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“分而治之”方法构建复杂分子体系高精度势能面及应用
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作者 宋国梁 李振华 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期16-24,I0002,30,共11页
“分而治之”是处理复杂分子势能面的一种快速简洁方案。本文介绍了近年来本课题组在这一领域的方法研究进展及相关应用研究。在新的组装势能面算法和数据库支持下,我们将复杂大分子势能面计算量降低到O(N1~2)次方的标度,并且计算精度接... “分而治之”是处理复杂分子势能面的一种快速简洁方案。本文介绍了近年来本课题组在这一领域的方法研究进展及相关应用研究。在新的组装势能面算法和数据库支持下,我们将复杂大分子势能面计算量降低到O(N1~2)次方的标度,并且计算精度接近DFT甚至CCSD(T)的水平。采用该方法,我们对两个不同的应用场景进行了测试。结果表明,高性能的组装势能面可以完成以往难以实现的大规模的分子结构搜索、稳定性分析以及新型分子结构设计等关键性任务。 展开更多
关键词 分而治之 复杂分子体系 势能函数 势能面
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异核二维J谱在复杂分子结构分析中的应用
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作者 冯春木 李巧玲 +1 位作者 朱京平 汤淼荣 《浙江大学学报(理学版)》 CAS CSCD 1995年第S1期140-142,共3页
本文利用异核二维J谱对复杂分子结构进行了应用研究.通过NOE增强,提高了图谱的信噪比,在电磁铁谱仪上实现了异核二维J谱的常规测试.
关键词 结构分析 复杂分子 异核 中心实验室 信噪比 去耦 采样时间 弛豫时间 常规测试 多重分裂
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测试复杂分子的仪器——仪器在化学中应用之二
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作者 胡柏顺 《现代科学仪器》 1991年第3期49-53,共5页
化学家们正在利用物理学家们发明的一系列有特色的仪器来分析和测定极其复杂分子的结构。在这些技术中,最突出的就是核磁共振,X 射线晶体衍射和质谱分析仪。一、核磁共振原子核带有电荷、在磁场里像一个微小的磁体。这就解释了为什么磁... 化学家们正在利用物理学家们发明的一系列有特色的仪器来分析和测定极其复杂分子的结构。在这些技术中,最突出的就是核磁共振,X 射线晶体衍射和质谱分析仪。一、核磁共振原子核带有电荷、在磁场里像一个微小的磁体。这就解释了为什么磁性的存在是由于核子转动或自旋的结果。如果核子的电荷分布于核整个体积内,那核子旋转就是指一些电荷将围绕着转动的轴线运动。这种电荷运动能产生磁场。 展开更多
关键词 分子 测试 复杂分子 测试仪器
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分子体系自由能地貌图的变分分析及AI算法实现
4
作者 杜泊船 田圃 《物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2024年第6期82-94,共13页
精确描述复杂分子体系的自由能地貌图是理解和操控其行为,并进一步实现分子设计制造工业化的重要基础.刻画高维空间自由能地貌图的主要挑战是其往往在不同时空间尺度上具有多个层次,每个层次都可能有不止一个亚稳态被相应的自由能垒分开... 精确描述复杂分子体系的自由能地貌图是理解和操控其行为,并进一步实现分子设计制造工业化的重要基础.刻画高维空间自由能地貌图的主要挑战是其往往在不同时空间尺度上具有多个层次,每个层次都可能有不止一个亚稳态被相应的自由能垒分开,且跨越路径有可能不止一条.另外很多体系涉及非线性行为,这使得理论解析和直接使用分子模拟都有很大困难.针对这些挑战,多年来研究者们发展了多种多样的增强采样方法,但往往需要很多经验选择和操作,从而一方面使得研究进程较为缓慢,另一方面也让误差控制成为困难.变分虽然在物理、统计和工程中已经被广泛应用并取得巨大成功,但在复杂分子体系中的应用却随着神经网络的发展刚刚开始.本文将对这些探索性工作的主要方向、进展和局限进行简要总结,也对将来的可能发展给出展望,希望能够激发更多对基于变分的分子体系自由能地貌图人工智能算法的关注和努力,促进大分子药物、分子生物机器等实践应用的发展. 展开更多
