痤疮患者和健康人群痤疮丙酸杆菌多序列位点分型分子流行病学研究

目的:本研究拟通过多序列分型(MLST)方法研究是否存在某些和痤疮发病密切相关的基因型。方法:分离培养痤疮患者和健康志愿者皮肤中的痤疮丙酸杆菌株,进行管家基因扩增、测序、比对,比较不同来源的菌株的基因型、亲缘关系及分子流行病学特征。结果:痤疮患者和健康志愿者皮肤标本痤疮丙酸杆菌检出阳性率分别为80.49%和80.77%,差异无统计学意义(P>0.05)。来自健康志愿者的21个菌株可以被分为8个序列类型(ST),分别是ST3、ST8、ST9、ST10、ST18、ST26、ST27和ST46;而来自于患者的33个菌株仅被分为3个ST,它们是ST3、ST26和ST28。结论:痤疮的发生和皮肤中痤疮丙酸杆菌的阳性检出率并无明显关系,但来自于痤疮患者菌株的ST生物多样性明显降低,ST28等基因型与痤疮的发病密切相关。

上海市热带念珠菌临床分离株耐药性及多位点序列分型研究

目的 分析上海市感染性疾病患者的热带念珠菌临床分离株耐药性,并对其进行分子特征研究.方法 于2012—2015年,从上海市公共卫生临床中心87例感染性疾病患者的真菌培养标本中分离热带念珠菌,共95株;同时,收集患者的临床基本资料.采用ATB FUNGUS 3药物敏感性检测板条分析菌株对抗真菌药物的耐药性,采用多位点序列分型法（MLST）对其进行分型,同时应用MEGA 5.2软件中UPGMA方法对95株热带念珠菌进行同源性分析.结果 95株热带念球菌分别来源于结核病患者（31株）、艾滋病患者（21株）、肝病患者（19株）和罕见原因感染或发热患者（24株）;对5-氟胞嘧啶、两性霉素B、氟康唑、伊曲康唑和伏立康唑的耐药率分别为：2.1%（2株）、0、26.3%（25株）、26.3%（25株）和26.3%（25株）,其中,唑类耐药株患者分别来源于罕见原因感染或发热患者（14株）、艾滋病患者（8株）和结核病患者（3株）.MLST分型分析显示,产生72个序列型（ST型）,其中70种为新型别;进化树分析显示,95株临床株分布为三大簇,唑类耐药株中有24株（96.0%）分布于同一簇.结论 分离的热带念珠菌主要对唑类药物耐药,MLST分型显示与其遗传背景密切相关.

福州市生殖道沙眼衣原体的MLST分子流行病学研究

目的研究多位点序列分型法(MLST)在福州地区性病门诊人群生殖道沙眼衣原体基因分型中的分辨力,并与来自阿姆斯特丹性病门诊女性患者的样本进行比较。方法采用MLST分型法研究福州性病门诊生殖道沙眼衣原体感染者的基因型,eBURST进行ST型地理分布特征分析。结果从86份阳性标本中可获得完整MLST数据的样本为76份,共分30个ST型,其中14个为新的型别。MLST分型法的Simpson分辨力指数为0.9。eBURST分型结果显示30个ST型分为3个克隆复合体和5个独特型。仅有4个ST型在福州和阿姆斯特丹两地同时存在。结论 MLST为生殖道沙眼衣原体分子流行病学调查提供高分辨率的分型手段。eBURST分析可揭示不同地理来源的生殖道沙眼衣原体之间的进化关系。