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古生物多样性统计方法及其适用性分析 被引量:5
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作者 陈清 樊隽轩 Melchin M J 《古生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期445-462,共18页
以化石产出记录为对象,以时间段为单位的编目式物种多样性统计分析是古生物多样性研究的主要内容。由于地层和化石记录本身的不完整性,以及不同地区和时段各门类化石系统古生物学、生物地层学等方面研究程度的差异,使得多样性统计结果... 以化石产出记录为对象,以时间段为单位的编目式物种多样性统计分析是古生物多样性研究的主要内容。由于地层和化石记录本身的不完整性,以及不同地区和时段各门类化石系统古生物学、生物地层学等方面研究程度的差异,使得多样性统计结果往往存在一定偏差,同时不合理的数学统计方法的选用也会对多样性演化形式产生进一步的误读。基于单一时间段内,不同化石延限类型对该时段物种多样性的贡献度的不同看法,存在多种不同的多样性统计方法。而针对时间段跨度、短延限分子比例和生物群多样性变化形式的不同情况,每一种统计方法各自具有一定的适用范围,合理的方法选择能够良好模拟真实情况;反之,不恰当的统计方法则会人为引进更多的偏差。提高原始数据精度、合理划分时间单元和采用不同统计方法对比研究,可以有效的减小偏差。 展开更多
关键词 古生物多样性 分类单元多样性 宏演化 多样性统计方法 统计偏差
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健康志愿者口腔样本的微生物宏基因组学研究 被引量:4
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作者 马姝祺 王一清 +2 位作者 邢亚菲 马惠珍 周秦 《口腔生物医学》 2018年第1期17-19,57,共4页
目的:通过宏基因组学方法研究健康志愿者口腔微生物群落,为慢性牙周炎治疗转归及预后提供生物学基础。方法:提取健康志愿者唾液样本及龈上、龈下菌斑样本的总DNA,构建基因文库,测序并分析结果(进行物种注释和相对丰度计算),获得样本微... 目的:通过宏基因组学方法研究健康志愿者口腔微生物群落,为慢性牙周炎治疗转归及预后提供生物学基础。方法:提取健康志愿者唾液样本及龈上、龈下菌斑样本的总DNA,构建基因文库,测序并分析结果(进行物种注释和相对丰度计算),获得样本微生物群落。结果:测序结果显示健康志愿者口腔唾液样本可获得15个微生物属,龈上菌斑样本中可获得19个微生物属,龈下菌斑样本中可获得20个微生物属,微生物群落存在多样性。健康志愿者龈上微生物样本组、龈下微生物样本组及唾液样本组间微生物门、属的平均相对丰度比差异有统计学意义(P<0.05)。结论:结合第二代高通量测序技术的宏基因组学方法能够较好地获得健康志愿者口腔样本中的微生物群落,并初步分析各样本组中的微生物群落结构。 展开更多
关键词 口腔宏基因组学 基因文库 多样性统计
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针对信号、噪音和叠前偏移的陆上3D施工设计 被引量:1
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作者 Norm Cooper 沈财余 《油气地球物理》 2007年第2期50-62,共13页
本文讨论的三维地震设计方法几乎不涉及面元尺寸和覆盖次数,因为这两个概念影响了三维地震设计过程中其他更重要概念的讨论。过分关注覆盖次数和面元阻碍了我们在地震工作中对成像和信噪比概念更广泛的思考。道密度和统计多样性是地震... 本文讨论的三维地震设计方法几乎不涉及面元尺寸和覆盖次数,因为这两个概念影响了三维地震设计过程中其他更重要概念的讨论。过分关注覆盖次数和面元阻碍了我们在地震工作中对成像和信噪比概念更广泛的思考。道密度和统计多样性是地震采集设计的重点,因为任何类型的理想设计在实际施工过程中都会有所变动,我们所关心的是在这种变动背景下的稳定性。施工环境和成本将影响激发点和接收点的布设,所以我们更注重设计类型和参数的选择。 展开更多
关键词 三维地震采集 观测类型 道密度 统计多样性 系统稳定性
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Multiformity of Optical Quantum Coherence Systems with Y and Inverted Y-type Schemes
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作者 刘晓东 孟冬冬 +2 位作者 张森林 陶万军 戚桢 《Communications in Theoretical Physics》 SCIE CAS CSCD 2010年第8期273-277,共5页
Y and inverted Y-type four-level schemes for optical quantum coherence systems,which may be intuitivelyconsidered to be very simple,have not been studied intensively till now.In this paper,we present the multiformity ... Y and inverted Y-type four-level schemes for optical quantum coherence systems,which may be intuitivelyconsidered to be very simple,have not been studied intensively till now.In this paper,we present the multiformity ofthese two types of schemes by considering that they can be classified into nine possible level styles as the second-ordersub-schemes using laser fields.Further we point out the complexity of their more than one hundred realistic configurationsas the third-order four-level sub-schemes that may appear in the optical quantum coherence experiments.Throughoutthis paper we review which configurations have been studied in some research aspects and which ones not,accordingto our knowledge,in order to be propitious to next steps of theoretical and experimental investigations,especially forapplications in the fields of quantum optics,quantum information science,laser spectroscopy,and so on. 展开更多
关键词 quantum coherence level configuration four-level scheme quantum optics quantum informationscience
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蔗糖富集环境土壤微生物宏基因组分析及蔗糖水解相关酶基因克隆 被引量:4
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作者 杜丽琴 庞浩 +2 位作者 胡媛媛 韦宇拓 黄日波 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期403-407,共5页
蔗糖水解酶是蔗糖转化生成生物质能源的关键酶,且还具有重要的转糖苷功能.针对蔗糖富集的土壤环境,利用未培养的宏基因组技术对蔗糖水解相关的酶基因进行克隆.首先使用微生态分子技术对蔗糖富集的土壤样品进行分析,在可信区间为95%的情... 蔗糖水解酶是蔗糖转化生成生物质能源的关键酶,且还具有重要的转糖苷功能.针对蔗糖富集的土壤环境,利用未培养的宏基因组技术对蔗糖水解相关的酶基因进行克隆.首先使用微生态分子技术对蔗糖富集的土壤样品进行分析,在可信区间为95%的情况下,样品覆盖率为20%(C指数为0.2),Species richness指数为235.0,Shannon index为5.2889,说明这个蔗糖富集样品中的微生物来源具有广泛性.然后使用宏基因组技术构建这个土壤样品中微生物的DNA文库,成功构建一个包含约100000个克隆的大片段DNA Fosmid文库.对文库中的Fosmid质粒进行随机测序,发现质粒的外源DNA与已报道的DNA都没有同源性,文库所克隆的DNA都来源于仍没有被研究的微生物.使用蔗糖作为唯一碳源对文库进行筛选,获得了能水解蔗糖的克隆.在蔗糖水解能力最强的两个克隆中所包含的蔗糖水解酶与GenBank数据库中已知蔗糖酶的相似性分别为38%和68%. 展开更多
关键词 宏基因组 环境DNA DNA文库 细菌多样性统计技术 蔗糖水解酶
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