关键词 变分 神经网络 复杂分子体系 自由能地貌图
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拉格朗日-欧拉方法模拟高分子复杂流体平面收缩流动 被引量:2
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作者 李险峰 袁学锋 +1 位作者 步怀天 赵得禄 《高分子学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第4期432-437,共6页
为验证拉格朗日 欧拉方法的准确性 ,对高分子溶液的 4∶1平面收缩流动问题进行了数值模拟 ,采用单松弛时间的PhanThien Tanner本构方程 ,得到PIB/C1 4溶液在De =3 0的收缩流动的计算结果 ,同Quinzani等所做的收缩流动实验中的稳态流场... 为验证拉格朗日 欧拉方法的准确性 ,对高分子溶液的 4∶1平面收缩流动问题进行了数值模拟 ,采用单松弛时间的PhanThien Tanner本构方程 ,得到PIB/C1 4溶液在De =3 0的收缩流动的计算结果 ,同Quinzani等所做的收缩流动实验中的稳态流场物理量的测量结果进行了比较 ,在定量上取得较好的一致性 .证明拉格朗日 欧拉方法能够在定性上乃至在定量上准确地预报高分子复杂流体的流动行为 ,在描述真实的物理过程时是合理、准确的 . 展开更多
关键词 平面收缩流动 分子复杂流体 模拟
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构建复杂有机分子的有力工具——2010年诺贝尔化学奖简述 被引量:7
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作者 张韶光 张文雄 《大学化学》 CAS 2010年第6期1-5,共5页
2010年诺贝尔化学奖授予美国科学家理查德.赫克和日本科学家根岸英一及铃木章,以表彰他们在"钯催化交叉偶联反应"研究领域做出的杰出贡献。本文简要介绍钯催化交叉偶联反应的基本原理及在合成复杂有机分子中的应用。
关键词 复杂有机分子 “2010年诺贝尔化学奖” “钯催化交叉偶联反应” 工具
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利用二维核磁解析复杂有机分子的结构 被引量:2
7
作者 叶克印 张香归 袁耀锋 《大学化学》 CAS 2021年第9期208-214,共7页
二维核磁是解析复杂有机化合物结构、精确归属核磁信号的有效分析工具。本文结合实例介绍了二维核磁在解析复杂有机分子结构方面的应用。相较于一维核磁,二维核磁将化学位移、偶合常数等重要参数展开在二维平面上,不仅解决了一维核磁谱... 二维核磁是解析复杂有机化合物结构、精确归属核磁信号的有效分析工具。本文结合实例介绍了二维核磁在解析复杂有机分子结构方面的应用。相较于一维核磁,二维核磁将化学位移、偶合常数等重要参数展开在二维平面上,不仅解决了一维核磁谱线拥挤重叠等问题,还能提供自旋核相互作用的信息。因此,学习和掌握好二维核磁,有利于提高学生解析复杂有机分子结构的能力。 展开更多
关键词 二维核磁 复杂分子结构分析 偶合常数
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化学合成的逻辑:复杂碳基质(Cahbogens)分子的多步合成
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作者 伊莱亚斯.詹姆斯.科里 张霁 廖红雨 《有机化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1992年第2期98-113,共16页
含碳化合物家族中的一员—碳基质(Car-bogens)在组成、形式和大小上都千变万化。天然的碳基质就是由通常的有机物构成的地球上所有的生命物质。这样,在分子水平上对其进行研究的这门科学,也就成了生命物质的基本语言。
关键词 碳基质 复杂分子 多步合成
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分子激发态动力学研究立项报告
9
作者 韩克利 杨何平 +2 位作者 莫宇翔 夏安东 袁开军 《科技创新导报》 2016年第26期184-184,共1页
