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蒙古羊、兰州大尾羊和哈萨克羊随机扩增多态DNA分析 被引量:4
1
作者 雷雪芹 陈宏 +4 位作者 刘波 宋述荣 陈玉林 雷初朝 孙维斌 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2003年第4期59-62,共4页
从 2 4个随机引物中筛选出 5个引物 ,对蒙古羊、兰州大尾羊和哈萨克羊 3个绵羊品种共计 89个个体进行了随机扩增多态 DNA分析 ,根据扩增片段计算了蒙古羊、兰州大尾羊和哈萨克羊扩增 DNA指纹条带的平均带纹数分别为 5 .32 ,5 .2 8和 5 .... 从 2 4个随机引物中筛选出 5个引物 ,对蒙古羊、兰州大尾羊和哈萨克羊 3个绵羊品种共计 89个个体进行了随机扩增多态 DNA分析 ,根据扩增片段计算了蒙古羊、兰州大尾羊和哈萨克羊扩增 DNA指纹条带的平均带纹数分别为 5 .32 ,5 .2 8和 5 .78;平均带纹相似率分别为 0 .5 9,0 .6 0和 0 .6 2 ;平均杂合度分别为 0 .75 ,0 .78和 0 .77。用 Nei氏片段共享度公式计算了 3个群体的遗传距离 ,构建了其关系图 ,聚类分析结果表明 ,蒙古羊与兰州大尾羊的遗传距离最小 (0 .0 34) ,彼此亲缘关系较近。相对而言 ,兰州大尾羊与哈萨克羊的遗传距离最大(0 .10 4 ) ,彼此亲缘关系较远。 展开更多
关键词 蒙古羊 兰州大尾羊 哈萨克羊 随机扩增 多态dna分析 遗传距离
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念珠菌DNA的提取及DNA酶切多态性分析的研究进展 被引量:1
2
作者 石晓红 宫奇林 《山东生物医学工程》 2003年第1期60-61,45,共3页
念珠菌是院内感染的重要菌之一。
关键词 念珠菌dna 提取 dna酶切多态分析 基因分型 限制性内切酶分析 医院真菌感染 RFLP
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铜绿假单胞菌随机扩增DNA多态性基因分型研究 被引量:1
3
作者 刘金禄 王蕾 李采青 《河北大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2006年第1期104-107,共4页
利用微量液体稀释法进行药敏检测和RAPD技术进行基因分型,调查了铜绿假单胞菌在临床各科中的流行情况,以期建立稳定的临床检测系统,在控制院内感染的流行病研究中发挥更大的作用.结果表明耐药谱分6型,Ⅰ型占44.5%,Ⅱ型占18.5%,Ⅲ型占7.... 利用微量液体稀释法进行药敏检测和RAPD技术进行基因分型,调查了铜绿假单胞菌在临床各科中的流行情况,以期建立稳定的临床检测系统,在控制院内感染的流行病研究中发挥更大的作用.结果表明耐药谱分6型,Ⅰ型占44.5%,Ⅱ型占18.5%,Ⅲ型占7.4%,Ⅳ型占7.4%,Ⅴ型占11.1%,Ⅵ型(不定型)占11.1%;RAPD分9型,A型占51.9%,B型占7.4%,C型占7.4%,D型占7.4%,E型占7.4%,F型占3.7%,G型占3.7%,H型占7.4%,I型占3.7%.说明基因型A型、耐药谱Ⅰ型的铜绿假单胞菌是此次ICU医院感染暴发流行的菌株,其他型别为非流行相关菌株.比较结果还说明RAPD基因分型的灵敏性、特异性及可靠性优于耐药谱分型,在医院感染流行病学调查中具有较大的应用价值. 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 随机扩增dna多态分析 基因分型 抗生素耐药谱
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铜绿假单胞菌随机扩增DNA多态性基因分型研究 被引量:1
4
作者 刘金禄 王蕾 李采青 《河北北方学院学报(医学版)》 2005年第3期1-3,共3页
目的:调查铜绿假单胞菌在临床各科中的流行情况,以期建立稳定的临床检测系统,在控制院内感染的流行病研究中发挥更大的作用。方法:用微量液体稀释法进行药敏检测,用RAPD技术进行基因分型。结果:耐药谱分6型,Ⅰ型占44·5%,Ⅱ型占18&#... 目的:调查铜绿假单胞菌在临床各科中的流行情况,以期建立稳定的临床检测系统,在控制院内感染的流行病研究中发挥更大的作用。方法:用微量液体稀释法进行药敏检测,用RAPD技术进行基因分型。结果:耐药谱分6型,Ⅰ型占44·5%,Ⅱ型占18·5%,Ⅲ型占7·4%,Ⅳ型占7·4%,Ⅴ型占11·1%,Ⅵ型(不定型)占1·1%;RAPD分9型,A型占51·9%,B型占7·4%,C型占7·4%,D型占7·4%,E型占7·4%,F型占3·7%,G型占3·7%,H型占7·4%,I型占3·7%。结论:基因型A型、耐药谱Ⅰ型的铜绿假单胞菌是此次ICU医院感染暴发流行的菌株,其它型别为非流行相关菌株。RAPD基因分型的灵敏性、特异性及可靠性优于耐药谱分型,在医院感染流行病学调查中具有较大的应用价值。铜绿假单胞菌对哌拉西林、头孢唑啉、头孢呋肟耐药率高;对喹诺酮类抗生素较敏感;对氨基糖甙类抗生素有一定的耐药性;亚胺培南的耐药率最低。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 随机扩增dna多态分析 基因分型 分子流行病学 医院感染 抗生素耐药谱
