24个菊芋品种(系)遗传多样性的ISSR标记分析

利用ISSR分子标记技术研究了来源于国内外不同区域的24个菊芋（Helianthus tuberosus Linn．）品种（系）的遗传多样性，并结合块茎特征采用聚类分析法探讨了它们的遗传关系。结果表明：用16条ISSR引物从24个品种（系）的基因组DNA共扩增出242条带，包含228条多态性条带，多态性条带百分率达94．2％，其中7条引物的多态性条带百分率达100．0％。各品种（系）间的遗传距离为0．19～1．01，遗传距离平均值为0．45。聚类分析结果显示：在遗传相似系数0．68处可将24个品种（系）划分为5类，第1类仅包含‘青芋1号’（‘Qingyu No．1’），第Ⅱ类仅包含W12，第Ⅲ类包含W30、W42、‘青芋2号’（‘Qingyu No．2’）、W09、W18、W26和WSl，第Ⅳ类包含W06和W84，第V类包含‘青芋3号’（‘Qingyu No．3’）、w23、W36、W43、W54、W75、WS0、W62、W64、W79、S150、S138和W66；多数块茎特征相似的品种（系）被聚在一起，但也有部分块茎特征不同的品种（系）被聚在同一类中；部分品种（系）的聚类分析结果与其形态分类结果及地理分布不一致。研究结果表明：供试的菊芋品种（系）具有较高的遗传多样性，存在着较为频繁的基因交流；基于ISSR标记分析能较准确地揭示出菊芋品种（系）间的遗传多样性。

基于AFLP标记的山东省5个野核桃群体的遗传多样性分析

利用AFLP分子标记，对分布于山东省内5个样地（泰山鹁鸽崖、鲁山核心区边缘、崂山北九水、昆嵛山南天门和泰山佛爷寺）的46个野核桃（Juglans cathayensis Dode）单株的遗传多样性进行了分析，并采用聚类分析方法探讨了它们的遗传关系。结果表明：用8对PstI／MseI系列引物组合从46个单株中共扩增出1034条带，其中多态性条带1005条，多态性条带百分率达97．20％；每对引物可扩增出113～154条多态性条带，平均每对引物可扩增出125．6条多态性条带。在这些条带中包含174条特异性条带（其中有19条缺失条带），通过特异性条带可鉴别出91．3％的野核桃单株。5个野核桃群体的多态性条带百分率（PPB）、观测等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Nei’S基因多样度（H）和Shannon’S信息指数（，）分别为50．57％～63．51％、1．5057～1．6351、1．2735～1．3004、0．1632—0．1819和0．249l～0．2813，PPB、Na、Ne、H和，的平均值分别为55．23％、1．5523、1．2843、0．1696和0．2594，表明野核桃群体遗传多样性较高、遗传变异较为丰富。46个单株的遗传相似性系数为0．5368～0．8645，平均值为0．6249。聚类分析结果显示：在遗传相似性系数0．66处，可将46个单株分成7组，其中部分来源于同一产地的单株没有聚在同一组中，表明这些野核桃单株的遗传关系与其地理分布不完全一致。

西林水牛群体的RAPD遗传多样性分析

【目的】了解西林水牛群体的遗传变异和遗传结构,为其辅助标记育种、遗传资源保护及利用提供参考依据。【方法】从广西西林县的8个乡（镇）采集184份西林水牛血样,采用优化后的RAPD技术检测其多态性DNA,统计多态性条带数,并应用Popgene32软件对西林水牛群体的有效等位基因数、Nei氏基因多样性指数及Shannon多样性指数进行分析。【结果】从18条RAPD引物中筛选出8条扩增产物稳定、条带清晰可辨的引物,扩增出的DNA片段分子量为100-1000 bp;从184个样本中共扩增出4968个多态性条带,平均每条引物可扩增出621个多态性条带,多态性频率达60.0%-100.0%,平均为89.7%。西林水牛群体的平均有效等位基因数为1.6745,平均Nei氏基因多样度指数为0.3583,平均Shannon多样性指数为0.5510。【结论】西林水牛群体的遗传变异、遗传分化及遗传多样性均较高,但选育程度较低,育种潜力较大,有待进一步保种和开发利用。

云南昭通小叶种茶亲缘关系的ISSR分析

【目的】为了明确云南昭通小叶茶种之间的亲缘关系,为后续品种选育和种质资源的开发利用奠定基础。【方法】采用15个ISSR引物对云南昭通9份有代表性的小叶种茶样基因组DNA进行PCR扩增。【结果】试验共扩增得到清晰的PCR条带105条,多态性带比例为84.3%,遗传相似系数介于0.55~0.76之间;在0.60水平上,9份云南昭通小叶种茶样被分为3大类,两个西湖龙井茶样为第一类,两个广东白茶茶样为第二类,它们是早年被引进昭通的品种,其余5种为第三类。【结论】云南昭通小叶种茶存在丰富的遗传多样性,并且展示了它们之间的亲缘关系。

天女花与广玉兰杂交F_1代的ISSR遗传多样性分析

利用ISSR分子标记技术探讨了天女花与广玉兰杂交后代9株幼苗的遗传多样性。9株F_1代幼苗根据生长健壮的情况依次标记为SA、SB、SC、SD、SE、SF,、SG、SH、SI。选用10个ISSR引物对亲本以及9株F_1代幼苗的基因组进行分析。结果表明,11株植物共扩增出96条DNA条带,其中多态性条带为85条,占总条带的88.5%。UPGMA聚类结果表明所有F_1代幼苗与六倍体父本更为相似,与二倍体的母本遗传距离较远。其中SC无论从叶片大小、边缘的形态在9株F_1代幼苗中与父本最相似,SG叶片为披针形,在9株F_1代幼苗中较为特殊。其余7株F_1代幼苗日渐成熟后再根据UPGMA聚类树状图进行形态多样性分析。