发生在激发态的光解离、异构化、光致电子或质子转移等化学反应过程,以及激发态分子间的能量传递、转换等动力学过程在能源、大气化学以及生物学等领域都至关重要。针对激发态分子反应动力学的研究,该研究将聚焦在以下几方面研究:(1... 发生在激发态的光解离、异构化、光致电子或质子转移等化学反应过程,以及激发态分子间的能量传递、转换等动力学过程在能源、大气化学以及生物学等领域都至关重要。针对激发态分子反应动力学的研究,该研究将聚焦在以下几方面研究:(1)利用飞秒泵浦-探测技术等时间分辨光谱技术研究光化学、太阳能转化材料和生物分子检测中重要体系的激发态动力学过程;(2)利用单分子光谱技术研究单个超支化分子单光子发射的特点以及分子内各个分支之间的强或弱相干耦合作用的机理和规律;(3)利用实验方法,研究复杂体系中如化学激光体系,大气化学体系中重要激发态原子分子的传能以及非绝热反应动力学;(4)利用各种先进的实验方法,研究复杂体系光解离过程的非绝热动力学,特别是电子激发态与基态之间,以及激发态与激发态之间的锥形交叉点非绝热动力学的研究;(5)发展新的能够计算凝聚态复杂分子体系非绝热过程的动力学理论方法,并利用动力学理论方法来阐述复杂分子体系的激发态动力学机理。通过该研究,我们将在“分子激发态动力学”这个前沿性科学问题研究上取得突破性进展,取得一批具有重要影响力的创新性研究结果。 展开更多
关键词 分子激发态 反应动力学 时间分辨光谱 光解离 复杂分子体系
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生命起源和光学活性
10
作者 赵南生 何维凌 《自然辩证法通讯》 1982年第1期45-48,共4页
生命起源是自然科学的重要课题,千百年来这个课题在人类面前却像海市蜃楼一般可望而不可及。直到50年代初人们从分子层次的化学反应进行研究,这一课题才有了突破。70年代以来宇宙化学最新发现为生命起源的研究,开拓了新的领域。今后将... 生命起源是自然科学的重要课题,千百年来这个课题在人类面前却像海市蜃楼一般可望而不可及。直到50年代初人们从分子层次的化学反应进行研究,这一课题才有了突破。70年代以来宇宙化学最新发现为生命起源的研究,开拓了新的领域。今后将生成氨基酸和核酸的化学反应与这些分子结构特点——光学活性结合起来开展研究,对于解决生命起源问题可能具有重要意义。 展开更多
关键词 光学活性 生命起源 氨基酸 化学反应 宇宙化学 复杂分子 生命物质 分子结构 旋光性 蛋白质分子
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肝细胞癌术后生存率相关分子在复杂网络中的拓扑特性研究 被引量:2
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作者 单光宇 卢一鸣 +1 位作者 屈武斌 张成岗 《军事医学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期691-693,共3页
目的从系统层面探索基因和微小RNA(microRNA,miRNA)的网络结构,结合生存分析技术,研究生存率相关分子的拓扑特性。方法利用肝细胞癌的基因和miRNA表达谱数据构建调控网络,并研究节点中患者的生存信息。结果对基因共表达网络节点的度进... 目的从系统层面探索基因和微小RNA(microRNA,miRNA)的网络结构,结合生存分析技术,研究生存率相关分子的拓扑特性。方法利用肝细胞癌的基因和miRNA表达谱数据构建调控网络,并研究节点中患者的生存信息。结果对基因共表达网络节点的度进行全局计算发现,整个网络节点的度服从幂律分布,在一个网络中,度相对较高的节点称为"集线器(Hub)",与普通节点相比,这些Hub节点中与生存相关的基因更为富集。结论基因调控网络中的Hub节点,有望作为分子分型的潜在特征。 展开更多
关键词 肝细胞癌 外科手术 复杂分子网络 生存分析 基因表达
原文传递
内燃机余热有机朗肯循环工质筛选研究 被引量:5
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作者 戴晓业 安青松 +1 位作者 史琳 翟慧星 《汽车工程》 EI CSCD 北大核心 2017年第2期121-126,共6页
汽车发动机余热资源品位高、回收潜力大,适合使用有机朗肯循环(Organic Rankine Cycle,ORC)进行回收利用。本文中针对内燃机余热有机朗肯循环的特点提出工质筛选条件,并根据实际系统的性能和成本分析,提出以总净功量、热效率和膨胀机的... 汽车发动机余热资源品位高、回收潜力大,适合使用有机朗肯循环(Organic Rankine Cycle,ORC)进行回收利用。本文中针对内燃机余热有机朗肯循环的特点提出工质筛选条件,并根据实际系统的性能和成本分析,提出以总净功量、热效率和膨胀机的膨胀比与尺寸参数等为评价指标的系统评价方法,对筛选出的备选工质进行评价。结果表明,工质的表现主要与临界温度和分子复杂度有关,ORC系统的性能与工质的临界温度呈正相关,系统成本则与工质的分子复杂度呈正相关。因此,临界温度较高而分子复杂度偏低的工质R1233zd(E)是7种备选工质中的最佳选择。 展开更多
