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利用WGCNA挖掘黄精属植物多糖合成通路关键基因
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作者 汪蓉 孟然 +1 位作者 陈雪梅 孟盈 《吉首大学学报(自然科学版)》 CAS 2023年第5期64-71,共8页
为了获取黄精属植物多糖类有效成分合成的关键基因,基于转录组差异表达数据,采用加权共表达网络分析方法,并结合KEGG数据库中多糖合成通路信息,计算核心基因在多花黄精和玉竹的叶片及根状茎之间表达模式的相关性.结果表明,FBA(Fructose-... 为了获取黄精属植物多糖类有效成分合成的关键基因,基于转录组差异表达数据,采用加权共表达网络分析方法,并结合KEGG数据库中多糖合成通路信息,计算核心基因在多花黄精和玉竹的叶片及根状茎之间表达模式的相关性.结果表明,FBA(Fructose-Bisphosphate Aldolase)基因和GOLS(Galactinol Synthase)基因在叶片和根状茎之间对应多个转录本的表达量,在皮尔森线性回归计算结果中显示了强相关性,是黄精属植物多糖活性成分合成通路的关键基因. 展开更多
关键词 加权共表达网络 黄精属 多糖合成通路 转录组
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