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斑马鱼叶酸多聚谷氨酸合成酶基因的生物信息学特征及胚胎发育表达
1
作者
黄淑莹
唐诗雨
+4 位作者
黄婧童
李搏通
刘敏
黄四洲
陈炳宇
《成都医学院学报》
CAS
2024年第1期1-7,23,共8页
目的探索斑马鱼叶酸多聚谷氨酸合成酶(FPGS)的生物信息学特征及在胚胎发育中的表达模式。方法利用Ensemble数据库及ClustalW程序进行序列比对,分析斑马鱼与哺乳动物FPGS蛋白之间的氨基酸同源性;利用系统发育树分析不同物种间fpgs基因的...
目的探索斑马鱼叶酸多聚谷氨酸合成酶(FPGS)的生物信息学特征及在胚胎发育中的表达模式。方法利用Ensemble数据库及ClustalW程序进行序列比对,分析斑马鱼与哺乳动物FPGS蛋白之间的氨基酸同源性;利用系统发育树分析不同物种间fpgs基因的保守性;运用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)分析fpgs基因在斑马鱼重要器官及胚胎早期发育中的表达;运用整胚原位杂交技术检测野生型斑马鱼fpgsmRNA的表达。结果生物信息学分析显示,斑马鱼FPGS蛋白在进化上与哺乳动物同源物高度保守。RT-PCR结果显示,斑马鱼fpgs基因不仅在胚胎的各个发育阶段均有表达,且在成鱼的脑、肝和胃组织中高表达。原位杂交结果显示,fpgs基因在斑马鱼胚胎4细胞期广泛表达,而在尾芽期开始仅在卵黄合体细胞层中表达;在斑马鱼胚胎20体节期,fpgs在产生初级造血祖细胞的中间细胞团、眼睛和后脑区域呈现特异性表达;从斑马鱼胚胎受精后48~96 h,fpgs基因在其肝脏及端脑与后脑的交界处特异性表达。结论斑马鱼的FPGS蛋白与哺乳动物同源物高度保守,且fpgs基因在斑马鱼发育中的初级造血区、肝脏、后脑区及眼睛特异性表达,提示该基因在这些组织的发育中可能发挥着重要作用。
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关键词
叶酸
多聚
谷氨酸
合成酶
斑马鱼
造血
肝脏发育
下载PDF
职称材料
超高效液相串联质谱测定四棱豆中总叶酸和多聚谷氨酸叶酸的含量
被引量:
7
2
作者
戴金凤
徐明芳
+2 位作者
段翰英
邱瑞霞
王超
《现代食品科技》
EI
CAS
北大核心
2015年第10期295-300,共6页
本文建立了超高液相色谱串联三重四级杆质谱(UPLC-MS/MS)定量测定四棱豆中总叶酸的含量和多聚谷氨酸叶酸分布的方法。四棱豆在缓冲液中蒸煮灭活内源多聚谷氨酸水解酶和破坏叶酸结合蛋白,使结合态叶酸变成游离态,过滤得提取液。将提取的...
本文建立了超高液相色谱串联三重四级杆质谱(UPLC-MS/MS)定量测定四棱豆中总叶酸的含量和多聚谷氨酸叶酸分布的方法。四棱豆在缓冲液中蒸煮灭活内源多聚谷氨酸水解酶和破坏叶酸结合蛋白,使结合态叶酸变成游离态,过滤得提取液。将提取的各种形式叶酸转化为5-甲基四氢蝶酰多聚谷氨酸(5MTHFGlun),并经C18萃取小柱除盐后,采用UPLC分离不同形态的5MTHFGlun,电喷雾正离子电离模式(ESI+)和多反应监控扫描模式(MRM)测定不同形态的5MTHFGlun含量。方法采用Pte Glu(1-6)作为内标,5MTHFGlu(1-6)外标进行定量。该方法灵敏度高,最低检测限(LOD)为40~1133 fmol,最低定量限(LOQ)为120~3400 fmol,精密度为0.5%~6.8%,平均回收率为43%。研究发现四棱豆中多聚谷氨酸叶酸的主要形式是蝶酰五谷氨酸,占叶酸总量的65%;其次是蝶酰五谷氨酸占30%;其它形式只占5%;总叶酸含量为1.1μmol/100 g,其含量显著高于菠菜和西兰花等蔬菜。该方法快捷、灵敏、精确,适用于蔬菜中叶酸的分析。
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关键词
UPLC-MS/MS
总
叶酸
多聚谷氨酸叶酸
四棱豆
原文传递
题名
斑马鱼叶酸多聚谷氨酸合成酶基因的生物信息学特征及胚胎发育表达
1
作者
黄淑莹
唐诗雨
黄婧童
李搏通
刘敏
黄四洲
陈炳宇
机构
成都医学院基础医学院
成都医学院发育与再生四川省重点实验室
成都医学院临床医学院
成都医学院药学院
成都医学院人体解剖与组织胚胎学教研室
成都市第一人民医院针灸科
出处
《成都医学院学报》
CAS
2024年第1期1-7,23,共8页
基金
