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番茄P56和部分来源多糖裂解酶家族Ⅰ的其它蛋白的系统演化分析 被引量:1
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作者 赵庆新 张宇玲 《武汉植物学研究》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期282-288,共7页
果胶裂解酶包含果胶酸裂解酶(pectate lyase)和果胶酸酯裂解酶(pectin lyase)二种形式,是一类多糖裂解酶,由细菌、真菌、植物和线虫等生物产生,分布在5个多糖裂解酶家族,果胶酶在食品与饮料、纺织与洗涤、制药等工业中有广泛的应用。利... 果胶裂解酶包含果胶酸裂解酶(pectate lyase)和果胶酸酯裂解酶(pectin lyase)二种形式,是一类多糖裂解酶,由细菌、真菌、植物和线虫等生物产生,分布在5个多糖裂解酶家族,果胶酶在食品与饮料、纺织与洗涤、制药等工业中有广泛的应用。利用NCBI BLASTX服务器,搜索与番茄P56蛋白氨基酸序列相似且都属于多糖裂解酶家族Ⅰ的果胶裂解酶蛋白序列共28条,用DNAMAN软件分析其保守区,用CLUSTALX8.0软件进行序列比对和Bi-oEdit软件进行文件转换,进一步用PUAP4.0软件构建系统进化树。构建的MP树(phylogenetic trees)和NJ树(neighbor-joining)显示:来自植物的果胶酸裂解酶、真菌的果胶酸酯裂解酶、细菌的果胶酸裂解酶分别可聚为一个独立的类群;相对于细菌果胶酸裂解酶和真菌果胶酸酯裂解酶而言,构巢曲霉(Aspergillus nidulans)的果胶酸裂解酶A和植物的果胶酸裂解酶之间有较近的亲缘关系;细菌Pseudomonas syringae的果胶酸酯裂解酶和真菌的果胶酸酯裂解酶之间的亲缘关系较近。 展开更多
关键词 果胶酸 果胶酸酯 多糖裂解酶家族Ⅰ 系统演化树
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石莼多糖裂解酶原核表达方法比较
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作者 陈冉 冯思豫 +1 位作者 蔡春尔 何培民 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期842-846,共5页
比较不同原核表达载体和受体重组转化表达石莼多糖裂解酶基因的效果。将人工合成的石莼多糖裂解酶基因片段分别酶切接入原核表达载体pColdⅠ质粒和pET-28a(+)质粒,得到重组质粒pColdⅠ-859和pET-28a(+)-859(859代表石莼多糖裂解酶基因)... 比较不同原核表达载体和受体重组转化表达石莼多糖裂解酶基因的效果。将人工合成的石莼多糖裂解酶基因片段分别酶切接入原核表达载体pColdⅠ质粒和pET-28a(+)质粒,得到重组质粒pColdⅠ-859和pET-28a(+)-859(859代表石莼多糖裂解酶基因),经双酶切测序鉴定后,分别将质粒pColdⅠ-859转入大肠杆菌RP(DE3)感受态细胞,质粒pET-28a(+)-859转入大肠杆菌BL21(DE3)LysS中表达。试验结果显示,前者没有明显表达目的蛋白,后者表达的蛋白经分离纯化、电泳鉴定和Western Blot分析证明目的蛋白表达量较高。本试验经对比研究获得了能充分表达石莼多糖裂解酶的原核表达系统,为批量制备低成本高纯度的石莼多糖裂解酶蛋白提供了参考。 展开更多
关键词 石莼多糖裂解酶 原核表达 载体 大肠杆菌
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石莼多糖裂解酶的研究进展
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作者 胡富 李谦 +4 位作者 朱本伟 宁利敏 姚忠 孙芸 杜昱光 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期104-113,共10页
石莼多糖(Ulvan)由3-硫酸化鼠李糖,葡糖醛酸,艾杜糖醛酸及一些随机分布的木糖组成。石莼多糖及其降解得到的寡糖在医疗、食品等领域具有广泛的应用前景。为促进对石莼多糖裂解酶这一石莼多糖利用工具的开发,对石莼多糖裂解酶的底物组成... 石莼多糖(Ulvan)由3-硫酸化鼠李糖,葡糖醛酸,艾杜糖醛酸及一些随机分布的木糖组成。石莼多糖及其降解得到的寡糖在医疗、食品等领域具有广泛的应用前景。为促进对石莼多糖裂解酶这一石莼多糖利用工具的开发,对石莼多糖裂解酶的底物组成,来源分类,序列及进化关系,酶学性质及作用模式,蛋白结构以及作用机制进行了综述,以求对后续石莼多糖裂解酶研究者提供帮助。 展开更多
关键词 石莼多糖裂解酶 分类 性质与结构 催化机制
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人体肠道菌群来源碳水化合物活性酶(CAZYmes)研究进展 被引量:5
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作者 张浩雯 曹浩 +1 位作者 王钰璐 辛凤姣 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2020年第7期607-625,共19页
肠道菌群是人体重要的代谢"器官",对人体的健康和疾病起着至关重要的作用.肠道菌群参与人体消化、免疫、神经系统调节机能的分子机理是特异性物质代谢通路在微生物与人体之间的协同耦合.酶是代谢通路中参与物质转化的基本功... 肠道菌群是人体重要的代谢"器官",对人体的健康和疾病起着至关重要的作用.肠道菌群参与人体消化、免疫、神经系统调节机能的分子机理是特异性物质代谢通路在微生物与人体之间的协同耦合.酶是代谢通路中参与物质转化的基本功能单元,深入理解肠道菌群编码酶的分子催化机理将为以肠道菌群(或肠道酶)作为靶点的精准营养/医疗干预研究提供重要理论依据.特异性底物酶解研究表明,肠道菌群编码的酶系统不仅包含全部已知的碳水化合物活性酶(carbohydrateactive enzymes, CAZYmes)类,同时蕴含诸多潜在的新型CAZYmes.本文阐述CAZYmes的分类原则及催化机理,并主要从结构生物学方面综述人体肠道菌群来源的新型CAZYmes. 展开更多
关键词 肠道菌群 糖苷水 糖苷转移 多糖裂解酶 碳水化合物酯 辅助氧化还原
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一种甘露糖醛酸C-5差向异构酶的Loop区域结构对酶活性的影响 被引量:1
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作者 孙明 李唐 +2 位作者 赵小明 阎圣刚 尹恒 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期32-35,共4页