关键词 内燃机余热 有机朗肯循环 工质评价 临界温度 分子复杂
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纳米微粒Ni-ZrO_2复合镀层电镀液的制备 被引量:4
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作者 霍伟荣 刘家臣 +2 位作者 许黎明 王丽娟 王凯丽 《电镀与精饰》 CAS 2003年第6期1-4,共4页
选用ZrO2纳米粉,分别采用调节pH值、加入非离子型表面活性剂和离子型复杂大分子表面活性剂制备纳米微粒Ni-ZrO2复合镀层电镀液。研究发现在pH=3时,通过加入一定量的离子型复杂大分子表面活性剂可以得到高分散、高稳定的复合电镀液。
关键词 纳米微粒 Ni-ZrO2复合电镀液 复杂分子表面活性剂 分散 稳定性 PH值 氧化锆陶瓷
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“一锅法”不对称多组分串联反应合成手性氢化环氧异色烯衍生物:一种快速构建分子复杂性方法(英文) 被引量:2
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作者 唐敏 吴永 +4 位作者 刘源 蔡茂强 夏飞 刘顺英 胡文浩 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2016年第1期54-60,共7页
设计、研究了一种重氮、4-羟基丙烯酸乙酯和呋喃衍生物参与的三组分串联反应,在Rh2(OAc)4/Zr-3-I-联二萘酚共催化下,该反应能快速高效地一锅构建复杂O-杂并环化合物.利用该方法,可从简单起始原料高立体选择性地合成含有八个连续手性中... 设计、研究了一种重氮、4-羟基丙烯酸乙酯和呋喃衍生物参与的三组分串联反应,在Rh2(OAc)4/Zr-3-I-联二萘酚共催化下,该反应能快速高效地一锅构建复杂O-杂并环化合物.利用该方法,可从简单起始原料高立体选择性地合成含有八个连续手性中心的氢化环氧异色烯衍生物,非对映选择性和高对映选择性分别高达99/1 dr和99%ee.结合理论计算对反应的高立体选择性进行了探讨.可能的反应机理为羟基叶立德捕捉的多组分反应后发生分子内的Diels-Alder反应,再发生双键环氧化反应.该方法为复杂O-并杂环化合物的高效合成提供了一种新途径,同时也为高效构建分子复杂性提供了一种新思路,在基于表型筛选的新药发现中具有重要潜在应用. 展开更多
关键词 多组分串联反应 不对称催化 分子复杂 一锅法 O-杂环化合物
原文传递
活性阴离子聚合研究进展 被引量:1
15
作者 吴迪 魏峰 +5 位作者 鄂彦鹏 李嵬 刘晓杰 沈照千 卢俊典 朱思琪 《弹性体》 CAS 2020年第1期63-67,共5页
主要叙述了阴离子聚合的研究进展,通过阴离子聚合可以制备具有复杂大分子结构的聚合物,合成的结构包括星形、梳状/接枝、环状、支链、树枝状和多嵌段多组分聚合物。选用新型单体是一个重要研究方向,包括二苯乙烯、苯丙富烯等,将阴离子... 主要叙述了阴离子聚合的研究进展,通过阴离子聚合可以制备具有复杂大分子结构的聚合物,合成的结构包括星形、梳状/接枝、环状、支链、树枝状和多嵌段多组分聚合物。选用新型单体是一个重要研究方向,包括二苯乙烯、苯丙富烯等,将阴离子聚合与其他设备及聚合方式融合是另一个研究方向。 展开更多
关键词 阴离子聚合 复杂分子结构 极性单体
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Isolation and Chromosomal Mapping of a Corn B Chromosome Specific RAPDs 被引量:3
16
作者 祁仲夏 李秀兰 +2 位作者 陈成彬 宋文芹 陈瑞阳 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2002年第4期499-501,共3页
B染色体存在于多种动植物中 ,具有很多独特的性状。B染色体与正常染色体在DNA组成方面十分相似 ,寻找B染色体特异序列一直是B染色体研究的难点和热点。通过对含有和不含有B染色体的两种玉米 (ZeamaysL .)基因组进行了RAPD分析 ,筛选到一... B染色体存在于多种动植物中 ,具有很多独特的性状。B染色体与正常染色体在DNA组成方面十分相似 ,寻找B染色体特异序列一直是B染色体研究的难点和热点。通过对含有和不含有B染色体的两种玉米 (ZeamaysL .)基因组进行了RAPD分析 ,筛选到一个B染色体特异性分子标记B480。该标记与玉米的自主复制起始序列ARS1和ARS2同源 ,特别是该序列中的 2 5bp出现在多种模式生物基因组中。FISH的结果显示 。 展开更多
