应用非求导约束最大似然法DFREML分析杂种优势

鸡4×4的完全双列杂交,在8和14周龄进行了屠宰试验。根据杂种优势率估计,胸肌、腿肌、翅重、腹脂和全净膛重5个性状,在8周龄有7个杂交组合出现了杂种优势;在14周龄有11个杂交组合出现了杂种优势。用非求导约束最大似然法分析鸡屠宰试验得到的数据。分析的5个性状,艾维茵纯系的一般配合力明显高于其它3个品种,而在特殊配合力方面,有艾维茵纯系参加的交配组合特殊配合力皆不高。杂种优势的表达受众多因素的影响,剔除环境因素,不同生长阶段间特殊配合力存在明显差异,说明上位效应是杂种优势形成的重要原因之一。

基于约束最大似然法对虹鳟生长性状遗传参数的估计

文章以黑龙江水产研究所渤海冷水性鱼类试验站5个品系虹鳟为材料,建立300家系,养殖到2龄时,对约5000尾鱼的生长数据,采用单性状约束最大似然法(Restricted Maximum Likelihood Method,REML)对其生长性状进行遗传参数的估计。结果表明,体重的遗传力为范围为0.20～0.45、体长的遗传力范围为0.17～0.43、肥满度的遗传力范围为0.47～0.65。其中肥满度的遗传性能稍高于体重和全长的遗传性能。另外,从性状的表型相关来看,体重和体长之间存在较大的正相关。

MTDFREML法估计大白母猪繁殖性状的遗传参数

运用多性状非求导约束最大似然法(multiple traits derivative free restricted maximum likelihood,MTDFREML),对湖南正虹种猪场和益阳市农科所种猪场(益农种猪场)大白母猪1998-2004年的共7 736胎次的繁殖性状育种记录进行遗传参数估计.2个猪场繁殖母猪的总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)、初生窝重(LWB)和21日龄窝重(LW21)的遗传力分别为0.23,0.18,0.21,0.27,母体遗传效应占表型方差百分率为0.09～0.15,窝效应占表型方差百分率为0.08～0.38.繁殖性状间遗传相关为0.37～0.78,永久环境相关为0.80～0.93,表型相关为0.32～0.88.

阿拉善绒山羊繁殖性状加性效应和母体效应的方差分量估计

为了运用ASreml软件结合约束最大似然法(REML)估计阿拉善绒山羊初生重、出生窝重、断乳重、断乳窝重、产羔数和妊娠期的遗传参数,本研究收集了阿拉善绒山羊种羊场2017-2022年繁殖性状记录6517条,拟合了8种不同的单性状动物模型,通过LRT检验挑选出最佳模型,使用单性状模型对繁殖性状进行方差组分和遗传力估计,利用双性状模型分析繁殖性状之间的表型相关和遗传相关。结果显示:阿拉善白绒山羊初生重、出生窝重、断乳重、断乳窝重、产羔数和妊娠期的遗传力估计值分别为0.15±0.04、0.16±0.02、0.20±0.06、0.12±0.03、0.14±0.03和0.32±0.05。遗传相关系数的范围为-0.49~0.73,其中产羔数与出生窝重的遗传相关系数最高为0.73,与初生重遗传相关系数最低为-0.49。表型相关的范围为-0.50~0.65,其中断乳窝重与出生窝重的表型相关系数最高0.65,产羔数和初生重的表型相关系数最小-0.50。研究发现,阿拉善绒山羊繁殖性状属于低遗传力性状且不仅受群别、胎次等非遗传因素的影响,而且所有的性状均受到母体效应的影响;产羔数与其他繁殖性状之间具有较高的相关性表明基于产羔数的选择是有效的,可以提高母羊的整体繁殖性能,因此在实际生产过程中可通过提高饲养管理及营养水平来改善阿拉善绒山羊的繁殖性能。

