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基于Toy模型蛋白质折叠预测的多种群微粒群优化算法研究
被引量:
5
1
作者
张晓龙
李婷婷
芦进
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2008年第10期230-235,共6页
基于Toy模型的蛋白质折叠结构预测问题是一个典型的NP问题。提出了多种群微粒群优化算法用于计算蛋白质能量最小值。该算法采用了一种新的算法结构,在该结构中,每一代的种群被分为精英子种群、开采子种群和勘探子种群三部分,通过改善种...
基于Toy模型的蛋白质折叠结构预测问题是一个典型的NP问题。提出了多种群微粒群优化算法用于计算蛋白质能量最小值。该算法采用了一种新的算法结构,在该结构中,每一代的种群被分为精英子种群、开采子种群和勘探子种群三部分,通过改善种群的局部开采能力和全局勘探能力来提高算法的性能。分别采用Fibonacci蛋白质测试序列和真实蛋白质序列进行了折叠结构预测的仿真实验。实验结果表明该算法能够更精确地进行蛋白质折叠结构预测,为生物科学研究提供了一条有效途径。
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关键词
蛋白质折叠
Toy模型
多种群
微粒
群
优化
算法
(MPSO)
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职称材料
基于多群协同人工鱼群算法的分类规则提取算法
被引量:
8
2
作者
戴上平
姬盈利
+1 位作者
王华
金鹏
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2012年第5期1676-1679,共4页
在对基本人工鱼群算法原理分析的基础上,提出了一种多群协同人工鱼群算法用于实现对连续空间变量的分类规则提取问题。定义了基于规则支持度与置信度的规则评价函数,构造了人工鱼在规则提取应用中的特定编码及相关概念的计算公式,给出...
在对基本人工鱼群算法原理分析的基础上,提出了一种多群协同人工鱼群算法用于实现对连续空间变量的分类规则提取问题。定义了基于规则支持度与置信度的规则评价函数,构造了人工鱼在规则提取应用中的特定编码及相关概念的计算公式,给出了该算法的具体实现步骤,并用VC++软件编程实现。最后对Iris和Wine数据集进行测试实验,并与单群体鱼群算法及多种群微粒群算法进行比较。仿真结果表明,该算法能够快速提取分类精度较高的分类规则,因此利用该算法解决连续变量分类规则提取的相关问题是可行且有效的。
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关键词
多
群
体人工鱼
群
分类规则
协同
单
群
体人工鱼
群
算法
多种群微粒群算法
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职称材料
题名
基于Toy模型蛋白质折叠预测的多种群微粒群优化算法研究
被引量:
5
1
作者
张晓龙
李婷婷
芦进
机构
武汉科技大学计算机学院
华中科技大学CAD中心
出处
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2008年第10期230-235,共6页
基金
国家自然科学基金(No.60674115)
教育部回国人员科研启动基金(2005-2007)
文摘
基于Toy模型的蛋白质折叠结构预测问题是一个典型的NP问题。提出了多种群微粒群优化算法用于计算蛋白质能量最小值。该算法采用了一种新的算法结构,在该结构中,每一代的种群被分为精英子种群、开采子种群和勘探子种群三部分,通过改善种群的局部开采能力和全局勘探能力来提高算法的性能。分别采用Fibonacci蛋白质测试序列和真实蛋白质序列进行了折叠结构预测的仿真实验。实验结果表明该算法能够更精确地进行蛋白质折叠结构预测,为生物科学研究提供了一条有效途径。
关键词
蛋白质折叠
Toy模型
多种群
微粒
群
优化
算法
(MPSO)
Keywords
Protein folding,Toy model,Multi particle swarm optimization (MPSO)
分类号
TP24 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
O171 [理学—基础数学]
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职称材料
题名
基于多群协同人工鱼群算法的分类规则提取算法
被引量:
8
2
作者
戴上平
姬盈利
王华
金鹏
机构
华中师范大学计算机科学系
武汉大学资源与环境科学学院
出处
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2012年第5期1676-1679,共4页
基金
国家"863"计划资助项目(2011AA120304)
文摘
在对基本人工鱼群算法原理分析的基础上,提出了一种多群协同人工鱼群算法用于实现对连续空间变量的分类规则提取问题。定义了基于规则支持度与置信度的规则评价函数,构造了人工鱼在规则提取应用中的特定编码及相关概念的计算公式,给出了该算法的具体实现步骤,并用VC++软件编程实现。最后对Iris和Wine数据集进行测试实验,并与单群体鱼群算法及多种群微粒群算法进行比较。仿真结果表明,该算法能够快速提取分类精度较高的分类规则,因此利用该算法解决连续变量分类规则提取的相关问题是可行且有效的。
关键词
多
群
体人工鱼
群
分类规则
协同
单
群
体人工鱼
群
算法
多种群微粒群算法
Keywords
multi artificial fish swarm algorithm
classification rule
cooperation
single artificial fish swarm algorithm
multi particle swarm algorithm
分类号
TP301.6 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于Toy模型蛋白质折叠预测的多种群微粒群优化算法研究
张晓龙
李婷婷
芦进
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2008
5
下载PDF
职称材料
2
基于多群协同人工鱼群算法的分类规则提取算法
戴上平
姬盈利
王华
金鹏
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2012
8
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职称材料
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