关键词 corn B chromosome RAPD fluoresent in situ hybridization (FISH) autonomously replicating sequence (ARS)
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Gene-Ontology Analysis on the Differentially Expressed Genes in Maize (Zea mays L.) Ear Rot 被引量:2
17
作者 Guang-Sheng Yuan Jian Gao Zhi-Ming Zhang Juan Du Gui-Qing Mu Guang-Tang Pan 《Journal of Life Sciences》 2013年第3期219-226,共8页
To better know FM (Fusarium moniliforme) induced genes in maize ear rot, GO (gene ontology) method was performed to analyze detail physiological functions in the defensive response after pathogen infection. This g... To better know FM (Fusarium moniliforme) induced genes in maize ear rot, GO (gene ontology) method was performed to analyze detail physiological functions in the defensive response after pathogen infection. This gene annotation system was widely used to investigate large numbers of genes involving in real active role or regulator in cell response. First of all, differentially expressed genes were isolated by using genechip platform at 96 h post-inoculation with FM in maize inbred Bt-1. In total, 482 differentially expressed unique genes were screened out in inbred Bt-1 when compared to mock-inoculated bract tissues. Then, each gene was annotated to define functional class by GO method. Finally, these large FM-responsive genes with significant differentially change were sorted into cellular component, molecular function and biological process with complicated network by molecular annotation system. The demonstrated information in the GO analysis could provide another view for understanding the molecular mechanism and indicate a deeply complicated network with gene function underlying disease development in the host tissue. The findings in this study provide important bases to probe the molecular processes, the alteration of metabolism and the immune mechanism upon the FM infection in maize. 展开更多
关键词 Ear rot GENECHIP Fusarium moniliforme gene ontology Zea mays.