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细菌随机扩增DNA多态性反应体系优化
5
作者 王蕾 刘金禄 李采青 《河北北方学院学报(医学版)》 2005年第4期1-3,共3页
目的:对RAPD的反应体系进行优化,以期建立稳定的临床检测系统,在控制院内感染的流行病研究中发挥更大的作用。方法:用RAPD技术进行基因分型。结果:引物浓度:浓度为0·5μmol/L时扩增最好。DNA模板:浓度在0·50ng/μl、2ng/μl... 目的:对RAPD的反应体系进行优化,以期建立稳定的临床检测系统,在控制院内感染的流行病研究中发挥更大的作用。方法:用RAPD技术进行基因分型。结果:引物浓度:浓度为0·5μmol/L时扩增最好。DNA模板:浓度在0·50ng/μl、2ng/μl均得到了良好的扩增效果。镁离子浓度:在2·0mmol/L、4mmol/L时扩增效果较好。退火温度:在30℃时扩增条带最清晰。循环参数:在35、45个循环时扩增效果均好。结论:本试验对RAPD反应条件进行优化,建立了较稳定的临床检测体系。 展开更多
关键词 随机扩增dna多态分析 反应体系优化 细菌
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10种棕榈科植物的RAPD分析 被引量:11
6
作者 谭忠奇 冷艳 +2 位作者 周涵韬 廖启炓 林鹏 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期805-809,共5页
用RAPD法对厦门植物园引种栽培的4属10种棕榈科植物样本进行了基因组DNA多态性分析.从29个随机引物中筛选出9个有效引物共获得RAPD谱带558条,多态性谱带占71.32%.利用UPGMA法对10种棕榈科植物聚类分析,得其DNA的分子分类系统图.结果表明... 用RAPD法对厦门植物园引种栽培的4属10种棕榈科植物样本进行了基因组DNA多态性分析.从29个随机引物中筛选出9个有效引物共获得RAPD谱带558条,多态性谱带占71.32%.利用UPGMA法对10种棕榈科植物聚类分析,得其DNA的分子分类系统图.结果表明,棕榈属、琼棕属和鱼尾葵属聚类成一组,蒲葵属另成一组;棕榈属、琼棕属和蒲葵属中6种掌状叶型植物的平均遗传距离为0.47,羽状叶型的4种鱼尾葵属植物间的平均遗传距离为0.55;而羽状叶植物与掌状叶植物间的遗传距离达0.72.在同一属内,棕榈属内两种距离最近,蒲葵属两种最远.尽管分子分类结果与形态分类结果存在一定差异,但RAPD分子标记技术对棕榈等引种植物的分类鉴定和遗传多样性评价是有效可行的. 展开更多
关键词 棕榈科植物 RAPD分析 遗传距离 分子分类 基因组dna多态分析 短穗鱼尾葵 肯氏鱼尾葵 单穗鱼尾葵 董棕 蒲葵 圆叶蒲葵 龙棕 琼棕
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中国香菇自然种质遗传多样性的RAPD分析 被引量:24
7
作者 孙勇 林芳灿 《菌物系统》 CSCD 北大核心 2003年第3期387-393,共7页
用RAPD技术分析了收集自中国14个省份、分属于8个不同植物区系的53个野生香菇菌株的DNA多态性。用10个随机引物共扩增出147条DNA带,其中94%具有多态性。供试菌株在RAPD带型及DNA相似性上的差异表明,中国香菇自然群体具有丰富的遗传多样... 用RAPD技术分析了收集自中国14个省份、分属于8个不同植物区系的53个野生香菇菌株的DNA多态性。用10个随机引物共扩增出147条DNA带,其中94%具有多态性。供试菌株在RAPD带型及DNA相似性上的差异表明,中国香菇自然群体具有丰富的遗传多样性。其中,横断山脉、云南高原、台湾及华南地区菌株的多样性尤为丰富。用平均连锁聚类法构建了样本的遗传相关聚类图。大多数来自同一区域或相邻区域的菌株优先聚成小类,表明菌株的分组与其地理来源明显相关。以0.66的相似性为切割点,53个菌株可分成4大类群。类群Ⅰ和类群Ⅱ主要由横断山脉、云南高原和华中地区菌株组成,类群Ⅲ包含其他地区的菌株。类群Ⅳ则是由来自华北和四川省的共5个菌株组成的一个小的分支。 展开更多
关键词 dna多态 聚类分析 植物区系 种质资源
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5种笛鲷mtDNA及Cytb基因片段的RFLP比较 被引量:14
8
作者 王中铎 刘楚吾 郭昱嵩 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期327-332,共6页
