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利用WGCNA挖掘黄精属植物多糖合成通路关键基因
1
作者
汪蓉
孟然
+1 位作者
陈雪梅
孟盈
《吉首大学学报(自然科学版)》
CAS
2023年第5期64-71,共8页
为了获取黄精属植物多糖类有效成分合成的关键基因,基于转录组差异表达数据,采用加权共表达网络分析方法,并结合KEGG数据库中多糖合成通路信息,计算核心基因在多花黄精和玉竹的叶片及根状茎之间表达模式的相关性.结果表明,FBA(Fructose-...
为了获取黄精属植物多糖类有效成分合成的关键基因,基于转录组差异表达数据,采用加权共表达网络分析方法,并结合KEGG数据库中多糖合成通路信息,计算核心基因在多花黄精和玉竹的叶片及根状茎之间表达模式的相关性.结果表明,FBA(Fructose-Bisphosphate Aldolase)基因和GOLS(Galactinol Synthase)基因在叶片和根状茎之间对应多个转录本的表达量,在皮尔森线性回归计算结果中显示了强相关性,是黄精属植物多糖活性成分合成通路的关键基因.
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关键词
加权共表达网络
黄精属
多糖合成通路
转录组
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题名
利用WGCNA挖掘黄精属植物多糖合成通路关键基因
1
作者
汪蓉
孟然
陈雪梅
孟盈
机构
吉首大学生物资源与环境科学学院
出处
《吉首大学学报(自然科学版)》
CAS
2023年第5期64-71,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(32160052)
吉首大学大学生创新创业训练计划项目(201910531019)。
文摘
为了获取黄精属植物多糖类有效成分合成的关键基因,基于转录组差异表达数据,采用加权共表达网络分析方法,并结合KEGG数据库中多糖合成通路信息,计算核心基因在多花黄精和玉竹的叶片及根状茎之间表达模式的相关性.结果表明,FBA(Fructose-Bisphosphate Aldolase)基因和GOLS(Galactinol Synthase)基因在叶片和根状茎之间对应多个转录本的表达量,在皮尔森线性回归计算结果中显示了强相关性,是黄精属植物多糖活性成分合成通路的关键基因.
关键词
加权共表达网络
黄精属
多糖合成通路
转录组
Keywords
WGCNA
Polygonatum
polysaccharide synthesis pathway
transcriptome
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用WGCNA挖掘黄精属植物多糖合成通路关键基因
汪蓉
孟然
陈雪梅
孟盈
《吉首大学学报(自然科学版)》
CAS
2023
0
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