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Molecular-Based Simulation of Feedstock Properties for Complex Reaction System
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作者 Ouyang Fusheng Bao Wenjun +1 位作者 Jiang Hongbo Weng Huixin (Research Center of Petroleum Processing,East China University of Science and Technology,Shanghai 200237) 《China Petroleum Processing & Petrochemical Technology》 SCIE CAS 2010年第1期54-60,共7页
The kinetics of complex reaction systems were studied on molecular level with the combined method of Monte Carlo simulation and Structural Oriented Lumping by focusing on deep catalytic cracking (DCC) process, the m... The kinetics of complex reaction systems were studied on molecular level with the combined method of Monte Carlo simulation and Structural Oriented Lumping by focusing on deep catalytic cracking (DCC) process, the model parameters were optimized by means of routine analytic data of a DCC unit. A model was established to transform the feedstock of the complex reaction systems such as DCC to 1000-10000 pseudo-molecules with the Monte Carlo simulation and every molecule was expressed by 19 attributes. The results of model simulation showed that these pseudo-molecules reflected the characteristics of feedstock very well and their average properties gave a good agreement with the plant data. 展开更多
关键词 complex reaction system molecular scale kinetic model Monte Carlo simulation deep catalyticcracking
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NEW FAST ALGORITHM FOR 2-D ANGLE-OF-ARRIVAL ESTIMATION
19
作者 Wang Hongyang Liao Guisheng Wu Yuntao 《Journal of Electronics(China)》 2005年第5期465-469,共5页
Based on propagator method, a fast 2-D Angle-Of-Arrival (AOA) algorithm is proPosed in this paper. The proposed algorithm does not need the Eigen-Value Decomposition (EVD) or Singular Value Decomposition (SVD) of the ... Based on propagator method, a fast 2-D Angle-Of-Arrival (AOA) algorithm is proPosed in this paper. The proposed algorithm does not need the Eigen-Value Decomposition (EVD) or Singular Value Decomposition (SVD) of the Sample Covariance Matrix (SCM), thus the fast algorithm has lower computational complexity with insignificant performance degradation when comparing with conventional subspace approaches. Furthermore, the proposed algorithm has no performance degradation. Finally, computer simulations verify the effectiveness of the proposed algorithm. 展开更多
关键词 Angle-Of-Arrival(AOA) Computational complexity Subspace approach
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Modified Mohr-Coulomb strength criterion considering rock mass intrinsic material strength factorization 被引量:5
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作者 ZHANG Qiang,WANG Shuilin,GE Xiurun,WANG Hongying State Key Laboratory of Geomechanics and Geotechnical Engineering,Institute of Rock and Soil Mechanics,Chinese Academy of Sciences,Wuhan 430071,China 《Mining Science and Technology》 EI CAS 2010年第5期701-706,共6页
With the increase of mining depth of mineral resources,the rock mass stress state is being more and more complex.The rock mass show different features,namely,with the increase of hydrostatic pressure,rock mass failure... With the increase of mining depth of mineral resources,the rock mass stress state is being more and more complex.The rock mass show different features,namely,with the increase of hydrostatic pressure,rock mass failure mode turns from brittle tension failure to structure ductile failure and its limit strength also increases.The restriction of minimal principal stress on the initiation and development of microcrack and the change of micro-unit stress state by the intermediate principal stress play a decisive role in the increase of rock mass limit strength.Based on the rock mass failure behavior law under complex stress state and the σ2-dependence on the rock mass strength,we proposed a Modified Mohr-Coulomb(M-MC) strength criterion which is smooth and convex.Finally,the M-MC criterion is validated by multiaxial test data of eight kinds of rock mass.We also compared the fitting results with Mohr-Coulomb criterion(MC).It shows that the new criterion fits the test data better than the Mohr-Coulomb criterion.So the M-MC strength criterion well reveals the rock mass bearing behavior and can be widely used in the rock mass strength analysis.The results can provide theoretical foundations for stability analysis and reinforcement design of complex underground engineering. 展开更多
关键词 rock mass strength criterion Mohr-Coulomb criterion multiaxial test failure mode underground engineering
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