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基于多数据域描述的转录因子结合位点识别
被引量:
1
1
作者
陈鸣
薛慧君
+1 位作者
熊赟
朱扬勇
《计算机应用与软件》
CSCD
2011年第6期1-4,42,共5页
转录因子结合位点的识别对于理解转录调控机制起着重要作用,也是后基因组时代面临的巨大挑战之一。提出一个基于多任务学习的转录因子位点的识别方法。首先建立一个基于多任务学习理论的多数据域描述模型,然后结合核方法设计转录因子结...
转录因子结合位点的识别对于理解转录调控机制起着重要作用,也是后基因组时代面临的巨大挑战之一。提出一个基于多任务学习的转录因子位点的识别方法。首先建立一个基于多任务学习理论的多数据域描述模型,然后结合核方法设计转录因子结合位点多分类识别算法。最后对取自于TRANSFAC数据库的真实数据进行交叉验证测试。实验结果表明该方法能充分地利用稀缺的训练样本,有效地捕获不同类别间的联系,从而获得了较高的预测准确率。
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关键词
多任务学习
转录因子结合位点
多数据域描述
核方法
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职称材料
题名
基于多数据域描述的转录因子结合位点识别
被引量:
1
1
作者
陈鸣
薛慧君
熊赟
朱扬勇
机构
复旦大学计算机科学技术学院
内蒙古电子信息职业技术学院计算机科学系
出处
《计算机应用与软件》
CSCD
2011年第6期1-4,42,共5页
基金
国家自然基金项目(60903075)
上海市重点学科项目(B114)
文摘
转录因子结合位点的识别对于理解转录调控机制起着重要作用,也是后基因组时代面临的巨大挑战之一。提出一个基于多任务学习的转录因子位点的识别方法。首先建立一个基于多任务学习理论的多数据域描述模型,然后结合核方法设计转录因子结合位点多分类识别算法。最后对取自于TRANSFAC数据库的真实数据进行交叉验证测试。实验结果表明该方法能充分地利用稀缺的训练样本,有效地捕获不同类别间的联系,从而获得了较高的预测准确率。
关键词
多任务学习
转录因子结合位点
多数据域描述
核方法
Keywords
Multi-task learning Transcription factor binding sites Multiple data domain description Kernel methods
分类号
TP311.13 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于多数据域描述的转录因子结合位点识别
陈鸣
薛慧君
熊赟
朱扬勇
《计算机应用与软件》
CSCD
2011
1
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