番茄果皮颜色的基因功能标记开发及色差仪参数相关分析

番茄果皮颜色由已克隆的SIMYB12基因控制,是影响消费者选择的最直观标准和重要的外观品质之一,利用分子功能标记及精准的果皮颜色测定对果皮颜色进行筛选,对加快番茄果皮选育具有指导意义。根据SIMYB12基因起始密码子上游4 kbp处的603 bp片段缺失,共设计可在琼脂糖凝胶上检测的分子功能标记16对。结果显示,共有7对功能标记可用(4对显性标记和3对共显性标记),其中A-10扩增效果最好,扩增片段大小为890bp(有色果皮)和287 bp(无色果皮)。利用30份番茄种质资源对A-10进行验证,结果表明,A-10能够准确地鉴定供试材料是否包含缺失片段的基因型。利用色差仪对不同颜色的番茄果皮进行测定和分析,Ch和Lab测量值均可用于果皮颜色的定量分析,而Ch测量值更加直观和简便。本研究开发的果皮分子功能标记A-10可用于番茄果皮颜色的分子标记辅助选择育种,并且Ch测量值可用于果皮颜色快速和准确的测定。

椰子CnRADIALIS-like转录因子的克隆与表达分析

本研究依据前期已经完成的4个品种椰子外果皮转录组测序数据结果,筛选获得在4个品种椰子外果皮中表达水平显著差异的MYB类基因CnRADIALIS-like。从椰子(Cocos nucifera L.)外果皮中克隆获得CnRADIALIS-like,序列分析显示,CnRADIALIS-like基因的开放阅读框(ORF)长288 bp,编码95个氨基酸。结构域分析显示,CnRADIALIS-like含有1个典型的SANT/MYB结构域,属于MYB转录因子家族中的I-box-binding-MYB型。多序列比对发现,CnRADIALIS-like氨基酸序列与油棕MYB-RADIALIS(RAD)氨基酸序列相似度最高。理化性质、亲/疏水性和无序化分析显示,CnRADIALIS-like转录因子是亲水性蛋白且偏碱性,存在无序化区域。信号肽和跨膜结构域分析表明,其不存在信号肽和跨膜结构域。空间结构分析显示,CnRADIALIS-like有典型的α-螺旋结构。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)显示,CnRADIALIS-like基因在4个品种椰子外果皮中的表达量存在显著差异,在红矮椰子中表达量最高,红矮椰子不同组织中在外果皮表达量最高。该基因的表达在红矮椰果从幼果至成熟果的3个发育阶段依次降低,套袋条件下表达量低于正常光照条件下,表明该基因可能与光形态下细胞发育及代谢产物合成存在相关作用。通过对该基因的生物信息功能进行分析,为深入研究其功能及作用机制提供参考,同时以期为深入剖析椰子的外果皮颜色形成机制提供重要的理论依据。