难培养菌的多条带PCR产物产生原因分析

【目的】分析严重威胁柑橘产业发展的毁灭性病害——柑橘黄龙病的强致病性病原亚洲种"Candidatus Liberibacter asiaticus"的种群多样性研究中出现多条带PCR产物的原因,为难培养菌的分子生物学研究提供参考。【方法】通过使用PCR、聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和测序相结合分析"Ca.L.asiaticus"基因组上2个短串联重复(Short tandem repeats,STR)基因的PCR产物。【结果】单个菌株可扩增获得多个PCR条带且其扩增产物多态性受寄主品种影响;这2个STR基因的PCR产物在菌株间呈明显的多态性;扩增所获得的序列可来自"Ca.L.asiaticus"本身,也可来自其寄主或内生菌。【结论】难培养菌的STR基因PCR产物多态性产生的主要原因是该基因内部的串联重复序列数目存在差异,但目的菌及外源物种(寄主或内生菌等)基因组的非特异性扩增也是影响其多态性的因素。

银鲫人工杂交试验中雄核发育现象的RAPD实验证据

以随机扩增多态性DNA（RAPD）技术为手段，对雌性野鲫、雄性异育银鲫及其杂交F1代（选择性状接近父本的5％F1代）、父本国交F1代进行了遗传多态分析．从150个随机序列引物中筛选得到9种引物，并用它们可得到36个可用作遗传标记的RAPD多态性条带．其中的22条父本显性条带均遗传子代，而14条母本显性条带则均未被遗传子代．对两亲本和子代中的RAPD标记条带的分布情况及相似系数分析．以及聚类分析结果均支持部分异育银鲫精子在两性生殖的野鲫卵质中进行“雄核发育”的假说．

基于ISSR标记的麻花艽遗传多样性分析

目的探讨秦艽基原植物之一麻花艽Gentiana straminea的遗传多样性,并构建DNA指纹谱。方法在其自然分布区广泛取样,共涉及西藏、青海、甘肃及四川等地28个居群83份样本,应用ISSR分子标记技术,POPGEN软件分析遗传信息参数,NTSYS软件构建亲缘关系UPGMA聚类图。结果从100条引物中筛出7条多态性好、条带清晰的引物用于ISSR分析。共检测到95个条带,其中多态性条带88个,多态性条带百分率(PPL)为92.63%;麻花艽居群间的期望杂合度(H_e)为0.288 2,多样性信息指数(I_m)为0.437 1,种群间基因分化系数(G_(st))为0.678 3,基因流(N_m)为0.237 1,遗传距离为0.074 3~0.490 0。UPGMA树将麻花艽居群主要分为2大支。结论麻花艽种群遗传多样性水平较高,居群间遗传多样性水平高于居群内;其遗传变异主要存在于居群间;遗传特性与地理分布具有一定相关性。该工作可为麻花艽品种鉴定、物种就地保护、探讨环境等因素对于遗传分化的影响及药材道地性研究提供基础资料。

广西草珊瑚种质资源遗传多样性的AFLP分析

目的探索广西草珊瑚Sarcandra glabra种质资源的遗传多样性,为草珊瑚及其他中药种质资源保护、亲缘关系研究、品种选育和引种栽培提供分子生物学依据。方法利用AFLP标记对来自广西不同产地的18份草珊瑚开展遗传多样性分析,采用NTSYS软件进行聚类和主坐标分析。结果从64对AFLP引物组合中筛选出8对用于扩增,共获得319条清晰可辨条带,其中多态性条带251条,多态性位点百分率为78.68%。聚类和主坐标分析表明广西草珊瑚种质资源的遗传基础存在一定的多样性,但遗传相似性系数(0.630 3～0.836 6)较大,遗传距离较近。结论广西草珊瑚种质资源的遗传多样性偏低,应该尽快采取相应措施,对草珊瑚资源进行合理保护。

我国仙茅属植物遗传关系的RAPD分析

目的从分子水平研究我国仙茅属(Curculigo Gaertn.)植物的遗传关系。方法对我国仙茅属植物7个国产种30个单株进行RAPD分析。运用Popgene Version1.31软件计算相关参数,采用UPGMA聚类法进行聚类分析。结果 11个RAPD引物共扩增出157条带,其中有145条呈多态性。我国仙茅属植物的遗传多样性极为丰富,在物种水平上,多态位点百分率(PPB)为92.36%,平均每个位点的有效等位基因数(Ne)为1.493 7,Nei’s基因多样性指数(H)为0.300 1,Shannon’s多样性信息指数Hsp为0.457 7。在种内水平上,PPB=5.09%,Ne=1.036 6,H=0.020 4,种内Shannon’s多样性信息指数(Hpop)为0.029 8。Nei’s基因多样性指数计算的种间遗传分化系数(Gst=0.931 3)与Shannon’s分化系数(0.934 9)基本一致,均说明大部分遗传变异存在于种间。种间基因流(Nm)为0.036 9,说明种间基因流动较少,遗传分化程度较高。两种间的Nei’s遗传一致度(I)的范围为0.520 8～0.823 7。根据Nei’s遗传距离进行UPGMA聚类,基于RAPD分子标记的聚类结果与传统分类一致。结论我国仙茅属植物的遗传多样性十分丰富,且种间的遗传差异大于种内的遗传差异。