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题名人类蛋白编码基因外显子谱和同义密码子偏好的研究
被引量:2
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作者
杨潇
胡军
陈祥贵
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机构
西华大学生物工程学院
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出处
《西华大学学报(自然科学版)》
CAS
2008年第2期79-82,共4页
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基金
四川省应用基础研究项目(No.03JY029-041)
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文摘
从UCSC数据库提取基因序列,通过codon W软件进行密码子偏好性分析。比较分析不同外显子谱的人类蛋白编码基因密码子使用偏好,发现在多外显子基因中,随着基因外显子数增加,NNU和NNA型密码子RSCU值上升,NNC型密码子RSCU值下降,UUG密码子RSCU值增加,而其它NNG型密码子RSCU值下降。作为具有最少外显子数的基因,单外显子基因密码子RSCU值具有异常的表现,表明其具有和多外显子基因不同的起源和进化过程。
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关键词
人类蛋白编码基因
密码子偏好
外显子谱
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Keywords
human protein coding gene
condon bias
exonic pattern
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分类号
Q987
[生物学—遗传学]
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