应用DF-REML法估计牙鲆性状遗传参数

应用单性状无重复模型,利用非求导约束最大似然法(DF-REML),对牙鲆在185、235、345、465日龄下的体长、体高、体重、肥满度等性状遗传参数进行估计。结果表明,以上指标各日龄下遗传力范围分别是0.23～0.3、0.2～0.29、0.22～0.32、0.19～0.26;性状表型方差中遗传方差所占比重较小,环境方差较大,性状表型值受环境影响较大;各日龄下的体长、体高、体重间表型相关极显著(P≤0.01),体长、体高与肥满度间呈极显著的负相关(P≤0.01),体重与肥满度表现为显著正相关(P≤0.05);遗传相关性表现趋势与表型相关性一致。

影响科尔沁细毛羊主要数量性状的非遗传因素分析

为了研究非遗传因素对科尔沁细毛羊主要数量性状的影响,试验采用最大似然法(MTDFREML)调查分析了影响科尔沁细毛羊的场别、母羊年龄、性别、出生年份等因素。结果表明:性别、出生年份对所有性状有极显著影响(P<0.01);母羊年龄对初生重、断奶重有极显著影响(P<0.01),对断奶毛长度、断奶毛细度的影响显著(P<0.05);群别对断奶毛长度、断奶毛细度、成年毛细度的影响不显著(P>0.05),对其余性状有极显著影响(P<0.01);出生年份、鉴定年份与其他因素的二级互作效应均对产毛性状有极显著影响(P<0.01),母羊年龄与群别、性别的互作效应分别对断奶毛长度、断奶毛细度影响不显著(P>0.05);年龄与群别的互作效应对成年毛细度的影响不显著(P>0.05)。

用MTDFREML法对奶牛泌乳曲线模型参数的遗传分析

用Wood模型对507头中国荷斯坦奶牛的第一胎日产奶量进行泌乳曲线拟合,用多性状非求导约束最大似然(MTDFREML)法对模型参数进行了遗传分析,使用SAS软件包对固定效应进行不同水平间差异显著性检验.结果表明:1)参数a,b,c的遗传力h^2分别为0.110 4,0.142 3,0.181 3,永久环境效应方差占表型方差比率c^2分别为0.075 2,0.065 0,0.053 3.2)参数a与b间的遗传相关为-0.251 3;a与c间的遗传相关为0.721 4;b与c间的遗传相关为0.406 1.3)参数a与b的永久环境相关系数为-0.329 7,呈负相关;a与c间的为0.700 1,呈强正相关;b与c间的为0.442 9,呈弱正相关.

大白猪高繁母本新品系主要繁殖性状的遗传参数估测

应用多性状非求导约束最大似然法(MTDFREML)对大白猪高繁母本新品系繁殖性状的遗传参数进行了估计。结果表明,总产仔数(TNB)、活产仔数(ANB)、初生窝重(LWB)和21日龄窝重(LW21)的遗传力估计值分别为0.10、0.15、0.09和0.14。各性状间(TNB/ANB、TNB/LWB、TNB/LW21、ANB/LWB、ANB/LW21、LWB/LW21)的遗传相关分别为0.87、0.74、0.43、0.69、0.59和0.51。

三河牛母牛产奶量及生长性状遗传参数的估测

本试验采用1984、1987、1992、1997、1998年内蒙古谢尔塔拉种牛场881头三河牛母牛的测定记录,配合动物模型BLUP方法用MTDFREML软件估计了三河牛产奶量、体尺、体重、外貌评分等7个性状的遗传力、遗传方差。得出三河牛305天产奶量、外貌评分、体高、体斜长、胸围、管围、体重的遗传力分别为0.80、0.04、0.84、0.93、0.77、0.24、0.64,并且得到了7个性状的平均值以及它们之间的遗传相关、表型相关及环境相关估计值。这些遗传参数的估计可为种畜的选择提供依据。

大白猪高繁母本新品系生长和繁殖性状的遗传趋势分析

配合混合模型,用多性状非求导约束最大似然法(Multiple traits derivative free restricted maximumlikelihood,MTDFREML)分析估计了大白猪高繁母本新品系生长和繁殖性状的表型与遗传趋势。结果表明,窝产仔数、窝产活仔数和达100 kg体重日龄性状的表型趋势分别为0.170、0.100和-2.072,遗传趋势分别为0.057 7、0.030 4和-0.658 0。说明大白猪品系选择试验的窝产仔数和达100 kg体重日龄2个主选性状的选择是明显有效的,繁殖性能在逐代提高,而且并未对肥育性能造成不利的影响。