采用线粒体DNA限制性片段长度多态性分析(mtDNARFLP)和线粒体DNA的细胞色素b基因(Cytb)的部分序列扩增限制性片段长度多态性分析(mtDNAPCRRFLP)两种方法,对笛鲷属5种鱼类进行种间系统发育的比较研究,结果显示:(1)画眉笛鲷依照其形态学... 采用线粒体DNA限制性片段长度多态性分析(mtDNARFLP)和线粒体DNA的细胞色素b基因(Cytb)的部分序列扩增限制性片段长度多态性分析(mtDNAPCRRFLP)两种方法,对笛鲷属5种鱼类进行种间系统发育的比较研究,结果显示:(1)画眉笛鲷依照其形态学上体侧条带颜色差异,可分为褐带画眉笛鲷和黄带画眉笛鲷两个种;(2)千年笛鲷和星点笛鲷、褐带画眉笛鲷和黄带画眉笛鲷、金带笛鲷和金焰笛鲷之间遗传距离相对较近;(3)两种分析方法都可以为种的区分提供方便有效的分子标记;(4)两种分析方法在构建发育系统树上不完全一致。本文从mtDNA角度深入研究了南海海域笛鲷的系统发生,表明了mtDNA作为一种广泛应用的分子标记的实用性,同时也有一些潜在问题需要进一步研究。 展开更多
关键词 笛鲷属 线粒体dna限制性片段长度多态分析 PCR-RFLP 系统发生 细胞色素B 假基因
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国内外法医DNA检验试剂发展现状
9
作者 叶健 姜成涛 +1 位作者 赵兴春 季安全 《刑事技术》 2009年第B12期23-27,共5页
DNA多态性分析技术是当前法医生物物证鉴定中最主要的技术手段,其承载的物质基础是法医DNA检验试剂。本文对国内外法医DNA检验试剂的研究现状与研究的进展情况进行综述报道。
关键词 dna多态分析 法医dna检验试剂 STR复合扩增 研究现状与进展
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烧伤患者耐甲氧西林金黄色葡萄球RAPD分析
10
作者 石书凡 杨长顺 《医学信息(医学与计算机应用)》 2014年第24期59-60,共2页
目的:调查烧伤患者耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的耐药性及分子流行病学情况,为控制感染提供科学依据。方法烧伤患者分离的金黄色葡萄球菌用PCR法扩增其mecA基因确定MRSA菌株,K-B纸片法检测MRSA的耐药性,随机引物扩增多态性DNA(RAPD... 目的:调查烧伤患者耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的耐药性及分子流行病学情况,为控制感染提供科学依据。方法烧伤患者分离的金黄色葡萄球菌用PCR法扩增其mecA基因确定MRSA菌株,K-B纸片法检测MRSA的耐药性,随机引物扩增多态性DNA(RAPD)进行同源性分析。结果 MRSA的分离率为41.1%,对多种抗生素均耐药,没有发现耐万古霉素和替考拉宁的菌株。23株MRSA经RAPD分型,均获得稳定的条带,可分为四型,以Ⅱ型为主,共检出13株。结论烧伤患者分离MRSA菌株具有多重耐药性,应根据药敏试验结果合理选用抗生素进行治疗;采用RAPD对MRSA的同源性进行研究,为控制感染提供分子流行病学依据。 展开更多
关键词 烧伤患者 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 耐药性 随机扩增dna多态分析
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ET-1基因突变位点的组合分析与原发性高血压病的关系 被引量:5
11
作者 邱逸敏 张勇 +3 位作者 黄林 晏辉芳 王镇 周代锋 《海南医学院学报》 CAS 2014年第9期1161-1163,共3页
目的:了解内皮素-1(ET-1)基因138A/-、K198N、G8002A3个突变位点多态性组合与海南汉族原发性高血压(EH)的关系。方法:应用等位基因特异性PCR技术,对201例海南汉族EH患者及311例海南汉族正常对照组ET-1基因多态性位点进行检测,利用统计... 目的:了解内皮素-1(ET-1)基因138A/-、K198N、G8002A3个突变位点多态性组合与海南汉族原发性高血压(EH)的关系。方法:应用等位基因特异性PCR技术,对201例海南汉族EH患者及311例海南汉族正常对照组ET-1基因多态性位点进行检测,利用统计学方法分析3个位点多态性组合与EH的关系。结果:138A/-、K198N、G8002A多态位点分别可检测出4A/4A、4A/3A、3A/3A3种基因型,GG、GT、TT 3种基因型和GG、GA、AA 3种基因型。多态位点组合分析发现有两组基因型4A3AGG-GG、3A3A-GG-GG在病例组中出现的频率远大于对照组;两组基因型4A4A-GT-GG、4A3A-GTGG在对照组中出现的频率大于病例组,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论:4A3A-GG-GG和3A3A-GG-GG这两组基因型串联可能会增加高血压的发病几率,4A4A-GT-GG和4A3A-GT-GG这两组基因型串联可能会降低高血压的发病几率。 展开更多
关键词 内皮素-1基因 dna多态性位点组合分析 高血压 汉族
