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混合线性非线性网络的多源miRNA-疾病关联预测方法
被引量:
1
1
作者
赵静
李浩琳
+1 位作者
王会青
王彬
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期439-449,共11页
现有miRNA-疾病关联研究大多采用miRNA功能和疾病语义相似性作为输入,未考虑miRNA序列和疾病功能等相似性信息,并且在特征提取过程中忽略了线性与非线性特征间的信息互补,影响特征质量。本文提出一种miRNA-疾病关联预测模型GCNMSF,它基...
现有miRNA-疾病关联研究大多采用miRNA功能和疾病语义相似性作为输入,未考虑miRNA序列和疾病功能等相似性信息,并且在特征提取过程中忽略了线性与非线性特征间的信息互补,影响特征质量。本文提出一种miRNA-疾病关联预测模型GCNMSF,它基于miRNA和疾病多源相似性信息,融合嵌入卷积注意块的图卷积网络学习的非线性特征和非负矩阵分解方法学习的线性特征,实现信息互补,以预测miRNA-疾病关联。实验结果表明,GCNMSF模型优于现有的miRNA-疾病关联预测方法,可以有效预测miRNA-疾病关联。
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关键词
多源相似性
图卷积网络
非负矩阵分解
注意力机制
拓扑结构信息
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职称材料
题名
混合线性非线性网络的多源miRNA-疾病关联预测方法
被引量:
1
1
作者
赵静
李浩琳
王会青
王彬
机构
太原理工大学信息与计算机学院
出处
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期439-449,共11页
基金
山西省自然科学基金青年基金项目(20210302124272)
国家自然科学基金面上项目(20210302123099)。
文摘
现有miRNA-疾病关联研究大多采用miRNA功能和疾病语义相似性作为输入,未考虑miRNA序列和疾病功能等相似性信息,并且在特征提取过程中忽略了线性与非线性特征间的信息互补,影响特征质量。本文提出一种miRNA-疾病关联预测模型GCNMSF,它基于miRNA和疾病多源相似性信息,融合嵌入卷积注意块的图卷积网络学习的非线性特征和非负矩阵分解方法学习的线性特征,实现信息互补,以预测miRNA-疾病关联。实验结果表明,GCNMSF模型优于现有的miRNA-疾病关联预测方法,可以有效预测miRNA-疾病关联。
关键词
多源相似性
图卷积网络
非负矩阵分解
注意力机制
拓扑结构信息
Keywords
multi-source similarity
graph convolutional network
non-negative matrix factorization
attention mechanism
topology information
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
混合线性非线性网络的多源miRNA-疾病关联预测方法
赵静
李浩琳
王会青
王彬
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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