中国西门塔尔牛肉用群体重要经济性状遗传参数估计

本研究旨在对出生于2008-2013年的中国西门塔尔牛肉用群体的重要经济性状进行遗传参数和方差组分估计,该群体大小为2 939头。采用非求导约束最大似然法估计遗传力、遗传相关和方差组分。结果显示,初生重、断奶重、出栏重、胴体重、屠宰率和净肉率的遗传力估计值分别为0.48、0.44、0.43、0.38、0.31、0.39。其中,初生重和断奶重的遗传相关估计结果为0.57,出栏重和胴体重的遗传相关为0.94,屠宰率和净肉率的遗传相关为0.89。该群体的生长和屠宰相关性状均属于中高遗传力性状,且性状之间具有较高的遗传相关。本研究对中国西门塔尔牛肉用群体重要经济性状的遗传参数做了系统评估分析,为将来制定育种方案和遗传评估奠定基础。

九孔鲍幼鲍生长性状的遗传参数估计

采用不平衡巢式设计方法和人工授精技术,1个父本配3个母本,建立九孔鲍(Haliotis diversicolor super-texta)12个半同胞家系和36个全同胞家系。在40日龄、120日龄、180日龄、240日龄时分别对所建36家系个体测量壳长,壳宽与体质量。采用单性状约束最大似然法(Restricted Maximum Likelihood Method,REML)估计九孔鲍(Haliotis diversicolor supertexta)各阶段体质量,壳宽与壳长性状的遗传参数。结果表明,九孔鲍幼鲍在40、120、180、240日龄时壳长遗传力估计值为(0.13±0.09)-(0.56±0.15),壳宽遗传力估计值为(0.13±0.06)-(0.62±0.13),体质量遗传力估计值为(0.18±0.15)-(0.26±0.08),均属于中等遗传力。另外,从性状的表型相关与遗传相关可以得出,九孔鲍稚鲍在不同日龄壳长、壳宽与体质量的表型相关和遗传相关均为正相关(P≤0.05)。表型相关系数为0.66-0.94,遗传相关系数为0.85-0.98,研究结果表明,以3个主要生长性状之一作为选育目标,均能达到遗传改良的目的。

山西白猪高产仔母系体重性状的遗传力估计

为了解山西白猪高产仔母系的遗传特性,利用WOMBAT软件,采用平均信息约束最大似然法（AIREML）,估计了山西白猪高产仔母系不同阶段体重性状的遗传力。结果表明,初生重遗传力较低,为0.090,断奶重、70日龄体重和180日龄体重的遗传力分别为0.147、0.302和0.157,属于中等遗传力。体重性状受母体效应的影响比较大,母体效应估计值在0.140-0.618之间,且生长早期受母体效应的影响比生长后期大。

北京荷斯坦牛体细胞数遗传参数估计及其与产量、体型性状的相关性分析

本文配合动物模型用多性状约束最大似然法(REML)分析估计了2000～2007年北京地区81385头荷斯坦母牛的体细胞数自然对数(LSCC)的遗传力,LSCC的遗传力为0.12;个体测定日的LSCC的遗传力为0.06到0.11。体细胞数与产奶量、乳脂量、乳蛋白量的遗传相关分别为0.06、0.14和0.09。头三个泌乳期LSCC间的遗传相关都比较高,特别是第二泌乳期与第三泌乳期间的遗传相关高达0.95,LSCC对第二泌乳期与第三泌乳期可以看作是同一个性状。LSCC预期传递力与体深等大部分体型性状的相关系数几乎为0,但与蹄角度、前乳房附着、后乳房深度有较强的负相关,相关系数分别为-0.17、-0.19、-0.20;与乳头长度呈正相关,相关系数为0.15。体细胞数存在真实的遗传变异,其遗传力高于普遍报道的乳房炎的遗传力估计值的平均值,通过对体细胞数的间接选择来提高乳房炎抗性的育种是可行的,结合部分体型性状的遗传评定也有助于通过遗传育种的方法降低乳房炎的发病率。