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Random amplified polymorphic DNA analysis of eel genome 被引量:3
12
作者 QIU JIA JING YI PING LI(Shanghai Institute of Cell Biology Chincsc Acadcmy of Sci-ences) 320 Yue Yang Road, Shanghal 200031, China) 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 1999年第3期217-223,共7页
Eel family is a huge one, in which many kinds of eelsespecially some migratory eels, bear strong resemblance toeach other, and are therefOre difficult to be identified. Inthis study 29 random primers were used to make... Eel family is a huge one, in which many kinds of eelsespecially some migratory eels, bear strong resemblance toeach other, and are therefOre difficult to be identified. Inthis study 29 random primers were used to make RAPDana1ysis for Japanese ee1 (Angui11ajaponica). European eel(Anguilla anguilla) and Pike eel (AIllrae1lesox cinereus).And totally 299 fragments were counted. Shared or spe-cific fragments were counted alld ge11etic similarity or ge-netic distance were calculated. The genetic similarity be-tween Japanese eel alld Pike eel is 0.68 and the geneticdistance between them is 0.32; those between Europeaneel and Pike eel are 0.72 and 0.28 respectively, and be-tween Japanese eel and Ellropean eel are 0.74 and 0.25 re-spectively. The method has been shown to be suitable tomolecular identification of eels. It provides an a1ternativeapproach to determine the relatiollship between species. 展开更多
关键词 EEL RAPD pojymrphic fragments genetic distance
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Assessment of Genetic Diversity and Relationships among Maize (Zea mays L,) Varieties in Iraq Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers
13
作者 Nidhal Abdul Hussein A1-Badeiry Thamer Khadhair Merza Ali Hmood A1-Saadi 《Journal of Life Sciences》 2013年第12期1260-1271,共12页
RAPD (random amplified polymorphic DNA) markers were performed to fingerprint 20 varieties of maize. Twenty operon primers generated informative RAPD patterns and selected for further RAPD analysis. These 20 primers... RAPD (random amplified polymorphic DNA) markers were performed to fingerprint 20 varieties of maize. Twenty operon primers generated informative RAPD patterns and