多组学测序分析敌草快致肾小管上皮细胞损伤的病理机制

目的:探索敌草快中毒时肾小管上皮细胞内显著变化的基因和信号通路,为阐明敌草快中毒相关肾损伤的病理机制和优化临床治疗措施提供科学依据。方法:通过灌胃给药构建小鼠敌草快中毒模型,分析染毒后肾脏形态学和功能学的变化,并分选小鼠肾小管上皮细胞进行mRNA和microRNA测序。筛选敌草快中毒后显著差异的基因并进行功能富集,分析中毒组肾小管上皮细胞内显著激活的信号通路。结果:(1)敌草快中毒后小鼠血浆中IL-6、肌酐和尿素氮含量显著升高;肾脏肿胀,暗红质脆;肾小管上皮细胞肿胀,部分空泡变性,偶见坏死;红细胞管型和蛋白管型致管腔狭窄甚至闭塞;肾间质充血伴炎症细胞浸润。(2)中毒后肾脏上皮细胞1925种基因上调,3858种基因下调,其中促炎因子(TNF和MMP8)、趋化因子(CCL2、CXCL1和CXCL2)和促凋亡分子(BAK、Tnfsf14和Caspase3)显著增加,抑炎因子(SOCS和TGF-β)以及抑制凋亡分子(BCL2)显著降低。(3)中毒后144种microRNA上调,146种microRNA降低,其中microRNA-21可靶向调控差异基因MMP-8和VCAM-1;microRNA-30a与BCL2L11存在靶向关系。(4)GO、KEGG和GSEA功能分析提示差异基因在程序性细胞死亡、氧化应激和炎症反应相关信号通路中富集,主要包括凋亡、IL-17、NF-κB和MAPK等信号通路。结论:敌草快中毒后肾脏显著损伤,肾小管上皮细胞内促炎因子和促凋亡分子增加,抑炎和抑凋亡分子降低;程序性细胞死亡、氧化应激和炎症反应等信号通路参与敌草快中毒相关肾损伤。未来,可针对本研究中的核心分子开发靶向治疗药物,优化临床策略,改善患者预后。

良性前列腺增生多组学生物标志物的研究进展

良性前列腺增生(benign prostatic hyperplasia,BPH)可引起下尿路症状,是中老年男性最常见的良性疾病之一,患病率随年龄增长呈上升趋势,严重影响患者的生活质量。药物治疗可有效缓解BPH引起的下尿路症状,但可能产生不良反应,早期诊断治疗可有效提高患者生存质量,但目前常用的诊断方法(国际前列腺症状评分、直肠指诊影像学检查等)难以区分良性/恶性BPH,因此生物标志物是筛查BPH、开发相关靶向治疗药物较为理想的方法。本文从基因、蛋白、代谢及微生物层面介绍了BPH多组学测序相关生物标志物的研究进展,旨在为BPH的早期诊疗提供方向和依据。

单细胞测序研究进展及其在口腔医学中的应用

单细胞测序是指在单细胞层面对细胞内的物质,特别是遗传物质进行检测、识别和分析,其分辨率可以达到单分子水平。单细胞测序通过获取和分析基因组、表观组(包括DNA甲基化、染色体可及性和染色质拓扑学等)、转录组以及空间组等信息来定义细胞类型,深入研究细胞功能、细胞谱系、细胞迁移和转变以及其中的分子对细胞命运决定的影响等。近年来,为提高单细胞测序因噪声而受限的效用和研究组学之间的相互关系,单细胞测序从单一组学迈向多组学,被广泛应用于生命科学研究的多个领域,为其发展提供了强大的技术支持。

单细胞组学视角下的心肌细胞增殖

单细胞多组学测序技术是在单细胞分辨率下精确分析细胞异质性和基因调控网络的新技术,提供了全新的视角来分析细胞的分化路径、细胞间的交互调控和细胞亚群的分离现象。心肌再生与修复是逆转心肌损伤后重构的重要研究方向。目前,单细胞多组学测序技术已应用于心肌再生领域:构建生理和病理条件下心肌再生图谱,探索心肌细胞增殖的分化路径和非心肌细胞对心肌再生的交互作用,建立全新的连续细胞周期分子标志监测的心肌细胞增殖评价体系以及寻找调控心肌细胞增殖的分子开关等,具有广阔的前景。本述评总结了近几年心肌再生领域的最新研究和进展,探讨单细胞技术在心肌再生领域研究中的应用及今后研究的方向,以期为后续研究提供积极合理的参考。

胆囊癌组学研究及临床前模型研究进展

胆囊癌是胆道系统常见的恶性肿瘤,预后极差。本综述从基因组学、转录组学、单细胞组学和临床前模型四个方面来概括目前胆囊癌体细胞驱动突变、分子分型、微环境异质性、类器官模型、原位模型、人源性肿瘤异种移植模型等相关基础研究进展,以及相应的临床转化路径探索。这将为了解胆囊癌的发生发展和治疗抵抗的分子生物学机制,实现胆囊癌的精准化治疗提供新的思路。