分,药物-疾病共同靶蛋白基因51个。PPI显示,关键靶点为TP53、IL6、EGFR、HIF1A、STAT3。主要活性成分为山奈酚、槲皮素、异鼠李素、常春藤皂苷元、β-谷甾醇。KEGG通路富集分析表明,主要涉及FoxO、NF-kappa B、Hippo等信号通路。分子对接结果表明,主要活性化合物与关键靶点均具有良好的结合活性。生物信息学结果表明,BC组织中IL6和EGFR的mRNA水平高表达,且TP53的预后价值差异有统计学意义(P<0.05)。cBioPortal工具显示,1756例患者中有658例(37.5%)存在基因突变。结论复方斑蝥胶囊可能通过多成分、多靶点、多途径的方式发挥调控铁死亡治疗BC的作用,为其临床应用提供参考依据。

基于网络药理学和分子对接技术探讨复方菖蒲益智汤治疗轻度认知功能障碍的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接技术探究复方菖蒲益智汤治疗轻度认知功能障碍(MCI)的药理学作用机制。方法:通过TCMSP平台和PubChem、Swiss Target Prediction数据库获取复方菖蒲益智汤主要的6味中药的活性成分和作用靶点,从GeneCards、DisGeNet、OMIM、TTD数据库获取MCI的相关基因。利用Venny 2.1.0平台将药物的成分靶点与MCI相关的靶基因取交集,利用Cytoscape 3.7.2进行“药物-成分-靶点-疾病”网络图的构建,并利用STRING平台构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图,然后利用Metascape平台进行KEGG通路富集分析与GO功能富集分析。最后利用Autodock vina V1.2.0对核心作用靶点及主要药效成分进行分子对接,验证它们之间的紧密联系程度。结果:复方菖蒲益智汤治疗MCI的潜在靶基因共178种。PPI网络图筛选出AKT1、TNF、EGFR、CASP3、IL1B、VEGFA 6个关键核心靶点,涉及7NH5、6Q00、8A27等关键核心靶蛋白;KEGG通路富集分析结果表明,AKT1、TNF、IL1B、VEGFA 4个关键核心靶点在AGE-RAGE信号通路中。分子对接结果显示,复方菖蒲益智汤的有效成分与上述6个关键核心靶点的结合活性良好。结论:复方菖蒲益智汤中主要的6味中药的活性成分可作用于AKT1、TNF、IL1B等多个靶点,通过调控AGE-RAGE通路发挥治疗MCI的作用。

基于网络药理学和HPLC法建立宠物用复方石淋通片中多指标成分的质量控制方法

建立宠物用复方石淋通片多指标成分含量测定方法。利用网络药理学方法筛选复方石淋通片治疗尿石症、膀胱炎的关键活性成分,结合相关文献及《中国药典》相关要求,确定指标性成分。利用HPLC分析方法,使用CAPCELL PAK C18 MG(S-5)4.6×250 mm色谱柱,柱温30℃,进样量10μL,流速为1.0 mL·min^(-1),检测波长335 nm,以乙腈-0.1%甲酸水为流动相,梯度洗脱,建立指标性成分含量测定的方法。通过网络药理学筛选出槲皮素、咖啡酸、绿原酸等十个关键成分。结合《中国药典》及相关文献选出新绿原酸、绿原酸、隐绿原酸、咖啡酸、夏佛塔苷、异夏佛塔苷六种指标性成分。含量测定方法学结果表明:各成分线性关系良好(r≥0.999);精密度良好,RSD为0.03%~0.21%;重复性良好,RSD为0.70%~2.02%;供试品在24h内稳定性良好,RSD为0.30%~2.02%;平均加样回收率(RSD)在98.31%~104.31%(0.36%~2.28%);三批样品中六种成分的含量分别在0.990~1.434 mg·g^(-1)、1.533~2.083 mg·g^(-1)、1.311~2.023 mg·g^(-1)、0.332~0.353 mg·g^(-1)、1.594~1.768 mg·g^(-1)、0.787~1.057 mg·g^(-1)之间。该含量测定方法有较好的重复性和稳定性,可用于宠物用复方石淋通片的质量分析。

