移植肾缺血/再灌注损伤后PBRM1分子表达及作用分析

目的探讨PBRM1分子在移植肾缺血/再灌注损伤(ischemia reperfusion injury,IRI)中的表达及其作用机制。方法选取3组肾脏组织(每组5例),分为正常肾脏组(Control组)、移植术后肾功能稳定组(STA组)、移植肾缺血/再灌注损伤组(IRI组)。采用免疫组化技术检测多溴蛋白1(polybromo 1,PBRM1)在3组中的蛋白表达。结合基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)数据集分析PBRM1在肾脏IRI后的表达,探讨其机制,并通过体外实验验证Pbrm1分子在Th17细胞的表达。结果免疫组化染色结果显示,与Control组和STA组相比,IRI组的PBRM1表达程度显著高于其他两组。经GSE180420数据库分析显示,与Control相比,IRI组PBRM1分子表达水平显著升高,GSEA结果提示PBRM1可促进Th17细胞的功能。体外实验证实,与Th0细胞相比,Pbrm1基因的转录水平在Th17细胞中显著升高。结论移植肾IRI后PBRM1分子表达水平显著升高,PBRM1分子可能通过影响Th17细胞的功能,从而加重肾脏IRI。

CRISPR/Cas9系统靶向敲除多溴蛋白1基因对肝癌细胞功能的影响

目的探讨应用规律成簇的间隔短回文重复(CRISPR)/CRISPR相关蛋白9(Cas9)系统靶向敲除多溴蛋白1(PBRM1)基因对肝癌细胞功能的影响。方法应用CRISPR/Cas9系统靶向敲除Huh7细胞的PBRM1基因。采用Sanger测序和蛋白质印迹法(Western blot)检测基因敲除情况。基于转录本测序(RNA-seq)结果,对Huh7敲除(KO)细胞株与Huh7野生(WT)细胞系差异表达基因进行功能富集。采用流式细胞术分析细胞周期的改变。通过CCK-8法和克隆形成实验研究细胞增殖情况。采用不同浓度的γ-干扰素(IFN-γ)处理Huh7-KO细胞株和Huh7-WT细胞系,验证GO富集中IFN-γ应答通路的改变。结果成功构建PBRM1基因敲除的Huh7细胞株。Huh7-KO细胞株的生长曲线和克隆形成率均显著慢于Huh7-WT细胞系(P<0.0001)。Huh7-KO细胞株中下调基因主要与细胞周期相关,上调基因主要与免疫应答相关。Huh7-KO细胞株处于G1期的细胞比例明显高于Huh7-WT细胞系(P=0.0166),而处于S期的细胞比例明显低于Huh7-WT细胞系(P=0.0002)。浓度为1000 U/ml的IFN-γ对Huh7-KO细胞株组的细胞抑制作用明显高于Huh7-WT细胞系组(P=0.0091)。结论在Huh7肝癌细胞株中敲除PBRM1可以导致G 1/S阻滞从而抑制细胞增殖。高浓度IFN-γ可以更加有效地杀伤PBRM1缺失的肿瘤细胞。

抑癌基因PBRM1在肾细胞癌中的作用研究进展

肾癌作为一种常见的泌尿系统肿瘤,其发生、发展涉及一系列遗传学包括表观遗传学水平的改变,且病因复杂,有着高度的异质性。肾细胞癌是肾癌的最主要类型,而透明肾细胞癌(CCRCC)是肾细胞癌最常见的亚型。近期通过外显子测序发现,多溴蛋白1(PBRM1)基因(编码BAF180蛋白)在CCRCC中的突变率可高达40%。BAF180蛋白是SWI/SNF染色质重塑复合体中PBAF(polybromo-associated BRG1-associated factor)的特异组成亚基之一,不仅参与了PBAF复合物的形成,还可介导该复合物与DNA特定区域的结合,从而影响基因的转录、翻译等过程,表明PBRM1在肾细胞癌发生发展中扮演着十分重要的角色。该文对肾细胞癌的主要癌相关基因尤其是抑癌基因PBRM1的研究现状、分子机制及临床转化研究进展进行综述,以期为SWI/SNF与肾细胞癌及其他相关肿瘤的基础和临床转化研究提供参考。