selected for further RAPD analysis. These 20 primers yielded 291 of main bands, out of which 169 were polymorphic bands across tested varieties. Each selected primer produced between 59 bands (OPC-01) to 142 bands (OPX-04). Amplification products (DNA amplicons) and fragments size ranged from 260 bp (OPT-06) to 2,365 bp (OPP-05). The largest number of polymorphic bands (20 bands) was produced by primer OPX-04 while, the lowest number of polymorphic bands (1 band) was produced by primer OPA-03. The primers of the most interest of this purpose were those that produced more variety specific DNA profiles, such as OPD-03, OPE-18, OPF-05, OPL-11 and OPX-04. The primer efficiency ranged from 0.20 in primer OPA-12 to 0.01 in primer OPA-03. The highest polymorphism and value of discrimination in this study were obtained with primers OPX-04, while, the lowest polymorphism and value of discrimination were obtained with primers OPA-03. The lowest genetic distance was 0.1941 between varieties Manlcet and Biotech Bag, while, the highest genetic distance was 0.6433 between varieties Pio 3751 and Buhooth 106. Cluster analysis (phylogenetic tree) by UPGMA (unweighted pair-group method of arithmetic means) based dendrogram revealed that they were four main genetic groups. The overall analysis of the results reveals that the genetic relationships among the maize varieties were related to some of their morphological characters as well as to their geographical origins at the molecular genetics. 展开更多
关键词 Genetic diversity Zea mays RAPD markers genetic distance.
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Use of random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis to detect jujube witches' broom phytoplasmas
14
作者 FAN Xin-ping TIAN Jian-bao Bertaccini Assunta 《Journal of Agricultural Science and Technology》 2009年第4期1-4,16,共5页
Jujube witches' broom is a devastating disease of Ziziphusjujube that occurs in various jujube regions of China. Nucleic acid extracted from midribs of samples collected from three jujube varieties ("Suanzao", "L... Jujube witches' broom is a devastating disease of Ziziphusjujube that occurs in various jujube regions of China. Nucleic acid extracted from midribs of