基于网络药理学探究复方龙血竭胶囊治疗心绞痛的作用机制

目的采用网络药理学研究复方龙血竭胶囊治疗心绞痛的潜在分子机制。方法通过TCMSP数据库、BATMAN-TCM数据库并结合国内外文献调研获取复方龙血竭胶囊组成药材龙血竭、三七、冰片的主要化学成分。通过DrugBank、SwissTargetPrediction数据库获取复方龙血竭胶囊化学成分的作用靶点。利用GeneCards、OMIM和TTD数据库检索“angina pectoris”相关靶点,得到复方龙血竭胶囊和心绞痛交集靶点。应用STRING数据库Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白相互作用(PPI)网络及“复方龙血竭胶囊-活性成分-关键作用靶点”网络,并对该网络进行拓扑学分析。利用R软件对复方龙血竭胶囊的交集靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,预测其作用机制。结果复方龙血竭胶囊包含活性成分107个,对应靶标568个,其中与心绞痛相关的共同靶标基因有50个;涉及1033个生物过程,62个分子功能,39个细胞组成,13条信号通路。结论复方龙血竭胶囊可通过IL6、TNF、VEGFA、NOS3等多靶点,调节低氧诱导因子1(HIF-1)、NF-κB信号通路、MAPK信号通路、PI3K/AKT信号通路、钙信号通路等多途径发挥治疗心绞痛的作用。

基于网络药理学的复方血栓通胶囊治疗视网膜静脉阻塞机制研究

目的:基于网络药理学方法探究复方血栓通胶囊治疗视网膜静脉阻塞(retinal vein occlusion,RVO)的潜在作用靶点及机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)获取三七、黄芪、丹参、玄参的活性成分及相关靶点。运用GeneCards、在线孟德尔人类遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)以及DrugBank数据库获取RVO的相关作用靶点,采用Cytoscape 3.7.2软件绘制“疾病-药物-活性成分-靶点”图,借助STRING数据库建立靶点蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI),并挖掘其中潜在的蛋白质功能模块。最后通过Metascape平台进行基因本体论功能(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。结果:筛选得到复方血栓通胶囊119个有效活性成分,有效靶点202个,RVO的疾病靶点1539个,最终获得复方血栓通胶囊治疗RVO有效靶点115个,通过PPI筛选出主要核心靶点10个,富集分析得到的有效靶点主要参与癌症相关通路,糖尿病并发症相关AGE-RAGE、流体剪切应力与动脉粥样硬化、白细胞介素17、肿瘤坏死因子、PI3K-Akt、MAPK等信号通路。结论:复方血栓通胶囊主要通过调节氧化应激、炎症因子、新血管生成、细胞凋亡等过程治疗RVO。

基于网络药理学探讨复方苁蓉益智胶囊治疗轻度认知障碍的作用机制

目的基于网络药理学对复方苁蓉益智胶囊(fufang congrong yizhi capsule,FCYC)治疗轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)的作用机制进行预测和细胞实验验证。方法利用TCMSP、GeneCards、OMIM和TTD数据库、《中国药典》以及文献筛选FCYC的活性成分及治疗MCI的作用靶点,构建中药-化合物-靶点-疾病网络图以及交集靶点的蛋白相互作用图,通过易汉博生物信息平台进行GO和KEGG分析。利用Aβ25-35诱导神经细胞PC12损伤建立MCI细胞模型,FCYC预处理探究药效及机制:CCK-8法和LDH试剂盒测定细胞活力,JC-1检测细胞线粒体膜电位,ELISA法检测IL-1β、IL-6和TNF-α表达,免疫荧光法及Western blot法检测Bcl2、Bax和PI3K/AKT信号通路相关蛋白的表达。结果FCYC共有57个活性成分可能通过66个潜在靶点治疗MCI,GO富集分析结果显示这些靶点涉及339个生物过程、39个细胞组成以及65个分子功能;KEGG通路主要涉及PI3K-AKT、TNF信号通路等。实验结果表明,FCYC可明显提高Aβ25-35诱导损伤的PC-12细胞活力,降低PC-12细胞中IL-1β、IL-6和TNF-α的分泌,上调Bcl2/Bax的比例,并增加p-PI3K/PI3K和p-AKT/AKT的表达。结论FCYC通过多成分-多靶点-多通路治疗MCI,其可抑制神经炎症和神经细胞凋亡,其可能机制为通过调控PI3K/AKT信号治疗MCI。