中国地鼠山医群体近交系E繁殖性状的遗传力估计

目的对中国地鼠山医群体近交系E的一些繁殖性状进行遗传力估计分析。方法采用平均信息约束最大似然法(AIREML),利用WOMBAT软件进行处理。结果产仔数、离乳数、胎间隔2-1和胎间隔3-2的遗传力均较低,分别为0.05、0.096、0.182和0.116。结论中国地鼠山医群体近交系E繁殖性状的遗传力均属于低遗传力。

应用动物模型DFREML方法对绒山羊遗传参数和遗传趋势的研究

应用动物模型非求导约束最大似然法(DFREML)对内蒙古白绒山羊群的遗传参数和遗传趋势进行估计。抓绒量、抓绒后体重、绒厚、毛长、绒细度、绒伸直长度、出生重、断乳重、日增重和周岁重遗传力的估计值分别为:0.30,0.11,0.21,0.31,0.28,0.21,0.21,0.11,0.14,0.17。绒伸直长度与抓绒量、绒厚、毛长,绒厚与抓绒量、绒细度,周岁重与出生重、断乳重、日增重,日增重与断乳重的遗传相关系数分别为:0.26,0.91,0.26,0.38,0.28,0.37,0.65,0.82,0.93。体重与抓绒量、绒厚、毛长、绒细度、绒伸直长度,抓绒量与毛长,绒细度与绒伸直长度的遗传相关系数分别为:-0.13,-0.22,-0.12,-0.11,-0.24,-0.23,-0.02。

长白猪繁殖性状的遗传参数估测

本研究资料取自杭州市种猪试验场长白猪 S 系选育群母猪第 1胎和 3胎以上共335 6胎的繁殖生产记录 ,采取动物模型非求导约束最大似然法 (MTDFREML )进行遗传参数估测 ,结果表明 :总产仔数、产活仔数、初生个体重、初生窝重、断奶头数、断奶个体重、断奶窝重、60日龄头数、60日龄个体重、60日龄窝重的遗传力估计值分别为 :0 .14、0 .12、0 .2 0、0 .16、0 .17、0 .10、0 .16、0 .13、0 .11、0 .13。初生个体重与 60日龄个体重、断奶个体重与 60日龄个体重。

不同动物模型对贵州黑山羊生长性状遗传参数的估计

为计算贵州黑山羊生长性状的遗传参数,试验建立了三种不同混合模型,运用平均信息-期望最大约束似然法(EM-AI REML)对贵州黑山羊初生重、3月龄体重、12月龄体重和24月龄体重的遗传力进行估计,最后使用赤池信息法则(AIC)对各模型进行验证。结果表明:不同的模型对遗传力的估计存在差异,当模型中只设加性效应为随机效应时,模型对贵州黑山羊12月龄体重和24月龄体重的遗传力估计最准确;当设加性效应和母体遗传效应为随机效应时,模型对初生重和3月龄体重的遗传力估计最准确。说明贵州黑山羊初生重、3月龄体重受母体遗传效应的影响较大,而12月龄体重和24月龄体重受母体遗传效应影响较小;贵州黑山羊的生长性状属于中等遗传力性状。

用随机回归模型对湖南荷斯坦奶牛日产奶量进行协方差函数估计

用随机回归模型对507头中国荷斯坦奶牛的第1胎日产奶量进行了分析,将时间配合勒让德多项式作为自变量,再用平均信息约束最大似然法(AIREML)进行估计。然后通过协方差函数对时间轴上的时间点间估计协方差值,再用Excel绘制三维图。结果表明:配合M6-5-10时,能对月间隔的测定日产奶量数据进行分析,并能反映出整个时间轴上的加性遗传效应和永久环境效应的变异,且能得到光滑的三维图形。降价配合涉及的参数比较少,同时能够很好地缓和协方差函数估计值间的差异。