samples collected from three jujube varieties ("Suanzao", "Lajiaozao" and "Langzao") from symptomatic and asymptomatic shoots were tested by random amplified polymorphic DNA analyses. Using 13 different 10 and 11-bp random primers the amplification of jujube DNA was achieved from all the samples; AMI4 primer provided amplification of specific DNA fragments of about 400 bp, only from samples collected from symptomatic plants. No genetic variations in these varieties were identified using the other 11 arbitrary primers; only with primer AL07 it was possible to differentiate "Langzao" from the other two varieties tested. All the experiments were repeated 2 times and the results were consistent. Compared with PCR analyses with phytoplasma-specific primers, RAPD techniques resulted to be an alternative rapid and sensitive method for detecting jujube phytoplasmas presence in different jujube varieties. 展开更多
关键词 jujube witches' broom PHYTOPLASMAS Random Amplified Polymorphic dna DETECTION
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波氏假阿利什菌和尖端赛多孢子菌随机扩增DNA多态性分析
15
作者 曾敬思 福岛和贵 +2 位作者 郑岳臣 滝泽香代子 西村和子 《中华皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第8期485-487,共3页
目的了解波氏假阿利什菌和尖端赛多孢子菌的基因学特征,研究DNA分型与菌种来源的关系。方法采用随机扩增多态性DNA分析(RAPD)方法。结果3种引物可将来自5个国家的13株波氏假阿利什菌和18株尖端赛多孢子菌分为31个基因型。多引物聚类分... 目的了解波氏假阿利什菌和尖端赛多孢子菌的基因学特征,研究DNA分型与菌种来源的关系。方法采用随机扩增多态性DNA分析(RAPD)方法。结果3种引物可将来自5个国家的13株波氏假阿利什菌和18株尖端赛多孢子菌分为31个基因型。多引物聚类分析所得树状图显示,除来自哥伦比亚土壤的3株波氏假阿利什菌外,其他受试菌株无地域性群集分布特点。但受试菌株中的多数波氏假阿利什菌和尖端赛多孢子菌株分别聚集成一群。结论波氏假阿利什菌和尖端赛多孢子菌存在较大株间差异,致病菌没有明显的地域性分布趋势,RAPD分型聚类分析结果与形态学分类之间具有一定一致性。 展开更多
关键词 假霉样真菌属 丝孢菌属 随机扩增多态dna技术 尖端赛多孢子菌 随机扩增dna多态分析 随机扩增多态 RAPD分型 聚类分析 分布趋势 基因学特征
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PCR-RAPD分子生物学技术及其在植物抗病性研究中的应用 被引量:4
16
作者 李淼 檀根甲 +5 位作者 赵彦 周冬生 章焰生 江佳富 吴新安 承河元 《生物技术通讯》 CAS 2003年第2期152-155,共4页
PCR-RAPD技术是一种高效的基因组DNA多态性分析技术,能够在对生物细胞或组织中DNA遗传多样性、亲缘关系及系统进化分子标记检测的同时进行基因定位与遗传作图。本文综述了PCR-RAPD技术的基本原理和应用范围,以及近年来在植物抗感病品种... PCR-RAPD技术是一种高效的基因组DNA多态性分析技术,能够在对生物细胞或组织中DNA遗传多样性、亲缘关系及系统进化分子标记检测的同时进行基因定位与遗传作图。本文综述了PCR-RAPD技术的基本原理和应用范围,以及近年来在植物抗感病品种(品系)间亲缘远近关系分析、植物抗病性遗传基因的DNA分子标记与检测、植物抗病基因的标记和定位、植物抗病基因的分离与克隆、植物抗病育种的分子标记辅助选择与检测等植物抗病性分子机制研究方面的应用,并对该技术所存在的问题及应用前景进行了探讨。 展开更多
关键词 PCR—RAPD技术 植物抗病性研究 基因组dna多态分析技术 基本原理 应用