复方鹿茸健骨胶囊治疗老年性骨质疏松的网络药理学与分子对接机制研究

通过网络药理学来预测复方鹿茸健骨胶囊(CLJC)治疗老年性骨质疏松(Senile Osteoporosis,SOP)的作用机制。通过中药系统药理学成分分析平台(BATMAN-TCM)、TCMID数据库、中国知网、PubMed和Web of Science等途径查阅相关文献,中药系统药理学数据库(TCMSP)检索CLJC的主要活性成分,ADME功能以及Uniprot数据库检索筛选CLJC的主要活性成分靶点;通过GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、疾病相关的基因与突变位点数据库(DisGeNET)检索SOP主要作用靶点;通过Venny2.1.0软件对药物靶点与疾病靶点取交集,两者交集即为CLJC治疗SOP潜在靶点;用STRING数据库分析蛋白质-蛋白质相互作用(PPI),并且构建PPI网络图;用Metascape数据库进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并通过Cytoscape 3.9.2软件构建“药物成分-靶点-疾病-通路”网络图;最后,通过Auto Dock Tools 1.5.7软件将核心活性成分与核心靶点进行分子对接,并进一步验证CLJC治疗SOP以及网络药理学所得出的结论。CLJC共筛选到89种活性成分,相对应的药物靶点有463个;SOP共筛选到972个疾病靶点;CLJC与SOP共有81个靶点,核心靶点有AKT1、TP53、CTNNB1、SRC、RXRA、ITGB3、SP1、MMP3、TNF、MMP9、MMP2、TGFB1、PPARG、FOS、IGF2、VEGFA和IL10等;GO分析显示,BP有激素反应(Response to hormone)、肽反应(Response to peptide)、细胞对氮化合物的反应(Cellular response to nitrogen compound)等;MF有信号受体调节器活性(Signaling receptor regulator activity)、信号受体激活器活性(Signaling receptor activator activity)、受体配体活性(Receptor ligand activity)等;CC有隔膜筏(Membrane raft)、膜微结构域(Membrane microdomain)、质膜筏(Plasma membrane raft)等;KEGG富集分析共得到164条通路,主要有癌症通路(Pathways in cancer)、MAPK信号通路(MAPK signaling pathway)、癌症蛋白聚糖(Proteoglycans in cancer)以及脂质和动脉粥样硬化(Lipid and atherosclerosis)等;分子对接验证核心活性成分与核心靶点都表现出良好的对接活性。本研究证实了CLJC中的quercetin成分与AKT1和TP53靶蛋白相互作用,通过Pathways in cancer、MAPK signaling pathway等信号通路多成分、多靶点、多通路治疗SOP。

基于网络药理学探讨复方阿胶浆干预癌因性疲乏的作用机制研究

目的基于网络药理学探讨复方阿胶浆干预癌因性疲乏(CRF)的多成分、多靶点、多通路作用机制,为其实验研究和临床应用提供依据。方法通过TCMSP、化学数据库、TCM-MESH、ETCM平台检索并筛选出复方阿胶浆的活性成分,利用TCMSP靶点预测模型和Swiss ADME平台筛选出活性成分的潜在靶点;利用Genecards、OMIM数据库检索并筛选出CRF的相关靶点;利用STRING11.0获得蛋白互作PPI关系,并通过Cytoscape3.8.2构建PPI网络,通过Cytoscape的Cytohubba模块依据度值获得核心基因,利用Metascape获得复方阿胶浆干预CRF的聚类模块;用Metascape对交集靶点进行GO和KEGG富集分析,得到复方阿胶浆干预CRF的潜在作用通路。结果复方阿胶浆筛选得到44个活性成分,其中涉及CRF相关靶点248个,复方阿胶浆干预CRF的主要成分可能是赖氨酸、槲皮素、甘氨酸、表儿茶素、木樨草素等,PPI网络中定位到20个核心基因,主要包括ACTB、TP53、AKT1、VEGFA、MYC、EGFR、TNF、CASP3、IL-6、JUN等,可能涉及癌症相关信号通路、乙型肝炎信号通路、癌症蛋白多糖信号通路、细胞凋亡信号通路、催乳素信号通路、癌症中的转录失调、NF-κB信号通路等主要通路。结论本研究初步揭示了复方阿胶浆多成分、多靶点、多途径干预CRF的机制,为复方阿胶浆的临床使用提供了依据。