利用大肠杆菌(Escherichia coli)表达系统,成功异源表达并纯化了来自Pseudomonas syringae的一种周质甘糖醛酸C-5差向异构酶AlgG_PSEAM及其loop^(439-455)截短体。通过对产物进行分析发现,截去loop^(439-455)后,该甘露糖醛酸C-5差向异... 利用大肠杆菌(Escherichia coli)表达系统,成功异源表达并纯化了来自Pseudomonas syringae的一种周质甘糖醛酸C-5差向异构酶AlgG_PSEAM及其loop^(439-455)截短体。通过对产物进行分析发现,截去loop^(439-455)后,该甘露糖醛酸C-5差向异构酶的活性提高了14.7%。进一步分析,发现AlgG_PSEAM同时具有褐藻多糖裂解酶活性且通过测定其裂解酶活性发现,截去loop^(439-455)后,裂解酶活性提高了23.3%。截去loop^(439-455),可同时提高AlgG_PSEAM的甘露糖醛酸C-5差向异构酶和褐藻多糖裂解酶活性。 展开更多
关键词 LOOP 异源表达 甘露糖醛酸C-5差向异构 褐藻多糖裂解酶
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Theoretical perspective on mononuclear copper‐oxygen mediated C–H and O–H activations:A comparison between biological and synthetic systems 被引量:1
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作者 Peng Wu Jinyan Zhang +2 位作者 Qianqian Chen Wei Peng Binju Wang 《Chinese Journal of Catalysis》 SCIE EI CAS CSCD 2022年第4期913-927,共15页
Dioxygen activations constitute one of core issues in copper-dependent metalloenzymes. Upon O_(2) activation, copper-dependent metalloenzymes such as particulate methane monooxygenases(pM MOs), lytic polysaccharide mo... Dioxygen activations constitute one of core issues in copper-dependent metalloenzymes. Upon O_(2) activation, copper-dependent metalloenzymes such as particulate methane monooxygenases(pM MOs), lytic polysaccharide monooxygenases(LPMOs) and binuclear copper enzymes PHM and DβM, are able to perform various challenging C–H bond activations. Meanwhile, various copper-oxygen core containing complexes have been synthetized to mimic the active species of metalloenzymes. Dioxygen activation by mononuclear copper active site may generate various copper-oxygen intermediates, including Cu(Ⅱ)-superoxo, Cu(Ⅱ)-hydroperoxo, Cu(Ⅱ)-oxyl as well as the Cu(Ⅲ)-hydroxide species. Intriguingly, all these species have been invoked as the potential active intermediates for C–H/O–H activations in either biological or synthetic systems. Due to the poor understanding on reactivities of copper-oxygen complex, the nature of active species in both biological and synthetic systems are highly controversial. In this account, we will compare the reactivities of various mononuclear copper-oxygen species between biological systems and the synthetic systems. The present study is expected to provide the consistent understanding on reactivities of various copper-oxygen active species in both biological and synthetic systems. 展开更多
关键词 Dioxygen activation Cu(Ⅱ)-superoxo Cu(Ⅱ)-hydroperoxo Cu(Ⅱ)-oxyl Cu(Ⅲ)-hydroxide C–H activation Lytic polysaccharide monooxygenase Particulate methane monooxygenase
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海洋弧菌QY105中褐藻胶寡糖酶OalA的基因克隆、重组表达与性质研究 被引量:2
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作者 王莹 张兰 +3 位作者 王亚 楚艺 于文功 韩峰 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2016年第4期47-52,共6页
目的褐藻胶寡糖酶可将褐藻胶多糖和寡糖降解为单糖,但现有的褐藻胶寡糖酶数量极少且活力较差。本文旨在从海洋弧菌QY105中克隆寡糖酶OalA的编码基因,重组表达并研究其酶学性质。方法利用简并PCR和SiteFinding-PCR从海洋弧菌QY105中克隆... 目的褐藻胶寡糖酶可将褐藻胶多糖和寡糖降解为单糖,但现有的褐藻胶寡糖酶数量极少且活力较差。本文旨在从海洋弧菌QY105中克隆寡糖酶OalA的编码基因,重组表达并研究其酶学性质。方法利用简并PCR和SiteFinding-PCR从海洋弧菌QY105中克隆得到褐藻胶寡糖酶OalA的编码基因,在大肠杆菌中进行重组表达,对重组酶进行分离纯化及酶学性质研究。结果褐藻胶寡糖酶OalA基因全长2082bp,编码1条含有693个氨基酸残基的多肽链,理论分子量为79.17kDa,理论等电点为4.98,属于多糖裂解酶第15家族(PL^(-1)5)。重组OalA比活力为9.2U·mg^(-1),最适温度30℃,在10℃的酶活力达到最高酶活的45%,最适pH7.6,在低于30℃和pH6~10范围内稳定,偏好降解polyM。结论OalA具有低温酶的特点,且对polyM具有偏好性,可用于褐藻胶单糖制备、PL^(-1)5家族结构与功能相互关系研究等领域。 展开更多
关键词 褐藻胶寡糖 褐藻胶 多糖裂解酶 弧菌
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