环状RNA研究进展

环状RNA(circular RNAs,circRNAs)是一类通过反向剪接(backsplice)方式形成的非编码RNA,因其剪接来源不同,主要分为外显子来源环状RNA(exonic circRNAs)和内含子来源环状RNA(ciRNAs).长期以来,由于环状RNA较低的表达量和科研条件的限制,相关研究较少.近年来,科研工作者借助高通量测序技术,结合其他现代分子生物学手段对其进行研究,取得了重要进展.目前已发现,环状RNA较线性RNA更加稳定,且有调控转录等作用.本文对环状RNA的研究历程、形成机制及一般特征、检测方法、功能等方面的最新研究进展进行了综述.

环状RNA（circular RNA，CircRNA）

CircRNA是近几年来发现的一类新型、特殊的非编码RNA分子，通常是通过特殊的选择性剪接机制而产生的包含一个以上外显子环化构成环状RNA，几乎存在于所有物种，大量存在于真核细胞的细胞质中。现有研究表明，在人或动物中，其表达具有组织特异性和疾病特异性，有可能成为新型的分子标志物。

Mini患者来源异种移植和WES/RNA测序指导一例转移性十二指肠腺癌患者的个体化治疗

背景与目的各种癌症的治疗指南已越来越多地应用于临床实践,并已极大地改善了患者预后。然而,医生推荐的治疗方案(甚至一线治疗)并非对每位患者都是最佳的。在本研究中,我们应用mini患者来源的异种移植(mini patient-derived xenograft,mini-PDX)和二代测序技术指导了一例转移性十二指肠腺癌患者的个体化治疗。方法将切除的异位转移瘤组织植入SCID小鼠体内,来确定对各种药物的敏感性。采用DNA全外显子测序(DNA whole-exome sequencing,DNA-WES)和RNA测序分析突变谱。所得分析结果用于选择对转移性十二指肠腺癌的最佳治疗方案。结果使用mini-PDX模型进行评估只用了7 d。结果表明,对S-1+顺铂、吉西他滨+顺铂、依维莫司单药具有高敏感性。患者最初接受吉西他滨联合顺铂治疗,但由于毒性而终止治疗。随后,该患者单独使用S-1进行治疗。总无病生存期为34个月。DNA-WES和RNA测序鉴定了转移性十二指肠腺癌中KRAS突变(A146T)、TP53(C229Yfs*10)和RICTOR扩增。这些发现进一步为mini-PDX的结果提供了支持,并建议当该患者最终复发时应使用m TOR抑制剂治疗。结论联合WES/RNA测序的mini-PDX模型可以快速检测癌症患者的药物敏感性,揭示关键的基因变异。有必要进一步研究该技术用以对难治性恶性肿瘤患者进行个体化治疗。

线虫环状RNA分析

外显子环状RNA (ecircRNA)是前体信使RNA中外显子经过反向剪接首尾相连而成环的一类特殊的RNA分子。近期多项研究发现,这类环状RNA广泛存在于真核生物细胞中,并具有调控基因表达的重要功能。本文根据线虫不同生长发育阶段的RNA测序数据,共预测出1112个典型的外显子环状RNA。对这些环状RNA进行分析,发现它们具有生长发育阶段特异性,并同线性的mRNA分子不具有直接的相关性。通过分析环状RNA侧翼内含子序列信息,证明在线虫中环状RNA的形成支持内含子配对驱动环化模型。

环状RNA的研究现状及展望

环状RNA（circular RNA,circRNA）或称环形RNA,是新近确认的一类特殊的非编码RNA（non-coding RNA,ncRNA）分子,是继microRNA （miRNA）后RNA家族的一颗极具发展潜力的正在升起的新星,也是RNA领域最新的研究热点,方兴未艾.通过与疾病关联的miRNA相互作用,circRNA在疾病中发挥着重要的调控作用,有巨大潜力成为新型的临床诊断标志物.

环状RNA概述及其在动物肌肉发育中的研究进展

环状RNA是一种具有环状结构的非编码RNA,在转录过程中出现,由单链RNA分子通过共价结合形成环形。环状RNA在植物和动物机体中广泛分布,主要承担了与蛋白质结合、调控转录等生物功能,对动物的肌肉发育也有重要的调控作用。文章综述了环状RNA的发现、合成与特征、检测方法及生物学功能,介绍了环状RNA在动物肌肉发育中的研究进展,展望了环状RNA的研究应用前景。

环状RNA及其临床应用研究进展

RNA （circular RNA,circRNA）是一类由特殊剪切机制形成的,具有闭合环状结构的非编码RNA分子,广泛存在于真核细胞中,主要包括外显子来源的和内含子来源的环形RNA.早在1993年,Cocquerelle等[1]在人体细胞中发现了一些由外显子构成的circRNA,但是在当时其被认为是由于外显子转录本错误剪接而形成的低丰度分子.

环形RNA分子揭秘

环形RNA分子是一类不具有5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。利用针对环形结构RNA分子的实验和计算方法,并结合新一代高通量测序,现已在多种细胞内发现了大量环形RNA分子的稳定存在。目前,尽管环形RNA分子的产生机制及其代谢仍然不清楚,但是已有的研究表明环形RNA分子具有调控基因表达的功能。对环形RNA分子的产生机制和功能等的进一步研究,将为人们深入理解生命活动在转录水平的复杂性调控提供重要的分子基础和研究依据。