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水产品腐败希瓦氏菌外膜脂蛋白受体结构、功能及基因表达分析
被引量:
3
1
作者
周文萱
李秋莹
+3 位作者
崔方超
檀茜倩
孙彤
励建荣
《食品科学技术学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期131-140,共10页
外膜脂蛋白受体LolB是革兰氏阴性菌运输脂蛋白的关键因子。采用生物信息学方法和实时荧光定量PCR技术探究水产品腐败希瓦氏菌LolB的理化性质、结构和功能及其在不同环境中的基因表达变化。结果表明:lolB基因具有较高的序列保守性;其蛋白...
外膜脂蛋白受体LolB是革兰氏阴性菌运输脂蛋白的关键因子。采用生物信息学方法和实时荧光定量PCR技术探究水产品腐败希瓦氏菌LolB的理化性质、结构和功能及其在不同环境中的基因表达变化。结果表明:lolB基因具有较高的序列保守性;其蛋白LolB分子质量约为23 ku,是稳定的亲水性蛋白,含有信号肽,具有21个磷酸化位点,不具有跨膜结构。LolB的二级结构以无规则卷曲和β-折叠为主,三级结构呈β桶状结构。预测到LolB与脂蛋白转运系统的LolA、LolC和LolE家族跨膜蛋白、ABC转运相关蛋白及增加细胞膜刚性、维持胞壁质稳定性的催化型裂解转糖酶等多种蛋白质存在相互作用。荧光定量PCR结果表明:lolB基因在菌体受到一定程度的饥饿、乙醇、渗透压及高温胁迫时上调表达,而随着胁迫程度增加呈先升后降的表达趋势;4℃条件下,lolB基因表达模式与对照组相似;外源信号分子C6-HSL诱导lolB高表达,并和LolB蛋白的Leu51残基通过π-烷基存在相互作用。研究结果旨在为解析LolB在腐败希瓦氏菌中的功能和水产品腐败希瓦氏菌的靶向抑制提供新思路。
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关键词
腐败希瓦氏菌
外膜脂蛋白定位系统
外膜
脂
蛋白
受体LolB
实时荧光定量PCR
生物信息学分析
环境胁迫
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职称材料
题名
水产品腐败希瓦氏菌外膜脂蛋白受体结构、功能及基因表达分析
被引量:
3
1
作者
周文萱
李秋莹
崔方超
檀茜倩
孙彤
励建荣
机构
渤海大学食品科学与工程学院/生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心
出处
《食品科学技术学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期131-140,共10页
基金
辽宁省自然科学基金资助项目(2020-MS-288)。
文摘
外膜脂蛋白受体LolB是革兰氏阴性菌运输脂蛋白的关键因子。采用生物信息学方法和实时荧光定量PCR技术探究水产品腐败希瓦氏菌LolB的理化性质、结构和功能及其在不同环境中的基因表达变化。结果表明:lolB基因具有较高的序列保守性;其蛋白LolB分子质量约为23 ku,是稳定的亲水性蛋白,含有信号肽,具有21个磷酸化位点,不具有跨膜结构。LolB的二级结构以无规则卷曲和β-折叠为主,三级结构呈β桶状结构。预测到LolB与脂蛋白转运系统的LolA、LolC和LolE家族跨膜蛋白、ABC转运相关蛋白及增加细胞膜刚性、维持胞壁质稳定性的催化型裂解转糖酶等多种蛋白质存在相互作用。荧光定量PCR结果表明:lolB基因在菌体受到一定程度的饥饿、乙醇、渗透压及高温胁迫时上调表达,而随着胁迫程度增加呈先升后降的表达趋势;4℃条件下,lolB基因表达模式与对照组相似;外源信号分子C6-HSL诱导lolB高表达,并和LolB蛋白的Leu51残基通过π-烷基存在相互作用。研究结果旨在为解析LolB在腐败希瓦氏菌中的功能和水产品腐败希瓦氏菌的靶向抑制提供新思路。
关键词
腐败希瓦氏菌
外膜脂蛋白定位系统
外膜
脂
蛋白
受体LolB
实时荧光定量PCR
生物信息学分析
环境胁迫
Keywords
Shewanella putrefaciens
lipoprotein outer membrane localization system
outer membrane lipoprotein receptor LolB
real-time fluorescence quantitative PCR
bioinformatic analysis
environmental stress
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
TS254.4 [轻工技术与工程—水产品加工及贮藏工程]
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题名
作者
出处
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被引量
操作
1
水产品腐败希瓦氏菌外膜脂蛋白受体结构、功能及基因表达分析
周文萱
李秋莹
崔方超
檀茜倩
孙彤
励建荣
《食品科学技术学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023
3
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