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RAPD用于结核暴发流行点传染源鉴别及其意义 被引量:1
17
作者 匡铁吉 董梅 +5 位作者 张青霞 雷红 张翠英 薛建莉 孟祥红 宋萍 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第7期636-636,共1页
关键词 随机扩增dna多态分析 生物学鉴定方法 传染源 结核暴发流行点 结核病
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酵母菌的5种鉴定方法 被引量:36
18
作者 周春艳 张秀玲 王冠蕾 《中国酿造》 CAS 北大核心 2006年第8期51-54,共4页
介绍了5种酵母菌的鉴定方法,API 20C AUX系统、傅里叶变换红外吸收光谱(FT-IR)显微分光仪、Biolog微生物鉴定系统、5.8S-ITS扩增片段的RFLP分析和微卫星DNA多态性分析。与传统方法相比具有简便、快速、适合实验室及工业化生产过程中酵... 介绍了5种酵母菌的鉴定方法,API 20C AUX系统、傅里叶变换红外吸收光谱(FT-IR)显微分光仪、Biolog微生物鉴定系统、5.8S-ITS扩增片段的RFLP分析和微卫星DNA多态性分析。与传统方法相比具有简便、快速、适合实验室及工业化生产过程中酵母菌的鉴定。 展开更多
关键词 API 20C AUX系统 傅里叶变换红外吸收光谱(FT-IR)显微分光仪 Biolog微生物鉴定系统 5.8S-ITS扩增片段的RFLP分析 微卫星dna多态分析
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家蚕来源肠球菌RAPD反应体系的优化
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作者 宋连花 王彦文 +1 位作者 牟志美 黄艳红 《河北林果研究》 2006年第1期78-80,82,共4页
通过调整Mg2+、DNA模板、引物、T aqDNA聚合酶和dNTPs的浓度及PCR反应循环次数,建立并优化了家蚕来源肠球菌的RAPD-PCR反应体系及条件。结果表明,在25μl反应体系下,当Mg2+的浓度为3.5 mmol/L、DNA模板加入量为50 ng、引物浓度为15 pmo... 通过调整Mg2+、DNA模板、引物、T aqDNA聚合酶和dNTPs的浓度及PCR反应循环次数,建立并优化了家蚕来源肠球菌的RAPD-PCR反应体系及条件。结果表明,在25μl反应体系下,当Mg2+的浓度为3.5 mmol/L、DNA模板加入量为50 ng、引物浓度为15 pmol/L、T aqDNA聚合酶加入量为3U、PCR反应循环次数为45时,扩增结果最好。在本实验室,为家蚕来源肠球菌的遗传多样性研究建立了一种最佳RAPD分析模型。 展开更多
关键词 家蚕 肠球菌 随机扩增dna多态分析 条件优化
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铜绿假单胞菌临床分离株gyrA基因突变与喹诺酮类药物耐药关系研究
20
作者 赵廷坤 凌保东 +2 位作者 周岐新 刘刚 雷军 《中国药房》 CAS CSCD 北大核心 2006年第20期1531-1533,共3页
目的:研究铜绿假单胞菌临床分离株gyrA基因突变与喹诺酮类药物耐药关系,并对聚合酶联反应(PCR)-限制性片段长度多态性(RFLP)-DNA单链构象多态性(SSCP)分析铜绿假单胞菌临床分离株gyrA基因突变的可行性进行评估。方法:以铜绿假单胞菌临... 目的:研究铜绿假单胞菌临床分离株gyrA基因突变与喹诺酮类药物耐药关系,并对聚合酶联反应(PCR)-限制性片段长度多态性(RFLP)-DNA单链构象多态性(SSCP)分析铜绿假单胞菌临床分离株gyrA基因突变的可行性进行评估。方法:以铜绿假单胞菌临床分离株gyrA基因序列为靶序列,用PCR、PCR-RFLP、PCR-SSCP、DNA测序等方法对铜绿假单胞菌ATCC27853及16株临床分离株gyrA基因突变进行对比研究。结果:在8株耐环丙沙星铜绿假单胞菌中,有6株gyrA基因的83位表现出单点突变,其突变方式全为ACC→ATC,导致氨基酸苏氨酸→异亮氨酸的改变;gyrA基因的PCR扩增产物SacⅡ酶切片段与测序结果一致;SSCP分析结果显示,16株细菌中仅2株gyrA带型与ATCC27853相同,其它菌株gyrA带型与ATCC27853均不同。结论:临床分离的铜绿假单胞菌对喹诺酮类药物耐药的分子机制主要表现为gyrA基因83位氨基酸密码子突变,应用PCR-RFLP-SSCP系统可快速、准确地检测耐喹诺酮类药物的铜绿假单胞菌gyrA中碱基的变异。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 GYRA基因 限制性片段多态分析 dna单链构象多态分析
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