国家自然科学基金(No:32070805)。
文摘
目的探索斑马鱼叶酸多聚谷氨酸合成酶(FPGS)的生物信息学特征及在胚胎发育中的表达模式。方法利用Ensemble数据库及ClustalW程序进行序列比对,分析斑马鱼与哺乳动物FPGS蛋白之间的氨基酸同源性;利用系统发育树分析不同物种间fpgs基因的保守性;运用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)分析fpgs基因在斑马鱼重要器官及胚胎早期发育中的表达;运用整胚原位杂交技术检测野生型斑马鱼fpgsmRNA的表达。结果生物信息学分析显示,斑马鱼FPGS蛋白在进化上与哺乳动物同源物高度保守。RT-PCR结果显示,斑马鱼fpgs基因不仅在胚胎的各个发育阶段均有表达,且在成鱼的脑、肝和胃组织中高表达。原位杂交结果显示,fpgs基因在斑马鱼胚胎4细胞期广泛表达,而在尾芽期开始仅在卵黄合体细胞层中表达;在斑马鱼胚胎20体节期,fpgs在产生初级造血祖细胞的中间细胞团、眼睛和后脑区域呈现特异性表达;从斑马鱼胚胎受精后48~96 h,fpgs基因在其肝脏及端脑与后脑的交界处特异性表达。结论斑马鱼的FPGS蛋白与哺乳动物同源物高度保守,且fpgs基因在斑马鱼发育中的初级造血区、肝脏、后脑区及眼睛特异性表达,提示该基因在这些组织的发育中可能发挥着重要作用。
关键词
叶酸
多聚
谷氨酸
合成酶
斑马鱼
造血
肝脏发育
Keywords
Folylpolyglutamate synthetase
Zebrafish
Hematopoiesis
Liver development
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
超高效液相串联质谱测定四棱豆中总叶酸和多聚谷氨酸叶酸的含量
被引量:
7
2
作者
戴金凤
徐明芳
段翰英
邱瑞霞
王超
机构
暨南大学生命科学技术学院
暨南大学食品科学与工程系
暨南大学-萨斯喀切温大学"油料生物炼制与营养"联合实验室
出处
《现代食品科技》
EI
CAS
北大核心
2015年第10期295-300,共6页
基金
国家自然科学基金(31201404)
文摘
本文建立了超高液相色谱串联三重四级杆质谱(UPLC-MS/MS)定量测定四棱豆中总叶酸的含量和多聚谷氨酸叶酸分布的方法。四棱豆在缓冲液中蒸煮灭活内源多聚谷氨酸水解酶和破坏叶酸结合蛋白,使结合态叶酸变成游离态,过滤得提取液。将提取的各种形式叶酸转化为5-甲基四氢蝶酰多聚谷氨酸(5MTHFGlun),并经C18萃取小柱除盐后,采用UPLC分离不同形态的5MTHFGlun,电喷雾正离子电离模式(ESI+)和多反应监控扫描模式(MRM)测定不同形态的5MTHFGlun含量。方法采用Pte Glu(1-6)作为内标,5MTHFGlu(1-6)外标进行定量。该方法灵敏度高,最低检测限(LOD)为40~1133 fmol,最低定量限(LOQ)为120~3400 fmol,精密度为0.5%~6.8%,平均回收率为43%。研究发现四棱豆中多聚谷氨酸叶酸的主要形式是蝶酰五谷氨酸,占叶酸总量的65%;其次是蝶酰五谷氨酸占30%;其它形式只占5%;总叶酸含量为1.1μmol/100 g,其含量显著高于菠菜和西兰花等蔬菜。该方法快捷、灵敏、精确,适用于蔬菜中叶酸的分析。
关键词
UPLC-MS/MS
总
叶酸
多聚谷氨酸叶酸
四棱豆
Keywords
ultra-performance liquid chromatography tandem mass-spectrometry
total folate
polyglutamate folate
winged bean
分类号
TS214.9 [轻工技术与工程—粮食、油脂及植物蛋白工程]
O657.63 [理学—分析化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
斑马鱼叶酸多聚谷氨酸合成酶基因的生物信息学特征及胚胎发育表达
黄淑莹
唐诗雨
黄婧童
李搏通
刘敏
黄四洲
陈炳宇
《成都医学院学报》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
超高效液相串联质谱测定四棱豆中总叶酸和多聚谷氨酸叶酸的含量
戴金凤
徐明芳
段翰英
邱瑞霞
王超
《现代食品科技》
EI
CAS
北大核心
2015
7
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